उत्परिवर्तन दर: Difference between revisions

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{{short description|Rate at which mutations occur during some unit of time}}
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[[File:Recent estimates of the human genome-wide mutation rate.png|thumb|मानव जीनोम-व्यापी उत्परिवर्तन दर के वर्तमान में में सूची किए गए अनुमान। मानव [[जर्मलाइन]] उत्परिवर्तन दर लगभग 0.5 × 10 है<sup>−9</सुपर बेस जोड़ी प्रति वर्ष।<ref name="Scally2016">{{cite journal |vauthors=Scally A |title=मानव विकास और जनसांख्यिकीय अनुमान में उत्परिवर्तन दर|journal=Current Opinion in Genetics & Development |volume=41 |pages=36–43 |date=December 2016 |pmid=27589081 |doi=10.1016/j.gde.2016.07.008 |url=https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/257350 |access-date=2020-09-08 |archive-date=2021-01-02 |archive-url=https://web.archive.org/web/20210102024301/https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/257350 |url-status=live }}</ref>]][[आनुवंशिकी]] में, [[उत्परिवर्तन]] दर समय के साथ एक जीन या जीव में नए उत्परिवर्तन की आवृत्ति होती है।<ref>{{cite journal |vauthors=Crow JF |title=The high spontaneous mutation rate: is it a health risk? |journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=94 |issue=16 |pages=8380–6 |date=August 1997 |pmid=9237985 |pmc=33757 |doi=10.1073/pnas.94.16.8380 |bibcode=1997PNAS...94.8380C |doi-access=free}}</ref> उत्परिवर्तन दर स्थिर नहीं हैं और एक प्रकार के उत्परिवर्तन तक सीमित नहीं हैं; कई अलग-अलग प्रकार के उत्परिवर्तन होते हैं। उत्परिवर्तन दर उत्परिवर्तन के विशिष्ट वर्गों के लिए दी गई हैं। [[प्वाइंट म्यूटेशन|बिंदु]] उत्परिवर्तन उत्परिवर्तन का एक वर्ग है जो एक आधार में परिवर्तन होते हैं। [[ गलत उत्तराधिकारी |अपार्थक उत्तराधिकारी]] और [[ बकवास उत्परिवर्तन | निरर्थक उत्परिवर्तन]] बिंदु उत्परिवर्तन के दो उपप्रकार हैं। इस प्रकार के प्रतिस्थापनों की दर को एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम में उप-विभाजित किया जा सकता है जो उत्परिवर्तन दर पर आनुवंशिक संदर्भ के प्रभाव का वर्णन करता है।<ref>{{cite journal |vauthors=Pope CF, O'Sullivan DM, McHugh TD, Gillespie SH |title=एंटीबायोटिक प्रतिरोध में उत्परिवर्तन दर को मापने के लिए एक व्यावहारिक मार्गदर्शिका|journal=Antimicrobial Agents and Chemotherapy |volume=52 |issue=4 |pages=1209–14 |date=April 2008 |pmid=18250188 |pmc=2292516 |doi=10.1128/AAC.01152-07}}</ref>
[[File:Recent estimates of the human genome-wide mutation rate.png|thumb|मानव जीनोम-व्यापी उत्परिवर्तन दर के वर्तमान में में सूची किए गए अनुमान। मानव [[जर्मलाइन]] उत्परिवर्तन दर लगभग 0.5 × 10<sup>−9</sup>  बेस जोड़ी प्रति वर्ष है<sup><sup>।<ref name="Scally2016">{{cite journal |vauthors=Scally A |title=मानव विकास और जनसांख्यिकीय अनुमान में उत्परिवर्तन दर|journal=Current Opinion in Genetics & Development |volume=41 |pages=36–43 |date=December 2016 |pmid=27589081 |doi=10.1016/j.gde.2016.07.008 |url=https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/257350 |access-date=2020-09-08 |archive-date=2021-01-02 |archive-url=https://web.archive.org/web/20210102024301/https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/257350 |url-status=live }}</ref>]][[आनुवंशिकी]] में, [[उत्परिवर्तन]] दर समय के साथ एक जीन या जीव में नए उत्परिवर्तन की आवृत्ति होती है।<ref>{{cite journal |vauthors=Crow JF |title=The high spontaneous mutation rate: is it a health risk? |journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=94 |issue=16 |pages=8380–6 |date=August 1997 |pmid=9237985 |pmc=33757 |doi=10.1073/pnas.94.16.8380 |bibcode=1997PNAS...94.8380C |doi-access=free}}</ref> उत्परिवर्तन दर स्थिर नहीं हैं और एक प्रकार के उत्परिवर्तन तक सीमित नहीं हैं; कई अलग-अलग प्रकार के उत्परिवर्तन होते हैं। उत्परिवर्तन दर उत्परिवर्तन के विशिष्ट वर्गों के लिए दी गई हैं। [[प्वाइंट म्यूटेशन|बिंदु]] उत्परिवर्तन उत्परिवर्तन का एक वर्ग है जो एक आधार में परिवर्तन होते हैं। [[ गलत उत्तराधिकारी |अपार्थक उत्तराधिकारी]] और [[ बकवास उत्परिवर्तन |निरर्थक उत्परिवर्तन]] बिंदु उत्परिवर्तन के दो उपप्रकार हैं। इस प्रकार के प्रतिस्थापनों की दर को एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम में उप-विभाजित किया जा सकता है जो उत्परिवर्तन दर पर आनुवंशिक संदर्भ के प्रभाव का वर्णन करता है।<ref>{{cite journal |vauthors=Pope CF, O'Sullivan DM, McHugh TD, Gillespie SH |title=एंटीबायोटिक प्रतिरोध में उत्परिवर्तन दर को मापने के लिए एक व्यावहारिक मार्गदर्शिका|journal=Antimicrobial Agents and Chemotherapy |volume=52 |issue=4 |pages=1209–14 |date=April 2008 |pmid=18250188 |pmc=2292516 |doi=10.1128/AAC.01152-07}}</ref>


इन दरों में से प्रत्येक के लिए समय की कई प्राकृतिक इकाइयाँ हैं, जिनमें दरों को प्रति कोशिका विभाजन प्रति आधार जोड़ी, प्रति जीन प्रति पीढ़ी, या प्रति [[जीनोम]] प्रति पीढ़ी उत्परिवर्तन के रूप में वर्णित किया गया है। एक जीव की उत्परिवर्तन दर एक विकसित विशेषता है और पर्यावरण से शक्तिशाली प्रभाव के अतिरिक्त , प्रत्येक जीव के आनुवंशिकी द्वारा दृढ़ता से प्रभावित होती है। ऊपरी और निचली सीमाएँ जिनमें उत्परिवर्तन दर विकसित हो सकती है, चल रही जाँच का विषय है। चूंकि , उत्परिवर्तन दर जीनोम पर भिन्न होती है। डीएनए, आरएनए या एक जीन पर, उत्परिवर्तन दर बदल रही है।{{cn|date=June 2022}}
इन दरों में से प्रत्येक के लिए समय की कई प्राकृतिक इकाइयाँ हैं, जिनमें दरों को प्रति कोशिका विभाजन प्रति आधार जोड़ी, प्रति जीन प्रति पीढ़ी, या प्रति [[जीनोम]] प्रति पीढ़ी उत्परिवर्तन के रूप में वर्णित किया गया है। एक जीव की उत्परिवर्तन दर एक विकसित विशेषता है और पर्यावरण से शक्तिशाली प्रभाव के अतिरिक्त , प्रत्येक जीव के आनुवंशिकी द्वारा दृढ़ता से प्रभावित होती है। ऊपरी और निचली सीमाएँ जिनमें उत्परिवर्तन दर विकसित हो सकती है, चल रही जाँच का विषय है। चूंकि , उत्परिवर्तन दर जीनोम पर भिन्न होती है। डीएनए, आरएनए या एक जीन पर, उत्परिवर्तन दर बदल रही है।


जब मनुष्यों में उत्परिवर्तन दर बढ़ती है तो कुछ स्वास्थ्य कठिन परिस्थिति हो सकती हैं, उदाहरण के लिए, [[कैंसर]] और अन्य वंशानुगत रोग। उत्परिवर्तन दर का ज्ञान होना कैंसर और कई वंशानुगत बीमारियों के भविष्य को समझने के लिए महत्वपूर्ण है।<ref>{{cite journal |vauthors=Tomlinson IP, Novelli MR, Bodmer WF |title=उत्परिवर्तन दर और कैंसर|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=93 |issue=25 |pages=14800–3 |date=December 1996 |pmid=8962135 |pmc=26216 |doi=10.1073/pnas.93.25.14800 |bibcode=1996PNAS...9314800T |doi-access=free}}</ref>
जब मनुष्यों में उत्परिवर्तन दर बढ़ती है तो कुछ स्वास्थ्य कठिन परिस्थिति हो सकती हैं, उदाहरण के लिए, [[कैंसर]] और अन्य वंशानुगत रोग। उत्परिवर्तन दर का ज्ञान होना कैंसर और कई वंशानुगत बीमारियों के भविष्य को समझने के लिए महत्वपूर्ण है।<ref>{{cite journal |vauthors=Tomlinson IP, Novelli MR, Bodmer WF |title=उत्परिवर्तन दर और कैंसर|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=93 |issue=25 |pages=14800–3 |date=December 1996 |pmid=8962135 |pmc=26216 |doi=10.1073/pnas.93.25.14800 |bibcode=1996PNAS...9314800T |doi-access=free}}</ref>
== पृष्ठभूमि ==
== पृष्ठभूमि           ==


एक प्रजाति के अंदर विभिन्न अनुवांशिक रूपों को एलील कहा जाता है, इसलिए एक नया उत्परिवर्तन एक नया एलील बना सकता है। [[जनसंख्या आनुवंशिकी]] में, प्रत्येक एलील को एक चयन गुणांक की विशेषता होती है, जो समय के साथ एलील की आवृत्ति में अपेक्षित परिवर्तन को मापता है। चयन गुणांक या तो ऋणात्मक हो सकता है, अपेक्षित कमी के अनुरूप, सकारात्मक, अपेक्षित वृद्धि के अनुरूप, या शून्य, अपेक्षित परिवर्तन के अनुरूप नहीं। नए उत्परिवर्तन के स्वास्थ्य प्रभाव का वितरण जनसंख्या आनुवंशिकी में एक महत्वपूर्ण पैरामीटर है और व्यापक जांच का विषय रहा है।<ref name="Adam Eyre-Walker">{{cite journal |vauthors=Eyre-Walker A, Keightley PD |title=नए म्यूटेशनों के फिटनेस प्रभावों का वितरण|journal=Nature Reviews. Genetics |volume=8 |issue=8 |pages=610–8 |date=August 2007 |pmid=17637733 |doi=10.1038/nrg2146 |s2cid=10868777}}</ref> चूंकि इस वितरण के माप अतीत में असंगत रहे हैं, अब सामान्यतः यह सोचा जाता है कि अधिकांश उत्परिवर्तन कम हानिकारक होते हैं, कई जीवों की स्वास्थ्य पर बहुत कम प्रभाव डालते हैं, और कुछ अनुकूल हो सकते हैं।
एक प्रजाति के अंदर विभिन्न अनुवांशिक रूपों को एलील कहा जाता है, इसलिए एक नया उत्परिवर्तन एक नया एलील बना सकता है। [[जनसंख्या आनुवंशिकी]] में, प्रत्येक एलील को एक चयन गुणांक की विशेषता होती है, जो समय के साथ एलील की आवृत्ति में अपेक्षित परिवर्तन को मापता है। चयन गुणांक या तो ऋणात्मक हो सकता है, अपेक्षित कमी के अनुरूप, सकारात्मक, अपेक्षित वृद्धि के अनुरूप, या शून्य, अपेक्षित परिवर्तन के अनुरूप नहीं। नए उत्परिवर्तन के स्वास्थ्य प्रभाव का वितरण जनसंख्या आनुवंशिकी में एक महत्वपूर्ण पैरामीटर है और व्यापक जांच का विषय रहा है।<ref name="Adam Eyre-Walker">{{cite journal |vauthors=Eyre-Walker A, Keightley PD |title=नए म्यूटेशनों के फिटनेस प्रभावों का वितरण|journal=Nature Reviews. Genetics |volume=8 |issue=8 |pages=610–8 |date=August 2007 |pmid=17637733 |doi=10.1038/nrg2146 |s2cid=10868777}}</ref> चूंकि इस वितरण के माप अतीत में असंगत रहे हैं, अब सामान्यतः यह सोचा जाता है कि अधिकांश उत्परिवर्तन कम हानिकारक होते हैं, कई जीवों की स्वास्थ्य पर बहुत कम प्रभाव डालते हैं, और कुछ अनुकूल हो सकते हैं।


[[प्राकृतिक चयन]] के कारण, प्रतिकूल उत्परिवर्तन सामान्यतः एक जनसंख्या से समाप्त हो जाएंगे, जबकि अनुकूल परिवर्तन सामान्यतः अगली पीढ़ी के लिए रखे जाते हैं, और तटस्थ परिवर्तन उत्परिवर्तन द्वारा बनाए गए दर पर जमा होते हैं। यह प्रक्रिया प्रजनन द्वारा होती है। एक विशेष पीढ़ी में 'सर्वोत्तम योग्य' उच्च संभावना के साथ जीवित रहता है, अपने जीन को अपनी संतानों में पारित करता है। इस संभाव्यता में परिवर्तन का संकेत उत्परिवर्तन को जीवों के लिए लाभकारी, तटस्थ या हानिकारक होने के रूप में परिभाषित करता है।<ref>{{cite journal |vauthors=Scally A, Durbin R |title=Revising the human mutation rate: implications for understanding human evolution |journal=Nature Reviews. Genetics |volume=13 |issue=10 |pages=745–53 |date=October 2012 |pmid=22965354 |doi=10.1038/nrg3295 |s2cid=18944814}}</ref>
[[प्राकृतिक चयन]] के कारण, प्रतिकूल उत्परिवर्तन सामान्यतः एक जनसंख्या से समाप्त हो जाएंगे, जबकि अनुकूल परिवर्तन सामान्यतः अगली पीढ़ी के लिए रखे जाते हैं, और तटस्थ परिवर्तन उत्परिवर्तन द्वारा बनाए गए दर पर जमा होते हैं। यह प्रक्रिया प्रजनन द्वारा होती है। एक विशेष पीढ़ी में 'सर्वोत्तम योग्य' उच्च संभावना के साथ जीवित रहता है, अपने जीन को अपनी संतानों में पारित करता है। इस संभाव्यता में परिवर्तन का संकेत उत्परिवर्तन को जीवों के लिए लाभकारी, तटस्थ या हानिकारक होने के रूप में परिभाषित करता है।<ref>{{cite journal |vauthors=Scally A, Durbin R |title=Revising the human mutation rate: implications for understanding human evolution |journal=Nature Reviews. Genetics |volume=13 |issue=10 |pages=745–53 |date=October 2012 |pmid=22965354 |doi=10.1038/nrg3295 |s2cid=18944814}}</ref>




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एक जीव की उत्परिवर्तन दर को कई विधियों द्वारा मापा जा सकता है।
एक जीव की उत्परिवर्तन दर को कई विधियों द्वारा मापा जा सकता है।


उत्परिवर्तन दर को मापने का एक विधि उतार-चढ़ाव परीक्षण है, जिसे लुरिया-डेलब्रुक प्रयोग के रूप में भी जाना जाता है। इस प्रयोग ने प्रदर्शित किया कि चयन की उपस्थिति के अतिरिक्त चयन के अभाव में बैक्टीरिया उत्परिवर्तन होता है।<ref>"Luria–Delbrück experiment". ''Wikipedia''. 2017-04-25.</ref>
उत्परिवर्तन दर को मापने का एक विधि उतार-चढ़ाव परीक्षण है, जिसे लुरिया-डेलब्रुक प्रयोग के रूप में भी जाना जाता है। इस प्रयोग ने प्रदर्शित किया कि चयन की उपस्थिति के अतिरिक्त चयन के अभाव में बैक्टीरिया उत्परिवर्तन होता है।<ref>"Luria–Delbrück experiment". ''Wikipedia''. 2017-04-25.</ref>


यह उत्परिवर्तन दरों के लिए बहुत महत्वपूर्ण है क्योंकि यह सिद्ध करता है कि प्रयोगात्मक रूप से उत्परिवर्तन एक घटक होने के बिना हो सकता है - वास्तव में, उत्परिवर्तन और चयन पूरी तरह से अलग हैं [https://www.livescience.com/1796-forces-evolution.html विकासवादी बल] . अलग-अलग डीएनए अनुक्रमों में उत्परिवर्तन (नीचे देखें) के लिए अलग-अलग प्रवृत्ति हो सकती है और यादृच्छिक रूप से नहीं हो सकती है।<ref>Monroe, J.G., Srikant, T., Carbonell-Bejerano, P. et al. Mutation bias reflects natural selection in Arabidopsis thaliana. Nature 602, 101–105 (2022). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04269-6 {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20220625052244/https://www.nature.com/articles/s41586-021-04269-6 |date=2022-06-25 }}</ref> उत्परिवर्तन का सबसे सामान्य रूप से मापा गया वर्ग प्रतिस्थापन है, क्योंकि डीएनए अनुक्रम डेटा के मानक विश्लेषण के साथ मापना अपेक्षाकृत आसान है। चूंकि प्रतिस्थापन में उत्परिवर्तन की अधिक भिन्न दर होती है (10<sup>−8</sup> से 10 तक<sup>−9</sup> अधिकांश कोशिकीय जीवों के लिए प्रति पीढ़ी) उत्परिवर्तन के अन्य वर्गों की तुलना में, जो अधिकांशतः बहुत अधिक होते हैं (~10<sup>−3</sup> उपग्रह डीएनए विस्तार/संकुचन के लिए प्रति पीढ़ी<ref>{{Cite journal |url=https://www.genetics.org/content/207/2/697 |doi=10.1534/genetics.117.300146 |title=Daphnia pulex में टैंडेम दोहरावदार डीएनए म्यूटेशन की उच्च दरों का चयन विवश करता है|year=2017 |last1=Flynn |first1=Jullien M. |last2=Caldas |first2=Ian |last3=Cristescu |first3=Melania E. |last4=Clark |first4=Andrew G. |journal=Genetics |volume=207 |issue=2 |pages=697–710 |pmid=28811387 |pmc=5629333 |access-date=2020-03-21 |archive-date=2020-03-21 |archive-url=https://web.archive.org/web/20200321203018/https://www.genetics.org/content/207/2/697 |url-status=live }}</ref>).
यह उत्परिवर्तन दरों के लिए बहुत महत्वपूर्ण है क्योंकि यह सिद्ध करता है कि प्रयोगात्मक रूप से उत्परिवर्तन एक घटक होने के बिना हो सकता है - वास्तव में, उत्परिवर्तन और चयन पूरी तरह से अलग हैं [https://www.livescience.com/1796-forces-evolution.html विकासवादी बल] . अलग-अलग डीएनए अनुक्रमों में उत्परिवर्तन (नीचे देखें) के लिए अलग-अलग प्रवृत्ति हो सकती है और यादृच्छिक रूप से नहीं हो सकती है।<ref>Monroe, J.G., Srikant, T., Carbonell-Bejerano, P. et al. Mutation bias reflects natural selection in Arabidopsis thaliana. Nature 602, 101–105 (2022). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04269-6 {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20220625052244/https://www.nature.com/articles/s41586-021-04269-6 |date=2022-06-25 }}</ref> उत्परिवर्तन का सबसे सामान्य रूप से मापा गया वर्ग प्रतिस्थापन है, क्योंकि डीएनए अनुक्रम डेटा के मानक विश्लेषण के साथ मापना अपेक्षाकृत आसान है। चूंकि प्रतिस्थापन में उत्परिवर्तन की अधिक भिन्न दर होती है (10<sup>−8</sup> से 10<sup>−9</sup> तक अधिकांश कोशिकीय जीवों के लिए प्रति पीढ़ी) उत्परिवर्तन के अन्य वर्गों की तुलना में, जो अधिकांशतः बहुत अधिक होते हैं (~10<sup>−3</sup> उपग्रह डीएनए विस्तार/संकुचन के लिए प्रति पीढ़ी है )<ref>{{Cite journal |url=https://www.genetics.org/content/207/2/697 |doi=10.1534/genetics.117.300146 |title=Daphnia pulex में टैंडेम दोहरावदार डीएनए म्यूटेशन की उच्च दरों का चयन विवश करता है|year=2017 |last1=Flynn |first1=Jullien M. |last2=Caldas |first2=Ian |last3=Cristescu |first3=Melania E. |last4=Clark |first4=Andrew G. |journal=Genetics |volume=207 |issue=2 |pages=697–710 |pmid=28811387 |pmc=5629333 |access-date=2020-03-21 |archive-date=2020-03-21 |archive-url=https://web.archive.org/web/20200321203018/https://www.genetics.org/content/207/2/697 |url-status=live }}</ref>


=== प्रतिस्थापन दर ===
=== प्रतिस्थापन दर ===
एक जीव के जीनोम में कई स्थल छोटे स्वास्थ्य प्रभावों के साथ उत्परिवर्तन को स्वीकार कर सकती हैं। इन स्थलो को सामान्यतः तटस्थ स्थल कहा जाता है। सैद्धांतिक रूप से उत्परिवर्तन बिना किसी चयन के जीवों के बीच ठीक उत्परिवर्तन दर पर तय (जनसंख्या आनुवंशिकी) हो जाते हैं। निश्चित पर्यायवाची उत्परिवर्तन, अर्थात पर्यायवाची प्रतिस्थापन, एक जीन के अनुक्रम में परिवर्तन होते हैं जो उस जीन द्वारा उत्पादित प्रोटीन को नहीं बदलते हैं। वे अधिकांशतः उस उत्परिवर्तन दर के अनुमान के रूप में उपयोग किए जाते हैं, इस तथ्य के अतिरिक्त कि कुछ पर्यायवाची उत्परिवर्तनों का स्वास्थ्य प्रभाव होता है। एक उदाहरण के रूप में, एस्चेरिचिया कोली बी की प्रयोगात्मक रूप से विकसित प्रतिकृति रेखाओ के पूरे जीनोम अनुक्रमों से उत्परिवर्तन दर सीधे अनुमान लगाया गया है।<ref name="Wielgoss">{{cite journal |vauthors=Wielgoss S, Barrick JE, Tenaillon O, Cruveiller S, Chane-Woon-Ming B, Médigue C, Lenski RE, Schneider D |title=Escherichia कोलाई के साथ एक लंबी अवधि के विकास प्रयोग में पर्यायवाची प्रतिस्थापन से अनुमानित उत्परिवर्तन दर|journal=G3 |volume=1 |issue=3 |pages=183–186 |date=August 2011 |pmid=22207905 |pmc=3246271 |doi=10.1534/g3.111.000406}}</ref>
एक जीव के जीनोम में कई स्थल छोटे स्वास्थ्य प्रभावों के साथ उत्परिवर्तन को स्वीकार कर सकती हैं। इन स्थलो को सामान्यतः तटस्थ स्थल कहा जाता है। सैद्धांतिक रूप से उत्परिवर्तन बिना किसी चयन के जीवों के बीच ठीक उत्परिवर्तन दर पर तय (जनसंख्या आनुवंशिकी) हो जाते हैं। निश्चित पर्यायवाची उत्परिवर्तन, अर्थात पर्यायवाची प्रतिस्थापन, एक जीन के अनुक्रम में परिवर्तन होते हैं जो उस जीन द्वारा उत्पादित प्रोटीन को नहीं बदलते हैं। वे अधिकांशतः उस उत्परिवर्तन दर के अनुमान के रूप में उपयोग किए जाते हैं, इस तथ्य के अतिरिक्त कि कुछ पर्यायवाची उत्परिवर्तनों का स्वास्थ्य प्रभाव होता है। एक उदाहरण के रूप में, एस्चेरिचिया कोली बी की प्रयोगात्मक रूप से विकसित प्रतिकृति रेखाओ के पूरे जीनोम अनुक्रमों से उत्परिवर्तन दर सीधे अनुमान लगाया गया है।<ref name="Wielgoss">{{cite journal |vauthors=Wielgoss S, Barrick JE, Tenaillon O, Cruveiller S, Chane-Woon-Ming B, Médigue C, Lenski RE, Schneider D |title=Escherichia कोलाई के साथ एक लंबी अवधि के विकास प्रयोग में पर्यायवाची प्रतिस्थापन से अनुमानित उत्परिवर्तन दर|journal=G3 |volume=1 |issue=3 |pages=183–186 |date=August 2011 |pmid=22207905 |pmc=3246271 |doi=10.1534/g3.111.000406}}</ref>


=== उत्परिवर्तन संचय रेखाएँ ===
=== उत्परिवर्तन संचय रेखाएँ ===
उत्परिवर्तन दर को चिह्नित करने का एक विशेष रूप से श्रम-गहन विधि उत्परिवर्तन संचय रेखा है।
उत्परिवर्तन दर को चिह्नित करने का एक विशेष रूप से श्रम-गहन विधि उत्परिवर्तन संचय रेखा है।


उत्परिवर्तन संचय रेखाओ का उपयोग बेटमैन-मुकाई विधि के साथ उत्परिवर्तन दर को चिह्नित करने और आंतों के बैक्टीरिया (ई. कोलाई), गोल कृमि (सी. एलिगेंस), खमीर (एस. सेरेविसिया), फल से लेकर अच्छी तरह से अध्ययन किए गए प्रायोगिक जीवों के प्रत्यक्ष अनुक्रमण के लिए किया गया है। मक्खियाँ (डी। मेलानोगास्टर), और छोटे अल्पकालिक पौधे (ए। थलियाना) है।<ref name="Lucas-Lledo">{{cite journal |vauthors=Ossowski S, Schneeberger K, Lucas-Lledó JI, Warthmann N, Clark RM, Shaw RG, Weigel D, Lynch M |title=अरबिडोप्सिस थलियाना में सहज उत्परिवर्तन की दर और आणविक स्पेक्ट्रम|journal=Science |volume=327 |issue=5961 |pages=92–4 |date=January 2010 |pmid=20044577 |pmc=3878865 |doi=10.1126/science.1180677 |bibcode=2010Sci...327...92O}}</ref>
उत्परिवर्तन संचय रेखाओ का उपयोग बेटमैन-मुकाई विधि के साथ उत्परिवर्तन दर को चिह्नित करने और आंतों के बैक्टीरिया (ई. कोलाई), गोल कृमि (सी. एलिगेंस), खमीर (एस. सेरेविसिया), फल से लेकर अच्छी तरह से अध्ययन किए गए प्रायोगिक जीवों के प्रत्यक्ष अनुक्रमण के लिए किया गया है। मक्खियाँ (डी। मेलानोगास्टर), और छोटे अल्पकालिक पौधे (ए। थलियाना) है।<ref name="Lucas-Lledo">{{cite journal |vauthors=Ossowski S, Schneeberger K, Lucas-Lledó JI, Warthmann N, Clark RM, Shaw RG, Weigel D, Lynch M |title=अरबिडोप्सिस थलियाना में सहज उत्परिवर्तन की दर और आणविक स्पेक्ट्रम|journal=Science |volume=327 |issue=5961 |pages=92–4 |date=January 2010 |pmid=20044577 |pmc=3878865 |doi=10.1126/science.1180677 |bibcode=2010Sci...327...92O}}</ref>




== उत्परिवर्तन दर में भिन्नता ==
== उत्परिवर्तन दर में भिन्नता ==


[[File:Molecular evolution bamboos.svg|thumb|250px|left|alt=Phylogram showing three groups, one of which has strikingly longer branches than the two others|पीढ़ी का समय उत्परिवर्तन दर को प्रभावित करता है: लंबे समय तक रहने वाले लकड़ी के बांस (जनजाति [[अरुंडिनेरी]] और [[बम्बूसी]]) में तेजी से विकसित होने वाले शाकाहारी बांस ([[Olyreae]]) की तुलना में कम उत्परिवर्तन दर (फाइलोजेनेटिक पेड़ में छोटी शाखाएं) होती हैं।]]उत्परिवर्तन दर प्रजातियों के बीच और यहां तक ​​कि एक ही प्रजाति के जीनोम के विभिन्न क्षेत्रों के बीच भिन्न होती है। न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन की इन विभिन्न दरों को प्रतिस्थापन (निर्धारण (जनसंख्या आनुवंशिकी)) प्रति आधार जोड़ी प्रति पीढ़ी में मापा जाता है। उदाहरण के लिए, इंटरजेनिक, या गैर-कोडिंग में उत्परिवर्तन, डीएनए में उत्परिवर्तन की तुलना में डीएनए में तेजी से जमा होता है जो जीव (जीन अभिव्यक्ति) में सक्रिय रूप से उपयोग में है। यह आवश्यक रूप से उच्च उत्परिवर्तन दर के कारण नहीं है, किंतु शुद्ध चयन के निम्न स्तर के कारण है। एक क्षेत्र जो अनुमानित दर पर उत्परिवर्तित होता है वह [[आणविक घड़ी|आणविक समय]] के रूप में उपयोग के लिए एक उम्मीदवार है।
[[File:Molecular evolution bamboos.svg|thumb|250px|left|alt=Phylogram showing three groups, one of which has strikingly longer branches than the two others|पीढ़ी का समय उत्परिवर्तन दर को प्रभावित करता है: लंबे समय तक रहने वाले लकड़ी के बांस (जनजाति [[अरुंडिनेरी]] और [[बम्बूसी]]) में तेजी से विकसित होने वाले शाकाहारी बांस ([[Olyreae|ओलिरिया]]) की तुलना में कम उत्परिवर्तन दर (फाइलोजेनेटिक पेड़ में छोटी शाखाएं) होती हैं।]]उत्परिवर्तन दर प्रजातियों के बीच और यहां तक ​​कि एक ही प्रजाति के जीनोम के विभिन्न क्षेत्रों के बीच भिन्न होती है। न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन की इन विभिन्न दरों को प्रतिस्थापन (निर्धारण (जनसंख्या आनुवंशिकी)) प्रति आधार जोड़ी प्रति पीढ़ी में मापा जाता है। उदाहरण के लिए, इंटरजेनिक, या गैर-कोडिंग में उत्परिवर्तन, डीएनए में उत्परिवर्तन की तुलना में डीएनए में तेजी से जमा होता है जो जीव (जीन अभिव्यक्ति) में सक्रिय रूप से उपयोग में है। यह आवश्यक रूप से उच्च उत्परिवर्तन दर के कारण नहीं है, किंतु शुद्ध चयन के निम्न स्तर के कारण है। एक क्षेत्र जो अनुमानित दर पर उत्परिवर्तित होता है वह [[आणविक घड़ी|आणविक समय]] के रूप में उपयोग के लिए एक उम्मीदवार है।


यदि एक क्रम में तटस्थ उत्परिवर्तन की दर को स्थिर (घड़ी की तरह) माना जाता है, और यदि प्रजातियों के बीच अधिकांश अंतर अनुकूली के अतिरिक्त तटस्थ हैं, तो दो अलग-अलग प्रजातियों के बीच के अंतरों की संख्या का अनुमान लगाने के लिए उपयोग किया जा सकता है कि कितने समय पहले दो प्रजातियां अलग हो गईं (आण्विक घड़ी देखें)। वास्तव में, पर्यावरणीय तनाव की प्रतिक्रिया में जीव की उत्परिवर्तन दर बदल सकती है। उदाहरण के लिए, यूवी प्रकाश डीएनए को हानि पहुंचाता है, जिसके परिणामस्वरूप [[डीएनए की मरम्मत]] करने के लिए कक्ष द्वारा त्रुटि प्रवण प्रयास हो सकते हैं।
यदि एक क्रम में तटस्थ उत्परिवर्तन की दर को स्थिर (घड़ी की तरह) माना जाता है, और यदि प्रजातियों के बीच अधिकांश अंतर अनुकूली के अतिरिक्त तटस्थ हैं, तो दो अलग-अलग प्रजातियों के बीच के अंतरों की संख्या का अनुमान लगाने के लिए उपयोग किया जा सकता है कि कितने समय पहले दो प्रजातियां अलग हो गईं (आण्विक घड़ी देखें)। वास्तव में, पर्यावरणीय तनाव की प्रतिक्रिया में जीव की उत्परिवर्तन दर बदल सकती है। उदाहरण के लिए, यूवी प्रकाश डीएनए को हानि पहुंचाता है, जिसके परिणामस्वरूप [[डीएनए की मरम्मत|डीएनए की]] सुधार करने के लिए कक्ष द्वारा त्रुटि प्रवण प्रयास हो सकते हैं।


मानव उत्परिवर्तन दर महिला (अंडे की कोशिकाओं) की तुलना में पुरुष रोगाणु रेखा (शुक्राणु) में अधिक है, , किन्तु स्पष्ट दर का अनुमान परिमाण या अधिक के क्रम से भिन्न होता है। इसका कारण यह है कि एक मानव जीनोम प्रति पीढ़ी लगभग 64 नए उत्परिवर्तन जमा करता है क्योंकि प्रत्येक पूर्ण पीढ़ी में युग्मक उत्पन्न करने के लिए कई कोशिका विभाजन सम्मिलित होते हैं।<ref name="Genetics">{{cite journal |vauthors=Drake JW, Charlesworth B, Charlesworth D, Crow JF |title=सहज उत्परिवर्तन की दरें|journal=Genetics |volume=148 |issue=4 |pages=1667–86 |date=April 1998 |doi=10.1093/genetics/148.4.1667 |pmid=9560386 |pmc=1460098 |url=http://www.genetics.org/cgi/content/full/148/4/1667 |access-date=2007-09-27 |archive-date=2010-08-21 |archive-url=https://web.archive.org/web/20100821100757/http://www.genetics.org/cgi/content/full/148/4/1667 |url-status=live }}</ref> मानव माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए में उत्परिवर्तन दर ~ 3 × या ~ 2.7 × 10<sup>−5</sup> होने का अनुमान लगाया गया है प्रति आधार प्रति 20 वर्ष पीढ़ी (अनुमान की विधि के आधार पर);<ref>{{cite journal |vauthors=Schneider S, Excoffier L |title=Estimation of past demographic parameters from the distribution of pairwise differences when the mutation rates vary among sites: application to human mitochondrial DNA |journal=Genetics |volume=152 |issue=3 |pages=1079–89 |date=July 1999 |doi=10.1093/genetics/152.3.1079 |pmid=10388826 |pmc=1460660 |url=http://www.genetics.org/cgi/reprint/152/3/1079 |access-date=2008-02-25 |archive-date=2008-09-08 |archive-url=https://web.archive.org/web/20080908074904/http://www.genetics.org/cgi/reprint/152/3/1079 |url-status=live }}</ref> इन दरों को ~ 2.5 × 10<sup>−8</sup> पर मानव जीनोमिक उत्परिवर्तन की दर से अधिक अधिक माना जाता है प्रति आधार प्रति पीढ़ी।<ref name="Nachman">{{cite journal |vauthors=Nachman MW, Crowell SL |title=मनुष्यों में प्रति न्यूक्लियोटाइड उत्परिवर्तन दर का अनुमान|journal=Genetics |volume=156 |issue=1 |pages=297–304 |date=September 2000 |doi=10.1093/genetics/156.1.297 |pmid=10978293 |pmc=1461236 |url=http://www.genetics.org/cgi/content/full/156/1/297 |access-date=2007-10-19 |archive-date=2011-04-08 |archive-url=https://web.archive.org/web/20110408213817/http://www.genetics.org/cgi/content/full/156/1/297 |url-status=live }}</ref> संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण से उपलब्ध डेटा का उपयोग करते हुए, मानव जीनोम उत्परिवर्तन दर समान रूप से ~ 1.1 × 10<sup>−8</sup> प्रति स्थल प्रति पीढ़ी होने का अनुमान लगाया गया है <ref name="Science">{{cite journal |vauthors=Roach JC, Glusman G, Smit AF, Huff CD, Hubley R, Shannon PT, Rowen L, Pant KP, Goodman N, Bamshad M, Shendure J, Drmanac R, Jorde LB, Hood L, Galas DJ |title=संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण द्वारा एक पारिवारिक चौकड़ी में आनुवंशिक वंशानुक्रम का विश्लेषण|journal=Science |volume=328 |issue=5978 |pages=636–9 |date=April 2010 |pmid=20220176 |pmc=3037280 |doi=10.1126/science.1186802 |bibcode=2010Sci...328..636R}}</ref>
मानव उत्परिवर्तन दर महिला (अंडे की कोशिकाओं) की तुलना में पुरुष रोगाणु रेखा (शुक्राणु) में अधिक है, , किन्तु स्पष्ट दर का अनुमान परिमाण या अधिक के क्रम से भिन्न होता है। इसका कारण यह है कि एक मानव जीनोम प्रति पीढ़ी लगभग 64 नए उत्परिवर्तन जमा करता है क्योंकि प्रत्येक पूर्ण पीढ़ी में युग्मक उत्पन्न करने के लिए कई कोशिका विभाजन सम्मिलित होते हैं।<ref name="Genetics">{{cite journal |vauthors=Drake JW, Charlesworth B, Charlesworth D, Crow JF |title=सहज उत्परिवर्तन की दरें|journal=Genetics |volume=148 |issue=4 |pages=1667–86 |date=April 1998 |doi=10.1093/genetics/148.4.1667 |pmid=9560386 |pmc=1460098 |url=http://www.genetics.org/cgi/content/full/148/4/1667 |access-date=2007-09-27 |archive-date=2010-08-21 |archive-url=https://web.archive.org/web/20100821100757/http://www.genetics.org/cgi/content/full/148/4/1667 |url-status=live }}</ref> मानव माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए में उत्परिवर्तन दर ~ 3 × या ~ 2.7 × 10<sup>−5</sup> होने का अनुमान लगाया गया है प्रति आधार प्रति 20 वर्ष पीढ़ी (अनुमान की विधि के आधार पर);<ref>{{cite journal |vauthors=Schneider S, Excoffier L |title=Estimation of past demographic parameters from the distribution of pairwise differences when the mutation rates vary among sites: application to human mitochondrial DNA |journal=Genetics |volume=152 |issue=3 |pages=1079–89 |date=July 1999 |doi=10.1093/genetics/152.3.1079 |pmid=10388826 |pmc=1460660 |url=http://www.genetics.org/cgi/reprint/152/3/1079 |access-date=2008-02-25 |archive-date=2008-09-08 |archive-url=https://web.archive.org/web/20080908074904/http://www.genetics.org/cgi/reprint/152/3/1079 |url-status=live }}</ref> इन दरों को ~ 2.5 × 10<sup>−8</sup> पर मानव जीनोमिक उत्परिवर्तन की दर से अधिक अधिक माना जाता है प्रति आधार प्रति पीढ़ी।<ref name="Nachman">{{cite journal |vauthors=Nachman MW, Crowell SL |title=मनुष्यों में प्रति न्यूक्लियोटाइड उत्परिवर्तन दर का अनुमान|journal=Genetics |volume=156 |issue=1 |pages=297–304 |date=September 2000 |doi=10.1093/genetics/156.1.297 |pmid=10978293 |pmc=1461236 |url=http://www.genetics.org/cgi/content/full/156/1/297 |access-date=2007-10-19 |archive-date=2011-04-08 |archive-url=https://web.archive.org/web/20110408213817/http://www.genetics.org/cgi/content/full/156/1/297 |url-status=live }}</ref> संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण से उपलब्ध डेटा का उपयोग करते हुए, मानव जीनोम उत्परिवर्तन दर समान रूप से ~ 1.1 × 10<sup>−8</sup> प्रति स्थल प्रति पीढ़ी होने का अनुमान लगाया गया है <ref name="Science">{{cite journal |vauthors=Roach JC, Glusman G, Smit AF, Huff CD, Hubley R, Shannon PT, Rowen L, Pant KP, Goodman N, Bamshad M, Shendure J, Drmanac R, Jorde LB, Hood L, Galas DJ |title=संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण द्वारा एक पारिवारिक चौकड़ी में आनुवंशिक वंशानुक्रम का विश्लेषण|journal=Science |volume=328 |issue=5978 |pages=636–9 |date=April 2010 |pmid=20220176 |pmc=3037280 |doi=10.1126/science.1186802 |bibcode=2010Sci...328..636R}}</ref>


उत्परिवर्तन के अन्य रूपों की दर भी बिंदु उत्परिवर्तन से बहुत भिन्न होती है। एक व्यक्तिगत माइक्रोसैटेलाइट (आनुवांशिकी) ठिकाने में अधिकांशतः 10<sup>−4</sup> के क्रम में उत्परिवर्तन दर होती है, चूंकि यह लंबाई के साथ अधिक भिन्न हो सकता है।<ref>{{cite journal |vauthors=Whittaker JC, Harbord RM, Boxall N, Mackay I, Dawson G, Sibly RM |title=माइक्रोसैटेलाइट म्यूटेशन दरों की संभावना-आधारित अनुमान|journal=Genetics |volume=164 |issue=2 |pages=781–7 |date=June 2003 |doi=10.1093/genetics/164.2.781 |pmid=12807796 |pmc=1462577 |url=http://www.genetics.org/content/164/2/781.full |access-date=2011-05-03 |archive-date=2011-11-28 |archive-url=https://web.archive.org/web/20111128184524/http://www.genetics.org/content/164/2/781.full |url-status=live }}</ref>
उत्परिवर्तन के अन्य रूपों की दर भी बिंदु उत्परिवर्तन से बहुत भिन्न होती है। एक व्यक्तिगत माइक्रोसैटेलाइट (आनुवांशिकी) ठिकाने में अधिकांशतः 10<sup>−4</sup> के क्रम में उत्परिवर्तन दर होती है, चूंकि यह लंबाई के साथ अधिक भिन्न हो सकता है।<ref>{{cite journal |vauthors=Whittaker JC, Harbord RM, Boxall N, Mackay I, Dawson G, Sibly RM |title=माइक्रोसैटेलाइट म्यूटेशन दरों की संभावना-आधारित अनुमान|journal=Genetics |volume=164 |issue=2 |pages=781–7 |date=June 2003 |doi=10.1093/genetics/164.2.781 |pmid=12807796 |pmc=1462577 |url=http://www.genetics.org/content/164/2/781.full |access-date=2011-05-03 |archive-date=2011-11-28 |archive-url=https://web.archive.org/web/20111128184524/http://www.genetics.org/content/164/2/781.full |url-status=live }}</ref>


डीएनए के कुछ अनुक्रम उत्परिवर्तन के प्रति अधिक संवेदनशील हो सकते हैं। उदाहरण के लिए, मानव शुक्राणु में डीएनए का फैलाव जिसमें मेथिलिकरण की कमी होती है, उत्परिवर्तन के लिए अधिक प्रवण होता है।<ref>{{cite web |first=Lauren |last=Gravtiz |title=डीएनए संशोधन की कमी म्यूटेशन के लिए हॉटस्पॉट बनाती है|date=28 June 2012 |publisher=Simons Foundation Autism Research Initiative |url=http://sfari.org/news-and-opinion/news/2012/lack-of-dna-modification-creates-hotspots-for-mutations |access-date=20 February 2014 |archive-date=5 March 2014 |archive-url=https://web.archive.org/web/20140305134537/http://sfari.org/news-and-opinion/news/2012/lack-of-dna-modification-creates-hotspots-for-mutations |url-status=live }}</ref>
डीएनए के कुछ अनुक्रम उत्परिवर्तन के प्रति अधिक संवेदनशील हो सकते हैं। उदाहरण के लिए, मानव शुक्राणु में डीएनए का फैलाव जिसमें मेथिलिकरण की कमी होती है, उत्परिवर्तन के लिए अधिक प्रवण होता है।<ref>{{cite web |first=Lauren |last=Gravtiz |title=डीएनए संशोधन की कमी म्यूटेशन के लिए हॉटस्पॉट बनाती है|date=28 June 2012 |publisher=Simons Foundation Autism Research Initiative |url=http://sfari.org/news-and-opinion/news/2012/lack-of-dna-modification-creates-hotspots-for-mutations |access-date=20 February 2014 |archive-date=5 March 2014 |archive-url=https://web.archive.org/web/20140305134537/http://sfari.org/news-and-opinion/news/2012/lack-of-dna-modification-creates-hotspots-for-mutations |url-status=live }}</ref>




सामान्यतः , एककोशिकीय [[ यूकैर्योसाइटों | यूकैर्योसाइटों]] (और [[ जीवाणु | जीवाणु]] ) में उत्परिवर्तन दर लगभग 0.003 उत्परिवर्तन प्रति जीनोम प्रति 'कोशिका' पीढ़ी है।<ref name="Genetics" />चूंकि , कुछ प्रजातियों, विशेष रूप से जीनस [[Paramecium|पैरामीशियम]] के पक्ष्माभी में असामान्य रूप से कम उत्परिवर्तन दर होती है। उदाहरण के लिए, पैरामीशियम टेट्राउरेलिया की आधार-प्रतिस्थापन उत्परिवर्तन दर ~2 × 10<sup>-11</sup>  है प्रति स्थल प्रति कोशिका विभाजन। यह प्रकृति में अब तक देखी गई सबसे कम उत्परिवर्तन दर है, जो समान जीनोम आकार वाले अन्य यूकेरियोट्स की तुलना में लगभग 75× कम है, और यहां तक ​​कि अधिकांश प्रोकैरियोट्स की तुलना में 10× कम है। पैरामीशियम में कम उत्परिवर्तन दर को इसके प्रतिलेखनीय रूप से मूक जर्म-लाइन [[ कोशिका केंद्रक | कोशिका केंद्रक]] द्वारा समझाया गया है, जो इस परिकल्पना के अनुरूप है कि प्रतिकृति निष्ठा कम जीन अभिव्यक्ति स्तरों पर अधिक होती है।<ref>{{cite journal |vauthors=Sung W, Tucker AE, Doak TG, Choi E, Thomas WK, Lynch M |title=पक्ष्माभी Paramecium tetraurelia में असाधारण जीनोम स्थिरता|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=109 |issue=47 |pages=19339–44 |date=November 2012 |pmid=23129619 |pmc=3511141 |doi=10.1073/pnas.1210663109 |bibcode=2012PNAS..10919339S |doi-access=free}}</ref>


उच्चतम प्रति आधार जोड़ी प्रति पीढ़ी उत्परिवर्तन दर वायरस में पाए जाते हैं, जिनमें या तो आरएनए या डीएनए जीनोम हो सकते हैं। डीएनए वायरस में उत्परिवर्तन दर 10<sup>−6</sup> से 10<sup>−8</sup> उत्परिवर्तन प्रति आधार प्रति पीढ़ी के बीच होती है, और आरएनए वायरस की उत्परिवर्तन दर 10<sup>-3</sup> से 10 तक<sup>−5</sup> प्रति आधार प्रति पीढ़ी के बीच होती है।<ref name="Genetics" />
सामान्यतः , एककोशिकीय [[ यूकैर्योसाइटों |यूकैर्योसाइटों]] (और [[ जीवाणु |जीवाणु]] ) में उत्परिवर्तन दर लगभग 0.003 उत्परिवर्तन प्रति जीनोम प्रति 'कोशिका' पीढ़ी है।<ref name="Genetics" /> चूंकि , कुछ प्रजातियों, विशेष रूप से जीनस [[Paramecium|पैरामीशियम]] के पक्ष्माभी में असामान्य रूप से कम उत्परिवर्तन दर होती है। उदाहरण के लिए, पैरामीशियम टेट्राउरेलिया की आधार-प्रतिस्थापन उत्परिवर्तन दर ~2 × 10<sup>-11</sup> है प्रति स्थल प्रति कोशिका विभाजन। यह प्रकृति में अब तक देखी गई सबसे कम उत्परिवर्तन दर है, जो समान जीनोम आकार वाले अन्य यूकेरियोट्स की तुलना में लगभग 75× कम है, और यहां तक ​​कि अधिकांश प्रोकैरियोट्स की तुलना में 10× कम है। पैरामीशियम में कम उत्परिवर्तन दर को इसके प्रतिलेखनीय रूप से मूक जर्म-लाइन [[ कोशिका केंद्रक |कोशिका केंद्रक]] द्वारा समझाया गया है, जो इस परिकल्पना के अनुरूप है कि प्रतिकृति निष्ठा कम जीन अभिव्यक्ति स्तरों पर अधिक होती है।<ref>{{cite journal |vauthors=Sung W, Tucker AE, Doak TG, Choi E, Thomas WK, Lynch M |title=पक्ष्माभी Paramecium tetraurelia में असाधारण जीनोम स्थिरता|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=109 |issue=47 |pages=19339–44 |date=November 2012 |pmid=23129619 |pmc=3511141 |doi=10.1073/pnas.1210663109 |bibcode=2012PNAS..10919339S |doi-access=free}}</ref>
 
उच्चतम प्रति आधार जोड़ी प्रति पीढ़ी उत्परिवर्तन दर विषाणु में पाए जाते हैं, जिनमें या तो आरएनए या डीएनए जीनोम हो सकते हैं। डीएनए विषाणु में उत्परिवर्तन दर 10<sup>−6</sup> से 10<sup>−8</sup> उत्परिवर्तन प्रति आधार प्रति पीढ़ी के बीच होती है, और आरएनए विषाणु की उत्परिवर्तन दर 10<sup>-3</sup> से 10 तक<sup>−5</sup> प्रति आधार प्रति पीढ़ी के बीच होती है।<ref name="Genetics" />
== उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम ==
== उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम ==


एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम कुछ संदर्भ में प्रासंगिक उत्परिवर्तन के लिए दरों या आवृत्तियों का वितरण है, इस मान्यता के आधार पर कि घटना की दर सभी समान नहीं हैं। किसी भी संदर्भ में, उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम उत्परिवर्तन के विवरण को दर्शाता है और रासायनिक उत्परिवर्तनों की उपस्थिति या उत्परिवर्तक एलील्स या क्षतिग्रस्त डीएनए मरम्मत प्रणालियों के साथ आनुवंशिक पृष्ठभूमि जैसी स्थितियों से प्रभावित होता है। एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम की सबसे मौलिक और विस्तृत अवधारणा सभी व्यक्तिगत उत्परिवर्तनों के लिए दरों का वितरण है जो जीनोम में हो सकती है (उदाहरण के लिए, <ref name=Lopez-Cortegano2022>{{cite journal | author=E. Lopez-Cortegano, R. J. Craig, J. Chebib, E. J. Balogun and P. D. Keightley | year=2022 | title=क्लैमाइडोमोनस रीन्हार्डेटी में डे नोवो स्ट्रक्चरल म्यूटेशन की दरें और स्पेक्ट्रा| journal=Genome Res | volume=33 | issue=1 | pages=45–60 | doi=10.1101/gr.276957.122| pmid=36617667 | pmc=9977147 }}</ref>). इस पूर्ण डे नोवो स्पेक्ट्रम से, उदाहरण के लिए, कोई [[कोडिंग क्षेत्र]] बनाम गैर-कोडिंग डीएनए | गैर-कोडिंग क्षेत्रों में उत्परिवर्तन की सापेक्ष दर की गणना कर सकता है। सामान्यतः उत्परिवर्तन दर के एक स्पेक्ट्रम की अवधारणा को [[संक्रमण (आनुवांशिकी)]] और [[अनुप्रस्थ]] (आंकड़ा) जैसे व्यापक वर्गों को कवर करने के लिए सरलीकृत किया जाता है, अर्थात , जीनोम में विभिन्न उत्परिवर्तनीय रूपांतरण वर्गों में एकत्र किए जाते हैं, और प्रत्येक वर्ग के लिए एक समग्र दर होती है। .
एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम कुछ संदर्भ में प्रासंगिक उत्परिवर्तन के लिए दरों या आवृत्तियों का वितरण है, इस मान्यता के आधार पर कि घटना की दर सभी समान नहीं हैं। किसी भी संदर्भ में, उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम उत्परिवर्तन के विवरण को दर्शाता है और रासायनिक उत्परिवर्तनों की उपस्थिति या उत्परिवर्तक एलील्स या क्षतिग्रस्त डीएनए सुधार प्रणालियों के साथ आनुवंशिक पृष्ठभूमि जैसी स्थितियों से प्रभावित होता है। एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम की सबसे मौलिक और विस्तृत अवधारणा सभी व्यक्तिगत उत्परिवर्तनों के लिए दरों का वितरण है जो जीनोम में हो सकती है (उदाहरण के लिए, <ref name=Lopez-Cortegano2022>{{cite journal | author=E. Lopez-Cortegano, R. J. Craig, J. Chebib, E. J. Balogun and P. D. Keightley | year=2022 | title=क्लैमाइडोमोनस रीन्हार्डेटी में डे नोवो स्ट्रक्चरल म्यूटेशन की दरें और स्पेक्ट्रा| journal=Genome Res | volume=33 | issue=1 | pages=45–60 | doi=10.1101/gr.276957.122| pmid=36617667 | pmc=9977147 }}</ref>). इस पूर्ण डे नोवो स्पेक्ट्रम से, उदाहरण के लिए, कोई [[कोडिंग क्षेत्र]] बनाम गैर-कोडिंग डीएनए गैर-कोडिंग क्षेत्रों में उत्परिवर्तन की सापेक्ष दर की गणना कर सकता है। सामान्यतः उत्परिवर्तन दर के एक स्पेक्ट्रम की अवधारणा को [[संक्रमण (आनुवांशिकी)]] और [[अनुप्रस्थ]] (आंकड़ा) जैसे व्यापक वर्गों को आवरण करने के लिए सरलीकृत किया जाता है, अर्थात , जीनोम में विभिन्न उत्परिवर्तनीय रूपांतरण वर्गों में एकत्र किए जाते हैं, और प्रत्येक वर्ग के लिए एक समग्र दर होती है। .


कई संदर्भों में, एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम को कुछ चयन मानदंड द्वारा पहचाने गए उत्परिवर्तनों की देखी गई आवृत्तियों के रूप में परिभाषित किया जाता है, उदाहरण के लिए, एक विशेष प्रकार के कैंसर के साथ चिकित्सकीय रूप से जुड़े उत्परिवर्तनों का वितरण,<ref name=Cao2013>{{cite journal | author=W. Cao, X. Wang and J. C. Li | year=2013 | title=हान चीनी आबादी में वंशानुगत स्तन कैंसर| journal=J Epidemiol | volume=23 | issue=2 | pages=75–84 | doi=10.2188/jea.je20120043| pmid=23318652 | pmc=3700245 }}</ref> या किसी विशेष संदर्भ में अनुकूली परिवर्तनों का वितरण जैसे कि एंटीबायोटिक प्रतिरोध (जैसे,
कई संदर्भों में, एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम को कुछ चयन मानदंड द्वारा पहचाने गए उत्परिवर्तनों की देखी गई आवृत्तियों के रूप में परिभाषित किया जाता है, उदाहरण के लिए, एक विशेष प्रकार के कैंसर के साथ चिकित्सकीय रूप से जुड़े उत्परिवर्तनों का वितरण,<ref name=Cao2013>{{cite journal | author=W. Cao, X. Wang and J. C. Li | year=2013 | title=हान चीनी आबादी में वंशानुगत स्तन कैंसर| journal=J Epidemiol | volume=23 | issue=2 | pages=75–84 | doi=10.2188/jea.je20120043| pmid=23318652 | pmc=3700245 }}</ref> या किसी विशेष संदर्भ में अनुकूली परिवर्तनों का वितरण जैसे कि एंटीबायोटिक प्रतिरोध (जैसे, <ref name=Levy2004>{{cite journal | author=D. D. Levy, B. Sharma and T. A. Cebula | year=2004 | title=एक उत्परिवर्ती फेनोटाइप के साथ साल्मोनेला एंटरिका सेरोवर एंटरिटिडिस में क्विनोलोन के लिए एकल-न्यूक्लियोटाइड बहुरूपता उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रा और प्रतिरोध| journal=Antimicrob Agents Chemother | volume=48 | issue=7 | pages=2355–63 | doi=10.1128/AAC.48.7.2355-2363.2004| pmid=15215081 | pmc=434170 }}</ref> ).जबकि नए सिरे से उत्परिवर्तन दर का स्पेक्ट्रम केवल उत्परिवर्तन को दर्शाता है, इस प्रकार का स्पेक्ट्रम चयन और आकलन पूर्वाग्रह के प्रभावों को भी प्रतिबिंबित कर सकता है (उदाहरण के लिए, दोनों प्रकार के स्पेक्ट्रम का उपयोग किया जाता है <ref name=Cano2022>{{cite journal | author=A. V. Cano, H. Rozhonova, A. Stoltzfus, D. M. McCandlish and J. L. Payne | year=2022 | title=उत्परिवर्तन पूर्वाग्रह अनुकूली प्रतिस्थापन के स्पेक्ट्रम को आकार देता है| journal=Proc Natl Acad Sci U S A | volume=119 | issue=7 | doi=10.1073/pnas.2119720119| pmid=35145034 | pmc=8851560 | bibcode=2022PNAS..11919720C }}</ref>).
<ref name=Levy2004>{{cite journal | author=D. D. Levy, B. Sharma and T. A. Cebula | year=2004 | title=एक उत्परिवर्ती फेनोटाइप के साथ साल्मोनेला एंटरिका सेरोवर एंटरिटिडिस में क्विनोलोन के लिए एकल-न्यूक्लियोटाइड बहुरूपता उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रा और प्रतिरोध| journal=Antimicrob Agents Chemother | volume=48 | issue=7 | pages=2355–63 | doi=10.1128/AAC.48.7.2355-2363.2004| pmid=15215081 | pmc=434170 }}</ref> ).
जबकि नए सिरे से उत्परिवर्तन दर का स्पेक्ट्रम केवल उत्परिवर्तन को दर्शाता है, इस प्रकार का स्पेक्ट्रम चयन और असेसमेंट बायसेस के प्रभावों को भी प्रतिबिंबित कर सकता है (उदाहरण के लिए, दोनों प्रकार के स्पेक्ट्रम का उपयोग <ref name=Cano2022>{{cite journal | author=A. V. Cano, H. Rozhonova, A. Stoltzfus, D. M. McCandlish and J. L. Payne | year=2022 | title=उत्परिवर्तन पूर्वाग्रह अनुकूली प्रतिस्थापन के स्पेक्ट्रम को आकार देता है| journal=Proc Natl Acad Sci U S A | volume=119 | issue=7 | doi=10.1073/pnas.2119720119| pmid=35145034 | pmc=8851560 | bibcode=2022PNAS..11919720C }}</ref>).


   [[File:TsTvMutation.jpg|thumb|संक्रमण (आनुवंशिकी) एस (अल्फा) और परिवर्तन (बीटा)।]]
   [[File:TsTvMutation.jpg|thumb|संक्रमण (आनुवंशिकी) एस (अल्फा) और परिवर्तन (बीटा)।]]


== विकास ==
== विकास ==
उत्परिवर्तन दर के विकास पर सिद्धांत सम्मिलित तीन प्रमुख बलों की पहचान करता है: उच्च उत्परिवर्तन के साथ अधिक हानिकारक उत्परिवर्तन की पीढ़ी, उच्च उत्परिवर्तन के साथ अधिक लाभप्रद उत्परिवर्तन की पीढ़ी, और उत्परिवर्तन को रोकने के लिए आवश्यक चयापचय निवेश और कम प्रतिकृति दर। प्रत्येक बल के सापेक्ष महत्व के आधार पर विभिन्न निष्कर्ष निकाले जाते हैं। उच्च उत्परिवर्तन दर की निवेश के बीच व्यापार-बंद द्वारा जीवों की इष्टतम उत्परिवर्तन दर निर्धारित की जा सकती है,<ref name=Altenberg>{{cite journal |vauthors=Altenberg L |title=एकाधिक लोकी में उत्परिवर्तन दर के लिए एक विकासवादी कमी सिद्धांत|journal=Bulletin of Mathematical Biology |volume=73 |issue=6 |pages=1227–70 |date=June 2011 |pmid=20737227 |doi=10.1007/s11538-010-9557-9 |arxiv=0909.2454 |s2cid=15027684}}</ref> जैसे हानिकारक उत्परिवर्तन, और उत्परिवर्तन दर को कम करने के लिए प्रणाली को बनाए रखने की चयापचय निवेश (जैसे डीएनए मरम्मत एंजाइमों की अभिव्यक्ति में वृद्धि)।<ref name=Sniegowski>{{cite journal |vauthors=Sniegowski PD, Gerrish PJ, Johnson T, Shaver A |title=The evolution of mutation rates: separating causes from consequences |journal=BioEssays |volume=22 |issue=12 |pages=1057–66 |date=December 2000 |pmid=11084621 |doi=10.1002/1521-1878(200012)22:12<1057::AID-BIES3>3.0.CO;2-W |s2cid=36771934}}</ref> या, जैसा कि बर्नस्टीन एट अल द्वारा समीक्षा की गई है।<ref>{{cite journal |vauthors=Bernstein H, Hopf FA, Michod RE |title=सेक्स के विकास का आणविक आधार|journal=Advances in Genetics |volume=24 |pages=323–70 |year=1987 |pmid=3324702 |doi=10.1016/s0065-2660(08)60012-7 |isbn=9780120176243}}</ref> मरम्मत, अतिरिक्त जीन उत्पादों के लिए कोडिंग और/या धीमी प्रतिकृति के लिए ऊर्जा का उपयोग बढ़ाना)। दूसरे, उच्च उत्परिवर्तन दर लाभकारी उत्परिवर्तन की दर में वृद्धि करती है, और अनुकूलन की इष्टतम दरों को बनाए रखने के लिए विकास उत्परिवर्तन दर को कम करने से रोक सकता है।<ref name=Orr>{{cite journal |vauthors=Orr HA |title=अलैंगिकों में अनुकूलन की दर|journal=Genetics |volume=155 |issue=2 |pages=961–8 |date=June 2000 |doi=10.1093/genetics/155.2.961 |pmid=10835413 |pmc=1461099 |url=http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=10835413 |access-date=2014-11-01 |archive-date=2022-06-25 |archive-url=https://web.archive.org/web/20220625052242/https://academic.oup.com/genetics |url-status=live }}</ref> जैसे, अतिपरिवर्तन कुछ कोशिकाओं को पूरी जनसंख्या को विलुप्त होने से बचाने के लिए बदलती परिस्थितियों के लिए तेजी से अनुकूलन करने में सक्षम बनाता है।<ref>{{Cite journal |last1=Swings |first1=Toon |last2=Van den Bergh |first2=Bram |last3=Wuyts |first3=Sander |last4=Oeyen |first4=Eline |last5=Voordeckers |first5=Karin |last6=Verstrepen |first6=Kevin J |last7=Fauvart |first7=Maarten |last8=Verstraeten |first8=Natalie |last9=Michiels |first9=Jan |date=2017-05-02 |title=उत्परिवर्तन दर की अनुकूली ट्यूनिंग एस्चेरिचिया कोलाई में घातक तनाव के लिए तेजी से प्रतिक्रिया की अनुमति देती है|journal=eLife |language=en |volume=6 |doi=10.7554/eLife.22939 |pmid=28460660 |pmc=5429094 |issn=2050-084X}}</ref> अंत में, उत्परिवर्तन दर को कम करने के अपेक्षाकृत सामान्य लाभों के कारण प्राकृतिक चयन उत्परिवर्तन दर को अनुकूलित करने में विफल हो सकता है, और इस प्रकार देखी गई उत्परिवर्तन दर तटस्थ प्रक्रियाओं का उत्पाद है।<ref name=Lynch_1>{{cite journal |vauthors=Lynch M |title=उत्परिवर्तन दर का विकास|journal=Trends in Genetics |volume=26 |issue=8 |pages=345–52 |date=August 2010 |pmid=20594608 |pmc=2910838 |doi=10.1016/j.tig.2010.05.003}}</ref><ref name=Sung_1>{{cite journal |vauthors=Sung W, Ackerman MS, Miller SF, Doak TG, Lynch M |title=बहाव-बाधा परिकल्पना और उत्परिवर्तन-दर विकास|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=109 |issue=45 |pages=18488–92 |date=November 2012 |pmid=23077252 |doi=10.1073/pnas.1216223109 |pmc=3494944 |bibcode=2012PNAS..10918488S |doi-access=free}}</ref>
उत्परिवर्तन दर के विकास पर सिद्धांत सम्मिलित तीन प्रमुख बलों की पहचान करता है: उच्च उत्परिवर्तन के साथ अधिक हानिकारक उत्परिवर्तन की पीढ़ी, उच्च उत्परिवर्तन के साथ अधिक लाभप्रद उत्परिवर्तन की पीढ़ी, और उत्परिवर्तन को रोकने के लिए आवश्यक चयापचय निवेश और कम प्रतिकृति दर। प्रत्येक बल के सापेक्ष महत्व के आधार पर विभिन्न निष्कर्ष निकाले जाते हैं। उच्च उत्परिवर्तन दर की निवेश के बीच व्यापार-बंद द्वारा जीवों की इष्टतम उत्परिवर्तन दर निर्धारित की जा सकती है,<ref name=Altenberg>{{cite journal |vauthors=Altenberg L |title=एकाधिक लोकी में उत्परिवर्तन दर के लिए एक विकासवादी कमी सिद्धांत|journal=Bulletin of Mathematical Biology |volume=73 |issue=6 |pages=1227–70 |date=June 2011 |pmid=20737227 |doi=10.1007/s11538-010-9557-9 |arxiv=0909.2454 |s2cid=15027684}}</ref> जैसे हानिकारक उत्परिवर्तन, और उत्परिवर्तन दर को कम करने के लिए प्रणाली को बनाए रखने की चयापचय निवेश (जैसे डीएनए सुधार एंजाइमों की अभिव्यक्ति में वृद्धि)।<ref name=Sniegowski>{{cite journal |vauthors=Sniegowski PD, Gerrish PJ, Johnson T, Shaver A |title=The evolution of mutation rates: separating causes from consequences |journal=BioEssays |volume=22 |issue=12 |pages=1057–66 |date=December 2000 |pmid=11084621 |doi=10.1002/1521-1878(200012)22:12<1057::AID-BIES3>3.0.CO;2-W |s2cid=36771934}}</ref> या, जैसा कि बर्नस्टीन एट अल द्वारा समीक्षा की गई है।<ref>{{cite journal |vauthors=Bernstein H, Hopf FA, Michod RE |title=सेक्स के विकास का आणविक आधार|journal=Advances in Genetics |volume=24 |pages=323–70 |year=1987 |pmid=3324702 |doi=10.1016/s0065-2660(08)60012-7 |isbn=9780120176243}}</ref> सुधार के लिए ऊर्जा का उपयोग बढ़ाना, अतिरिक्त जीन उत्पादों के लिए कोडिंग और/या धीमी प्रतिकृति के लिए ऊर्जा का उपयोग बढ़ाना)। दूसरे, उच्च उत्परिवर्तन दर लाभकारी उत्परिवर्तन की दर में वृद्धि करती है, और अनुकूलन की इष्टतम दरों को बनाए रखने के लिए विकास उत्परिवर्तन दर को कम करने से रोक सकता है।<ref name=Orr>{{cite journal |vauthors=Orr HA |title=अलैंगिकों में अनुकूलन की दर|journal=Genetics |volume=155 |issue=2 |pages=961–8 |date=June 2000 |doi=10.1093/genetics/155.2.961 |pmid=10835413 |pmc=1461099 |url=http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=10835413 |access-date=2014-11-01 |archive-date=2022-06-25 |archive-url=https://web.archive.org/web/20220625052242/https://academic.oup.com/genetics |url-status=live }}</ref> जैसे, अतिपरिवर्तन कुछ कोशिकाओं को पूरी जनसंख्या को विलुप्त होने से बचाने के लिए बदलती परिस्थितियों के लिए तेजी से अनुकूलन करने में सक्षम बनाता है।<ref>{{Cite journal |last1=Swings |first1=Toon |last2=Van den Bergh |first2=Bram |last3=Wuyts |first3=Sander |last4=Oeyen |first4=Eline |last5=Voordeckers |first5=Karin |last6=Verstrepen |first6=Kevin J |last7=Fauvart |first7=Maarten |last8=Verstraeten |first8=Natalie |last9=Michiels |first9=Jan |date=2017-05-02 |title=उत्परिवर्तन दर की अनुकूली ट्यूनिंग एस्चेरिचिया कोलाई में घातक तनाव के लिए तेजी से प्रतिक्रिया की अनुमति देती है|journal=eLife |language=en |volume=6 |doi=10.7554/eLife.22939 |pmid=28460660 |pmc=5429094 |issn=2050-084X}}</ref> अंत में, उत्परिवर्तन दर को कम करने के अपेक्षाकृत सामान्य लाभों के कारण प्राकृतिक चयन उत्परिवर्तन दर को अनुकूलित करने में विफल हो सकता है, और इस प्रकार देखी गई उत्परिवर्तन दर तटस्थ प्रक्रियाओं का उत्पाद है।<ref name=Lynch_1>{{cite journal |vauthors=Lynch M |title=उत्परिवर्तन दर का विकास|journal=Trends in Genetics |volume=26 |issue=8 |pages=345–52 |date=August 2010 |pmid=20594608 |pmc=2910838 |doi=10.1016/j.tig.2010.05.003}}</ref><ref name=Sung_1>{{cite journal |vauthors=Sung W, Ackerman MS, Miller SF, Doak TG, Lynch M |title=बहाव-बाधा परिकल्पना और उत्परिवर्तन-दर विकास|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=109 |issue=45 |pages=18488–92 |date=November 2012 |pmid=23077252 |doi=10.1073/pnas.1216223109 |pmc=3494944 |bibcode=2012PNAS..10918488S |doi-access=free}}</ref>


अध्ययनों से पता चला है कि [[ रिबावायरिन ]] के साथ [[पोलियोवायरस]] जैसे [[आरएनए वायरस]] का इलाज इस विचार के अनुरूप परिणाम उत्पन्न करता है कि वायरस अपने जीनोम में जानकारी की अखंडता को बनाए रखने के लिए बहुत बार उत्परिवर्तित होते हैं।
अध्ययनों से पता चला है कि [[ रिबावायरिन |रिबावायरिन]] के साथ [[पोलियोवायरस]] जैसे [[आरएनए वायरस|आरएनए]] विषाणु का उपचार इस विचार के अनुरूप परिणाम उत्पन्न करता है कि विषाणु अपने जीनोम में जानकारी की अखंडता को बनाए रखने के लिए बहुत बार उत्परिवर्तित होते हैं। इसे [[त्रुटि आपदा]] कहा जाता है।
रेफ नाम = क्रेट्टी>{{cite journal |vauthors=Crotty S, Cameron CE, Andino R |title=आरएनए वायरस त्रुटि तबाही: रिबाविरिन का उपयोग करके प्रत्यक्ष आणविक परीक्षण|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |volume=98 |issue=12 |pages=6895–900 |date=June 2001 |pmid=11371613 |pmc=34449 |doi=10.1073/pnas.111085598 |bibcode=2001PNAS...98.6895C |doi-access=free}}</ref> इसे [[त्रुटि आपदा]] कहा जाता है।


3 x 10 की उच्च उत्परिवर्तन दर एचआईवी (ह्यूमन इम्युनोडेफिशिएंसी वायरस)।<sup>-5</sup> प्रति आधार और पीढ़ी, इसके छोटे प्रतिकृति चक्र के साथ मिलकर एक उच्च प्रतिजन परिवर्तनशीलता की ओर जाता है, जिससे यह प्रतिरक्षा प्रणाली से बचने की अनुमति देता है।<ref name="Rambaut_2004">{{cite journal |vauthors=Rambaut A, Posada D, Crandall KA, Holmes EC |title=एचआईवी विकास के कारण और परिणाम|journal=Nature Reviews Genetics |volume=5 |issue=52–61 |pages=52–61 |date=January 2004 |pmid=14708016 |doi=10.1038/nrg1246 |s2cid=5790569 |url=http://tree.bio.ed.ac.uk/downloadPaper.php?id=242 |doi-access=free |access-date=2019-05-28 |archive-date=2019-11-09 |archive-url=https://web.archive.org/web/20191109035127/http://tree.bio.ed.ac.uk/downloadPaper.php?id=242 |url-status=live }}</ref>
3 x 10<sup>-5</sup> प्रति आधार और पीढ़ी की उच्च उत्परिवर्तन दर एचआईवी (मानव प्रतिरक्षी न्यूनता विषाणु) इसके छोटे प्रतिकृति चक्र के साथ मिलकर एक उच्च प्रतिजन परिवर्तनशीलता की ओर ले जाती है जिससे यह प्रतिरक्षा प्रणाली से बचने की अनुमति देती है।<ref name="Rambaut_2004">{{cite journal |vauthors=Rambaut A, Posada D, Crandall KA, Holmes EC |title=एचआईवी विकास के कारण और परिणाम|journal=Nature Reviews Genetics |volume=5 |issue=52–61 |pages=52–61 |date=January 2004 |pmid=14708016 |doi=10.1038/nrg1246 |s2cid=5790569 |url=http://tree.bio.ed.ac.uk/downloadPaper.php?id=242 |doi-access=free |access-date=2019-05-28 |archive-date=2019-11-09 |archive-url=https://web.archive.org/web/20191109035127/http://tree.bio.ed.ac.uk/downloadPaper.php?id=242 |url-status=live }}</ref>


== यह भी देखें ==
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*{{Commons category-inline|Mutation rate}}
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Latest revision as of 11:31, 24 April 2023

मानव जीनोम-व्यापी उत्परिवर्तन दर के वर्तमान में में सूची किए गए अनुमान। मानव जर्मलाइन उत्परिवर्तन दर लगभग 0.5 × 10−9 बेस जोड़ी प्रति वर्ष है।[1]

आनुवंशिकी में, उत्परिवर्तन दर समय के साथ एक जीन या जीव में नए उत्परिवर्तन की आवृत्ति होती है।[2] उत्परिवर्तन दर स्थिर नहीं हैं और एक प्रकार के उत्परिवर्तन तक सीमित नहीं हैं; कई अलग-अलग प्रकार के उत्परिवर्तन होते हैं। उत्परिवर्तन दर उत्परिवर्तन के विशिष्ट वर्गों के लिए दी गई हैं। बिंदु उत्परिवर्तन उत्परिवर्तन का एक वर्ग है जो एक आधार में परिवर्तन होते हैं। अपार्थक उत्तराधिकारी और निरर्थक उत्परिवर्तन बिंदु उत्परिवर्तन के दो उपप्रकार हैं। इस प्रकार के प्रतिस्थापनों की दर को एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम में उप-विभाजित किया जा सकता है जो उत्परिवर्तन दर पर आनुवंशिक संदर्भ के प्रभाव का वर्णन करता है।[3]

इन दरों में से प्रत्येक के लिए समय की कई प्राकृतिक इकाइयाँ हैं, जिनमें दरों को प्रति कोशिका विभाजन प्रति आधार जोड़ी, प्रति जीन प्रति पीढ़ी, या प्रति जीनोम प्रति पीढ़ी उत्परिवर्तन के रूप में वर्णित किया गया है। एक जीव की उत्परिवर्तन दर एक विकसित विशेषता है और पर्यावरण से शक्तिशाली प्रभाव के अतिरिक्त , प्रत्येक जीव के आनुवंशिकी द्वारा दृढ़ता से प्रभावित होती है। ऊपरी और निचली सीमाएँ जिनमें उत्परिवर्तन दर विकसित हो सकती है, चल रही जाँच का विषय है। चूंकि , उत्परिवर्तन दर जीनोम पर भिन्न होती है। डीएनए, आरएनए या एक जीन पर, उत्परिवर्तन दर बदल रही है।

जब मनुष्यों में उत्परिवर्तन दर बढ़ती है तो कुछ स्वास्थ्य कठिन परिस्थिति हो सकती हैं, उदाहरण के लिए, कैंसर और अन्य वंशानुगत रोग। उत्परिवर्तन दर का ज्ञान होना कैंसर और कई वंशानुगत बीमारियों के भविष्य को समझने के लिए महत्वपूर्ण है।[4]

पृष्ठभूमि

एक प्रजाति के अंदर विभिन्न अनुवांशिक रूपों को एलील कहा जाता है, इसलिए एक नया उत्परिवर्तन एक नया एलील बना सकता है। जनसंख्या आनुवंशिकी में, प्रत्येक एलील को एक चयन गुणांक की विशेषता होती है, जो समय के साथ एलील की आवृत्ति में अपेक्षित परिवर्तन को मापता है। चयन गुणांक या तो ऋणात्मक हो सकता है, अपेक्षित कमी के अनुरूप, सकारात्मक, अपेक्षित वृद्धि के अनुरूप, या शून्य, अपेक्षित परिवर्तन के अनुरूप नहीं। नए उत्परिवर्तन के स्वास्थ्य प्रभाव का वितरण जनसंख्या आनुवंशिकी में एक महत्वपूर्ण पैरामीटर है और व्यापक जांच का विषय रहा है।[5] चूंकि इस वितरण के माप अतीत में असंगत रहे हैं, अब सामान्यतः यह सोचा जाता है कि अधिकांश उत्परिवर्तन कम हानिकारक होते हैं, कई जीवों की स्वास्थ्य पर बहुत कम प्रभाव डालते हैं, और कुछ अनुकूल हो सकते हैं।

प्राकृतिक चयन के कारण, प्रतिकूल उत्परिवर्तन सामान्यतः एक जनसंख्या से समाप्त हो जाएंगे, जबकि अनुकूल परिवर्तन सामान्यतः अगली पीढ़ी के लिए रखे जाते हैं, और तटस्थ परिवर्तन उत्परिवर्तन द्वारा बनाए गए दर पर जमा होते हैं। यह प्रक्रिया प्रजनन द्वारा होती है। एक विशेष पीढ़ी में 'सर्वोत्तम योग्य' उच्च संभावना के साथ जीवित रहता है, अपने जीन को अपनी संतानों में पारित करता है। इस संभाव्यता में परिवर्तन का संकेत उत्परिवर्तन को जीवों के लिए लाभकारी, तटस्थ या हानिकारक होने के रूप में परिभाषित करता है।[6]


नाप

एक जीव की उत्परिवर्तन दर को कई विधियों द्वारा मापा जा सकता है।

उत्परिवर्तन दर को मापने का एक विधि उतार-चढ़ाव परीक्षण है, जिसे लुरिया-डेलब्रुक प्रयोग के रूप में भी जाना जाता है। इस प्रयोग ने प्रदर्शित किया कि चयन की उपस्थिति के अतिरिक्त चयन के अभाव में बैक्टीरिया उत्परिवर्तन होता है।[7]

यह उत्परिवर्तन दरों के लिए बहुत महत्वपूर्ण है क्योंकि यह सिद्ध करता है कि प्रयोगात्मक रूप से उत्परिवर्तन एक घटक होने के बिना हो सकता है - वास्तव में, उत्परिवर्तन और चयन पूरी तरह से अलग हैं विकासवादी बल . अलग-अलग डीएनए अनुक्रमों में उत्परिवर्तन (नीचे देखें) के लिए अलग-अलग प्रवृत्ति हो सकती है और यादृच्छिक रूप से नहीं हो सकती है।[8] उत्परिवर्तन का सबसे सामान्य रूप से मापा गया वर्ग प्रतिस्थापन है, क्योंकि डीएनए अनुक्रम डेटा के मानक विश्लेषण के साथ मापना अपेक्षाकृत आसान है। चूंकि प्रतिस्थापन में उत्परिवर्तन की अधिक भिन्न दर होती है (10−8 से 10−9 तक अधिकांश कोशिकीय जीवों के लिए प्रति पीढ़ी) उत्परिवर्तन के अन्य वर्गों की तुलना में, जो अधिकांशतः बहुत अधिक होते हैं (~10−3 उपग्रह डीएनए विस्तार/संकुचन के लिए प्रति पीढ़ी है )[9]

प्रतिस्थापन दर

एक जीव के जीनोम में कई स्थल छोटे स्वास्थ्य प्रभावों के साथ उत्परिवर्तन को स्वीकार कर सकती हैं। इन स्थलो को सामान्यतः तटस्थ स्थल कहा जाता है। सैद्धांतिक रूप से उत्परिवर्तन बिना किसी चयन के जीवों के बीच ठीक उत्परिवर्तन दर पर तय (जनसंख्या आनुवंशिकी) हो जाते हैं। निश्चित पर्यायवाची उत्परिवर्तन, अर्थात पर्यायवाची प्रतिस्थापन, एक जीन के अनुक्रम में परिवर्तन होते हैं जो उस जीन द्वारा उत्पादित प्रोटीन को नहीं बदलते हैं। वे अधिकांशतः उस उत्परिवर्तन दर के अनुमान के रूप में उपयोग किए जाते हैं, इस तथ्य के अतिरिक्त कि कुछ पर्यायवाची उत्परिवर्तनों का स्वास्थ्य प्रभाव होता है। एक उदाहरण के रूप में, एस्चेरिचिया कोली बी की प्रयोगात्मक रूप से विकसित प्रतिकृति रेखाओ के पूरे जीनोम अनुक्रमों से उत्परिवर्तन दर सीधे अनुमान लगाया गया है।[10]

उत्परिवर्तन संचय रेखाएँ

उत्परिवर्तन दर को चिह्नित करने का एक विशेष रूप से श्रम-गहन विधि उत्परिवर्तन संचय रेखा है।

उत्परिवर्तन संचय रेखाओ का उपयोग बेटमैन-मुकाई विधि के साथ उत्परिवर्तन दर को चिह्नित करने और आंतों के बैक्टीरिया (ई. कोलाई), गोल कृमि (सी. एलिगेंस), खमीर (एस. सेरेविसिया), फल से लेकर अच्छी तरह से अध्ययन किए गए प्रायोगिक जीवों के प्रत्यक्ष अनुक्रमण के लिए किया गया है। मक्खियाँ (डी। मेलानोगास्टर), और छोटे अल्पकालिक पौधे (ए। थलियाना) है।[11]


उत्परिवर्तन दर में भिन्नता

Phylogram showing three groups, one of which has strikingly longer branches than the two others
पीढ़ी का समय उत्परिवर्तन दर को प्रभावित करता है: लंबे समय तक रहने वाले लकड़ी के बांस (जनजाति अरुंडिनेरी और बम्बूसी) में तेजी से विकसित होने वाले शाकाहारी बांस (ओलिरिया) की तुलना में कम उत्परिवर्तन दर (फाइलोजेनेटिक पेड़ में छोटी शाखाएं) होती हैं।

उत्परिवर्तन दर प्रजातियों के बीच और यहां तक ​​कि एक ही प्रजाति के जीनोम के विभिन्न क्षेत्रों के बीच भिन्न होती है। न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन की इन विभिन्न दरों को प्रतिस्थापन (निर्धारण (जनसंख्या आनुवंशिकी)) प्रति आधार जोड़ी प्रति पीढ़ी में मापा जाता है। उदाहरण के लिए, इंटरजेनिक, या गैर-कोडिंग में उत्परिवर्तन, डीएनए में उत्परिवर्तन की तुलना में डीएनए में तेजी से जमा होता है जो जीव (जीन अभिव्यक्ति) में सक्रिय रूप से उपयोग में है। यह आवश्यक रूप से उच्च उत्परिवर्तन दर के कारण नहीं है, किंतु शुद्ध चयन के निम्न स्तर के कारण है। एक क्षेत्र जो अनुमानित दर पर उत्परिवर्तित होता है वह आणविक समय के रूप में उपयोग के लिए एक उम्मीदवार है।

यदि एक क्रम में तटस्थ उत्परिवर्तन की दर को स्थिर (घड़ी की तरह) माना जाता है, और यदि प्रजातियों के बीच अधिकांश अंतर अनुकूली के अतिरिक्त तटस्थ हैं, तो दो अलग-अलग प्रजातियों के बीच के अंतरों की संख्या का अनुमान लगाने के लिए उपयोग किया जा सकता है कि कितने समय पहले दो प्रजातियां अलग हो गईं (आण्विक घड़ी देखें)। वास्तव में, पर्यावरणीय तनाव की प्रतिक्रिया में जीव की उत्परिवर्तन दर बदल सकती है। उदाहरण के लिए, यूवी प्रकाश डीएनए को हानि पहुंचाता है, जिसके परिणामस्वरूप डीएनए की सुधार करने के लिए कक्ष द्वारा त्रुटि प्रवण प्रयास हो सकते हैं।

मानव उत्परिवर्तन दर महिला (अंडे की कोशिकाओं) की तुलना में पुरुष रोगाणु रेखा (शुक्राणु) में अधिक है, , किन्तु स्पष्ट दर का अनुमान परिमाण या अधिक के क्रम से भिन्न होता है। इसका कारण यह है कि एक मानव जीनोम प्रति पीढ़ी लगभग 64 नए उत्परिवर्तन जमा करता है क्योंकि प्रत्येक पूर्ण पीढ़ी में युग्मक उत्पन्न करने के लिए कई कोशिका विभाजन सम्मिलित होते हैं।[12] मानव माइटोकॉन्ड्रियल डीएनए में उत्परिवर्तन दर ~ 3 × या ~ 2.7 × 10−5 होने का अनुमान लगाया गया है प्रति आधार प्रति 20 वर्ष पीढ़ी (अनुमान की विधि के आधार पर);[13] इन दरों को ~ 2.5 × 10−8 पर मानव जीनोमिक उत्परिवर्तन की दर से अधिक अधिक माना जाता है प्रति आधार प्रति पीढ़ी।[14] संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण से उपलब्ध डेटा का उपयोग करते हुए, मानव जीनोम उत्परिवर्तन दर समान रूप से ~ 1.1 × 10−8 प्रति स्थल प्रति पीढ़ी होने का अनुमान लगाया गया है [15]

उत्परिवर्तन के अन्य रूपों की दर भी बिंदु उत्परिवर्तन से बहुत भिन्न होती है। एक व्यक्तिगत माइक्रोसैटेलाइट (आनुवांशिकी) ठिकाने में अधिकांशतः 10−4 के क्रम में उत्परिवर्तन दर होती है, चूंकि यह लंबाई के साथ अधिक भिन्न हो सकता है।[16]

डीएनए के कुछ अनुक्रम उत्परिवर्तन के प्रति अधिक संवेदनशील हो सकते हैं। उदाहरण के लिए, मानव शुक्राणु में डीएनए का फैलाव जिसमें मेथिलिकरण की कमी होती है, उत्परिवर्तन के लिए अधिक प्रवण होता है।[17]


सामान्यतः , एककोशिकीय यूकैर्योसाइटों (और जीवाणु ) में उत्परिवर्तन दर लगभग 0.003 उत्परिवर्तन प्रति जीनोम प्रति 'कोशिका' पीढ़ी है।[12] चूंकि , कुछ प्रजातियों, विशेष रूप से जीनस पैरामीशियम के पक्ष्माभी में असामान्य रूप से कम उत्परिवर्तन दर होती है। उदाहरण के लिए, पैरामीशियम टेट्राउरेलिया की आधार-प्रतिस्थापन उत्परिवर्तन दर ~2 × 10-11 है प्रति स्थल प्रति कोशिका विभाजन। यह प्रकृति में अब तक देखी गई सबसे कम उत्परिवर्तन दर है, जो समान जीनोम आकार वाले अन्य यूकेरियोट्स की तुलना में लगभग 75× कम है, और यहां तक ​​कि अधिकांश प्रोकैरियोट्स की तुलना में 10× कम है। पैरामीशियम में कम उत्परिवर्तन दर को इसके प्रतिलेखनीय रूप से मूक जर्म-लाइन कोशिका केंद्रक द्वारा समझाया गया है, जो इस परिकल्पना के अनुरूप है कि प्रतिकृति निष्ठा कम जीन अभिव्यक्ति स्तरों पर अधिक होती है।[18]

उच्चतम प्रति आधार जोड़ी प्रति पीढ़ी उत्परिवर्तन दर विषाणु में पाए जाते हैं, जिनमें या तो आरएनए या डीएनए जीनोम हो सकते हैं। डीएनए विषाणु में उत्परिवर्तन दर 10−6 से 10−8 उत्परिवर्तन प्रति आधार प्रति पीढ़ी के बीच होती है, और आरएनए विषाणु की उत्परिवर्तन दर 10-3 से 10 तक−5 प्रति आधार प्रति पीढ़ी के बीच होती है।[12]

उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम

एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम कुछ संदर्भ में प्रासंगिक उत्परिवर्तन के लिए दरों या आवृत्तियों का वितरण है, इस मान्यता के आधार पर कि घटना की दर सभी समान नहीं हैं। किसी भी संदर्भ में, उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम उत्परिवर्तन के विवरण को दर्शाता है और रासायनिक उत्परिवर्तनों की उपस्थिति या उत्परिवर्तक एलील्स या क्षतिग्रस्त डीएनए सुधार प्रणालियों के साथ आनुवंशिक पृष्ठभूमि जैसी स्थितियों से प्रभावित होता है। एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम की सबसे मौलिक और विस्तृत अवधारणा सभी व्यक्तिगत उत्परिवर्तनों के लिए दरों का वितरण है जो जीनोम में हो सकती है (उदाहरण के लिए, [19]). इस पूर्ण डे नोवो स्पेक्ट्रम से, उदाहरण के लिए, कोई कोडिंग क्षेत्र बनाम गैर-कोडिंग डीएनए गैर-कोडिंग क्षेत्रों में उत्परिवर्तन की सापेक्ष दर की गणना कर सकता है। सामान्यतः उत्परिवर्तन दर के एक स्पेक्ट्रम की अवधारणा को संक्रमण (आनुवांशिकी) और अनुप्रस्थ (आंकड़ा) जैसे व्यापक वर्गों को आवरण करने के लिए सरलीकृत किया जाता है, अर्थात , जीनोम में विभिन्न उत्परिवर्तनीय रूपांतरण वर्गों में एकत्र किए जाते हैं, और प्रत्येक वर्ग के लिए एक समग्र दर होती है। .

कई संदर्भों में, एक उत्परिवर्तन स्पेक्ट्रम को कुछ चयन मानदंड द्वारा पहचाने गए उत्परिवर्तनों की देखी गई आवृत्तियों के रूप में परिभाषित किया जाता है, उदाहरण के लिए, एक विशेष प्रकार के कैंसर के साथ चिकित्सकीय रूप से जुड़े उत्परिवर्तनों का वितरण,[20] या किसी विशेष संदर्भ में अनुकूली परिवर्तनों का वितरण जैसे कि एंटीबायोटिक प्रतिरोध (जैसे, [21] ).जबकि नए सिरे से उत्परिवर्तन दर का स्पेक्ट्रम केवल उत्परिवर्तन को दर्शाता है, इस प्रकार का स्पेक्ट्रम चयन और आकलन पूर्वाग्रह के प्रभावों को भी प्रतिबिंबित कर सकता है (उदाहरण के लिए, दोनों प्रकार के स्पेक्ट्रम का उपयोग किया जाता है [22]).

संक्रमण (आनुवंशिकी) एस (अल्फा) और परिवर्तन (बीटा)।

विकास

उत्परिवर्तन दर के विकास पर सिद्धांत सम्मिलित तीन प्रमुख बलों की पहचान करता है: उच्च उत्परिवर्तन के साथ अधिक हानिकारक उत्परिवर्तन की पीढ़ी, उच्च उत्परिवर्तन के साथ अधिक लाभप्रद उत्परिवर्तन की पीढ़ी, और उत्परिवर्तन को रोकने के लिए आवश्यक चयापचय निवेश और कम प्रतिकृति दर। प्रत्येक बल के सापेक्ष महत्व के आधार पर विभिन्न निष्कर्ष निकाले जाते हैं। उच्च उत्परिवर्तन दर की निवेश के बीच व्यापार-बंद द्वारा जीवों की इष्टतम उत्परिवर्तन दर निर्धारित की जा सकती है,[23] जैसे हानिकारक उत्परिवर्तन, और उत्परिवर्तन दर को कम करने के लिए प्रणाली को बनाए रखने की चयापचय निवेश (जैसे डीएनए सुधार एंजाइमों की अभिव्यक्ति में वृद्धि)।[24] या, जैसा कि बर्नस्टीन एट अल द्वारा समीक्षा की गई है।[25] सुधार के लिए ऊर्जा का उपयोग बढ़ाना, अतिरिक्त जीन उत्पादों के लिए कोडिंग और/या धीमी प्रतिकृति के लिए ऊर्जा का उपयोग बढ़ाना)। दूसरे, उच्च उत्परिवर्तन दर लाभकारी उत्परिवर्तन की दर में वृद्धि करती है, और अनुकूलन की इष्टतम दरों को बनाए रखने के लिए विकास उत्परिवर्तन दर को कम करने से रोक सकता है।[26] जैसे, अतिपरिवर्तन कुछ कोशिकाओं को पूरी जनसंख्या को विलुप्त होने से बचाने के लिए बदलती परिस्थितियों के लिए तेजी से अनुकूलन करने में सक्षम बनाता है।[27] अंत में, उत्परिवर्तन दर को कम करने के अपेक्षाकृत सामान्य लाभों के कारण प्राकृतिक चयन उत्परिवर्तन दर को अनुकूलित करने में विफल हो सकता है, और इस प्रकार देखी गई उत्परिवर्तन दर तटस्थ प्रक्रियाओं का उत्पाद है।[28][29]

अध्ययनों से पता चला है कि रिबावायरिन के साथ पोलियोवायरस जैसे आरएनए विषाणु का उपचार इस विचार के अनुरूप परिणाम उत्पन्न करता है कि विषाणु अपने जीनोम में जानकारी की अखंडता को बनाए रखने के लिए बहुत बार उत्परिवर्तित होते हैं। इसे त्रुटि आपदा कहा जाता है।

3 x 10-5 प्रति आधार और पीढ़ी की उच्च उत्परिवर्तन दर एचआईवी (मानव प्रतिरक्षी न्यूनता विषाणु) इसके छोटे प्रतिकृति चक्र के साथ मिलकर एक उच्च प्रतिजन परिवर्तनशीलता की ओर ले जाती है जिससे यह प्रतिरक्षा प्रणाली से बचने की अनुमति देती है।[30]

यह भी देखें

संदर्भ

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बाहरी संबंध

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