जेमटिमोनडोटा: Difference between revisions

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जेमटिमोनडोटा 2003 में स्थापित [[जीवाणु]]ओं का एक समूह है। इस संघ में दो वर्ग हैं जेमटिमोनडोटा और लोंगिमाइक्रोबिया।
'''जेमटिमोनडोटा''' 2003 में स्थापित [[जीवाणु]]ओं का एक समूह है। इस संघ में दो वर्ग हैं '''जेमटिमोनडोटा और लोंगिमाइक्रोबिया'''।


== प्रजातियां ==
== प्रजातियां ==
2003 में सीवेज उपचार प्रणाली में सक्रिय कीचड़ से [[Gemmatimonas aurantiaca|जेमटिमोनडोटा ऑरेंटियाका]]  T-27<sup>टी</sup> प्रकार की प्रजातियों को  अलग किया गया था।<ref>{{cite journal |vauthors=Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K | title = Gemmatimonas aurantiaca gen. नव., सपा. नव।, एक ग्राम-नकारात्मक, एरोबिक, पॉलीफॉस्फेट-जमा करने वाला सूक्ष्म जीव, नए बैक्टीरियल फाइलम जेमटिमोनडेट्स फाइल का पहला सुसंस्कृत प्रतिनिधि। नवम्बर| journal = Int J Syst Evol Microbiol | volume = 53 | issue = Pt 4 | pages = 1155–63 | year = 2003 | pmid = 12892144 | doi = 10.1099/ijs.0.02520-0| doi-access = free }}</ref> यह एरोबिक और एनारोबिक श्वसन दोनों से बढ़ने में सक्षम ग्राम-नकारात्मक जीवाणु है।<ref>{{cite journal | author = Takaichi, S | author2 = Maoka, T | author3 = Takasaki, K | author4 = Hanada, S | title = Carotenoids of ''Gemmatimonas aurantiaca (Gemmatimonadetes)'': identification of a novel carotenoid, deoxyoscillol 2-rhamnoside, and proposed biosynthetic pathway of oscillol 2,2′-dirhamnoside | journal = Microbiology | volume = 156 | issue = 3 | pages = 757–763 | year = 2009 | doi = 10.1099/mic.0.034249-0 | pmid=19959572| doi-access = free }}</ref>
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दूसरी सुसंस्कृत प्रजाति जेमटिमोनडोटा कालामाज़ूनेंसिस जीन थी। नव., सपा. नवम्बर स्ट्रेन केबीएस 708, जिसे मिशिगन यूएसए में व्यवस्थित रूप से प्रबंधित कृषि मिट्टी से अलग किया गया था।<ref>{{cite journal | author = DeBruyn J.M.| author2 = Fawaz M.N.| author3 = Peacock, A.D.| author4 = Dunlap J.R.| author5 = Nixon L.T.| author6 = Cooper K.E. | author7 = Radosevich M.| title = '' जेममेटिरोसा कलामज़ूनिसिस '' जीन। नव., सपा. nov., शायद ही कभी खेती किए जाने वाले बैक्टीरियल फ़ाइलम Gemmatimonades का एक सदस्य।| journal = J Gen Appl Microbiol| volume =  59 | pages = 305–312 |year = 2013| issue = 4| doi = 10.2323/jgam.59.305| pmid = 24005180| doi-access = free}}</ref>
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तीसरी सुसंस्कृत प्रजाति जेमटिमोनडोटा प्रकाशपोषित तनाव AP64<sup>T</sup> उत्तरी चीन में एक उथले मीठे पानी के रेगिस्तानी झील तिआन ए हू (स्वान झील) से अलग किया गया था।<ref>{{cite journal | author = Zeng Y.| author2 = Selyanin V.| author3 = Lukeš M. | author4 = Dean J. | author5 = Kaftan D. | author6 = Feng F.| author7 = Koblížek M.| title = माइक्रोएरोफिलिक, बैक्टीरियोक्लोरोफिल ए-युक्त जीवाणु '' जेमेटिमोनस फोटोट्रोफिका '' एसपी की विशेषता। नोव।, और जीनस जेमटिमोनस और जेमटिमोनस ऑरांटियाका के संशोधित विवरण।| journal = Int J Syst Evol Microbiol| volume = 65 | pages = 2410–2419 |year = 2015| issue = 8| doi = 10.1099/ijs.0.000272| pmid = 25899503| doi-access = free}}</ref> इस जीव की एक अनूठी विशेषता जीवाणु प्रकाश संश्लेषक प्रतिक्रिया केंद्रों की उपस्थिति है। यह संभवतः [[क्षैतिज जीन स्थानांतरण]] के माध्यम से एनोक्सीजेनिक प्रकाश संश्लेषण के लिए जीन प्राप्त करता है। जी। फोटोट्रोफिका एक ऐच्छिक फोटोथेरोट्रॉफिक जीव है। इसके विकास के लिए जैविक सब्सट्रेट की आपूर्ति की आवश्यकता होती है, किन्तु यह प्रकाश से अपने चयापचय के लिए अतिरिक्त ऊर्जा प्राप्त कर सकता है।<ref>{{cite journal | author = Zeng Y.| author2 = Feng F.| author3 = Medová H.| author4 = Dean J.| author5 = Koblížek M.| title = Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes. | journal = Proc Natl Acad Sci USA| volume = 111 | pages = 7795–7800 |year = 2014| issue = 21| doi = 10.1073/pnas.1400295111| pmid = 24821787| pmc = 4040607| bibcode = 2014PNAS..111.7795Z| doi-access = free}}</ref>
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* [http://trace.tennessee.edu/cgi/viewcontent.cgi?article=2747&context=utk_gradthes Fawaz, M. N. (2013). Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils.] 44–60. Brief review of the phylum.
* [http://trace.tennessee.edu/cgi/viewcontent.cgi?article=2747&context=utk_gradthes Fawaz, M. N. (2013). Revealing the Ecological Role of Gemmatimonadetes Through Cultivation and Molecular Analysis of Agricultural Soils.] 44–60. Brief review of the phylum.


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Latest revision as of 12:01, 28 June 2023

जेमटिमोनडोटा 2003 में स्थापित जीवाणुओं का एक समूह है। इस संघ में दो वर्ग हैं जेमटिमोनडोटा और लोंगिमाइक्रोबिया।

प्रजातियां

2003 में सीवेज उपचार प्रणाली में सक्रिय कीचड़ से जेमटिमोनडोटा ऑरेंटियाका T-27T प्रकार की प्रजातियों को अलग किया गया था।[1] यह एरोबिक और एनारोबिक श्वसन दोनों से बढ़ने में सक्षम ग्राम-नकारात्मक जीवाणु है।[2]

दूसरी सुसंस्कृत प्रजाति जेमटिमोनडोटा कालामाज़ूनेंसिस जीन थी। नव., सपा. नवम्बर स्ट्रेन केबीएस 708, जिसे मिशिगन यूएसए में व्यवस्थित रूप से प्रबंधित कृषि मिट्टी से अलग किया गया था।[3]

तीसरी सुसंस्कृत प्रजाति जेमटिमोनडोटा प्रकाशपोषित तनाव AP64T उत्तरी चीन में एक उथले मीठे पानी के रेगिस्तानी झील तिआन ए हू (स्वान झील) से अलग किया गया था।[4] इस जीव की एक अनूठी विशेषता जीवाणु प्रकाश संश्लेषक प्रतिक्रिया केंद्रों की उपस्थिति है। यह संभवतः क्षैतिज जीन स्थानांतरण के माध्यम से एनोक्सीजेनिक प्रकाश संश्लेषण के लिए जीन प्राप्त करता है। जी। फोटोट्रोफिका एक ऐच्छिक फोटोथेरोट्रॉफिक जीव है। इसके विकास के लिए जैविक सब्सट्रेट की आपूर्ति की आवश्यकता होती है, किन्तु यह प्रकाश से अपने चयापचय के लिए अतिरिक्त ऊर्जा प्राप्त कर सकता है।[5]

लोंगिमाइक्रोबियम टेरा स्ट्रेन सीबी-286315टी को ग्रेनेडा, स्पेन में स्थित एक विशिष्ट भूमध्यसागरीय वन पारिस्थितिकी तंत्र से मिट्टी के नमूने से अलग किया गया था। अन्य सुसंस्कृत जेमटिमोनडोटा से इस बड़ी वंशावली दूरी के कारण, इसने लोंगिमाइक्रोबिया नामक एक उपन्यास वर्ग की स्थापना की।[6]

पर्यावरण वितरण

संस्कृति-स्वतंत्र अध्ययनों के डेटा से पता चलता है कि अनेक प्राकृतिक आवासों में जेमटिमोनडोटा व्यापक रूप से वितरित हैं। वे मिट्टी के जीवाणु समुदायों का लगभग 2% बनाते हैं और उन्हें मिट्टी में पाए जाने वाले शीर्ष नौ फ़ाइला में से एक के रूप में पहचाना गया है; अभी तक, वर्तमान में केवल छह सुसंस्कृत आइसोलेट्स हैं।[7] जेमटिमोनडोटा विभिन्न प्रकार की शुष्क मिट्टी में पाए गए हैं, जैसे चरागाह, प्रेयरी और चरागाह मिट्टी, साथ ही यूट्रोफिक झील तलछट और अल्पाइन मिट्टी। वातावरण की यह विस्तृत श्रृंखला जहां जेम्मतिमोनडोटा पाया गया है, मिट्टी की कम नमी के लिए एक अनुकूलन का सुझाव देता है। [8] किए गए एक अध्ययन से पता चला है कि मिट्टी में जेमटिमोनडोटा का वितरण एकत्रीकरण की तुलना में नमी की उपलब्धता पर अधिक निर्भर करता है, इस विश्वास को मजबूत करता है कि इस फाइलम के सदस्य सूखी मिट्टी को पसंद करते हैं।[9] विभिन्न जलीय वातावरणों में भी छोटी संख्याएँ पाई गईं, जैसे कि ताजे पानी और तलछट।

फाइलोजेनी

16S rRNA आधारित एलटीपी_12_2021[10][11][12] जीटीडीबी 07-आरएस207 बाय जीनोम टैक्सोनॉमी डेटाबेस [13][14][15]
लोंगिमाइक्रोबिया
लोंगिमाइक्रोबियल्स
लोंगिमाइक्रोबिएसी लोंगिमाइक्रोबियम टेरा
"जेमटिमोनडोटा"
जेमटिमोनडोटा
Gemmatimonadaceae
रोजिसोलिबैक्टर कृषि
Gemmatimonas
जी फोटोट्रोफिका
जी औरांतियाका
जेमटिमोनडोटा
"ग्लासबैक्टीरिया" (RIF5)
"जेमटिमोनडोटा"
लोंगिमाइक्रोबियल्स
लोंगिमाइक्रोबिएसी लोंगिमाइक्रोबियम टेरा
Gemmatimonadales
Gemmatimonadaceae
Gemmatirosa kalamazoonesis
Gemmatimonas
जी औरांतियाका
जी फोटोट्रोफिका

टैक्सोनॉमी

वर्तमान में स्वीकृत टैक्सोनॉमी स्टैंडिंग इन नोमेनक्लेचर (एलएसपीएन) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची पर आधारित है।[16] और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र।[17]

  • संघ जेमटिमोनडोटा झांग एट अल। 2003
    • क्लास जेमटिमोनादियास झांग एट अल। 2003 [जेमटिमोनादियास ओरेन, पार्टे और गैरिटी 2016 पूर्व कैवेलियर-स्मिथ 2020]
      • ऑर्डर जेमटीमोंडलेस झांग एट अल। 2003
        • परिवार जेमटिमोनादियास झांग एट अल। 2003
          • जीनस रोज़िसोलिबैक्टेर पास्कुअल एट अल। 2018
            • प्रजातियां रोजिसोलिबैक्टर एग्री|आर. मैदान पास्कुअल एट अल। 2018
          • जीनस जेवेलेड डेब्रुयन एट अल। 2013
            • प्रजातियां जेममैटिरोसा कलमाज़ोनेसिस|जी. कलामज़ू डेब्रुयन एट अल। 2013
          • वंश जेमटिमोनडोटा झांग एट अल। 2003 ई.एम. ज़ेंग एट अल। 2015
            • प्रजाति जेमटीमोनास ऑरेंज जी. नारंगी झांग एट अल। 2003 ई.एम. ज़ेंग एट अल। 2015
            • प्रजाति जेमटीमोनस फोटोट्रोफिका | जी। फोटोट्रोफिका ज़ेंग एट अल। 2015
    • वर्ग लोंगिमाइक्रोबिया पास्कुअल एट अल। 2016


यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ Zhang H, Sekiguchi Y, Hanada S, Hugenholtz P, Kim H, Kamagata Y, Nakamura K (2003). "Gemmatimonas aurantiaca gen. नव., सपा. नव।, एक ग्राम-नकारात्मक, एरोबिक, पॉलीफॉस्फेट-जमा करने वाला सूक्ष्म जीव, नए बैक्टीरियल फाइलम जेमटिमोनडेट्स फाइल का पहला सुसंस्कृत प्रतिनिधि। नवम्बर". Int J Syst Evol Microbiol. 53 (Pt 4): 1155–63. doi:10.1099/ijs.0.02520-0. PMID 12892144.
  2. ↑ Takaichi, S; Maoka, T; Takasaki, K; Hanada, S (2009). "Carotenoids of Gemmatimonas aurantiaca (Gemmatimonadetes): identification of a novel carotenoid, deoxyoscillol 2-rhamnoside, and proposed biosynthetic pathway of oscillol 2,2′-dirhamnoside". Microbiology. 156 (3): 757–763. doi:10.1099/mic.0.034249-0. PMID 19959572.
  3. ↑ DeBruyn J.M.; Fawaz M.N.; Peacock, A.D.; Dunlap J.R.; Nixon L.T.; Cooper K.E.; Radosevich M. (2013). " जेममेटिरोसा कलामज़ूनिसिस जीन। नव., सपा. nov., शायद ही कभी खेती किए जाने वाले बैक्टीरियल फ़ाइलम Gemmatimonades का एक सदस्य।". J Gen Appl Microbiol. 59 (4): 305–312. doi:10.2323/jgam.59.305. PMID 24005180.
  4. ↑ Zeng Y.; Selyanin V.; Lukeš M.; Dean J.; Kaftan D.; Feng F.; Koblížek M. (2015). "माइक्रोएरोफिलिक, बैक्टीरियोक्लोरोफिल ए-युक्त जीवाणु जेमेटिमोनस फोटोट्रोफिका एसपी की विशेषता। नोव।, और जीनस जेमटिमोनस और जेमटिमोनस ऑरांटियाका के संशोधित विवरण।". Int J Syst Evol Microbiol. 65 (8): 2410–2419. doi:10.1099/ijs.0.000272. PMID 25899503.
  5. ↑ Zeng Y.; Feng F.; Medová H.; Dean J.; Koblížek M. (2014). "Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes". Proc Natl Acad Sci USA. 111 (21): 7795–7800. Bibcode:2014PNAS..111.7795Z. doi:10.1073/pnas.1400295111. PMC 4040607. PMID 24821787.
  6. ↑ Pascual J.; García-López M.; Bills G.F.; Genilloud O. (2016). " लोंगिमाइक्रोबियम टेरा जीन। नव., सपा. नोव।, लघुरूपित प्रसार कक्षों की एक प्रणाली के माध्यम से अलग-थलग किए गए फ़ाइलम जेमटिमोनडेट्स के एक उपन्यास ऑलिगोट्रोफ़िक जीवाणु।". Int J Syst Evol Microbiol. 66 (5): 1976–1985. doi:10.1099/ijsem.0.000974. PMID 26873585.
  7. ↑ Fawaz, Mariam (2013). "कृषि मिट्टी की खेती और आणविक विश्लेषण के माध्यम से जेमटिमोनडेट्स की पारिस्थितिक भूमिका का खुलासा". Master's Thesis, University of Tennessee: vi.
  8. ↑ DeBruyn, J; Nixon, L; Fawaz, M; Johnson, M; Radosevich, M (2011). "ग्लोबल बायोग्राफी एंड क्वांटिटेटिव सीजन डायनेमिक्स ऑफ जेमटिमोनडेट्स इन सॉयल". Appl. Environ. Microbiol. 77 (17): 6295–300. Bibcode:2011ApEnM..77.6295D. doi:10.1128/AEM.05005-11. PMC 3165389. PMID 21764958.
  9. ↑ Fawaz, Mariam (2013). "कृषि मिट्टी की खेती और आणविक विश्लेषण के माध्यम से जेमटिमोनडेट्स की पारिस्थितिक भूमिका का खुलासा". Master's Thesis, University of Tennessee: vi.
  10. ↑ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
  11. ↑ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
  12. ↑ "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2021.
  13. ↑ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  14. ↑ "ar53_r207.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  15. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  16. ↑ J.P. Euzéby. "Gematimonadetes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2016-03-20.
  17. ↑ Sayers; et al. "Gematimonadetes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-03-20.


बाहरी संबंध

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