जीन रिडंडेंसी: Difference between revisions

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जीन अतिरेक जीव के जीनोम में अनेक जीनों का अस्तित्व है जो वही कार्य करते हैं। जिसने जीन अतिरेक जीन द्विगुणन के परिणामस्वरूप हो सकता है।^[1] इस तरह की द्विगुणन की घटनाएँ पैरालॉग्स जीन के अनेक समूहों के लिए ज़िम्मेदार होती हैं।^[1] जब ऐसे समूह में व्यक्तिगत जीन उत्परिवर्तन या लक्षित जीन नॉकआउट द्वारा बाधित होता है, तो जीन अतिरेक के परिणामस्वरूप फेनोटाइप पर बहुत कम प्रभाव हो सकता है, जबकि केवल प्रतिलिपि वाले जीन के नॉकआउट के लिए प्रभाव बड़ा होता है।^[2] जीन नॉकआउट कुछ अध्ययनों में उपयोग की जाने वाली विधि है जिसका उद्देश्य रखरखाव और फिटनेस प्रभावों के कार्यात्मक ओवरलैप को चिह्नित करना है।^[3]

मेंटेनेंस के मौलिक मॉडल का प्रस्ताव है कि फ़ंक्शन उत्परिवर्तन के हानिकारक हानि की भरपाई करने की उनकी क्षमता के कारण डुप्लिकेट जीन को जीनोम में विभिन्न सीमा तक संरक्षित किया जा सकता है।^[4]^[5] यह मौलिक मॉडल सकारात्मक चयन के संभावित प्रभाव को ध्यान में नहीं रखते हैं। इन मौलिक मॉडलों से परे, शोधकर्ता उन तंत्रों का पता लगाना जारी रखते हैं जिनके द्वारा अनावश्यक जीन बनाए रखे जाते हैं और विकसित होते हैं।^[6]^[7]^[8] जीन अतिरेक को नवीन जीन उत्पत्ति के स्रोत के रूप में लंबे समय से सराहा गया है;^[8] अर्थात्, जब डुप्लिकेट पर चयनात्मक दबाव उपस्तिथ होता है तो नए जीन उत्पन्न हो सकते हैं, जबकि मूल जीन को मूल कार्य करने के लिए बनाए रखा जाता है, जैसा कि नए मॉडल द्वारा प्रस्तावित है^[4].

चित्रा 1. जीन द्विगुणन के सामान्य तंत्र।

निरर्थक जीन की उत्पत्ति और विकास

जीन अतिरेक अधिकांशतः जीन द्विगुणन के परिणामस्वरूप होता है।^[9] जीन द्विगुणन के तीन अधिक सामान्य तंत्र रेट्रोपोसॉन, असमान क्रोमोसोमल क्रॉसओवर और गैर-होमोलॉगस खंडीय द्विगुणन हैं। रिट्रोपोजिशन तब होता है जब किसी जीन के एमआरएनए प्रतिलेख को डीएनए में रिवर्स ट्रांसक्रिप्ट किया जाता है और भिन्न स्थान पर जीनोम में डाला जाता है। असमान क्रॉसिंग ओवर के समय, होमोलॉजी (जीवविज्ञान) गुणसूत्र अपने डीएनए के असमान हिस्सों का आदान-प्रदान करते हैं। इससे गुणसूत्र के जीन को दूसरे गुणसूत्र में स्थानांतरित किया जा सकता है, जिससे गुणसूत्र पर दो समान जीन रह जाते हैं और दूसरे गुणसूत्र पर जीन की कोई प्रति नहीं रह जाती है। गैर-समरूप दोहराव, प्रतिकृति त्रुटियों के परिणामस्वरूप होता है जो रुचि के जीन को नई स्थिति में स्थानांतरित कर देता है। फिर अग्रानुक्रम द्विगुणन होता है, जिससे ही जीन की दो प्रतियों के साथ गुणसूत्र बनता है। चित्र 1 इन तीन तंत्रों का दृश्य प्रदान करता है।^[10] जब जीन को जीनोम के अंदर दोहराया जाता है, तो दो प्रतियां प्रारंभ में कार्यात्मक रूप से अनावश्यक होती हैं। इन निरर्थक जीनों को पैरालॉग्स माना जाता है क्योंकि वे समय के साथ परिवर्तन संग्रहित करते हैं, जब तक कि वे कार्यात्मक रूप से भिन्न नहीं हो जाते।^[11]

अधिकांश शोध इस प्रश्न पर केंद्रित है कि अनावश्यक जीन कैसे बने रहते हैं।^[12] निरर्थक जीनों के संरक्षण को समझाने का प्रयास करने के लिए तीन मॉडल सामने आए हैं: जो कि कुछ इस प्रकार है अनुकूली विकिरण, विचलन, और अनुकूली संघर्ष से बचना आदि। विशेष रूप से, द्विगुणन की घटना के पश्चात प्रतिधारण द्विगुणन की घटना के प्रकार और जीन वर्ग के प्रकार से प्रभावित होता है। अर्थात्, कुछ जीन वर्ग छोटे मापदंड पर द्विगुणन या संपूर्ण जीनोम द्विगुणन घटना के पश्चात अतिरेक के लिए उत्तम तथा अनुकूल हैं।^[13] निरर्थक जीनों के जीवित रहने की अधिक संभावना होती है जब वह सम्मिश्र मार्गों में सम्मिलित होते हैं और संपूर्ण जीनोम द्विगुणन या बहुवर्ग द्विगुणन के उत्पाद होते हैं।^[13]

एकल जीन डुप्लिकेट के लिए वर्तमान में स्वीकृत परिणामों में सम्मिलित हैं: तथा जहाँ जीन हानि (गैर-कार्यात्मकता), कार्यात्मक विचलन, और बढ़ी हुई आनुवंशिक दृढ़ता के लिए संरक्षण होते है।^[11] अन्यथा, बहुजीन वर्ग ठोस विकास, या जन्म और मृत्यु विकास से गुजर सकते हैं।^[11] ठोस विकास यह विचार है कि समूह में जीन, जैसे कि जीन परिवार, समानांतर रूप से में विकसित होते हैं।^[11] तथा जन्म मृत्यु विकास की अवधारणा यह होती है कि जीन वर्ग शक्तिशाली शुद्धिकरण चयन से गुजरता है।^[11]

कार्यात्मक विचलन

चूंकि जीनोम अनेक पीढ़ियों तक प्रतिकृति बनाता है, जहाँ अनावश्यक जीन का कार्य आनुवंशिक प्रवाह के कारण विकसित होने की सबसे अधिक संभावना है। आनुवंशिक प्रवाह या तो विविधताओं को समाप्त करके या जनसंख्या में भिन्नताओं को ठीक करके आनुवंशिक अतिरेक को प्रभावित करता है।^[12] इस घटना में कि आनुवंशिक प्रवाह वेरिएंट को बनाए रखता है, जीन उत्परिवर्तन संग्रहित कर सकता है जो कि समग्र कार्य को परिवर्तित कर देता है।^[14] चूँकि, अनेक अनावश्यक जीन भिन्न-भिन्न हो सकते हैं किन्तु सबफ़ंक्शनलाइज़ेशन जैसे तंत्र द्वारा मूल कार्य को बनाए रखते हैं, जो डुप्लिकेट की पूरक प्रतिक्रिया के अतिरिक्त मूल जीन फ़ंक्शन को संरक्षित करता है।^[13]^[12] जीन में कार्यात्मक विचलन के तीन तंत्र हैं जैसे नॉनफंक्शनलाइजेशन (या जीन हानि), नियोफंक्शनलाइजेशन और सबफंक्शनलाइजेशन आदि ।^[11]

इस प्रकार की अक्रियाशीलता, या अध:पतन/जीन हानि के समय, डुप्लिकेट जीन की प्रति उत्परिवर्तन प्राप्त करती है जो इसे निष्क्रिय कर देती है या जीन को शांत कर देती है। गैर-कार्यात्मकता अधिकांशतः एकल जीन द्विगुणन का परिणाम होती है।^[11] इस समय, जीन का कोई कार्य नहीं होता है और इसे स्यूडोजीन कहा जाता है। आनुवंशिक उत्परिवर्तन के कारण स्यूडोजेन समय के साथ नष्ट हो सकते हैं। नियोफ़ंक्शनलाइज़ेशन तब होता है जब जीन की प्रति उत्परिवर्तन संग्रहित करती है जो जीन को नया, लाभकारी कार्य देती है जो मूल कार्य से भिन्न होती है। सबफ़ंक्शनलाइज़ेशन तब होता है जब निरर्थक जीन की दोनों प्रतियां उत्परिवर्तन प्राप्त कर लेती हैं। प्रत्येक प्रतिलिपि केवल आंशिक रूप से सक्रिय होती है; इनमें से दो आंशिक प्रतियाँ मूल जीन की सामान्य प्रति के रूप में कार्य करती हैं। दाईं ओर चित्र 2 इस अवधारणा का दृश्य प्रदान करता है।

ट्रांसपोज़ेबल अवयव

ट्रांसपोज़ेबल अवयव कार्यात्मक विभेदन में विभिन्न भूमिकाएँ निभाते हैं। पुनर्संयोजन क्रियान्वित करके, ट्रांसपोज़ेबल अवयव जीनोम में अनावश्यक अनुक्रमों को स्थानांतरित कर सकते हैं।^[15] इस प्रकार के अनुक्रम संरचना और स्थान में यह परिवर्तन कार्यात्मक विचलन का स्रोत है।^[15] जहाँ ट्रांसपोज़ेबल अवयव संभावित रूप से जीन अभिव्यक्ति को प्रभावित करते हैं, यह देखते हुए कि उनमें बड़ी मात्रा में माइक्रो-आरएनए होते हैं।^[15]

जीन रखरखाव परिकल्पना

निरर्थक जीनों का विकास और उत्पत्ति मुख्यतः अज्ञात रहती है, क्योंकि विकास इतनी लंबी अवधि में होता है। सैद्धांतिक रूप से, जीन को उत्परिवर्तन के बिना तब तक बनाए नहीं रखा जा सकता जब तक कि उस पर चयनात्मक दबाव न हो। इसलिए, जीन अतिरेक, जीन की दोनों प्रतियों को उत्परिवर्तन संग्रहित करने की अनुमति देगा, जब तक कि दूसरा अभी भी अपना कार्य करने में सक्षम है। इसका अर्थ यह है कि सभी अनावश्यक जीन सैद्धांतिक रूप से छद्म जीन बन जाएंगे और अंततः नष्ट हो जाएंगे। वैज्ञानिकों ने दो परिकल्पनाएँ बैकअप परिकल्पना और पिग्गीबैक परिकल्पना तैयार की हैं जिससे वह यह बता सके कि क्यों अनावश्यक जीन जीनोम में रह सकते हैं:।^[16]

बैकअप परिकल्पना का प्रस्ताव है कि अनावश्यक जीन प्रकार की बैक-अप योजना के रूप में जीनोम में रहते हैं। यदि मूल जीन अपना कार्य खो देता है, तब अनावश्यक जीन कोशिका पर कब्ज़ा कर लेता है और उसे जीवित रखता है। पिग्गीबैक परिकल्पना में कहा गया है कि जीनोम में दो पैरालॉग्स में कुछ प्रकार के गैर-अतिव्यापी फ़ंक्शन के साथ-साथ अनावश्यक फ़ंक्शन भी होते हैं। इस स्तिथि में, जीन का अनावश्यक हिस्सा उस क्षेत्र की निकटता के कारण जीनोम में रहता है जिसका अद्वितीय कार्य के लिए कोड करता है।^[17] जीनोम में अनावश्यक जीन के बने रहने का कारण सतत प्रश्न है और हर जगह शोधकर्ताओं द्वारा जीन अतिरेक का अध्ययन किया जा रहा है। बैकअप और पिग्गीबैक मॉडल के अतिरिक्त अनेक परिकल्पनाएँ हैं। उदाहरण के लिए, मिशिगन विश्वविद्यालय में, अध्ययन यह सिद्धांत प्रदान करता है कि अनावश्यक जीन को कम अभिव्यक्ति द्वारा जीनोम में बनाए रखा जाता है।

अनुसंधान

जीन वर्ग और फाइलोजेनी

किसी प्रजाति की फाइलोजेनी के बारे में जानने के लिए शोधकर्ता अधिकांशतः जीन वर्ग के रूप में अनावश्यक जीन के इतिहास का उपयोग करते हैं। जहाँ अनावश्यक जीनों को कार्यात्मक विविधीकरण से गुजरने में समय लगता है; तथा ऑर्थोलॉग्स के मध्य विविधीकरण की डिग्री हमें बताती है कि दोनों जीनोम कितने निकट से संबंधित हैं। जहाँ जीन द्विगुणन में वृद्धि को देखकर भी जीन द्विगुणन की घटनाओं का पता लगाया जा सकता है।

एवोलूशनरी अध्ययनों में जीन अतिरेक का उपयोग करने का अच्छा उदाहरण पौधों में केसीएस जीन वर्ग का विकास है। यह पेपर अध्ययन करता है कि कैसे केसीएस जीन द्विगुणन की घटनाओं के माध्यम से पूरे जीन वर्ग में विकसित हुआ था। तथा इस प्रकार की प्रजातियों में अनावश्यक जीनों की संख्या शोधकर्ताओं को यह निर्धारित करने की अनुमति देती है कि द्विगुणन की घटनाएँ कब हुईं और प्रजातियाँ कितनी निकटता से संबंधित हैं।

निरर्थक जीनों का पता लगाना और उनका लक्षण वर्णन करना

वर्तमान में, ज्ञात जीनोमिक अनुक्रम में पैरालॉग्स का पता लगाने की तीन विधियाँ हैं: जो कि कुछ इस प्रकार है सरल होमोलॉजी (एफएएसटीए), जीन वर्ग विकास (ट्रीफैम) और ऑर्थोलॉजी (एगएनओजी v3) आदि। तथा जहाँ शोधकर्ता अधिकांशतः फाइलोजेनी का निर्माण करते हैं और अतिरेक की पहचान करने के लिए जीनोम की संरचनाओं की तुलना करने के लिए माइक्रोएरे का उपयोग करते हैं।^[18] एकाधिक जीनोम की तुलना करने के लिए सिन्टेनिक संरेखण बनाने और ऑर्थोलॉगस क्षेत्रों के विश्लेषण जैसी विधियों का उपयोग किया जाता है। संपूर्ण जोड़ीवार तुलनाओं का उपयोग करके एकल जीनोम को अनावश्यक जीन के लिए स्कैन किया जा सकता है।^[18] अनावश्यक जीनों का अधिक श्रमसाध्य विश्लेषण करने से पहले, शोधकर्ता सामान्यतः खुले पढ़ने के फ्रेम की लंबाई और मूक और गैर-मूक उत्परिवर्तन के मध्य की दरों की तुलना करके कार्यक्षमता का परीक्षण करते हैं।^[18] मानव जीनोम परियोजना के पूरा होने के पश्चात से, शोधकर्ता मानव जीनोम की अधिक आसानी से व्याख्या करने में सक्षम हैं। यूसीएससी में जीनोम ब्राउज़र जैसे ऑनलाइन डेटाबेस का उपयोग करके, शोधकर्ता अपनी रुचि के जीन के अनुक्रम में होमोलॉजी को प्रतीत कर सकते हैं।

स्तन कैंसर स्वभाव जीन

द्विगुणन की वह विधि जिसके द्वारा अतिरेक होता है, स्तन कैंसर स्वभाव जीनों में वर्गीकरण को प्रभावित करती हुई पाई गई है।^[19] सकल द्विगुणन नैदानिक व्याख्या को सम्मिश्र बनाता है क्योंकि यह समझना मुश्किल है कि क्या वे साथ घटित होते हैं। डीएनए ब्रेकप्वाइंट परख जैसी वर्तमान में ही हुई विधियों का उपयोग अग्रानुक्रम स्थिति निर्धारित करने के लिए किया गया है।^[19] तथा इसे परिवर्तित करने में, इन अग्रानुक्रम सकल द्विगुणनो को रोगजनक स्थिति के लिए अधिक स्पष्ट रूप से जांचा जा सकता है।^[19] तथा स्तन कैंसर के खतरे के मूल्यांकन के लिए इस शोध के महत्वपूर्ण निहितार्थ हैं।^[19]

ट्रिटिसिया घास में रोगज़नक़ प्रतिरोध

शोधकर्ताओं ने अनावश्यक जीन की भी पहचान की है जो जीव स्तर पर चयनात्मक लाभ प्रदान करते हैं। तथा जहाँ आंशिक एआरएम1 जीन, आंशिक द्विगुणन से उत्पन्न अनावश्यक जीन, ब्लूमेरिया ग्रैमिनिस, फफूंदी कवक के प्रति प्रतिरोध प्रदान करने के लिए पाया गया है।^[20] यह जीन गेहूं, राई और जौ सहित ट्रिटिसिया जनजाति के सदस्यों में उपस्तिथ होते है।^[20]

मानव निरर्थक जीन

घ्राण रिसेप्टर्स

मानव घ्राण रिसेप्टर (ओआर) जीन वर्ग में 339 अक्षुण्ण जीन और 297 स्यूडोजीन सम्मिलित होते हैं। यह जीन पूरे जीनोम में भिन्न-भिन्न स्थानों पर पाए जाते हैं, परन्तु केवल 13% ही भिन्न-भिन्न गुणसूत्रों पर या दूर-दूर स्थित लोकी पर पाए जाते हैं। मनुष्यों में ओआर जीन के 172 उपवर्ग पाए गए हैं, जिसमे प्रत्येक का अपना लोकी है। चूँकि इनमें से प्रत्येक उपवर्ग में जीन संरचनात्मक और कार्यात्मक रूप से समान हैं, और एक-दूसरे के समीप हैं, इसलिए यह अनुमान लगाया गया है कि प्रत्येक जीन द्विगुणन की घटनाओं से गुजरने वाले एकल जीन से विकसित हुआ है। जो कि मनुष्यों में उपवर्गों की उच्च संख्या बताती है कि हम इतनी सारी गंधों को पहचानने में सक्षम क्यों हैं।

मानव या चूहों जैसे अन्य स्तनधारियों में जीन के समरूप होते हैं, जो घ्राण रिसेप्टर जीन के विकास को प्रदर्शित करते हैं। गंध बोध की प्रारंभिक घटना में सम्मिलित विशेष वर्ग को संपूर्ण कशेरुकी विकास के समय अत्यधिक संरक्षित पाया गया है।^[21]

रोग

द्विगुणन की घटनाओं और अनावश्यक जीनों की अधिकांशतः कुछ मानव रोगों में भूमिका मानी जाती है। तथा जहाँ बड़े मापदंड पर संपूर्ण जीनोम द्विगुणन की घटनाएं जो कशेरुक विकास के प्रारंभ में हुईं थी, यही कारण हो सकता है कि मानव मोनोजेनिक रोग जीन में अधिकांशतः बड़ी संख्या में अनावश्यक जीन होते हैं। जहाँ चेन एट अल. परिकल्पना है कि मानव मोनोजेनिक रोग जीन में कार्यात्मक रूप से निरर्थक पैरालॉग्स प्रमुख हानिकारक उत्परिवर्तन के प्रभावों को छुपाते हैं, जिससे मानव जीनोम में रोग जीन बना रहता है।^[22]

संपूर्ण जीनोम द्विगुणन मानव जीनोम में ट्यूमर उत्पन्न करने वाले कुछ जीनों के बने रहने का प्रमुख कारण हो सकता है।^[23] उदाहरण के लिए, स्ट्राउट एट अल।^[24] दिखाया गया है कि अग्रानुक्रम द्विगुणन की घटनाएं, संभवतः सजातीय पुनर्संयोजन के माध्यम से, तीव्र मायलोइड ल्यूकेमिया से जुड़ी हुई हैं। एएलएल 1 (एमएलएल ) जीन का आंशिक द्विगुणन आनुवंशिक दोष है जो कि तीव्र माइलॉयड ल्यूकेमिया वाले रोगियों में पाया गया है।

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-'''जीन अतिरेक''' जीव के जीनोम में अनेक जीनों का अस्तित्व है जो वही कार्य करते हैं। जिसने जीन अतिरेक [[जीन दोहराव]] के परिणामस्वरूप हो सकता है।<ref name=":0">{{Cite journal|last1=Conrad|first1=Bernard|last2=Antonarakis|first2=Stylianos E.|date=September 2007|title=Gene Duplication: A Drive for Phenotypic Diversity and Cause of Human Disease|url=http://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|journal=Annual Review of Genomics and Human Genetics|language=en|volume=8|issue=1|pages=17–35|doi=10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|pmid=17386002|issn=1527-8204}}</ref> इस तरह की दोहराव की घटनाएँ [[ निरर्थक |निरर्थक]] जीन के अनेक सेटों के लिए ज़िम्मेदार होती  हैं।<ref name=":0" /> जब ऐसे सेट में व्यक्तिगत जीन उत्परिवर्तन या लक्षित [[जीन नॉकआउट]] द्वारा बाधित होता है, तो जीन अतिरेक के परिणामस्वरूप [[फेनोटाइप]] पर बहुत कम प्रभाव हो सकता है, जबकि केवल प्रतिलिपि वाले जीन के नॉकआउट के लिए प्रभाव बड़ा होता है।<ref>{{cite journal |vauthors=Pérez-Pérez JM, Candela H, Micol JL |title=आनुवंशिक अंतःक्रियाओं में तालमेल को समझना|journal=Trends Genet. |volume=25 |issue=8 |pages=368–76 |date=August 2009 |pmid=19665253 |doi=10.1016/j.tig.2009.06.004}}</ref> जीन नॉकआउट कुछ अध्ययनों में उपयोग की जाने वाली विधि है जिसका उद्देश्य रखरखाव और फिटनेस प्रभावों के कार्यात्मक ओवरलैप को चिह्नित करना है।<ref>{{Cite journal|last1=Pérez-Pérez|first1=José Manuel|last2=Candela|first2=Héctor|last3=Micol|first3=José Luis|date=2009-08-01|title=आनुवंशिक अंतःक्रियाओं में तालमेल को समझना|url=https://www.cell.com/trends/genetics/abstract/S0168-9525(09)00132-2|journal=Trends in Genetics|language=en|volume=25|issue=8|pages=368–376|doi=10.1016/j.tig.2009.06.004|issn=0168-9525|pmid=19665253}}</ref>
+'''जीन अतिरेक''' जीव के जीनोम में अनेक जीनों का अस्तित्व है जो वही कार्य करते हैं। जिसने जीन अतिरेक [[जीन दोहराव|जीन द्विगुणन]] के परिणामस्वरूप हो सकता है।<ref name=":0">{{Cite journal|last1=Conrad|first1=Bernard|last2=Antonarakis|first2=Stylianos E.|date=September 2007|title=Gene Duplication: A Drive for Phenotypic Diversity and Cause of Human Disease|url=http://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|journal=Annual Review of Genomics and Human Genetics|language=en|volume=8|issue=1|pages=17–35|doi=10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|pmid=17386002|issn=1527-8204}}</ref> इस तरह की द्विगुणन की घटनाएँ [[ निरर्थक |पैरालॉग्स]] जीन के अनेक समूहों के लिए ज़िम्मेदार होती  हैं।<ref name=":0" /> जब ऐसे समूह में व्यक्तिगत जीन उत्परिवर्तन या लक्षित [[जीन नॉकआउट]] द्वारा बाधित होता है, तो जीन अतिरेक के परिणामस्वरूप [[फेनोटाइप]] पर बहुत कम प्रभाव हो सकता है, जबकि केवल प्रतिलिपि वाले जीन के नॉकआउट के लिए प्रभाव बड़ा होता है।<ref>{{cite journal |vauthors=Pérez-Pérez JM, Candela H, Micol JL |title=आनुवंशिक अंतःक्रियाओं में तालमेल को समझना|journal=Trends Genet. |volume=25 |issue=8 |pages=368–76 |date=August 2009 |pmid=19665253 |doi=10.1016/j.tig.2009.06.004}}</ref> जीन नॉकआउट कुछ अध्ययनों में उपयोग की जाने वाली विधि है जिसका उद्देश्य रखरखाव और फिटनेस प्रभावों के कार्यात्मक ओवरलैप को चिह्नित करना है।<ref>{{Cite journal|last1=Pérez-Pérez|first1=José Manuel|last2=Candela|first2=Héctor|last3=Micol|first3=José Luis|date=2009-08-01|title=आनुवंशिक अंतःक्रियाओं में तालमेल को समझना|url=https://www.cell.com/trends/genetics/abstract/S0168-9525(09)00132-2|journal=Trends in Genetics|language=en|volume=25|issue=8|pages=368–376|doi=10.1016/j.tig.2009.06.004|issn=0168-9525|pmid=19665253}}</ref>
-मेंटेनेंस के मौलिक मॉडल का प्रस्ताव है कि फ़ंक्शन उत्परिवर्तन के हानिकारक हानि की भरपाई करने की उनकी क्षमता के कारण डुप्लिकेट जीन को जीनोम में विभिन्न सीमा तक संरक्षित किया जा सकता है।<ref name=":1">Nowak MA, Boerlijst MC, Cooke J, Smith JM. 1997. nowak_smith_1997_evolution_of_genetic_redundancy_Nature97. 275:1–5. <nowiki>sftp://cerca@192.168.2.5/home/cerca/Desktop/data/laptop_files/info/biologia/filogeny_evolution/evolution_multigene_families/nowak_smith_1997_evolution_of_genetic_redundancy_Nature97.pdf%5Cnpapers2://publication/uuid/BFCD7B63-4802-4C83-96AE-A2ED496127F3</nowiki>.</ref><ref>{{Cite journal|last1=Martienssen|first1=Rob|last2=Irish|first2=Vivian|date=1999-11-01|title=Copying out our ABCs: the role of gene redundancy in interpreting genetic hierarchies|url=https://www.cell.com/trends/genetics/abstract/S0168-9525(99)01833-8|journal=Trends in Genetics|language=en|volume=15|issue=11|pages=435–437|doi=10.1016/S0168-9525(99)01833-8|issn=0168-9525|pmid=10529802}}</ref> यह मौलिक मॉडल सकारात्मक चयन के संभावित प्रभाव को ध्यान में नहीं रखते हैं। इन मौलिक मॉडलों से परे, शोधकर्ता उन तंत्रों का पता लगाना जारी रखते हैं जिनके द्वारा अनावश्यक जीन बनाए रखे जाते हैं और विकसित होते हैं।<ref name=":02">{{Cite journal|last1=Conrad|first1=Bernard|last2=Antonarakis|first2=Stylianos E.|date=September 2007|title=Gene Duplication: A Drive for Phenotypic Diversity and Cause of Human Disease|url=http://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|journal=Annual Review of Genomics and Human Genetics|language=en|volume=8|issue=1|pages=17–35|doi=10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|pmid=17386002|issn=1527-8204}}</ref><ref name=":2">Force A et al. 1999. Preservation of duplicate genes by complementary, degenerative mutations. Genetics. 151:1531–1545.</ref><ref name=":3">Long M, Vankuren NW, Chen S, Vibranovski MD. 2013. New gene evolution: Little did we know. Annu. Rev. Genet. 47:307–333. {{doi|10.1146/annurev-genet-111212-133301.}}</ref> जीन अतिरेक को नवीन जीन उत्पत्ति के स्रोत के रूप में लंबे समय से सराहा गया है;<ref name=":3" /> अर्थात्, जब डुप्लिकेट पर चयनात्मक दबाव उपस्तिथ होता है तो नए जीन उत्पन्न हो सकते हैं, जबकि मूल जीन को मूल कार्य करने के लिए बनाए रखा जाता है, जैसा कि नए मॉडल द्वारा प्रस्तावित है<ref name=":1" />.[[File:Gene Duplication.jpg|thumb|368x368px|चित्रा 1. जीन दोहराव के सामान्य तंत्र।]]
+मेंटेनेंस के मौलिक मॉडल का प्रस्ताव है कि फ़ंक्शन उत्परिवर्तन के हानिकारक हानि की भरपाई करने की उनकी क्षमता के कारण डुप्लिकेट जीन को जीनोम में विभिन्न सीमा तक संरक्षित किया जा सकता है।<ref name=":1">Nowak MA, Boerlijst MC, Cooke J, Smith JM. 1997. nowak_smith_1997_evolution_of_genetic_redundancy_Nature97. 275:1–5. <nowiki>sftp://cerca@192.168.2.5/home/cerca/Desktop/data/laptop_files/info/biologia/filogeny_evolution/evolution_multigene_families/nowak_smith_1997_evolution_of_genetic_redundancy_Nature97.pdf%5Cnpapers2://publication/uuid/BFCD7B63-4802-4C83-96AE-A2ED496127F3</nowiki>.</ref><ref>{{Cite journal|last1=Martienssen|first1=Rob|last2=Irish|first2=Vivian|date=1999-11-01|title=Copying out our ABCs: the role of gene redundancy in interpreting genetic hierarchies|url=https://www.cell.com/trends/genetics/abstract/S0168-9525(99)01833-8|journal=Trends in Genetics|language=en|volume=15|issue=11|pages=435–437|doi=10.1016/S0168-9525(99)01833-8|issn=0168-9525|pmid=10529802}}</ref> यह मौलिक मॉडल सकारात्मक चयन के संभावित प्रभाव को ध्यान में नहीं रखते हैं। इन मौलिक मॉडलों से परे, शोधकर्ता उन तंत्रों का पता लगाना जारी रखते हैं जिनके द्वारा अनावश्यक जीन बनाए रखे जाते हैं और विकसित होते हैं।<ref name=":02">{{Cite journal|last1=Conrad|first1=Bernard|last2=Antonarakis|first2=Stylianos E.|date=September 2007|title=Gene Duplication: A Drive for Phenotypic Diversity and Cause of Human Disease|url=http://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|journal=Annual Review of Genomics and Human Genetics|language=en|volume=8|issue=1|pages=17–35|doi=10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|pmid=17386002|issn=1527-8204}}</ref><ref name=":2">Force A et al. 1999. Preservation of duplicate genes by complementary, degenerative mutations. Genetics. 151:1531–1545.</ref><ref name=":3">Long M, Vankuren NW, Chen S, Vibranovski MD. 2013. New gene evolution: Little did we know. Annu. Rev. Genet. 47:307–333. {{doi|10.1146/annurev-genet-111212-133301.}}</ref> जीन अतिरेक को नवीन जीन उत्पत्ति के स्रोत के रूप में लंबे समय से सराहा गया है;<ref name=":3" /> अर्थात्, जब डुप्लिकेट पर चयनात्मक दबाव उपस्तिथ होता है तो नए जीन उत्पन्न हो सकते हैं, जबकि मूल जीन को मूल कार्य करने के लिए बनाए रखा जाता है, जैसा कि नए मॉडल द्वारा प्रस्तावित है<ref name=":1" />.[[File:Gene Duplication.jpg|thumb|368x368px|चित्रा 1. जीन द्विगुणन के सामान्य तंत्र।]]
 == निरर्थक जीन की उत्पत्ति और विकास                    ==
-जीन अतिरेक अधिकांशतः जीन दोहराव के परिणामस्वरूप होता है।<ref>{{Cite journal|last=Wagner|first=Andreas|date=1996-06-01|title=जीन दोहराव और ट्रांसक्रिप्शनल नियामकों के नेटवर्क में इसके विकास के कारण आनुवंशिक अतिरेक|url=https://doi.org/10.1007/BF00209427|journal=Biological Cybernetics|language=en|volume=74|issue=6|pages=557–567|doi=10.1007/BF00209427|pmid=8672563|s2cid=8616418|issn=1432-0770}}</ref> जीन दोहराव के तीन अधिक सामान्य तंत्र [[रेट्रोपोसॉन]], असमान [[क्रोमोसोमल क्रॉसओवर]] और गैर-होमोलॉगस खंडीय दोहराव हैं। रिट्रोपोजिशन तब होता है जब किसी जीन के एमआरएनए प्रतिलेख को डीएनए में रिवर्स ट्रांसक्रिप्ट किया जाता है और भिन्न स्थान पर जीनोम में डाला जाता है। असमान क्रॉसिंग ओवर के समय, होमोलॉजी (जीवविज्ञान) गुणसूत्र अपने डीएनए के असमान हिस्सों का आदान-प्रदान करते हैं। इससे गुणसूत्र के जीन को दूसरे गुणसूत्र में स्थानांतरित किया जा सकता है, जिससे गुणसूत्र पर दो समान जीन रह जाते हैं और दूसरे गुणसूत्र पर जीन की कोई प्रति नहीं रह जाती है। गैर-समरूप दोहराव, प्रतिकृति त्रुटियों के परिणामस्वरूप होता है जो रुचि के जीन को नई स्थिति में स्थानांतरित कर देता है। फिर अग्रानुक्रम दोहराव होता है, जिससे ही जीन की दो प्रतियों के साथ गुणसूत्र बनता है। चित्र 1 इन तीन तंत्रों का दृश्य प्रदान करता है।<ref>{{Cite journal|last=Hurles|first=Matthew|date=2004-07-13|title=Gene Duplication: The Genomic Trade in Spare Parts|journal=PLOS Biology|language=en|volume=2|issue=7|pages=e206|doi=10.1371/journal.pbio.0020206|issn=1545-7885|pmc=449868|pmid=15252449}}</ref> जब जीन को जीनोम के अंदर दोहराया जाता है, तो दो प्रतियां प्रारंभ में कार्यात्मक रूप से अनावश्यक होती हैं। इन निरर्थक जीनों को परलोक माना जाता है क्योंकि वे समय के साथ परिवर्तन संग्रहित करते हैं, जब तक कि वे कार्यात्मक रूप से भिन्न नहीं हो जाते।<ref name=":04">{{Cite journal|last1=Conrad|first1=Bernard|last2=Antonarakis|first2=Stylianos E.|date=September 2007|title=Gene Duplication: A Drive for Phenotypic Diversity and Cause of Human Disease|url=http://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|journal=Annual Review of Genomics and Human Genetics|language=en|volume=8|issue=1|pages=17–35|doi=10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|pmid=17386002|issn=1527-8204}}</ref>
+जीन अतिरेक अधिकांशतः जीन द्विगुणन के परिणामस्वरूप होता है।<ref>{{Cite journal|last=Wagner|first=Andreas|date=1996-06-01|title=जीन दोहराव और ट्रांसक्रिप्शनल नियामकों के नेटवर्क में इसके विकास के कारण आनुवंशिक अतिरेक|url=https://doi.org/10.1007/BF00209427|journal=Biological Cybernetics|language=en|volume=74|issue=6|pages=557–567|doi=10.1007/BF00209427|pmid=8672563|s2cid=8616418|issn=1432-0770}}</ref> जीन द्विगुणन के तीन अधिक सामान्य तंत्र [[रेट्रोपोसॉन]], असमान [[क्रोमोसोमल क्रॉसओवर]] और गैर-होमोलॉगस खंडीय द्विगुणन हैं। रिट्रोपोजिशन तब होता है जब किसी जीन के एमआरएनए प्रतिलेख को डीएनए में रिवर्स ट्रांसक्रिप्ट किया जाता है और भिन्न स्थान पर जीनोम में डाला जाता है। असमान क्रॉसिंग ओवर के समय, होमोलॉजी (जीवविज्ञान) गुणसूत्र अपने डीएनए के असमान हिस्सों का आदान-प्रदान करते हैं। इससे गुणसूत्र के जीन को दूसरे गुणसूत्र में स्थानांतरित किया जा सकता है, जिससे गुणसूत्र पर दो समान जीन रह जाते हैं और दूसरे गुणसूत्र पर जीन की कोई प्रति नहीं रह जाती है। गैर-समरूप दोहराव, प्रतिकृति त्रुटियों के परिणामस्वरूप होता है जो रुचि के जीन को नई स्थिति में स्थानांतरित कर देता है। फिर अग्रानुक्रम द्विगुणन होता है, जिससे ही जीन की दो प्रतियों के साथ गुणसूत्र बनता है। चित्र 1 इन तीन तंत्रों का दृश्य प्रदान करता है।<ref>{{Cite journal|last=Hurles|first=Matthew|date=2004-07-13|title=Gene Duplication: The Genomic Trade in Spare Parts|journal=PLOS Biology|language=en|volume=2|issue=7|pages=e206|doi=10.1371/journal.pbio.0020206|issn=1545-7885|pmc=449868|pmid=15252449}}</ref> जब जीन को जीनोम के अंदर दोहराया जाता है, तो दो प्रतियां प्रारंभ में कार्यात्मक रूप से अनावश्यक होती हैं। इन निरर्थक जीनों को पैरालॉग्स माना जाता है क्योंकि वे समय के साथ परिवर्तन संग्रहित करते हैं, जब तक कि वे कार्यात्मक रूप से भिन्न नहीं हो जाते।<ref name=":04">{{Cite journal|last1=Conrad|first1=Bernard|last2=Antonarakis|first2=Stylianos E.|date=September 2007|title=Gene Duplication: A Drive for Phenotypic Diversity and Cause of Human Disease|url=http://www.annualreviews.org/doi/10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|journal=Annual Review of Genomics and Human Genetics|language=en|volume=8|issue=1|pages=17–35|doi=10.1146/annurev.genom.8.021307.110233|pmid=17386002|issn=1527-8204}}</ref>
-अधिकांश शोध इस प्रश्न पर केंद्रित है कि अनावश्यक जीन कैसे बने रहते हैं।<ref name=":32">Long M, Vankuren NW, Chen S, Vibranovski MD. 2013. New gene evolution: Little did we know. Annu. Rev. Genet. 47:307–333. {{doi|10.1146/annurev-genet-111212-133301.}}</ref> निरर्थक जीनों के संरक्षण को समझाने का प्रयास करने के लिए तीन मॉडल सामने आए हैं: जो कि कुछ इस प्रकार है अनुकूली विकिरण, विचलन, और अनुकूली संघर्ष से बचना आदि। विशेष रूप से, दोहराव की घटना के पश्चात प्रतिधारण दोहराव की घटना के प्रकार और जीन वर्ग के प्रकार से प्रभावित होता है। अर्थात्, कुछ जीन वर्ग छोटे मापदंड पर दोहराव या संपूर्ण जीनोम दोहराव घटना के पश्चात अतिरेक के लिए उत्तम तथा अनुकूल हैं।<ref name=":4">{{Cite journal|year=2008|language=en|doi=10.1038/nrg2482|pmid=19015656|last1=Conant|first1=G. C.|last2=Wolfe|first2=K. H.|title=Turning a hobby into a job: How duplicated genes find new functions |journal=Nature Reviews Genetics |volume=9|issue=12|pages=938–950|s2cid=1240225}}</ref> निरर्थक जीनों के जीवित रहने की अधिक संभावना होती है जब वह सम्मिश्र मार्गों में सम्मिलित होते हैं और संपूर्ण जीनोम दोहराव या बहुवर्ग दोहराव के उत्पाद होते हैं।<ref name=":4" />
+अधिकांश शोध इस प्रश्न पर केंद्रित है कि अनावश्यक जीन कैसे बने रहते हैं।<ref name=":32">Long M, Vankuren NW, Chen S, Vibranovski MD. 2013. New gene evolution: Little did we know. Annu. Rev. Genet. 47:307–333. {{doi|10.1146/annurev-genet-111212-133301.}}</ref> निरर्थक जीनों के संरक्षण को समझाने का प्रयास करने के लिए तीन मॉडल सामने आए हैं: जो कि कुछ इस प्रकार है अनुकूली विकिरण, विचलन, और अनुकूली संघर्ष से बचना आदि। विशेष रूप से, द्विगुणन की घटना के पश्चात प्रतिधारण द्विगुणन की घटना के प्रकार और जीन वर्ग के प्रकार से प्रभावित होता है। अर्थात्, कुछ जीन वर्ग छोटे मापदंड पर द्विगुणन या संपूर्ण जीनोम द्विगुणन घटना के पश्चात अतिरेक के लिए उत्तम तथा अनुकूल हैं।<ref name=":4">{{Cite journal|year=2008|language=en|doi=10.1038/nrg2482|pmid=19015656|last1=Conant|first1=G. C.|last2=Wolfe|first2=K. H.|title=Turning a hobby into a job: How duplicated genes find new functions |journal=Nature Reviews Genetics |volume=9|issue=12|pages=938–950|s2cid=1240225}}</ref> निरर्थक जीनों के जीवित रहने की अधिक संभावना होती है जब वह सम्मिश्र मार्गों में सम्मिलित होते हैं और संपूर्ण जीनोम द्विगुणन या बहुवर्ग द्विगुणन के उत्पाद होते हैं।<ref name=":4" />
 एकल जीन डुप्लिकेट के लिए वर्तमान में स्वीकृत परिणामों में सम्मिलित हैं: तथा जहाँ जीन हानि (गैर-कार्यात्मकता), कार्यात्मक विचलन, और बढ़ी हुई आनुवंशिक दृढ़ता के लिए संरक्षण होते है।<ref name=":04" /> अन्यथा, बहुजीन वर्ग ठोस विकास, या जन्म और मृत्यु विकास से गुजर सकते हैं।<ref name=":04" /> ठोस विकास यह विचार है कि समूह में जीन, जैसे कि जीन परिवार, समानांतर रूप से में विकसित होते हैं।<ref name=":04" /> तथा जन्म मृत्यु विकास की अवधारणा यह होती है कि जीन वर्ग शक्तिशाली शुद्धिकरण चयन से गुजरता है।<ref name=":04" />
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 चूंकि जीनोम अनेक पीढ़ियों तक प्रतिकृति बनाता है, जहाँ अनावश्यक जीन का कार्य [[आनुवंशिक बहाव|आनुवंशिक प्रवाह]] के कारण विकसित होने की सबसे अधिक संभावना है। आनुवंशिक प्रवाह या तो विविधताओं को समाप्त करके या जनसंख्या में भिन्नताओं को ठीक करके आनुवंशिक अतिरेक को प्रभावित करता है।<ref name=":32" /> इस घटना में कि आनुवंशिक प्रवाह वेरिएंट को बनाए रखता है, जीन उत्परिवर्तन संग्रहित कर सकता है जो कि समग्र कार्य को परिवर्तित कर देता है।<ref name=":22">Force A et al. 1999. Preservation of duplicate genes by complementary, degenerative mutations. Genetics. 151:1531–1545.</ref> चूँकि, अनेक अनावश्यक जीन भिन्न-भिन्न हो सकते हैं किन्तु सबफ़ंक्शनलाइज़ेशन जैसे तंत्र द्वारा मूल कार्य को बनाए रखते हैं, जो डुप्लिकेट की पूरक प्रतिक्रिया के अतिरिक्त मूल जीन फ़ंक्शन को संरक्षित करता है।<ref name=":4" /><ref name=":32" /> जीन में कार्यात्मक विचलन के तीन तंत्र हैं जैसे नॉनफंक्शनलाइजेशन (या जीन हानि), नियोफंक्शनलाइजेशन और सबफंक्शनलाइजेशन आदि ।<ref name=":04" />
-इस प्रकार की अक्रियाशीलता, या अध:पतन/जीन हानि के समय, डुप्लिकेट जीन की प्रति उत्परिवर्तन प्राप्त करती है जो इसे निष्क्रिय कर देती है या जीन को शांत कर देती है। गैर-कार्यात्मकता अधिकांशतः एकल जीन दोहराव का परिणाम होती है।<ref name=":04" /> इस समय, जीन का कोई कार्य नहीं होता है और इसे [[स्यूडोजीन]] कहा जाता है। आनुवंशिक उत्परिवर्तन के कारण स्यूडोजेन समय के साथ नष्ट हो सकते हैं। नियोफ़ंक्शनलाइज़ेशन तब होता है जब जीन की प्रति उत्परिवर्तन संग्रहित करती है जो जीन को नया, लाभकारी कार्य देती है जो मूल कार्य से भिन्न होती है। सबफ़ंक्शनलाइज़ेशन तब होता है जब निरर्थक जीन की दोनों प्रतियां उत्परिवर्तन प्राप्त कर लेती हैं। प्रत्येक प्रतिलिपि केवल आंशिक रूप से सक्रिय होती है; इनमें से दो आंशिक प्रतियाँ मूल जीन की सामान्य प्रति के रूप में कार्य करती हैं। दाईं ओर चित्र 2 इस अवधारणा का दृश्य प्रदान करता है।
+इस प्रकार की अक्रियाशीलता, या अध:पतन/जीन हानि के समय, डुप्लिकेट जीन की प्रति उत्परिवर्तन प्राप्त करती है जो इसे निष्क्रिय कर देती है या जीन को शांत कर देती है। गैर-कार्यात्मकता अधिकांशतः एकल जीन द्विगुणन का परिणाम होती है।<ref name=":04" /> इस समय, जीन का कोई कार्य नहीं होता है और इसे [[स्यूडोजीन]] कहा जाता है। आनुवंशिक उत्परिवर्तन के कारण स्यूडोजेन समय के साथ नष्ट हो सकते हैं। नियोफ़ंक्शनलाइज़ेशन तब होता है जब जीन की प्रति उत्परिवर्तन संग्रहित करती है जो जीन को नया, लाभकारी कार्य देती है जो मूल कार्य से भिन्न होती है। सबफ़ंक्शनलाइज़ेशन तब होता है जब निरर्थक जीन की दोनों प्रतियां उत्परिवर्तन प्राप्त कर लेती हैं। प्रत्येक प्रतिलिपि केवल आंशिक रूप से सक्रिय होती है; इनमें से दो आंशिक प्रतियाँ मूल जीन की सामान्य प्रति के रूप में कार्य करती हैं। दाईं ओर चित्र 2 इस अवधारणा का दृश्य प्रदान करता है।
 ==== ट्रांसपोज़ेबल अवयव                                                    ====
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 निरर्थक जीनों का विकास और उत्पत्ति मुख्यतः अज्ञात रहती है, क्योंकि विकास इतनी लंबी अवधि में होता है। सैद्धांतिक रूप से, जीन को उत्परिवर्तन के बिना तब तक बनाए नहीं रखा जा सकता जब तक कि उस पर चयनात्मक दबाव न हो। इसलिए, जीन अतिरेक, जीन की दोनों प्रतियों को उत्परिवर्तन संग्रहित करने की अनुमति देगा, जब तक कि दूसरा अभी भी अपना कार्य करने में सक्षम है। इसका अर्थ यह है कि सभी अनावश्यक जीन सैद्धांतिक रूप से छद्म जीन बन जाएंगे और अंततः नष्ट हो जाएंगे। वैज्ञानिकों ने दो परिकल्पनाएँ बैकअप परिकल्पना और पिग्गीबैक परिकल्पना तैयार की हैं जिससे वह यह बता सके कि क्यों अनावश्यक जीन जीनोम में रह सकते हैं:।<ref>{{Cite journal|title = आनुवंशिक अतिरेक और उनका विकासवादी रखरखाव|last = Zhang|first = Jianzhi|date = 2012|journal = Evolutionary Systems Biology Advances in Experimental Medicine and Biology|volume = 751|pages = 279–300|doi = 10.1007/978-1-4614-3567-9_13|pmid = 22821463|isbn = 978-1-4614-3566-2|series = Advances in Experimental Medicine and Biology}}</ref>
-बैकअप परिकल्पना का प्रस्ताव है कि अनावश्यक जीन प्रकार की बैक-अप योजना के रूप में जीनोम में रहते हैं। यदि मूल जीन अपना कार्य खो देता है, तब अनावश्यक जीन कोशिका पर कब्ज़ा कर लेता है और उसे जीवित रखता है। पिग्गीबैक परिकल्पना में कहा गया है कि जीनोम में दो [http://homepage.usask.ca/~ctl271/857/def_homolog.shtml परलॉग] में कुछ प्रकार के गैर-अतिव्यापी फ़ंक्शन के साथ-साथ अनावश्यक फ़ंक्शन भी होते हैं। इस स्तिथि में, जीन का अनावश्यक हिस्सा उस क्षेत्र की निकटता के कारण जीनोम में रहता है जिसका अद्वितीय कार्य के लिए कोड करता है।<ref>{{Cite journal|last1 = Qian|first1 = Wenfeng|last2 = Liao|first2 = Ben-Yang|last3 = Chang|first3 = Andrew Y.-F.|last4 = Zhang|first4 = Jianzhi|date = 2010-10-01|title = डुप्लिकेट जीन का रखरखाव और कम अभिव्यक्ति द्वारा उनकी कार्यात्मक अतिरेक|journal = Trends in Genetics|volume = 26|issue = 10|pages = 425–430|doi = 10.1016/j.tig.2010.07.002|issn = 0168-9525|pmc = 2942974|pmid = 20708291}}</ref> जीनोम में अनावश्यक जीन के बने रहने का कारण सतत प्रश्न है और हर जगह शोधकर्ताओं द्वारा जीन अतिरेक का अध्ययन किया जा रहा है। बैकअप और पिग्गीबैक मॉडल के अतिरिक्त अनेक परिकल्पनाएँ हैं। उदाहरण के लिए, मिशिगन विश्वविद्यालय में, अध्ययन यह सिद्धांत प्रदान करता है कि अनावश्यक जीन को कम अभिव्यक्ति द्वारा जीनोम में बनाए रखा जाता है।
+बैकअप परिकल्पना का प्रस्ताव है कि अनावश्यक जीन प्रकार की बैक-अप योजना के रूप में जीनोम में रहते हैं। यदि मूल जीन अपना कार्य खो देता है, तब अनावश्यक जीन कोशिका पर कब्ज़ा कर लेता है और उसे जीवित रखता है। पिग्गीबैक परिकल्पना में कहा गया है कि जीनोम में दो [http://homepage.usask.ca/~ctl271/857/def_homolog.shtml पैरालॉग्स] में कुछ प्रकार के गैर-अतिव्यापी फ़ंक्शन के साथ-साथ अनावश्यक फ़ंक्शन भी होते हैं। इस स्तिथि में, जीन का अनावश्यक हिस्सा उस क्षेत्र की निकटता के कारण जीनोम में रहता है जिसका अद्वितीय कार्य के लिए कोड करता है।<ref>{{Cite journal|last1 = Qian|first1 = Wenfeng|last2 = Liao|first2 = Ben-Yang|last3 = Chang|first3 = Andrew Y.-F.|last4 = Zhang|first4 = Jianzhi|date = 2010-10-01|title = डुप्लिकेट जीन का रखरखाव और कम अभिव्यक्ति द्वारा उनकी कार्यात्मक अतिरेक|journal = Trends in Genetics|volume = 26|issue = 10|pages = 425–430|doi = 10.1016/j.tig.2010.07.002|issn = 0168-9525|pmc = 2942974|pmid = 20708291}}</ref> जीनोम में अनावश्यक जीन के बने रहने का कारण सतत प्रश्न है और हर जगह शोधकर्ताओं द्वारा जीन अतिरेक का अध्ययन किया जा रहा है। बैकअप और पिग्गीबैक मॉडल के अतिरिक्त अनेक परिकल्पनाएँ हैं। उदाहरण के लिए, मिशिगन विश्वविद्यालय में, अध्ययन यह सिद्धांत प्रदान करता है कि अनावश्यक जीन को कम अभिव्यक्ति द्वारा जीनोम में बनाए रखा जाता है।
 == अनुसंधान                                                                                                    ==
 === [[जीन परिवार|जीन]] वर्ग और फाइलोजेनी                                           ===
-किसी प्रजाति की फाइलोजेनी के बारे में जानने के लिए शोधकर्ता अधिकांशतः जीन वर्ग के रूप में अनावश्यक जीन के इतिहास का उपयोग करते हैं। जहाँ अनावश्यक जीनों को कार्यात्मक विविधीकरण से गुजरने में समय लगता है; तथा [http://homepage.usask.ca/~ctl271/857/def_homolog.shtml ऑर्थोलॉग्स] के मध्य विविधीकरण की डिग्री हमें बताती है कि दोनों जीनोम कितने निकट से संबंधित हैं। जहाँ जीन दोहराव में वृद्धि को देखकर भी जीन दोहराव की घटनाओं का पता लगाया जा सकता है।
+किसी प्रजाति की फाइलोजेनी के बारे में जानने के लिए शोधकर्ता अधिकांशतः जीन वर्ग के रूप में अनावश्यक जीन के इतिहास का उपयोग करते हैं। जहाँ अनावश्यक जीनों को कार्यात्मक विविधीकरण से गुजरने में समय लगता है; तथा [http://homepage.usask.ca/~ctl271/857/def_homolog.shtml ऑर्थोलॉग्स] के मध्य विविधीकरण की डिग्री हमें बताती है कि दोनों जीनोम कितने निकट से संबंधित हैं। जहाँ जीन द्विगुणन में वृद्धि को देखकर भी जीन द्विगुणन की घटनाओं का पता लगाया जा सकता है।
-एवोलूशनरी अध्ययनों में जीन अतिरेक का उपयोग करने का अच्छा उदाहरण [https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00438-015-1142-3 पौधों में केसीएस जीन वर्ग का विकास] है। यह पेपर अध्ययन करता है कि कैसे केसीएस जीन दोहराव की घटनाओं के माध्यम से पूरे जीन वर्ग में विकसित हुआ था। तथा इस प्रकार की प्रजातियों में अनावश्यक जीनों की संख्या शोधकर्ताओं को यह निर्धारित करने की अनुमति देती है कि दोहराव की घटनाएँ कब हुईं और प्रजातियाँ कितनी निकटता से संबंधित हैं।
+एवोलूशनरी अध्ययनों में जीन अतिरेक का उपयोग करने का अच्छा उदाहरण [https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00438-015-1142-3 पौधों में केसीएस जीन वर्ग का विकास] है। यह पेपर अध्ययन करता है कि कैसे केसीएस जीन द्विगुणन की घटनाओं के माध्यम से पूरे जीन वर्ग में विकसित हुआ था। तथा इस प्रकार की प्रजातियों में अनावश्यक जीनों की संख्या शोधकर्ताओं को यह निर्धारित करने की अनुमति देती है कि द्विगुणन की घटनाएँ कब हुईं और प्रजातियाँ कितनी निकटता से संबंधित हैं।
 === निरर्थक जीनों का पता लगाना और उनका लक्षण वर्णन करना                                   ===
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 === स्तन कैंसर स्वभाव जीन           ===
-दोहराव की वह विधि जिसके द्वारा अतिरेक होता है, स्तन कैंसर स्वभाव जीनों में वर्गीकरण को प्रभावित करती हुई पाई गई है।<ref name=":05">{{Cite journal|last1=Richardson|first1=Marcy E.|last2=Chong|first2=Hansook|last3=Mu|first3=Wenbo|last4=Conner|first4=Blair R.|last5=Hsuan|first5=Vickie|last6=Willett|first6=Sara|last7=Lam|first7=Stephanie|last8=Tsai|first8=Pei|last9=Pesaran|first9=Tina|last10=Chamberlin|first10=Adam C.|last11=Park|first11=Min-Sun|date=2018-07-28|title=डीएनए ब्रेकप्वाइंट परख से पता चलता है कि स्तन कैंसर की प्रवृत्ति वाले जीनों में वीयूएस वर्गीकरण को कम करने के लिए अधिकांश सकल दोहराव एक साथ होते हैं।|journal=Genetics in Medicine|volume=21|issue=3|pages=683–693|doi=10.1038/s41436-018-0092-7|pmid=30054569|pmc=6752314|issn=1098-3600|doi-access=free}}</ref> सकल दोहराव नैदानिक व्याख्या को सम्मिश्र बनाता है क्योंकि यह समझना मुश्किल है कि क्या वे साथ घटित होते हैं। डीएनए ब्रेकप्वाइंट परख जैसी वर्तमान में ही हुई विधियों का उपयोग अग्रानुक्रम स्थिति निर्धारित करने के लिए किया गया है।<ref name=":05" /> तथा इसे परिवर्तित करने में, इन अग्रानुक्रम सकल दोहरावों को रोगजनक स्थिति के लिए अधिक स्पष्ट रूप से जांचा जा सकता है।<ref name=":05" /> स्तन कैंसर के खतरे के मूल्यांकन के लिए इस शोध के महत्वपूर्ण निहितार्थ हैं।<ref name=":05" />
+द्विगुणन की वह विधि जिसके द्वारा अतिरेक होता है, स्तन कैंसर स्वभाव जीनों में वर्गीकरण को प्रभावित करती हुई पाई गई है।<ref name=":05">{{Cite journal|last1=Richardson|first1=Marcy E.|last2=Chong|first2=Hansook|last3=Mu|first3=Wenbo|last4=Conner|first4=Blair R.|last5=Hsuan|first5=Vickie|last6=Willett|first6=Sara|last7=Lam|first7=Stephanie|last8=Tsai|first8=Pei|last9=Pesaran|first9=Tina|last10=Chamberlin|first10=Adam C.|last11=Park|first11=Min-Sun|date=2018-07-28|title=डीएनए ब्रेकप्वाइंट परख से पता चलता है कि स्तन कैंसर की प्रवृत्ति वाले जीनों में वीयूएस वर्गीकरण को कम करने के लिए अधिकांश सकल दोहराव एक साथ होते हैं।|journal=Genetics in Medicine|volume=21|issue=3|pages=683–693|doi=10.1038/s41436-018-0092-7|pmid=30054569|pmc=6752314|issn=1098-3600|doi-access=free}}</ref> सकल द्विगुणन नैदानिक व्याख्या को सम्मिश्र बनाता है क्योंकि यह समझना मुश्किल है कि क्या वे साथ घटित होते हैं। डीएनए ब्रेकप्वाइंट परख जैसी वर्तमान में ही हुई विधियों का उपयोग अग्रानुक्रम स्थिति निर्धारित करने के लिए किया गया है।<ref name=":05" /> तथा इसे परिवर्तित करने में, इन अग्रानुक्रम सकल द्विगुणनो को रोगजनक स्थिति के लिए अधिक स्पष्ट रूप से जांचा जा सकता है।<ref name=":05" /> तथा स्तन कैंसर के खतरे के मूल्यांकन के लिए इस शोध के महत्वपूर्ण निहितार्थ हैं।<ref name=":05" />
-=== ट्रिटिसिया घास में रोगज़नक़ प्रतिरोध                                                                                       ===
+=== ट्रिटिसिया घास में रोगज़नक़ प्रतिरोध         ===
-शोधकर्ताओं ने अनावश्यक जीन की भी पहचान की है जो जीव स्तर पर चयनात्मक लाभ प्रदान करते हैं। तथा जहाँ आंशिक एआरएम1 जीन, आंशिक दोहराव से उत्पन्न अनावश्यक जीन, [[घास के फूल|ब्लूमेरिया ग्रैमिनिस]], फफूंदी कवक के प्रति प्रतिरोध प्रदान करने के लिए पाया गया है।<ref name=":12">{{Cite journal|last1=Rajaraman|first1=Jeyaraman|last2=Douchkov|first2=Dimitar|last3=Lück|first3=Stefanie|last4=Hensel|first4=Götz|last5=Nowara|first5=Daniela|last6=Pogoda|first6=Maria|last7=Rutten|first7=Twan|last8=Meitzel|first8=Tobias|last9=Brassac|first9=Jonathan|last10=Höfle|first10=Caroline|last11=Hückelhoven|first11=Ralph|date=2018-08-15|title=घास की ट्रिटिसिया जनजाति में विकासात्मक रूप से संरक्षित आंशिक जीन दोहराव रोगज़नक़ प्रतिरोध प्रदान करता है|journal=Genome Biology|volume=19|issue=1|page=116|doi=10.1186/s13059-018-1472-7|pmid=30111359|pmc=6092874|issn=1474-760X|doi-access=free}}</ref> यह जीन गेहूं, [[राई]] और [[जौ]] सहित [[टीआर आईटी बर्फ एई|ट्रिटिसिया]] जनजाति के सदस्यों में उपस्तिथ है।<ref name=":12" />
+शोधकर्ताओं ने अनावश्यक जीन की भी पहचान की है जो जीव स्तर पर चयनात्मक लाभ प्रदान करते हैं। तथा जहाँ आंशिक एआरएम1 जीन, आंशिक द्विगुणन से उत्पन्न अनावश्यक जीन, [[घास के फूल|ब्लूमेरिया ग्रैमिनिस]], फफूंदी कवक के प्रति प्रतिरोध प्रदान करने के लिए पाया गया है।<ref name=":12">{{Cite journal|last1=Rajaraman|first1=Jeyaraman|last2=Douchkov|first2=Dimitar|last3=Lück|first3=Stefanie|last4=Hensel|first4=Götz|last5=Nowara|first5=Daniela|last6=Pogoda|first6=Maria|last7=Rutten|first7=Twan|last8=Meitzel|first8=Tobias|last9=Brassac|first9=Jonathan|last10=Höfle|first10=Caroline|last11=Hückelhoven|first11=Ralph|date=2018-08-15|title=घास की ट्रिटिसिया जनजाति में विकासात्मक रूप से संरक्षित आंशिक जीन दोहराव रोगज़नक़ प्रतिरोध प्रदान करता है|journal=Genome Biology|volume=19|issue=1|page=116|doi=10.1186/s13059-018-1472-7|pmid=30111359|pmc=6092874|issn=1474-760X|doi-access=free}}</ref> यह जीन गेहूं, [[राई]] और [[जौ]] सहित [[टीआर आईटी बर्फ एई|ट्रिटिसिया]] जनजाति के सदस्यों में उपस्तिथ होते है।<ref name=":12" />
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 === घ्राण रिसेप्टर्स         ===
-मानव घ्राण रिसेप्टर (ओआर) जीन वर्ग में 339 अक्षुण्ण जीन और 297 स्यूडोजेन सम्मिलित हैं। यह जीन पूरे जीनोम में भिन्न-भिन्न स्थानों पर पाए जाते हैं, परन्तु केवल 13% ही भिन्न-भिन्न गुणसूत्रों पर या दूर-दूर स्थित लोकी पर पाए जाते हैं। मनुष्यों में OR जीन के 172 उपवर्ग पाए गए हैं, जिसमे प्रत्येक का अपना लोकी है। चूँकि इनमें से प्रत्येक उपवर्ग में जीन संरचनात्मक और कार्यात्मक रूप से समान हैं, और एक-दूसरे के समीप हैं, इसलिए यह अनुमान लगाया गया है कि प्रत्येक जीन दोहराव की घटनाओं से गुजरने वाले एकल जीन से विकसित हुआ है। जो कि मनुष्यों में उपवर्गों की उच्च संख्या बताती है कि हम इतनी सारी गंधों को पहचानने में सक्षम क्यों हैं।
+मानव घ्राण रिसेप्टर (ओआर) जीन वर्ग में 339 अक्षुण्ण जीन और 297 स्यूडोजीन सम्मिलित होते हैं। यह जीन पूरे जीनोम में भिन्न-भिन्न स्थानों पर पाए जाते हैं, परन्तु केवल 13% ही भिन्न-भिन्न गुणसूत्रों पर या दूर-दूर स्थित लोकी पर पाए जाते हैं। मनुष्यों में ओआर जीन के 172 उपवर्ग पाए गए हैं, जिसमे प्रत्येक का अपना लोकी है। चूँकि इनमें से प्रत्येक उपवर्ग में जीन संरचनात्मक और कार्यात्मक रूप से समान हैं, और एक-दूसरे के समीप हैं, इसलिए यह अनुमान लगाया गया है कि प्रत्येक जीन द्विगुणन की घटनाओं से गुजरने वाले एकल जीन से विकसित हुआ है। जो कि मनुष्यों में उपवर्गों की उच्च संख्या बताती है कि हम इतनी सारी गंधों को पहचानने में सक्षम क्यों हैं।
 मानव या चूहों जैसे अन्य स्तनधारियों में जीन के समरूप होते हैं, जो घ्राण रिसेप्टर जीन के विकास को प्रदर्शित करते हैं। गंध बोध की प्रारंभिक घटना में सम्मिलित विशेष वर्ग को संपूर्ण कशेरुकी विकास के समय अत्यधिक संरक्षित पाया गया है।<ref>{{Cite journal|last1=Malnic|first1=Bettina|last2=Godfrey|first2=Paul A.|last3=Buck|first3=Linda B.|date=2004-02-24|title=मानव घ्राण रिसेप्टर जीन परिवार|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|language=en|volume=101|issue=8|pages=2584–2589|doi=10.1073/pnas.0307882100|issn=0027-8424|pmc=356993|pmid=14983052|bibcode=2004PNAS..101.2584M|doi-access=free}}</ref>
 === रोग                                                                                                                    ===
-दोहराव की घटनाओं और अनावश्यक जीनों की अधिकांशतः कुछ मानव रोगों में भूमिका मानी जाती है। तथा जहाँ बड़े मापदंड पर संपूर्ण जीनोम दोहराव की घटनाएं जो कशेरुक विकास के प्रारंभ में हुईं थी, यही कारण हो सकता है कि मानव मोनोजेनिक रोग जीन में अधिकांशतः बड़ी संख्या में अनावश्यक जीन होते हैं। जहाँ चेन एट अल. परिकल्पना है कि मानव मोनोजेनिक रोग जीन में कार्यात्मक रूप से निरर्थक पैरालॉग प्रमुख हानिकारक उत्परिवर्तन के प्रभावों को छुपाते हैं, जिससे मानव जीनोम में रोग जीन बना रहता है।<ref>{{Cite journal|last1=Chen|first1=Wei-Hua|last2=Zhao|first2=Xing-Ming|last3=van Noort|first3=Vera|last4=Bork|first4=Peer|date=2013-05-01|title=मानव मोनोजेनिक रोग जीन में अक्सर कार्यात्मक रूप से निरर्थक पैरालॉग होते हैं|journal=PLOS Computational Biology|volume=9|issue=5|doi=10.1371/journal.pcbi.1003073|issn=1553-734X|pmc=3656685|pmid=23696728|page=e1003073|bibcode=2013PLSCB...9E3073C}}</ref>
+द्विगुणन की घटनाओं और अनावश्यक जीनों की अधिकांशतः कुछ मानव रोगों में भूमिका मानी जाती है। तथा जहाँ बड़े मापदंड पर संपूर्ण जीनोम द्विगुणन की घटनाएं जो कशेरुक विकास के प्रारंभ में हुईं थी, यही कारण हो सकता है कि मानव मोनोजेनिक रोग जीन में अधिकांशतः बड़ी संख्या में अनावश्यक जीन होते हैं। जहाँ चेन एट अल. परिकल्पना है कि मानव मोनोजेनिक रोग जीन में कार्यात्मक रूप से निरर्थक पैरालॉग्स प्रमुख हानिकारक उत्परिवर्तन के प्रभावों को छुपाते हैं, जिससे मानव जीनोम में रोग जीन बना रहता है।<ref>{{Cite journal|last1=Chen|first1=Wei-Hua|last2=Zhao|first2=Xing-Ming|last3=van Noort|first3=Vera|last4=Bork|first4=Peer|date=2013-05-01|title=मानव मोनोजेनिक रोग जीन में अक्सर कार्यात्मक रूप से निरर्थक पैरालॉग होते हैं|journal=PLOS Computational Biology|volume=9|issue=5|doi=10.1371/journal.pcbi.1003073|issn=1553-734X|pmc=3656685|pmid=23696728|page=e1003073|bibcode=2013PLSCB...9E3073C}}</ref>
-संपूर्ण जीनोम दोहराव मानव जीनोम में ट्यूमर उत्पन्न करने वाले कुछ जीनों के बने रहने का प्रमुख कारण हो सकता है।<ref>{{Cite journal|last1=Malaguti|first1=Giulia|last2=Singh|first2=Param Priya|last3=Isambert|first3=Hervé|date=2014-05-01|title=जीन डुप्लिकेट के प्रतिधारण पर प्रमुख हानिकारक उत्परिवर्तन का खतरा होता है|journal=Theoretical Population Biology|volume=93|pages=38–51|doi=10.1016/j.tpb.2014.01.004|issn=1096-0325|pmid=24530892|url=https://zenodo.org/record/895351}}</ref> उदाहरण के लिए, स्ट्राउट एट अल।<ref>{{Cite journal|last1=Strout|first1=Matthew P.|last2=Marcucci|first2=Guido|last3=Bloomfield|first3=Clara D.|last4=Caligiuri|first4=Michael A.|date=1998-03-03|title=ALL1 (MLL) का आंशिक अग्रानुक्रम दोहराव तीव्र माइलॉयड ल्यूकेमिया में अलु-मध्यस्थता वाले समजात पुनर्संयोजन द्वारा लगातार उत्पन्न होता है|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|volume=95|issue=5|pages=2390–2395|issn=0027-8424|pmc=19353|pmid=9482895|doi=10.1073/pnas.95.5.2390|bibcode=1998PNAS...95.2390S|doi-access=free}}</ref> दिखाया गया है कि अग्रानुक्रम दोहराव की घटनाएं, संभवतः सजातीय पुनर्संयोजन के माध्यम से, [[सूक्ष्म अधिश्वेत रक्तता|तीव्र मायलोइड ल्यूकेमिया]] से जुड़ी हुई हैं। एएलएल 1 (एमएलएल ) जीन का आंशिक दोहराव आनुवंशिक दोष है जो कि तीव्र माइलॉयड ल्यूकेमिया वाले रोगियों में पाया गया है।
+संपूर्ण जीनोम द्विगुणन मानव जीनोम में ट्यूमर उत्पन्न करने वाले कुछ जीनों के बने रहने का प्रमुख कारण हो सकता है।<ref>{{Cite journal|last1=Malaguti|first1=Giulia|last2=Singh|first2=Param Priya|last3=Isambert|first3=Hervé|date=2014-05-01|title=जीन डुप्लिकेट के प्रतिधारण पर प्रमुख हानिकारक उत्परिवर्तन का खतरा होता है|journal=Theoretical Population Biology|volume=93|pages=38–51|doi=10.1016/j.tpb.2014.01.004|issn=1096-0325|pmid=24530892|url=https://zenodo.org/record/895351}}</ref> उदाहरण के लिए, स्ट्राउट एट अल।<ref>{{Cite journal|last1=Strout|first1=Matthew P.|last2=Marcucci|first2=Guido|last3=Bloomfield|first3=Clara D.|last4=Caligiuri|first4=Michael A.|date=1998-03-03|title=ALL1 (MLL) का आंशिक अग्रानुक्रम दोहराव तीव्र माइलॉयड ल्यूकेमिया में अलु-मध्यस्थता वाले समजात पुनर्संयोजन द्वारा लगातार उत्पन्न होता है|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|volume=95|issue=5|pages=2390–2395|issn=0027-8424|pmc=19353|pmid=9482895|doi=10.1073/pnas.95.5.2390|bibcode=1998PNAS...95.2390S|doi-access=free}}</ref> दिखाया गया है कि अग्रानुक्रम द्विगुणन की घटनाएं, संभवतः सजातीय पुनर्संयोजन के माध्यम से, [[सूक्ष्म अधिश्वेत रक्तता|तीव्र मायलोइड ल्यूकेमिया]] से जुड़ी हुई हैं। एएलएल 1 (एमएलएल ) जीन का आंशिक द्विगुणन आनुवंशिक दोष है जो कि तीव्र माइलॉयड ल्यूकेमिया वाले रोगियों में पाया गया है।
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Revision as of 10:14, 8 August 2023

Contents

निरर्थक जीन की उत्पत्ति और विकास

कार्यात्मक विचलन

ट्रांसपोज़ेबल अवयव

जीन रखरखाव परिकल्पना

अनुसंधान

जीन वर्ग और फाइलोजेनी

निरर्थक जीनों का पता लगाना और उनका लक्षण वर्णन करना

स्तन कैंसर स्वभाव जीन

ट्रिटिसिया घास में रोगज़नक़ प्रतिरोध

मानव निरर्थक जीन

घ्राण रिसेप्टर्स

रोग

संदर्भ

अग्रिम पठन

Navigation

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निरर्थक जीन की उत्पत्ति और विकास

कार्यात्मक विचलन

ट्रांसपोज़ेबल अवयव

जीन रखरखाव परिकल्पना

अनुसंधान

जीन वर्ग और फाइलोजेनी

निरर्थक जीनों का पता लगाना और उनका लक्षण वर्णन करना

स्तन कैंसर स्वभाव जीन

ट्रिटिसिया घास में रोगज़नक़ प्रतिरोध

मानव निरर्थक जीन

घ्राण रिसेप्टर्स

रोग

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