सिनर्जिस्टोटा: Difference between revisions
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'''सिनर्जिस्टोटा''' अवायवीय जीव बैक्टीरिया का एक समूह है जो ग्राम-नकारात्मक अभिरंजना प्रदर्शित करता हैं और इसमें रॉड / वाइब्रियोइड कोशिका का आकार होता है।<ref>Hugenholtz, P., Hooper, S.D., and Kyrpides, N.C. (2009). Focus: Synergistetes. Environ. Microbiol. 11, 1327–1329.</ref><ref name="Jumas">{{cite journal | last1 = Jumas-Bilak | first1 = E. | last2 = Roudiere | first2 = L. | last3 = Marchandin | first3 = H. | year = 2009 | title = 'सिनर्जिस्टेट' फाइल का विवरण। नवम्बर और फ़ाइलम 'डिफ़रीबैक्टीरेस' और सिंट्रोफ़ोमोनाडेसी परिवार, फ़ाइलम 'फ़र्मिक्यूट्स' का संशोधित विवरण| journal = Int. J. Syst. Evol. Microbiol. | volume = 59 | pages = 1028–1035 | doi=10.1099/ijs.0.006718-0| doi-access = free }}</ref> यद्यपि की सिनर्जिस्टोटा में डाइडर्म कोशिका आवरण होता है,<ref name= gupta >Gupta, R. S. (2011) Origin of Diderm (Gram-negative) Bacteria: Antibiotic Selection Pressure Rather than Endosymbiosis Likely led to the Evolution of Bacterial Cells with Two Membranes. Antonie van Leeuwenhoek. 100: 171–182</ref><ref name= "Sutcliffe" >{{cite journal | last1 = Sutcliffe | first1 = I.C. | year = 2010 | title = बैक्टीरियल सेल एनवेलप आर्किटेक्चर पर एक फाइलम स्तर का परिप्रेक्ष्य| journal = Trends Microbiol | volume = 18 | pages = 464–470 | doi=10.1016/j.tim.2010.06.005 | pmid=20637628}}</ref> लिपोपॉलेसेकेराइड जैवसंश्लेषण में सम्मलित विभिन्न प्रोटीनों के जीन अभी तक सिनर्जिस्टोटा में नहीं पाए गए हैं, यह दर्शाता है कि उनके पास एटिपिकल बाहरी कोशिका आवरण हो सकता है।<ref name= gupta /><ref name= "Sutcliffe" />सिनर्जिस्टोटा जानवरों के गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल ट्रैक्ट्स, मिट्टी, तेल कुओं और अपशिष्ट जल उपचार संयंत्रों के साथ ही अधिकांश अवायवीय वातावरण में निवास करते हैं और वे मानव रोगों जैसे अल्सर, फोड़े और पेरियोडोंटल रोग के क्षेत्रों में भी उपस्थित होते हैं।<ref>{{cite journal | last1 = Jumas-Bilak | first1 = E. | last2 = Carlier | first2 = J.P. | last3 = Jean-Pierre | first3 = H. | last4 = Citron | first4 = D. | last5 = Bernard | first5 = K. | last6 = Damay | first6 = A. | last7 = Gay | first7 = B. | last8 = Teyssier | first8 = C. | last9 = Campos | first9 = J. | last10 = Marchandin | first10 = H. | year = 2007 | title = '' जोंक्वेटेला एंथ्रोपी '' जीन। नव., सपा. नव., उम्मीदवार संघ 'सिनर्जिस्टेटेस' का पहला सदस्य जो मनुष्य से पृथक है| journal = Int. J. Syst. Evol. Microbiol. | volume = 57 | pages = 2743–2748 | doi=10.1099/ijs.0.65213-0 | pmid=18048718| doi-access = free }}</ref><ref name="Vartoukian">Vartoukian, S.R., Palmer, R.M., and Wade, W.G. (2007). The division "Synergistes". Anaerobe. 13, 99–106.</ref> बीमारी से संबंधित स्थलों पर उनकी उपस्थिति के कारण, सिनर्जिस्टोटा को अवसरवादी रोगजनक होने का सुझाव दिया जाता है, लेकिन वे नाभि के [[माइक्रोबायोम]] और साधारणतया [[योनि वनस्पति]]यों में भी पाए जा सकते हैं।<ref name="Vartoukian" /><ref>Marchandin, H., Damay, A., Roudiere, L., Teyssier, C., Zorgniotti, I., Dechaud, H., Jean-Pierre, H., and Jumas-Bilak, E. (2010). Phylogeny, diversity and host specialization in the phylum Synergistetes with emphasis on strains and clones of human origin. Res. Microbiol. 161, 91–100.</ref> इस समुदाय के अंतर्गत की प्रजातियों को पेरियोडोंटल बीमारी,<ref>{{cite journal |last=Horz |first=H.P. |author2=D.M. Citron |author3=Y.A. Warren |author4=E.J. Goldstein |author5=G. Conrads |date=August 2006 |title=मानव मूल के सिनर्जिस्ट समूह जीव|journal=Journal of Clinical Microbiology |volume=44 |issue=8 |pages=2914–2920 |pmid=16891512 |doi=10.1128/JCM.00568-06 |pmc=1594628 }}</ref> जठरांत्र संबंधी संक्रमण और कोमल ऊतक संक्रमण के रूप में भी जाना जाता हैं।<ref name=Vartoukian/> इस समुदाय की अन्य प्रजातियों को अवायवीय पाचको में [[बायोगैस]] के उत्पादन के लिए कीचड़ के क्षरण में महत्वपूर्ण योगदानकर्ता के रूप में पहचाना गया है और हाइड्रोजन गैस के उत्पादन के माध्यम से नवीकरणीय ऊर्जा उत्पादन में उपयोग के लिए संभावित पदान्वेषी हैं।<ref>Riviere, D., Desvignes, V., Pelletier, E., Chaussonnerie, S., Guermazi, S., Weissenbach, J., Li, T., Camacho, P., and Sghir, A. (2009). Towards the definition of a core of microorganisms involved in anaerobic digestion of sludge. ISME. J. 3, 700–714.</ref> सभी ज्ञात सिनर्जिस्टोटा प्रजातियाँ और जेनेरा वर्तमान में एकल वर्ग (सिनर्जिस्टिया), क्रम (सिनर्जिस्टियालेस) और समूह (सिनर्जिस्टेसिया) का हिस्सा हैं।<ref name="Jumas" /> | |||
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सिनर्जिस्टोटा अवायवीय जीव बैक्टीरिया का एक समूह है जो ग्राम-नकारात्मक अभिरंजना प्रदर्शित करता हैं और इसमें रॉड / वाइब्रियोइड कोशिका का आकार होता है।[1][2] यद्यपि की सिनर्जिस्टोटा में डाइडर्म कोशिका आवरण होता है,[3][4] लिपोपॉलेसेकेराइड जैवसंश्लेषण में सम्मलित विभिन्न प्रोटीनों के जीन अभी तक सिनर्जिस्टोटा में नहीं पाए गए हैं, यह दर्शाता है कि उनके पास एटिपिकल बाहरी कोशिका आवरण हो सकता है।[3][4]सिनर्जिस्टोटा जानवरों के गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल ट्रैक्ट्स, मिट्टी, तेल कुओं और अपशिष्ट जल उपचार संयंत्रों के साथ ही अधिकांश अवायवीय वातावरण में निवास करते हैं और वे मानव रोगों जैसे अल्सर, फोड़े और पेरियोडोंटल रोग के क्षेत्रों में भी उपस्थित होते हैं।[5][6] बीमारी से संबंधित स्थलों पर उनकी उपस्थिति के कारण, सिनर्जिस्टोटा को अवसरवादी रोगजनक होने का सुझाव दिया जाता है, लेकिन वे नाभि के माइक्रोबायोम और साधारणतया योनि वनस्पतियों में भी पाए जा सकते हैं।[6][7] इस समुदाय के अंतर्गत की प्रजातियों को पेरियोडोंटल बीमारी,[8] जठरांत्र संबंधी संक्रमण और कोमल ऊतक संक्रमण के रूप में भी जाना जाता हैं।[6] इस समुदाय की अन्य प्रजातियों को अवायवीय पाचको में बायोगैस के उत्पादन के लिए कीचड़ के क्षरण में महत्वपूर्ण योगदानकर्ता के रूप में पहचाना गया है और हाइड्रोजन गैस के उत्पादन के माध्यम से नवीकरणीय ऊर्जा उत्पादन में उपयोग के लिए संभावित पदान्वेषी हैं।[9] सभी ज्ञात सिनर्जिस्टोटा प्रजातियाँ और जेनेरा वर्तमान में एकल वर्ग (सिनर्जिस्टिया), क्रम (सिनर्जिस्टियालेस) और समूह (सिनर्जिस्टेसिया) का हिस्सा हैं।[2]
तुलनात्मक जीनोमिक्स और आणविक हस्ताक्षर
अनुक्रमित सिनर्जिस्टोटा जीनोम के हाल के तुलनात्मक विश्लेषणों ने प्रोटीन अनुक्रमों में बड़ी संख्या में संरक्षित हस्ताक्षर इंडल्स (सीएसआई) की पहचान की है जो या तो सभी अनुक्रमित सिनर्जिस्टोटा प्रजातियों या उनके कुछ उप-वर्गों के लिए विशिष्ट हैं जो कि फाइलोजेनेटिक पेड़ों में देखे गए हैं।[10] जिन CSI की पहचान की गई, उनमें से 32 व्यापक रूप से वितरित प्रोटीन जैसे RpoB, RpoC, UvrD, GyrA, PolA, PolC, MraW, NadD, PyrE, RpsA, RpsH, FtsA, RadA, आदि में बड़े >300 aa इन्सर्ट सहित RpoC प्रोटीन में, विभिन्न सिनर्जिस्टोटा प्रजातियों में मौजूद हैं, लेकिन पृथक जीवाणुओं को छोड़कर, ये CSI अन्य सभी जीवों के प्रोटीन समरूपों में नहीं पाए जाते हैं। ये सीएसआई अन्य सभी जीवाणुओं से सिनर्जिस्टोटा प्रजातियों को अलग करने के लिए उपन्यास आणविक मार्कर प्रदान करते हैं।[10]RpoB में 13 aa सहित महत्वपूर्ण प्रोटीनों में सात अन्य CSI, जोन्क्वेटेला, पिरामिडोबैक्टर और डेथियोसल्फ़ोविब्रियो प्रजातियों में विशिष्ट रूप से मौजूद पाए गए, जो इन जीवाणुओं के बीच घनिष्ठ और विशिष्ट संबंध का संकेत देते हैं, जो कि फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ों द्वारा भी दृढ़ता से समर्थित है। पंद्रह अतिरिक्त सीएसआई जो केवल जोंकेटेला और पिरामिडोबैक्टर में मौजूद थे, इन दो प्रजातियों के बीच घनिष्ठ संबंध का संकेत देते हैं।[10]अंत में, अमीनोमोनस और थर्मोनाएरोविब्रियो प्रजातियों के बीच घनिष्ठ संबंध को भी 9 चिन्हित सीएसआई द्वारा समर्थित किया गया है। पहचान किए गए आणविक मार्कर, फ़िलम सिनर्जिस्टोटा से प्रजातियों के विभाजन के लिए विश्वसनीय साधन प्रदान करते हैं जैसे परिवारों और आदेशों जैसे मध्यवर्ती टैक्सोनोमिक रैंक।[10]
फाइलोजेनी
| 16S rRNA based LTP_12_2021[11][12][13] | GTDB 07-RS207 by Genome Taxonomy Database[14][15][16] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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टैक्सोनॉमी
वर्तमान में स्वीकृत टैक्सोनॉमी स्टैंडिंग इन नोमेनक्लेचर (LSPN) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची पर आधारित है।[17] और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र (एनसीबीआई)।[18]
- संघ सिनर्जिस्टोटा Jumas-Bilak et al. 2021
- क्लास सहयोग Jumas-Bilak et al. 2009
- ऑर्डर सिनर्जिस्टेल्स Jumas-Bilak et al. 2009
- परिवार सिनर्जिस्टेसी Jumas-Bilak et al. 2009 [क्लोस्ट्रीडियल्स फैमिली XV; थर्मोसिनर्जिस्टेसी Yang et al. 2021]
- जीनस एसिटोमाइक्रोबियम Soutschek et al. 1985 [[[अवायवीय]] Rees et al. 1997]
- प्रजाति एसिटोमाइक्रोबियम फ्लेविडम|ए. फ्लेविडम Soutschek et al. 1985
- प्रजातियां एनारोबेकुलम हाइड्रोजनीफॉर्मन्स|ए. hydroniformans (Maune & Tanner 2012) Ben Hania et al. 2016
- प्रजाति एसीटोमाइक्रोबियम मोबाइल|ए. गतिमान (Menes & Muxi 2002) Ben Hania et al. 2016
- प्रजाति एसिटोमाइक्रोबियम थर्मोटेरेनम|ए. थर्मोटेरेनम (Rees et al. 1997) Ben Hania et al. 2016
- जीनस एमिनिफिलस Díaz et al. 2007
- प्रजाति एमिनिफिलस सर्कमस्क्रिप्टस|ए. घिरा Díaz et al. 2007
- जीनस अमिनिविब्रियो Honda et al. 2013
- प्रजाति अमिनिवब्रियो प्यूरुवतीफिलस|ए. पाइरुवतिफिलस Honda et al. 2013
- जीनस अमीनोबैक्टीरियम Baena et al. 1999
- प्रजाति अमीनोबैक्टीरियम कोलम्बिएन्स|ए. कोलंबियन Baena et al. 1999 (टाइप एसपी।)
- प्रजाति अमीनोबैक्टीरियम मोबाइल|ए। गतिमान Baena et al. 2000
- प्रजातियां अमीनोबैक्टीरियम टनैरियम|ए। टनारियम Hamdi et al. 2015
- जीनस अमीनोमोनस Baena et al. 1999
- प्रजाति अमीनोमोनस पॉसीवोरेंस|ए. pocivorans Baena et al. 1999
- जीनस कैंडिडा बूगी Gilroy et al. 2021
- प्रजाति सीए। कैकोकोला फेसिगैलिनेरम|सी. fecigallinarum Gilroy et al. 2021
- प्रजाति सीए। कैकोकोला फ़ेसिपुलोरम | सी। बच्चों की Gilroy et al. 2021
- जीनस क्लोएसिबैसिलस Ganesan et al. 2008 emend. Looft et al. 2013
- प्रजाति क्लोएसिबैसिलस इव्रेन्सिस|सी. eryensis Ganesan et al. 2008
- प्रजाति क्लोएसिबैसिलस पोरकोरम|सी. सूअरों का Looft et al. 2013
- जीनस Dethiosulfovibrio Magot et al. 1997
- प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो सालसुगिनिस|डी. salsuginis Díaz-Cárdenas et al. 2010
- प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो पेप्टिडोवोरांस|डी. peptidovorans Magot et al. 1997 (टाइप एसपी।)
- प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो एसिडएमिनोवोरांस|डी. acidaminovorans Surkov et al. 2001
- प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो मेरिनस|डी. मारीनस Surkov et al. 2001
- प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो रसेंसिस|डी. रूसी Surkov et al. 2001
- जीनस फ्रेटीबैक्टीरियम Vartoukian et al. 2013
- प्रजातियां फ्रेटिबैक्टीरियम फास्टिडिओसम | एफ। दुराराध्य Vartoukian et al. 2013
- जीनस टनटनाहट Jumas-Bilak et al. 2007
- स्पीकीज गोनकीटेला ह्यूमन|X. मनुष्य Jumas-Bilak et al. 2007
- जीनस लैक्टिविब्रियो Qiu et al. 2014
- प्रजाति लैक्टिविब्रियो एल्कोहलिकस|एल. मादक Qiu et al. 2014
- जीनस पकाएला Ndongo et al. 2017
- प्रजाति पकाएला मसिलिएन्सिस|पी. मासिलिएंसिस Ndongo et al. 2017
- जीनस पिरामिडोबैक्टर Downes et al. 2009
- प्रजाति पिरामिडोबैक्टर पिस्कोलेंस|पी. piscolen Downes et al. 2009
- प्रजाति पिरामिडोबैक्टर पोर्सी|पी. पोर्सी Wylensek et al. 2021
- जीनस रेरिमाइक्रोबियम Jumas-Bilak et al. 2015
- प्रजाति रारिमाइक्रोबियम होमिनिस|आर. आदमी की Jumas-Bilak et al. 2015
- जीनस योगदानकर्ता Allison et al. 1993
- प्रजाति सिनर्जिस्ट्स जोन्सी|एस. jonesii Allison et al. 1993
- जीनस कैंडिडेट तमेला Hongoh et al. 2007
- प्रजाति सीए। तममेला कैड्यूसियस|टी. caduceus Hongoh et al. 2007
- जीनस थर्मोनेरोविब्रियो Baena et al. 1999 emend. Palaniappan et al. 2013
- प्रजातियां थर्मोनेरोविब्रियो एसिडएमिनोवोरांस|टी. acidaminovorans (Guangsheng et al. 1997) Baena et al. 1999 [सेलेनोमोनास एसिडमिनोवोरेंस Guangsheng et al. 1997] (टाइप एसपी।)
- प्रजाति थर्मोनेरोविब्रियो वेलॉक्स|टी. वेलॉक्स Zavarzina et al. 2000
- जीनस थर्मोक्यूल्स Yang et al. 2021
- प्रजाति थर्मोसिनर्जिस्ट्स पायरुवतीवोरांस|टी. pyruvativorans Yang et al. 2021
- जीनस थर्मोविर्गा Dahle and Birkeland 2006
- प्रजाति थर्मोविर्गा लियनी|टी. lienii Dahle and Birkeland 2006
- जीनस एसिटोमाइक्रोबियम Soutschek et al. 1985 [[[अवायवीय]] Rees et al. 1997]
- परिवार सिनर्जिस्टेसी Jumas-Bilak et al. 2009 [क्लोस्ट्रीडियल्स फैमिली XV; थर्मोसिनर्जिस्टेसी Yang et al. 2021]
- ऑर्डर सिनर्जिस्टेल्स Jumas-Bilak et al. 2009
- क्लास सहयोग Jumas-Bilak et al. 2009
संदर्भ
- ↑ Hugenholtz, P., Hooper, S.D., and Kyrpides, N.C. (2009). Focus: Synergistetes. Environ. Microbiol. 11, 1327–1329.
- ↑ 2.0 2.1 Jumas-Bilak, E.; Roudiere, L.; Marchandin, H. (2009). "'सिनर्जिस्टेट' फाइल का विवरण। नवम्बर और फ़ाइलम 'डिफ़रीबैक्टीरेस' और सिंट्रोफ़ोमोनाडेसी परिवार, फ़ाइलम 'फ़र्मिक्यूट्स' का संशोधित विवरण". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59: 1028–1035. doi:10.1099/ijs.0.006718-0.
- ↑ 3.0 3.1 Gupta, R. S. (2011) Origin of Diderm (Gram-negative) Bacteria: Antibiotic Selection Pressure Rather than Endosymbiosis Likely led to the Evolution of Bacterial Cells with Two Membranes. Antonie van Leeuwenhoek. 100: 171–182
- ↑ 4.0 4.1 Sutcliffe, I.C. (2010). "बैक्टीरियल सेल एनवेलप आर्किटेक्चर पर एक फाइलम स्तर का परिप्रेक्ष्य". Trends Microbiol. 18: 464–470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.
- ↑ Jumas-Bilak, E.; Carlier, J.P.; Jean-Pierre, H.; Citron, D.; Bernard, K.; Damay, A.; Gay, B.; Teyssier, C.; Campos, J.; Marchandin, H. (2007). " जोंक्वेटेला एंथ्रोपी जीन। नव., सपा. नव., उम्मीदवार संघ 'सिनर्जिस्टेटेस' का पहला सदस्य जो मनुष्य से पृथक है". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57: 2743–2748. doi:10.1099/ijs.0.65213-0. PMID 18048718.
- ↑ 6.0 6.1 6.2 Vartoukian, S.R., Palmer, R.M., and Wade, W.G. (2007). The division "Synergistes". Anaerobe. 13, 99–106.
- ↑ Marchandin, H., Damay, A., Roudiere, L., Teyssier, C., Zorgniotti, I., Dechaud, H., Jean-Pierre, H., and Jumas-Bilak, E. (2010). Phylogeny, diversity and host specialization in the phylum Synergistetes with emphasis on strains and clones of human origin. Res. Microbiol. 161, 91–100.
- ↑ Horz, H.P.; D.M. Citron; Y.A. Warren; E.J. Goldstein; G. Conrads (August 2006). "मानव मूल के सिनर्जिस्ट समूह जीव". Journal of Clinical Microbiology. 44 (8): 2914–2920. doi:10.1128/JCM.00568-06. PMC 1594628. PMID 16891512.
- ↑ Riviere, D., Desvignes, V., Pelletier, E., Chaussonnerie, S., Guermazi, S., Weissenbach, J., Li, T., Camacho, P., and Sghir, A. (2009). Towards the definition of a core of microorganisms involved in anaerobic digestion of sludge. ISME. J. 3, 700–714.
- ↑ 10.0 10.1 10.2 10.3 Bhandari, V.; Gupta, R. S. (2012). "फाइलम सिनर्जिस्टेट्स और इसके कुछ उपवर्गों के लिए आणविक हस्ताक्षर". Antonie van Leeuwenhoek. 102: 517–40. doi:10.1007/s10482-012-9759-2. PMID 22711299.
- ↑ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
- ↑ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
- ↑ "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2021.
- ↑ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
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- ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
- ↑ J.P. Euzéby. "सहयोग". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2016-03-20.
- ↑ Sayers; et al. "सहयोग". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-03-20.
Lua error in package.lua at line 80: module 'Module:Taxonbar/conf' not found.
