डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए वायरस: Difference between revisions

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colspan=2 style="text-align: center; background-color: rgb(250,250,190)" | डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए वायरस
File:रोटावायरस.jpg
रोटावायरसईएस का इलेक्ट्रॉन माइक्रोग्राफ। द बार = 100 nm
colspan=2 style="min-width:15em; text-align: center; background-color: rgb(250,250,190)" | Virus classification
Group:
Group III (dsRNA)
colspan=2 style="text-align: center; background-color: rgb(250,250,190)" | किंगडम: फाइलम: क्लास

डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए वायरस (डीएसआरएनए वायरस) वायरस का पॉलीफाइली समूह है जिसमें न्यूक्लिक एसिड डबल हेलिक्स होता है। रीबोन्यूक्लीक एसिड से बने डबल-स्ट्रैंडेड जीनोम। डबल-स्ट्रैंडेड जीनोम का उपयोग वायरल आरएनए-निर्भर आरएनए पोलीमरेज़ (आरडीआरपी) द्वारा प्रतिलेखन (आनुवांशिकी)आनुवांशिकी) ए सेंस (आणविक जीव विज्ञान) के लिए टेम्पलेट के रूप में किया जाता है। आतिथेय (जीव विज्ञान) के लिए दूत आरएनए (एमआरएनए) के रूप में सकारात्मक-स्ट्रैंड आरएनए कार्य करता है। होस्ट सेल के राइबोसोम, जो इसे वायरल प्रोटीन में अनुवाद (जीव विज्ञान) करते हैं।एक नया डबल-स्ट्रैंडेड वायरल जीनोम बनाने के लिए सकारात्मक-स्ट्रैंड आरएनए को आरडीआरपी द्वारा भी दोहराया जा सकता है।[1]

डीएसआरएनए वायरस की विशिष्ट विशेषता कैप्सिड के अन्दर डीएसआरएनए सेगमेंट के ट्रांसक्रिप्शन को पूरा करने की उनकी क्षमता होती है, और आवश्यक एंजाइम वायरियन संरचना के भाग होते हैं।[2]

इस प्रकार से डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए वायरस को दो फ़ाइला, डुप्लोरनाविरिकोटा और पिसुविरिकोटा (विशेष रूप से वर्ग डुप्लोपिविरिकेट्स) में वर्गीकृत किया गया है, जो कि ऑर्थोनावीरा और क्षेत्र (वायरोलॉजी) रिबोविरिया में होते है। दो फ़ाइला सामान्य डीएसआरएनए वायरस पूर्वज को साझा नहीं करते हैं, किन्तु सकारात्मक-स्ट्रैंड आरएनए वायरस से दो अलग-अलग समय में अपनी दोहरी प्रकार विकसित की हैं। इस प्रकार से बाल्टीमोर वर्गीकरण प्रणाली में, डीएसआरएनए वायरस समूह III के अंतर्गत आते हैं।[3]

किन्तु वायरस समूह के सदस्य होस्ट रेंज में व्यापक रूप से भिन्न होते हैं (जानवर, पौधों, कवक और जीवाणु ), जीनोम खंड संख्या (एक से बारह), और विषाणु संगठन (टी-नंबर, कैप्सिड परतें, या बुर्ज) में व्यापक रूप से भिन्न होते हैं। डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए वायरस में रोटावायरस सम्मिलित होते हैं, जो विश्व स्तर पर छोटे बच्चों में आंत्रशोथ के सामान्य कारण के रूप में जाना जाता है, और ब्लूटॉन्ग वायरस, मवेशियों और भेड़ों का आर्थिक रूप से महत्वपूर्ण रोगज़नक़ होते है। होस्ट रेंज के संदर्भ में वर्ग रेओविरिडे अधिक बड़ा और अधिक विविध डीएसआरएनए वायरस वर्ग है।[2]

वर्गीकरण

डीएसआरएनए वायरस के दो वर्ग उपस्थित होते हैं: फाइलम डुप्लोरनाविरिकोटा और वर्ग डुप्लोपिविरिकेट्स, जो कि फाइलम पिसुविरिकोटा में है। दोनों रिबोविरिया के दायरे में ऑर्थोर्नवीरा राज्य में सम्मिलित होते हैं। आरडीआरपी के फाईलोजेनेटिक विश्लेषण के आधार पर, दो क्लैड सामान्य डीएसआरएनए पूर्वज को साझा नहीं करते हैं, किन्तु अलग-अलग सकारात्मक-भावना, एकल-फंसे हुए आरएनए वायरस से अलग होते हैं। बाल्टीमोर वर्गीकरण प्रणाली में, जो एमआरएनए संश्लेषण के विधि के आधार पर वायरस को साथ समूहित करते हैं, डीएसआरएनए वायरस समूह III हैं।[3][4]

डुप्लोरनाविरिकोटा

डुप्लोरनाविरिकोटा में अधिकांश डीएसआरएनए वायरस होते हैं, जिसमें रीओविरिडे भी सम्मिलित होते है, जोकी यूकेरियोट्स की विविध श्रेणी को संक्रमित करता है, और सिस्टोविरिडे, जो प्रोकैरियोट्स को संक्रमित करने के लिए जाने जाने वाले एकमात्र डीएसआरएनए वायरस हैं। आरडीआरपी के अतिरिक्त,डुप्लोरनाविरिकोटा में वायरस भी आईकोसाहेड्रल कैप्सिड्स साझा करते हैं जिसमें छद्म T = 2 जाली पर आयोजित कैप्सिड प्रोटीन के 60 होमो- या हेटेरोडिमर्स होते हैं। फाइलम को तीन वर्गों में विभाजित किया गया है: क्राइमोटिविरिसेट्स, जिसमें मुख्य रूप से फंगल और प्रोटोजोअन वायरस होते हैं, रेसेंटोवायरिसेट्स, जिसमें रीओवायरस होते हैं, और विडावरविरिकेट्स, जिसमें सिस्टोवायरस होते हैं।[3][4]

डुप्लोपिविरिकेट्स

इस प्रकार से वर्ग डुप्लोपिविरिकेट्स डीएसआरएनए वायरस का दूसरा क्लैड है और फाइलम पिसुविरिकोटा में है, जिसमें पॉजिटिव-सेंस सिंगल-स्ट्रैंडेड आरएनए वायरस भी होते हैं। डुप्लोपिविरिकेट्स में ज्यादातर पौधे और फंगल वायरस होते हैं और इसमें निम्नलिखित चार वर्ग सम्मिलित होते हैं: अमलगाविरिडे, हाइपोविरिडे, पार्टिटिविरिडे और पिकोबिरनाविरिडे[3][4]

चयनित प्रजातियों पर नोट्स

रिओविरिडे

रिओविरिडेको वर्तमान में नौ जाति में वर्गीकृत किया गया है। इन विषाणुओं के जीनोम में डीएसआरएनए के 10 से 12 खंड होते हैं, प्रत्येक सामान्यतः प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। परिपक्व विषाणु गैर-इन्वेलप्ड हैं। कई प्रोटीनों द्वारा गठित उनके कैप्सिड्स में आइकोसाहेड्रल समरूपता होती है और सामान्तः संकेंद्रित परतों में व्यवस्थित होती है।

ऑर्थोवायरस

ऑर्थोवायरस (रीओवायरस) वायरस रेओविरिडे वर्ग के प्रोटोटाइप सदस्य हैं और बुर्ज सदस्यों के प्रतिनिधि हैं, जिनमें लगभग आधे जेनेरा सम्मिलित होते हैं। वर्ग के अन्य सदस्यों की तरह, रीओवायरस गैर-आच्छादित होते हैं और संकेंद्रित कैप्सिड गोले की विशेषता होती है जो खंडित डीएसआरएनए जीनोम को घेरते हैं। विशेष रूप से, रीओवायरस में आठ संरचनात्मक प्रोटीन और डीएसआरएनए के दस खंड होते हैं। सेल प्रविष्टि और प्रतिकृति के साथ अनकोटिंग चरणों और गठनात्मक परिवर्तनों की श्रृंखला होती है। उच्च-रिज़ॉल्यूशन संरचनाएं स्तनधारी रीओवायरस (एमआरवी) के लगभग सभी प्रोटीनों के लिए जानी जाती हैं, जो कि अधिक अच्छा अध्ययन किया गया जीनोटाइप है। इलेक्ट्रॉन क्रायो-माइक्रोस्कोपी (क्रायोईएम) और एक्स-रे क्रिस्टलोग्राफी ने दो विशिष्ट एमआरवी उपभेदों, टाइप 1 लैंग (टी1एल) और टाइप 3 डियरिंग (टी3डी) के बारे में संरचनात्मक जानकारी का खजाना प्रदान किया है।[5]

साइपोवायरस

साइटोप्लाज्मिक पॉलीहेड्रोसिस वायरस (सीपीवी) वर्ग रिओविरिडेके जीनस साइपोवायरस का निर्माण करते हैं। सीपीवी को उनके जीनोम सेगमेंट के वैद्युतकणसंचलन प्रवासन प्रोफाइल के आधार पर 14 प्रजातियों में वर्गीकृत किया गया है। साइपोवायरस में केवल ही कैप्सिड शेल होता है, जो ऑर्थोरोवायरस इनर कोर के समान होता है। सीपीवी प्रहार कैप्सिड स्थिरता प्रदर्शित करता है और अंतर्जात आरएनए प्रतिलेखन और प्रसंस्करण में पूरी तरह से सक्षम है। सीपीवी प्रोटीन की समग्र परतें अन्य रीओवायरस के समान होती हैं। चूंकि, सीपीवी प्रोटीन में सम्मिलन डोमेन और अद्वितीय संरचनाएं होती हैं जो उनके व्यापक इंटरमॉलिक्युलर इंटरैक्शन में योगदान करती हैं। सीपीवी बुर्ज प्रोटीन में अत्यधिक संरक्षित कुंडलित वक्रता -जोड़ी/β-शीट/हेलिक्स-जोड़ी सैंडविच फोल्ड के साथ दो मिथाइलेज़ डोमेन होते हैं, किन्तु ऑर्थोरोवायरस लैम्ब्डा फेज λ2 में उपस्थित β-बैरल फ्लैप का अभाव होता है। बुर्ज प्रोटीन कार्यात्मक डोमेन का ढेर और संकुचन की उपस्थिति और एमआरएनए रिलीज पाथवे के साथ स्पाइक्स तंत्र को इंगित करता है जो आरएनए ट्रांसक्रिप्शन, प्रसंस्करण और रिलीज के अत्यधिक समन्वित चरणों को विनियमित करने के लिए छिद्रों और चैनलों का उपयोग करता है।[6]

रोटावायरस

रोटावायरस दुनिया भर में शिशुओं और छोटे बच्चों में तीव्र आंत्रशोथ का अधिक आम कारण है। इस वायरस में डीएसआरएनए जीनोम होता है और यह रिओविरिडेवर्ग का सदस्य है। रोटावायरस के जीनोम में डीएसआरएनए के ग्यारह खंड होते हैं। खंड 11 के अपवाद के साथ प्रत्येक जीनोम खंड प्रोटीन के लिए कोड करता है, जो दो प्रोटीनों के लिए कोड करता है। बारह प्रोटीनों में से छह संरचनात्मक हैं और छह गैर-संरचनात्मक प्रोटीन होते हैं।[7]

यह डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए नॉन-इन्वेलप्ड वायरस है।

ब्लूटंग वायरस

रिओविरिडेवर्ग के भीतर जीनस ऑर्बिवायरस के सदस्य आर्बोवायरस हैं और पागुर करने वालों में उच्च रुग्णता और मृत्यु दर के लिए उत्तरदायी हैं। ब्लूटॉन्ग वायरस (बीटीवी) जो पशुधन (भेड़, बकरी, मवेशी) में बीमारी का कारण बनता है, पिछले तीन दशकों से आणविक अध्ययनों में अधिक आगे है और अब आणविक और संरचनात्मक स्तरों पर अधिक अच्छी तरह से समझे जाने वाले ऑर्बिवायरस का प्रतिनिधित्व करता है। बीटीवी, वर्ग के अन्य सदस्यों की तरह, जटिल गैर-आच्छादित वायरस है जिसमें सात संरचनात्मक प्रोटीन होते हैं और आरएनए जीनोम होता है जिसमें 10 अलग-अलग आकार के डीएसआरएनए खंड होते हैं।[8][9]

फाइटोरोवायरस

फाइटोरोवायरस गैर-बुर्जयुक्त रिओविरिडेहैं जो प्रमुख कृषि रोगजनक हैं, विशेष रूप से एशिया में इस वर्ग के सदस्य, राइस ड्वार्फ वायरस (आरडीवी) का इलेक्ट्रॉन क्रायोमाइक्रोस्कोपी और एक्स-रे क्रिस्टलोग्राफी द्वारा बड़े माप पर अध्ययन किया गया है। इन विश्लेषणों से, कैप्सिड प्रोटीन के परमाणु मॉडल और कैप्सिड असेंबली के लिए प्रशंसनीय मॉडल प्राप्त किया गया है। जबकि आरडीवी के संरचनात्मक प्रोटीन अन्य प्रोटीनों के साथ कोई अनुक्रम समानता साझा नहीं करते हैं, उनके सिलवटों और समग्र कैप्सिड संरचना अन्य रिओविरिडेके समान हैं।[10]

सैक्रोमाइसेस सेरेविसिया वायरस एल-ए

सैक्रोमाइसेस सेरेविसिया वायरस एल-ए|एल-ए डीएसआरएनए यीस्ट के वायरस सैक्रोमाइसेस सेरेविसिया में एकल 4.6 kb जीनोमिक खंड होता है जो इसके प्रमुख कोट प्रोटीन, Gag (76 kDa) और Gag-Pol संलयन प्रोटीन (180 kDa) -1 राइबोसोमल द्वारा गठित होता है। फ्रेमशिफ्ट। एल-ए किसी भी कई उपग्रह डीएसआरएनए s के अलग-अलग वायरल कणों में प्रतिकृति और एनकैप्सिडेशन का समर्थन कर सकता है, जिन्हें एम डीएसआरएनए कहा जाता है, जिनमें से प्रत्येक गुप्त प्रोटीन विष (जानलेवा विष) और उस विष के प्रति प्रतिरोधकता को कूटबद्ध करता है। सम्बद्ध की प्रक्रिया में होने वाले साइटोप्लाज्मिक मिश्रण द्वारा एलए और एम सेल से सेल में प्रेषित होते हैं। न तो स्वाभाविक रूप से कोशिका से मुक्त होता है और न ही अन्य तंत्रों द्वारा कोशिकाओं में प्रवेश करता है, किन्तु प्रकृति में खमीर सम्बद्ध की उच्च आवृत्ति के परिणामस्वरूप इन विषाणुओं का प्राकृतिक आइसोलेट्स में व्यापक वितरण होता है। इसके अलावा, स्तनधारियों के डीएसआरएनए वायरस के साथ संरचनात्मक और कार्यात्मक समानता ने इन संस्थाओं को वायरस के रूप में मानना ​​उपयोगी बना दिया है।[11]

संक्रामक बर्सल रोग वायरस

संक्रामक बर्सल रोग विषाणु (आईबीडीवी) बिरनावीरिडे वर्ग का अधिक अच्छा लक्षण वाला सदस्य है। इन विषाणुओं में द्विदलीय डीएसआरएनए जीनोम होते हैं जो T=13l ज्यामिति के साथ एकल स्तरित आईकोसाहेड्रल कैप्सिड में संलग्न होते हैं। आईबीडीवी कई अन्य icosahedral डीएसआरएनए वायरस के साथ कार्यात्मक रणनीतियों और संरचनात्मक विशेषताओं को साझा करता है, सिवाय इसके कि इसमें T = 1 (या छद्म T = 2) कोर कॉमन रेओविरिडे, सिस्टोविरिडे, और टोटिविरिडे का अभाव है। आईबीडीवी कैप्सिड प्रोटीन संरचनात्मक डोमेन प्रदर्शित करता है जो कुछ सकारात्मक-भावना एकल-फंसे हुए आरएनए वायरस के कैप्सिड प्रोटीन के समरूपता को दर्शाता है, जैसे कि नोडावायरस और टेट्रावायरस, साथ ही रेओविरिडे के टी = 13 कैप्सिड शेल प्रोटीन। आईबीडीवी कैप्सिड का टी = 13 खोल वीपी2 के ट्रिमर द्वारा बनता है, प्रोटीन जो सी-टर्मिनल डोमेन को उसके पूर्ववर्ती, पीवीपी2 से हटाकर उत्पन्न होता है। परिपक्वता प्रक्रिया के भाग के रूप में अपरिपक्व कणों पर pVP2 की ट्रिमिंग की जाती है। अन्य प्रमुख संरचनात्मक प्रोटीन, VP3, T = 13 खोल के नीचे स्थित बहुक्रियाशील घटक है जो pVP2 के अंतर्निहित संरचनात्मक बहुरूपता को प्रभावित करता है। वायरस-एन्कोडेड आरएनए-आश्रित आरएनए पोलीमरेज़, वीपी1, वीपी3 के सहयोग से कैप्सिड में समाविष्ट है। VP3 भी वायरल डीएसआरएनए जीनोम के साथ बड़े माप पर परस्पर क्रिया करता है।[12]

जीवाणुभोजी Φ6

स्यूडोमोनास फेज Φ6 बैक्टीरियोफेज Φ6, सिस्टोविरिडे वर्ग का सदस्य होता है। यह स्यूडोमोनास बैक्टीरिया (सामान्तः पौधे-रोगजनक पी. सिरिंगी) को संक्रमित करता है। इस प्रकार से इसमें तीन भाग, खंडित, डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए जीनोम है, जिसकी कुल लंबाई ~13.5 kb है। Φ6 और उसके परिजन के पास उनके न्यूक्लियोकैप्सिड के चारों ओर लिपिड झिल्ली होती है, जो बैक्टीरियोफेज के बीच दुर्लभ लक्षण होते है। यह लाइटिक फेज है, चूंकि कुछ परिस्थितियों में लसीका में देरी प्रदर्शित करने के लिए देखा गया है जिसे वाहक राज्य के रूप में वर्णित किया जा सकता है।[13]

विषाणु-विरोधी

चूंकि कोशिकाएं सामान्य न्यूक्लिक एसिड चयापचय के समय डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए का उत्पादन नहीं करती हैं, प्राकृतिक चयन ने एंजाइमों के विकास का समर्थन किया है जो संपर्क पर डीएसआरएनए को नष्ट कर देता है। इस प्रकार के एंजाइमों का अधिक प्रसिद्ध वर्ग पासा खेलनेवाला है। यह आशा की जाती है कि ब्रॉड-स्पेक्ट्रम एंटी-वायरल को संश्लेषित किया जा सकता है जो डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए वायरस की इस भेद्यता का लाभ उठाते हैं।[14]

यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ "डबल-फंसे आरएनए वायरस प्रतिकृति". ViralZone. Swiss Institute of Bioinformatics. Retrieved 6 August 2020.
  2. ↑ 2.0 2.1 Patton 2008
  3. ↑ 3.0 3.1 3.2 3.3 Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (18 October 2019). "दायरे रिबोविरिया के लिए, सभी प्रमुख टैक्सोनोमिक रैंकों को भरते हुए एक मेगाटैक्सोनोमिक ढांचा बनाएं" (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (in English). Retrieved 15 August 2020.
  4. ↑ 4.0 4.1 4.2 Wolf YI, Kazlauskas D, Iranzo J, Lucia-Sanz A, Kuhn JH, Krupovic M, Dolja VV, Kooning EV (27 November 2018). "ग्लोबल आरएनए वायरोम की उत्पत्ति और विकास". mBio. 9 (6): e02329-18. doi:10.1128/mBio.02329-18. PMC 6282212. PMID 30482837.
  5. ↑ Dryden, Kelly A.; Coombs, Kevin M.; Yeager, Mark (2008). "Ch. 1: The Structure of Orthoreoviruses". Patton 2008. pp. 3–. ISBN 9781904455219.
  6. ↑ Z. Hong Zhou (2008). "Ch. 2: Cypovirus". Patton 2008. pp. 27–. ISBN 9781904455219.
  7. ↑ Xiaofang Jiang; Crawford, Sue E.; Estes, Mary K.; Prasad, B. V. Venkataram (2008). "Ch. 3: Rotavirus Structure". Patton 2008. pp. 45–. ISBN 9781904455219.
  8. ↑ Roy P (2008). "Structure and Function of Bluetongue Virus and its Proteins". Segmented Double-stranded RNA Viruses: Structure and Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-21-9.
  9. ↑ Mettenleiter, T.C.; Sobrino, F., eds. (2008). Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic. ISBN 978-1-904455-22-6.
  10. ↑ Baker, Matthew L.; Z. Hong Zhou; Wah Chiu (2008). "Ch. 5: Structures of Phytoreoviruses". Patton 2008. pp. 89–. ISBN 9781904455219.
  11. ↑ Wickner; et al. (2008). "The Yeast dsRNA Virus L-A Resembles Mammalian dsRNA Virus Cores". Segmented Double-stranded RNA Viruses: Structure and Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-21-9.
  12. ↑ Castón, José R.; Rodríguez, José F.; Carrascosa, José L. (2008). "Infectious Bursal Disease Virus (IBDV): A Segmented Double-Stranded RNA Virus With a T=13 Capsid That Lacks a T=1 Core". Patton 2008. pp. 133–. ISBN 9781904455219.
  13. ↑ Koivunen, Minni R. L.; Sarin, L. Peter; Bamford, Dennis H. (2008). "Ch. 14: Structure-Function Insights Into the RNA-Dependent RNA Polymerase of the dsRNA Bacteriophage Φ6". Patton 2008. pp. 239–. ISBN 9781904455219.
  14. ↑ Rider, Todd H.; Zook, Christina E.; Boettcher, Tara L.; Wick, Scott T.; Pancoast, Jennifer S.; Zusman, Benjamin D. (2011). Sambhara, Suryaprakash (ed.). "ब्रॉड-स्पेक्ट्रम एंटीवायरल थेरेप्यूटिक्स". PLoS ONE. 6 (7): e22572. Bibcode:2011PLoSO...622572R. doi:10.1371/journal.pone.0022572. PMC 3144912. PMID 21818340. ... एक नया ब्रॉड-स्पेक्ट्रम एंटीवायरल दृष्टिकोण, जिसे डबल-स्ट्रैंडेड आरएनए (डीएसआरएनए) सक्रिय कैस्पासे ओलिगोमेराइज़र (DRACO) कहा जाता है...

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