एफ़िनिटी क्रोमेटोग्राफ़ी: Difference between revisions
m (added Category:Vigyan Ready using HotCat) |
No edit summary |
||
| (One intermediate revision by one other user not shown) | |||
| Line 161: | Line 161: | ||
[[Category:Articles with hatnote templates targeting a nonexistent page|Affinity Chromatography]] | [[Category:Articles with hatnote templates targeting a nonexistent page|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category:CS1]] | [[Category:CS1|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category:CS1 British English-language sources (en-gb)]] | |||
[[Category:CS1 English-language sources (en)]] | |||
[[Category:Created On 09/03/2023|Affinity Chromatography]] | [[Category:Created On 09/03/2023|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category:Lua-based templates|Affinity Chromatography]] | |||
[[Category:Machine Translated Page|Affinity Chromatography]] | [[Category:Machine Translated Page|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category:Pages with reference errors]] | [[Category:Pages with reference errors|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category:Pages with script errors|Affinity Chromatography]] | [[Category:Pages with script errors|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category:Short description with empty Wikidata description|Affinity Chromatography]] | [[Category:Short description with empty Wikidata description|Affinity Chromatography]] | ||
| Line 170: | Line 173: | ||
[[Category:Templates Vigyan Ready|Affinity Chromatography]] | [[Category:Templates Vigyan Ready|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category:Templates that add a tracking category|Affinity Chromatography]] | [[Category:Templates that add a tracking category|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category: | [[Category:Templates that generate short descriptions|Affinity Chromatography]] | ||
[[Category:Templates using TemplateData|Affinity Chromatography]] | |||
Latest revision as of 09:47, 24 April 2023
एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी जैविक अणु पदार्थ के बीच अत्यधिक विशिष्ट आणविक बाध्यकारी वार्तालाप के आधार पर, जैविक अणु को मिश्रण से अलग करने की विधि है। इस प्रकार विशिष्ट रूप से बाध्यकारी वार्तालाप के आधार पर यह स्वार्थ जैविक अणुओं पर निर्भर करती है। प्रतिजन और एंटीबॉडी, एंजाइम और सब्सट्रेट (जैव रसायन), जैव रसायन संग्राहक और लिगैंड (जैव रसायन), प्रोटीन और न्यूक्लिक अम्ल के रूप में रहते हैं।[1] इस कारण विभिन्न जैव अणुओं के विरोध के कारण बाध्यकारी अंतःक्रियाओं का यहाँ पर अधिकांश रूप से उपयोग किया जाता है। इस प्रकार एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी इसकी उच्च चयनात्मकता (क्रोमैटोग्राफी) और विरोध के संकल्प (क्रोमैटोग्राफी),[2][3] अन्य क्रोमैटोग्राफिक विधियों की तुलना के लिए उपयोगी है।
सिद्धांत
एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी में रुचि के विश्लेषण सामान्यतः मोबाइल चरण में भंग और बाध्यकारी भागीदार लिगैंड स्थिर चरण (रसायन विज्ञान) के बीच विशिष्ट बाध्यकारी वार्तालाप का लाभ होता है। विशिष्ट एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी प्रयोग में लिगैंड ठोस, अघुलनशील आव्यूह से जुड़ा होता है। सामान्यतः बहुलक जैसे कि अगारोज पोलिया क्रायलामाइड - प्रतिक्रियाशील कार्यात्मक समूह को प्रस्तुत करने के लिए रासायनिक रूप से संशोधित किया जाता है जिसके साथ लिगैंड प्रतिक्रिया कर सकता है, जिससे स्थिर सहसंयोजक बंधन बनते हैं।[4] इस कारण स्थिर चरण को पहले स्तंभ में लोड किया जाता है जिसमें मोबाइल चरण प्रस्तुत किया जाता है। अणु जो लिगैंड से बंधते हैं, स्थिर चरण से जुड़े रहेंगे। उसके बाद स्थिर चरण के साथ उनकी कमजोर अंतःक्रियाओं को बाधित करके इन जैव अणुओं को हटाने के लिए धो बफर लगाया जाता है, जबकि स्वार्थ के जैव अणुओं के बाध्य रहते हैं। इस प्रकार लक्ष्य के अनुसार जैविक अणुओं को तथाकथित संदर्भ के अनुसार बफर लगाने से पृथक किया जा सकता है, जो बाध्य लक्ष्य जैविक अणु और लिगैंड के बीच वार्तालाप को बाधित करता है। लक्ष्य अणु इस प्रकार इल्यूटिंग समाधान में पुनर्प्राप्त किया जाता है।[5]
एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी को आणविक भार, प्रभार, हाइड्रोफोबिसिटी रुचि के विश्लेषण के अन्य भौतिक गुणों की आवश्यकता नहीं होती है, चूंकि इसके बाध्यकारी गुणों का ज्ञान पृथक्करण प्रोटोकॉल के डिजाइन में उपयोगी होता है।[5] एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी प्रक्रियाओं में सामान्यतः उपयोग किए जाने वाले बाध्यकारी परस्पर क्रिया के प्रकार नीचे दी गई सूची में संक्षेप में दिए गए हैं।
| क्रमांक | लिगैंड के प्रकार | लक्ष्य अणु |
|---|---|---|
| 1 | सब्सट्रेट एनालॉग | एंजाइमों |
| 2 | एंटीबॉडी | एंटीजन |
| 3 | लेक्टिन | बहुशर्करा |
| 4 | न्यूक्लिक अम्ल | पूरक आधार अनुक्रम |
| 5 | हार्मोन | संग्राहक |
| 6 | एविडिन | बायोटिन/बायोटिन-संयुग्मित अणु |
| 7 | शांतोडुलिन | शांतोडुलिन बाध्यकारी साथी |
| 8 | ग्लूटेथिओन | जीएसटी संलयन प्रोटीन |
| 9 | प्रोटीन ए या प्रोटीन जी | इम्युनोग्लोबुलिन |
| 10 | निकेल-एनटीए | पॉलीहिस्टिडाइन संलयन प्रोटीन |
बैच और स्तंभ सेटअप
स्तंभ क्रोमैटोग्राफी द्वारा ठोस चरण के लिए बाध्यकारी प्राप्त किया जा सकता है जिससे ठोस माध्यम को स्तंभ पर संकुल किया जाता है। प्रारंभिक मिश्रण स्तंभ के माध्यम से व्यवस्थित होने की अनुमति देता है, स्तंभ के माध्यम से धो बफर चलाया जाता है और बाद में स्तंभ पर लागू होने वाला संदर्भ बफर और एकत्र किया जाता है। इस कारण सामान्यतः वातावरण के दबाव में उपयोग किया जाता हैं। वैकल्पिक रूप से बैच उपचार का उपयोग करके बाध्यकारी प्राप्त किया जा सकता है, उदाहरण के लिए, बर्तन में ठोस चरण में प्रारंभिक मिश्रण जोड़कर, मिश्रण करना, ठोस चरण को अलग करना, तरल चरण को हटाना, धुलाई, पुन: सेंट्रीफ्यूगिंग, संदर्भ बफर को जोड़ना, फिर से केन्द्रापसारकऔर एल्यूट को हटाना आवश्यक होता हैं।
कभी-कभी संकर विधि का उपयोग किया जाता है जैसे कि बंधन बैच विधि द्वारा किया जाता है। किन्तु लक्ष्य अणु के साथ ठोस चरण स्तंभ पर संकुल किया जाता है और स्तंभ पर धुलाई और क्षालन किया जाता है।
एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी में प्रयुक्त लिगेंड कार्बनिक और अकार्बनिक दोनों स्रोतों से प्राप्त किए जाते हैं। जैविक स्रोतों के उदाहरण सीरम प्रोटीन, लेक्टिन और एंटीबॉडी हैं। अकार्बनिक स्रोत मोरोनिक अम्ल, धातु कीलेट और ट्राइज़ीन डाई हैं।[7] इस प्रकार तीसरी विधि, विस्तारित बिस्तर अवशोषण, जो ऊपर उल्लिखित दो विधियों के लाभों को जोड़ती है और विकसित भी किया गया है। ठोस चरण के कणों को स्तंभ में रखा जाता है, जहां तरल चरण को नीचे से पंप किया जाता है और ऊपर से बाहर निकल जाता है। कणों का गुरुत्वाकर्षण सुनिश्चित करता है कि ठोस चरण तरल चरण के साथ स्तंभ से बाहर नहीं निकलता है।
एफ़िनिटी स्तंभ नमक सांद्रता, पीएच, पीआई, प्रभार और आयनिक शक्ति को सीधे बदलकर स्वार्थ के कणों को हल करने के लिए ढाल के माध्यम से क्षालन हो सकता है।
हाल ही में, श्रृंखला में से अधिक स्तंभों को नियोजित करने वाले सेटअप विकसित किए गए हैं। एकल स्तंभ सेटअप की तुलना में लाभ यह है कि राल सामग्री को पूरी तरह से लोड किया जा सकता है। क्योंकि अ-बाध्यकारी उत्पाद को सीधे ताजा स्तंभ सामग्री के साथ लगातार स्तंभ पर पारित किया जाता है। इन क्रोमैटोग्राफिक प्रक्रियाओं को आवधिक प्रति-वर्तमान क्रोमैटोग्राफी (पीसीसी) के रूप में जाना जाता है। उत्पादित उत्पाद की प्रति राल लागत इस प्रकार अधिक कम हो सकती है। चूँकि स्तंभ सदैव दूसरे स्तंभ के लोड होने के पर्यंत विकसित और पुनर्जीवित किया जा सकता है, पहले से ही दो स्तंभ लाभ का पूरा उपयोग करने के लिए पर्याप्त हैं।[8] अतिरिक्त स्तंभ अतिरिक्त उपकरणों और राल लागतों की कीमत पर क्षालन और पुनर्जनन समय के लिए अतिरिक्त लचीलापन दे सकते हैं।
विशिष्ट उपयोग
एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी का उपयोग न्यूक्लिक अम्ल शुद्धि, प्रोटीन शुद्धि सहित कई अनुप्रयोगों में किया जा सकता है[9] सेल मुक्त अर्क, रक्त से शुद्धिकरण करता है।
एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी का उपयोग करके कोई प्रोटीन अलग कर सकता है, जो प्रोटीन से निश्चित टुकड़े को बांधता है, जो उस विशिष्ट टुकड़े को बांधता नहीं है।[10] क्योंकि शुद्धिकरण की यह प्रविधि आवश्यक प्रोटीन के जैविक गुणों पर निर्भर करती है, यह उपयोगी प्रविधि है और प्रोटीन को चरण में कई गुना शुद्ध किया जा सकता है।[11]
विभिन्न एफ़िनिटी मीडिया
विभिन्न प्रकार के संभावित उपयोगों के लिए कई अलग-अलग एफ़िनिटी मीडिया उपस्तिथ हैं।[12][9][13] संक्षेप में वे सामान्यीकृत सक्रिय हैं, जो कार्यात्मक स्पेसर के रूप में कार्य करते हैं।जो आव्यूह का समर्थन करते हैं और जहरीले अभिकर्मकों को संभालने को समाप्त करते हैं।
अमीनो अम्ल मीडिया का उपयोग विभिन्न प्रकार के सीरम प्रोटीन, प्रोटीन, पेप्टाइड्स और एंजाइमों के साथ-साथ आरआरएनए और डीएस डीएनए के साथ किया जाता है। एविडिन बायोटिन मीडिया का उपयोग उनके डेरिवेटिव की शुद्धिकरण प्रक्रिया में किया जाता है।
कार्बोहाइड्रेट बॉन्डिंग का उपयोग अधिकांशतः ग्लाइकोप्रोटीन किसी अन्य कार्बोहाइड्रेट युक्त पदार्थ के साथ किया जाता है। कार्बोहाइड्रेट का उपयोग लेक्टिन, ग्लाइकोप्रोटीन या किसी अन्य कार्बोहाइड्रेट मेटाबोलाइट प्रोटीन के साथ किया जाता है। डाई-लिगैंड एफिनिटी क्रोमैटोग्राफी विशिष्ट नहीं है किन्तु जैविक सबस्ट्रेट्स और प्रोटीन की नकल करती है। ग्लूटाथियोन जीएसटी टैग किए गए पुनः संयोजक प्रोटीन को अलग करने के लिए उपयोगी है। हेपरिन सामान्यीकृत एफ़िनिटी लिगैंड है और यह न्यूक्लिक अम्ल एंजाइम और लाइपेस के साथ प्लाज्मा जमावट प्रोटीन को अलग करने के लिए सबसे उपयोगी है।
हाइड्रोफोबिक परस्पर क्रिया मीडिया का उपयोग सामान्यतः मुक्त कार्बोक्सिल समूहों और प्रोटीनों को लक्षित करने के लिए किया जाता है।
इम्यूनोफिनिटी मीडिया नीचे विस्तृत अलग करने के लिए एंटीजन और एंटीबॉडी की उच्च विशिष्टता का उपयोग करता है। स्थिर धातु एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी नीचे विस्तृत है और अलग करने के लिए धातु आयनों और प्रोटीन सामान्यतः विशेष रूप से टैग के बीच वार्तालाप का उपयोग करती है। न्यूक्लियोटाइड कोएंजाइम जो डिहाइड्रोजनेज, किनेसेस और ट्रांज़ैमिनेज़ को अलग करने का कार्य करता है।
न्यूक्लिक अम्ल एमआरएनए, डीएनए, आरआरएनए और अन्य न्यूक्लिक अम्ल ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स को फंसाने का कार्य करते हैं। इम्यूनोग्लोबुलिन को शुद्ध करने के लिए प्रोटीन ए/जी विधि का उपयोग किया जाता है।
प्रस्तुतिकरण मीडिया को विशिष्ट वर्ग प्रकार के प्रोटीन सह एंजाइम के लिए डिज़ाइन किया गया है। इस प्रकार का मीडिया केवल विशिष्ट प्रोटीन, कोएंजाइम को अलग करने का कार्य करता हैं।
इम्यूनोफिनिटी
प्रक्रिया के लिए अन्य उपयोग रक्त सीरम से एंटीबॉडी की एफ़िनिटी शुद्धि है। यदि सीरम में विशिष्ट एंटीजन के विरुद्ध एंटीबॉडी होने के लिए जाना जाता है। उदाहरण के लिए यदि सीरम संबंधित एंटीजन के विरुद्ध प्रतिरक्षित जीव से आता है, तो इसका उपयोग उस एंटीजन की एफ़िनिटी शुद्धि के लिए किया जा सकता है। इसे इम्यूनोफिनिटी क्रोमैटोग्राफी के रूप में भी जाना जाता है। उदाहरण के लिए, यदि किसी जीव को जीएसटी-संलयन प्रोटीन के विरुद्ध प्रतिरक्षित किया जाता है, तो यह संलयन-प्रोटीन के विरुद्ध एंटीबॉडी का उत्पादन करेगा और संभवतः जीएसटी टैग के विरुद्ध भी एंटीबॉडी का उत्पादन करता हैं। फिर प्रोटीन को सहसंयोजक के रूप में ठोस समर्थन जैसे अगारोज के साथ जोड़ा जा सकता है और प्रतिरक्षा सीरम से एंटीबॉडी के शुद्धिकरण में एफ़िनिटी लिगैंड के रूप में उपयोग किया जाता है।
संपूर्णता के लिए जीएसटी प्रोटीन और जीएसटी-संलयन प्रोटीन प्रत्येक को अलग-अलग युग्मित किया जा सकता है। सीरम को प्रारंभ में जीएसटी एफ़िनिटी आव्यूह से छांदना करने की अनुमति है। यह संलयन प्रोटीन के जीएसटी भाग के विरुद्ध एंटीबॉडी को हटा देता हैं। इस प्रकार सीरम को फिर ठोस समर्थन से अलग किया जाता है और जीएसटी-संलयन प्रोटीन आव्यूह से जुड़ने की अनुमति दी जाती है। यह किसी भी एंटीबॉडी को ठोस समर्थन पर अधिकार में लेना की अनुमति देता है, जो एंटीजन को पहचानता है। स्वार्थ के एंटीबॉडी का सावधानी अधिकांशतः कम पीएच बफर जैसे ग्लाइसिन पीएच 2.8 का उपयोग करके प्राप्त किया जाता है। कम पीएच संदर्भ बफर को प्रभावहीन करने और एंटीबॉडी की गतिविधि के किसी भी गिरावट को रोकने के लिए एल्यूएट को तटस्थ ट्रिस या फॉस्फेट बफर में एकत्र किया जाता है। यह अच्छा उदाहरण है क्योंकि प्रारंभिक जीएसटी-संलयन प्रोटीन को शुद्ध करने के लिए एफ़िनिटी शुद्धि का उपयोग किया जाता है, सीरम से अवांछनीय एंटी-जीएसटी एंटीबॉडी को हटाने और लक्ष्य एंटीबॉडी को शुद्ध करने के लिए है।
मोनोक्लोनल एंटीबॉडी का चयन प्रोटीन को बड़ी विशिष्टता के साथ बाँधने के लिए भी किया जा सकता है, जहाँ प्रोटीन अधिक कोमल परिस्थितियों में जारी होता है। यह भविष्य में आगे के शोध के लिए उपयोगी हो सकता है।[14]पेप्टाइड प्रतिजनों के विरुद्ध उत्पन्न एंटीबॉडी को शुद्ध करने के लिए अधिकांशतः सरलीकृत रणनीति का उपयोग किया जाता है। जब पेप्टाइड प्रतिजनों को कृत्रिम रूप से उत्पादित किया जाता है, तो पेप्टाइड के एन- या सी-टर्मिनस में टर्मिनल सिस्टीन अवशेष जोड़ा जाता है। इस सिस्टीन अवशेषों में सल्फहाइड्रील कार्यात्मक समूह होता है जो पेप्टाइड को वाहक प्रोटीन जैसे कीहोल लिम्पेट हेमोसायनिन (केएलएच) के साथ सरलता से संयुग्मित होने की अनुमति देता है। उसी सिस्टीन युक्त पेप्टाइड को सिस्टीन अवशेषों के माध्यम से अगारोज राल पर भी स्थिर किया जाता है और फिर एंटीबॉडी को शुद्ध करने के लिए उपयोग किया जाता है।
बैक्टीरिया से प्राप्त इम्युनोग्लोबुलिन-विशिष्ट प्रोटीन ए या प्रोटीन जी पर आधारित एफिनिटी क्रोमैटोग्राफी का उपयोग करके अधिकांश मोनोक्लोनल ऐंटीबॉडी को शुद्ध किया गया है।[15] ईवीएस की सतह पर पाए जाने वाले टेट्रास्पैनिन और इंटीग्रिन को लक्षित करके मानव रक्त प्लाज्मा से बाह्य पुटिकाओं जैसे, एक्सोसोम और एक्सोमर्स को पकड़ने के लिए मोनोलिथिक स्तंभ पर स्थिर मोनोक्लोनल एंटीबॉडी के साथ इम्यूनोफिनिटी क्रोमैटोग्राफी का सफलतापूर्वक उपयोग किया गया है।[16][17]इम्यूनोफिनिटी क्रोमैटोग्राफी भी इम्यूनोक्रोमैटोग्राफिक टेस्ट (आईसीटी) स्ट्रिप्स का आधार है, जो रोगी देखभाल में निदान का तेज़ साधन प्रदान करता है। आईसीटी का उपयोग करते हुए, तकनीशियन किसी प्रयोगशाला की आवश्यकता के अतिरिक्त रोगी के बिस्तर के पास निर्धारण कर सकता है।[18] आईसीटी पहचान संक्रमण उत्पन्न करने वाले सूक्ष्म जीव के लिए अत्यधिक विशिष्ट है।[19]
स्थिर धातु आयन एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी
इमोबिलाइज्ड धातु आयन एफिनिटी क्रोमैटोग्राफी (आईमैक) धातुओं के लिए अमीनो अम्ल, विशेष रूप से हिस्टिडाइन के विशिष्ट समन्वय सहसंयोजक बंधन पर आधारित है। यह प्रविधि हिस्टिडाइन युक्त प्रोटीन या पेप्टाइड्स, लोहा, जस्ता या गैलियम की शुद्धि के लिए कोबाल्ट, निकल, तांबे जैसे स्थिर धातु आयनों वाले स्तंभ में धातु आयनों के लिए एफ़िनिटी के साथ प्रोटीन को बनाए रखने की अनुमति देकर कार्य करती है। फॉस्फोराइलेटेड प्रोटीन या पेप्टाइड्स के लिए प्राकृतिक रूप से पाए जाने वाले कई प्रोटीनों में धातु आयनों के लिए कोई बंधन नहीं होता है, इसलिए संबंधित जीन में ऐसे प्रोटीन टैग को प्रस्तुत करने के लिए पुनः संयोजक डीएनए प्रविधि का उपयोग किया जा सकता है। रुचि के प्रोटीन को भ्रम करने के लिए उपयोग की जाने वाली विधियों में पीएच को बदलना, इमीदाजोल जैसे प्रतिस्पर्धी अणु को जोड़ना सम्मलित है।[20][21]
पुनः संयोजक प्रोटीन
संभवतः एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी का अत्यन्त साधारण उपयोग पुनः संयोजक प्रोटीन की शुद्धि के लिए है। ज्ञात एफ़िनिटी वाले प्रोटीनों को उनके शुद्धिकरण में सहायता के लिए प्रोटीन टैग किया जाता है। प्रोटीन को आनुवंशिक रूप से संशोधित किया गया हो सकता है जिससे कि इसे एफ़िनिटी बाइंडिंग के लिए चुना जा सके। इसे संलयन प्रोटीन के रूप में जाना जाता है। प्रोटीन टैग में हेक्साहिस्टिडाइन हिस्टिडाइन, ग्लूटेथिओन -एस-ट्रांसफरेज़ (जीएसटी) और माल्टोज़ बाइंडिंग प्रोटीन (एमबीपी) सम्मलित हैं। हिस्टडीन टैग में निकल, कोबाल्ट, जस्ता, तांबा और लोहे के आयनों के लिए समानता है, जो स्थिर चरण में सम्मलित चेलेटर के साथ समन्वित सहसंयोजक बांड बनाकर स्थिर हो गए हैं। क्षालन के लिए, धातु आयन लिगैंड के रूप में कार्य करने में सक्षम यौगिक की अतिरिक्त मात्रा, जैसे कि इमिडाज़ोल, का उपयोग किया जाता है। जीएसटी में ग्लूटाथियोन के लिए आकर्षण है, जो व्यावसायिक रूप से ग्लूटाथियोन एग्रोज के रूप में स्थिर रूप से उपलब्ध है। संदर्भ के पर्यन्त, टैग किए गए प्रोटीन को विस्थापित करने के लिए अतिरिक्त ग्लूटाथियोन का उपयोग किया जाता है।
लेक्टिंस
लेक्टिन एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी का रूप है जहां लेक्टिन का उपयोग मॉडेल के भीतर घटकों को अलग करने के लिए किया जाता है। लेक्टिंस, जैसे कि कोंकनावेलिन ए प्रोटीन हैं जो विशिष्ट अल्फा-डी-मेननोज और अल्फा-डी-ग्लूकोज कार्बोहाइड्रेट अणुओं को बांध सकते हैं। कुछ सामान्य कार्बोहाइड्रेट अणु जिनका उपयोग लेक्टिन एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी में किया जाता है, कॉन ए-सेफ़रोज़ और डब्ल्यूजीए-एग्रोज़ हैं।[22] लेक्टिन का अन्य उदाहरण गेहूं रोगाणु एग्लूटीनिन है जो डी-एन-एसिटाइल-ग्लूकोसामाइन को बांधता है।[23] अत्यन्त साधारण अनुप्रयोग ग्लाइकोप्रोटीन को अ-ग्लाइकोसिलेटेड प्रोटीन से अलग करना है और ग्लाइकोफ़ॉर्म को दूसरे ग्लाइकोफ़ॉर्म से अलग करना है।[24] चूंकि लेक्टिन एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी करने के कई विधियाँ हैं, लक्ष्य वांछित प्रोटीन का चीनी लिगैंड निकालना है।[22]
विशेषता
एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी के लिए अन्य उपयोग जेल आव्यूह का उपयोग करके विशिष्ट प्रोटीन का शुद्धिकरण है जो विशिष्ट प्रोटीन के लिए अद्वितीय है। उदाहरण के लिए, ई. कोलाई β-गैलेक्टोसिडेज़ का शुद्धिकरण एफ़िनिटी आव्यूह के रूप में पी-एमिनोबेनीएल-1-थियो-बीटा-डी-एलेक्टोप्रानोसी l अगारोज का उपयोग करके एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी द्वारा पूरा किया जाता है। पी-एमिनोबेनीएल-1-थियो-बीटा-डी-एलेक्टोप्रानोसी द्वारा अगारोज का उपयोग एफ़िनिटी आव्यूह के रूप में किया जाता है क्योंकि इसमें गैलेक्टोपाइरानोसिल समूह होता है, जो ई. कोलाई β-गैलेक्टोसिडेज़ के लिए अच्छे सब्सट्रेट एनालॉग के रूप में कार्य करता है। यह संपत्ति एंजाइम को एफ़िनिटी आव्यूह के स्थिर चरण से बाँधने की अनुमति देती है और स्तंभ में नमक की बढ़ती सांद्रता जोड़कर β-गैलेक्टोसिडेस को अलग किया जाता है।[25]
क्षारीय फॉस्फेट
ई. कोलाई से क्षारीय फॉस्फेट को डीईएई-सेल्यूलोज आव्यूह का उपयोग करके शुद्ध किया जा सकता है। ए. फॉस्फेट में हल्का ऋणात्मक आवेश होता है, जो इसे आव्यूह में धनात्मक रूप से आवेशित अमाइन समूहों को कमजोर रूप से बाँधने की अनुमति देता है। फिर उच्च नमक सांद्रता वाले बफर को जोड़कर एंजाइम को बाहर निकाला जा सकता है।[26]
बोरोनेट एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी
बोरोनेट एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी में ग्लाइकोप्रोटीन की मात्रा को कम करने और मापने के लिए बोरोनिक अम्ल बोरोनेट का उपयोग होता है। ग्लाइकेटेड हीमोग्लोबिन माप के माध्यम से मधुमेह रोगियों के दीर्घकालिक मूल्यांकन के निर्धारण में उपयोग के लिए नैदानिक अनुकूलन ने इस प्रकार की क्रोमैटोग्राफी को लागू किया है।[23]
सीरम एल्बुमिन शुद्धि
अन्नसार और मैक्रोग्लोबुलिन संदूषण की एफ़िनिटी शुद्धि अतिरिक्त अन्नसार को हटाने में सहायक है और α2-मैक्रोग्लोबुलिन संदूषण, मास स्पेक्ट्रोमेट्री करते समय किया जाता हैं। सीरम अन्नसार की एफ़िनिटी शुद्धि में, सीरम प्रोटीन को इकट्ठा करने और आकर्षित करने के लिए उपयोग की जाने वाली स्थिर सिबैक्रोन ब्लू-सेफ़रोज़ हो सकती है। इसके कारण सीरम प्रोटीन को थियोसाइनेट (एससीएन) युक्त बफर के साथ सोखने वाले पदार्थ से निकाला जा सकता है। [27]
कमजोर एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी
कमजोर एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी[28] (डब्ल्यूएसी) औषध विकास में एफ़िनिटी स्क्रीनिंग के लिए एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी प्रविधि है।[29][30] डब्ल्यूएसी एफ़िनिटी-आधारित क्रोमैटोग्राफी प्रविधि है जो रासायनिक यौगिक को उनके अलग-अलग कमजोर बंधुताओं के आधार पर स्थिर लक्ष्य से अलग करती है। किसी मिश्रण का लक्ष्य के प्रति जितना अधिक जुड़ाव होता है, वह उतनी ही देर तक वह पृथक्करण इकाई में रहता है और इसे लंबे अवधारण समय के रूप में व्यक्त किया जाता है। विश्लेषण किए गए यौगिकों के प्राप्त प्रतिधारण समय को संसाधित करके एफ़िनिटी माप और एफ़िनिटी की रैंकिंग प्राप्त की जा सकती है। एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी केमो प्रोटिओमिक्स आधारित दवा लक्ष्य पहचान में उपयोग की जाने वाली तकनीकों के बड़े सूट का भाग है।
डब्ल्यूएसी प्रविधि को कई अलग-अलग प्रोटीन लक्ष्यों - प्रोटीज, काइनेज, चैपरोन (प्रोटीन) और प्रोटीन-प्रोटीन इंटरेक्शन (पीपीआई) लक्ष्य के विरुद्ध प्रदर्शित किया जाता है। खंड आधारित स्क्रीनिंग के लिए स्थापित विधियों की तुलना में डब्ल्यूएसी को अधिक प्रभावी दिखाया गया है।[30]
इतिहास
एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी की कल्पना की गई थी और सबसे पहले इसे पेड्रो क्वाट्रेकास और मीर विल्चेक द्वारा विकसित किया गया था।[31][32]
संदर्भ
- ↑ Aizpurua-Olaizola, Oier; Sastre Torano, Javier; Pukin, Aliaksei; Fu, Ou; Boons, Geert Jan; de Jong, Gerhardus J.; Pieters, Roland J. (January 2018). "कार्बोहाइड्रेट आधारित हैजा विष अवरोधकों की बाध्यकारी आत्मीयता के आकलन के लिए आत्मीयता केशिका वैद्युतकणसंचलन". Electrophoresis (in English). 39 (2): 344–347. doi:10.1002/elps.201700207. PMID 28905402. S2CID 33657660.
- ↑ Ninfa, Alexander J.; Ballou, David P.; Benore, Marilee (2009). जैव रसायन और जैव प्रौद्योगिकी के लिए मौलिक प्रयोगशाला दृष्टिकोण (2nd ed.). Wiley. p. 133. ISBN 9780470087664.
- ↑ ""एफ़िनिटी क्रोमैटोग्राफी का परिचय"". bio-rad.com. Bio-Rad. 2020-09-14. Retrieved 2020-09-14.
- ↑ Zachariou, Michael, ed. (2008). Affinity Chromatography: Methods and Protocols (2nd ed.). Totowa, N.J.: Humana Press. ISBN 9781588296597.
- ↑ 5.0 5.1 Bonner, Philip L.R. (2007). प्रोटीन शोधन (2nd ed.). Totowa, N.J.: Taylor & Francis Group. ISBN 9780415385114.
- ↑ Kumar, Pranav (2018). Biophysics and Molecular Biology. New Delhi: Pathfinder Publication. p. 11. ISBN 978-93-80473-15-4.
- ↑ Fanali, Salvatore; Haddad, Paul R.; Poole, Colin F.; Schoenmakers, Peter; Lloyd, David, eds. (2013). Liquid Chromatography: Applications. Handbooks in Separation Science. Saint Louis: Elsevier. p. 3. ISBN 9780124158061.
- ↑ Baur, Daniel; Angarita, Monica; Müller-Späth, Thomas; Steinebach, Fabian; Morbidelli, Massimo (2016). "इष्टतम डिजाइन द्वारा बैच और निरंतर मल्टी-कॉलम प्रोटीन ए कैप्चर प्रक्रियाओं की तुलना". Biotechnology Journal. 11 (7): 920–931. doi:10.1002/biot.201500481. hdl:11311/1013726. PMID 26992151.
- ↑ 9.0 9.1 "Cube Biotech". Cube Biotech (in British English). Retrieved 2019-09-11.
- ↑ Ahern, Kevin (February 12, 2015). जैव रसायन मुक्त और आसान. DaVinci Press; 3rd Edition. p. 822.
- ↑ Grisham, Charles M. (2013-01-01). जीव रसायन. Brooks/Cole, Cengage Learning. ISBN 978-1133106296. OCLC 777722371.
- ↑ Mahmoudi Gomari, Mohammad; Saraygord-Afshari, Neda; Farsimadan, Marziye; Rostami, Neda; Aghamiri, Shahin; Farajollahi, Mohammad M. (1 December 2020). "Opportunities and challenges of the tag-assisted protein purification techniques: Applications in the pharmaceutical industry". Biotechnology Advances (in English). 45: 107653. doi:10.1016/j.biotechadv.2020.107653. ISSN 0734-9750. PMID 33157154. S2CID 226276355.
- ↑ "Affinity Chromatography".
- ↑ Thompson, Nancy E.; Foley, Katherine M.; Stalder, Elizabeth S.; Burgess, Richard R. (2009). Guide to Protein Purification, 2nd Edition. Methods in Enzymology (in English). Vol. 463. pp. 475–494. doi:10.1016/s0076-6879(09)63028-7. ISBN 9780123745361. PMID 19892188.
- ↑ Uhlén M (2008). "जीवन विज्ञान में एक उपकरण के रूप में आत्मीयता।". BioTechniques. 44 (5): 649–54. doi:10.2144/000112803. PMID 18474040.
- ↑ Multia E, Tear CJ, Palviainen M, et al. (December 2019). "Fast isolation of highly specific population of platelet-derived extracellular vesicles from blood plasma by affinity monolithic column, immobilized with anti-human CD61 antibody". Analytica Chimica Acta. 1091: 160–168. doi:10.1016/j.aca.2019.09.022. hdl:10138/321264. PMID 31679569. S2CID 203147714.
- ↑ Multia E, Liangsupree T, Jussila M, et al. (September 2020). "Automated On-Line Isolation and Fractionation System for Nanosized Biomacromolecules from Human Plasma". Analytical Chemistry. 92 (19): 13058–13065. doi:10.1021/acs.analchem.0c01986. PMC 7586295. PMID 32893620.
- ↑ Luppa, Peter (2018). Point-of-care testing: principles and clinical applications. Berlin, Germany: Springer. pp. 71–72. ISBN 9783662544976.
- ↑ J. D. Muller; C. R. Wilks; K. J. O'Riley; R. J. Condron; R. Bull; A. Mateczun (2004). "Specificity of an immunochromatographic test for anthrax". Australian Veterinary Journal. 82 (4): 220–222. doi:10.1111/j.1751-0813.2004.tb12682.x. PMID 15149073.
- ↑ Singh, Naveen K.; DSouza, Roy N.; Bibi, Noor S.; Fernández-Lahore, Marcelo (2015). "Chapter 16 Direct Capture of His6-Tagged Proteins Using Megaporous Cryogels Developed for Metal-Ion एफ़िनिटी क्रोमेटोग्राफ़ी". In Reichelt, S. (ed.). एफ़िनिटी क्रोमेटोग्राफ़ी. Methods in Molecular Biology (in English). Vol. 1286. New York: Humana Press. pp. 201–212. doi:10.1007/978-1-4939-2447-9_16. ISBN 978-1-4939-2447-9. PMID 25749956.
- ↑ Gaberc-Porekar, Vladka K.; Menart, Viktor (2001). "इमोबिलाइज्ड-मेटल एफिनिटी क्रोमैटोग्राफी के परिप्रेक्ष्य". J Biochem Biophys Methods. 49 (1–3): 335–360. doi:10.1016/S0165-022X(01)00207-X. PMID 11694288.
- ↑ 22.0 22.1 Freeze, H. H. (May 2001). "9". लेक्टिन आत्मीयता क्रोमैटोग्राफी. pp. 9.1.1–9.1.9. doi:10.1002/0471140864.ps0901s00. ISBN 978-0471140863. ISSN 1934-3663. PMID 18429210. S2CID 3197260.
{{cite book}}:|journal=ignored (help) - ↑ 23.0 23.1 Hage, David (May 1999). "Affinity Chromatography: A Review of Clinical Applications" (PDF). Clinical Chemistry. 45 (5): 593–615. doi:10.1093/clinchem/45.5.593. PMID 10222345.
- ↑ "जीई हेल्थकेयर लाइफ साइंसेज, इमोबिलाइज्ड लेक्टिन". Archived from the original on 2012-03-03. Retrieved 2010-11-29.
- ↑ Ninfa, Alexander J.; Ballou, David P.; Benore, Marilee (2006). जैव रसायन और जैव प्रौद्योगिकी के लिए मौलिक प्रयोगशाला दृष्टिकोण (2nd ed.). Wiley. p. 153.
- ↑ Ninfa, Alexander J.; Ballou, David P.; Benore, Marilee (2010). जैव रसायन और जैव प्रौद्योगिकी के लिए मौलिक प्रयोगशाला दृष्टिकोण (2nd ed.). Hoboken, N.J.: John Wiley. p. 240. ISBN 9780470087664. OCLC 420027217.
- ↑ Naval, Javier; Calvo, Miguel; Lampreave, Fermin; Piñeiro, Andrés (1983-01-01). "Affinity chromatography of serum albumin: An illustrative laboratory experiment on biomolecular interactions". Biochemical Education (in English). 11 (1): 5–8. doi:10.1016/0307-4412(83)90004-3. ISSN 1879-1468.
- ↑ Zopf, D.; S. Ohlson (1990). "कमजोर-आत्मीयता क्रोमैटोग्राफी". Nature. 346 (6279): 87–88. Bibcode:1990Natur.346...87Z. doi:10.1038/346087a0. ISSN 0028-0836. S2CID 4306269.
- ↑ Duong-Thi, M. D.; Meiby, E.; Bergström, M.; Fex, T.; Isaksson, R.; Ohlson, S. (2011). "ड्रग डिस्कवरी में फ्रैगमेंट स्क्रीनिंग के लिए एक नए दृष्टिकोण के रूप में कमजोर आत्मीयता क्रोमैटोग्राफी". Analytical Biochemistry. 414 (1): 138–146. doi:10.1016/j.ab.2011.02.022. PMID 21352794.
- ↑ 30.0 30.1 Meiby, E.; Simmonite, H.; Le Strat, L.; Davis, B.; Matassova, N.; Moore, J. D.; Mrosek, M.; Murray, J.; Hubbard, R. E.; Ohlson, S. (2013). "Fragment Screening by Weak Affinity Chromatography: Comparison with Established Techniques for Screening against HSP90". Analytical Chemistry. 85 (14): 6756–6766. doi:10.1021/ac400715t. PMID 23806099.
- ↑ "मीर विल्चेक - वुल्फ फाउंडेशन". Wolf Foundation. 9 December 2018. Retrieved 17 March 2021.
Affinity chromatography is a novel technique which was conceived by Cuatrecasas and Wilchek
- ↑ P Cuatrecasas; M Wilchek; C B Anfinsen (October 1968). "आत्मीयता क्रोमैटोग्राफी द्वारा चयनात्मक एंजाइम शुद्धि". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 61 (2): 636–643. Bibcode:1968PNAS...61..636C. doi:10.1073/pnas.61.2.636. PMC 225207. PMID 4971842.
