अणु संपादक: Difference between revisions
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अणु संपादक [[रासायनिक संरचना|रासायनिक संरचनाओं]] के प्रतिनिधित्व को बनाने और संशोधित करने के लिए एक [[कंप्यूटर प्रोग्राम]] है। | अणु संपादक [[रासायनिक संरचना|रासायनिक संरचनाओं]] के प्रतिनिधित्व को बनाने और संशोधित करने के लिए एक [[कंप्यूटर प्रोग्राम]] है। | ||
अणु संपादक क्रमशः [[2डी कंप्यूटर ग्राफिक्स]] या [[3 डी कंप्यूटर ग्राफिक्स|3डी कंप्यूटर ग्राफिक्स]] के माध्यम से एक सिम्युलेटेड द्वि-आयामी अंतरिक्ष या त्रि-आयामी स्पेस में रासायनिक संरचना प्रतिनिधित्व में हेरफेर कर सकते हैं। द्वि-आयामी आउटपुट का उपयोग चित्रण के रूप में या [[रासायनिक डेटाबेस]] को क्वेरी करने के लिए किया जाता है। [[आणविक मॉडलिंग]] सॉफ़्टवेयर पैकेज के भाग के रूप में सामान्यतः आणविक मॉडल बनाने के लिए त्रि-आयामी आउटपुट का उपयोग किया जाता है। | अणु संपादक क्रमशः [[2डी कंप्यूटर ग्राफिक्स]] या [[3 डी कंप्यूटर ग्राफिक्स|3डी कंप्यूटर ग्राफिक्स]] के माध्यम से एक सिम्युलेटेड द्वि-आयामी अंतरिक्ष या त्रि-आयामी स्पेस में रासायनिक संरचना प्रतिनिधित्व में हेरफेर कर सकते हैं। द्वि-आयामी आउटपुट का उपयोग चित्रण के रूप में या [[रासायनिक डेटाबेस]] को क्वेरी करने के लिए किया जाता है। [[आणविक मॉडलिंग]] सॉफ़्टवेयर पैकेज के भाग के रूप में सामान्यतः आणविक मॉडल बनाने के लिए त्रि-आयामी आउटपुट का उपयोग किया जाता है। | ||
डेटाबेस आणविक संपादक जैसे लेदरफेस,<ref>{{cite book|doi=10.1002/3527603743.ch11|chapter=Structure Modification in Chemical Databases|title=ड्रग डिस्कवरी में केमोइन्फॉर्मेटिक्स|pages=[https://archive.org/details/isbn_9783527307531_0/page/271 271–285]|series=Methods and Principles in Medicinal Chemistry|year=2005|last1=Kenny|first1=Peter W.|last2=Sadowski|first2=Jens|isbn=9783527307531|url=https://archive.org/details/isbn_9783527307531_0/page/271}}</ref> रिकैप,<ref>{{cite journal|doi=10.1021/ci970429i|pmid=9611787|title=RECAP-Retrosynthetic Combinatorial Analysis Procedure: A Powerful New Technique for Identifying Privileged Molecular Fragments with Useful Applications in Combinatorial Chemistry|journal=Journal of Chemical Information and Computer Sciences|volume=38|issue=3|pages=511–522|year=1998|last1=Lewell|first1=Xiao Qing|last2=Judd|first2=Duncan B.|last3=Watson|first3=Stephen P.|last4=Hann|first4=Michael M.}}</ref> और अणु स्लाइसर<ref>{{cite journal|doi=10.1021/jm030267j|pmid=14695836|title=विशेषता भौतिक गुण और विपणित मौखिक दवाओं के संरचनात्मक टुकड़े|journal=Journal of Medicinal Chemistry|volume=47|pages=224–232|year=2004|last1=Vieth|first1=Michal|last2=Siegel|first2=Miles G.|last3=Higgs|first3=Richard E.|last4=Watson|first4=Ian A.|last5=Robertson|first5=Daniel H.|last6=Savin|first6=Kenneth A.|last7=Durst|first7=Gregory L.|last8=Hipskind|first8=Philip A.|issue=1}}</ref> बड़ी संख्या में अणुओं को 'डिप्रोटोनेट कार्बोक्जिलिक | डेटाबेस आणविक संपादक जैसे लेदरफेस,<ref>{{cite book|doi=10.1002/3527603743.ch11|chapter=Structure Modification in Chemical Databases|title=ड्रग डिस्कवरी में केमोइन्फॉर्मेटिक्स|pages=[https://archive.org/details/isbn_9783527307531_0/page/271 271–285]|series=Methods and Principles in Medicinal Chemistry|year=2005|last1=Kenny|first1=Peter W.|last2=Sadowski|first2=Jens|isbn=9783527307531|url=https://archive.org/details/isbn_9783527307531_0/page/271}}</ref> रिकैप,<ref>{{cite journal|doi=10.1021/ci970429i|pmid=9611787|title=RECAP-Retrosynthetic Combinatorial Analysis Procedure: A Powerful New Technique for Identifying Privileged Molecular Fragments with Useful Applications in Combinatorial Chemistry|journal=Journal of Chemical Information and Computer Sciences|volume=38|issue=3|pages=511–522|year=1998|last1=Lewell|first1=Xiao Qing|last2=Judd|first2=Duncan B.|last3=Watson|first3=Stephen P.|last4=Hann|first4=Michael M.}}</ref> और अणु स्लाइसर<ref>{{cite journal|doi=10.1021/jm030267j|pmid=14695836|title=विशेषता भौतिक गुण और विपणित मौखिक दवाओं के संरचनात्मक टुकड़े|journal=Journal of Medicinal Chemistry|volume=47|pages=224–232|year=2004|last1=Vieth|first1=Michal|last2=Siegel|first2=Miles G.|last3=Higgs|first3=Richard E.|last4=Watson|first4=Ian A.|last5=Robertson|first5=Daniel H.|last6=Savin|first6=Kenneth A.|last7=Durst|first7=Gregory L.|last8=Hipskind|first8=Philip A.|issue=1}}</ref> बड़ी संख्या में अणुओं को 'डिप्रोटोनेट कार्बोक्जिलिक अम्ल' या 'ब्रेक एक्सोसाइक्लिक बॉन्ड' जैसे नियमों के अनुसार स्वचालित रूप से संशोधित करने की अनुमति देता है जिसे उपयोगकर्ता द्वारा निर्दिष्ट किया जा सकता है। | ||
अणु संपादक सामान्यतः कम से कम एक फ़ाइल प्रारूप या [[ रेखा अंकन ]] पढ़ने और लिखने का समर्थन करते हैं। प्रत्येक के उदाहरणों में क्रमशः [[मोलफाइल]] और [[सरलीकृत आणविक इनपुट लाइन प्रविष्टि विनिर्देश]] (एसएमआईएलईएस) सम्मिलित हैं। | अणु संपादक सामान्यतः कम से कम एक फ़ाइल प्रारूप या [[ रेखा अंकन ]] पढ़ने और लिखने का समर्थन करते हैं। प्रत्येक के उदाहरणों में क्रमशः [[मोलफाइल]] और [[सरलीकृत आणविक इनपुट लाइन प्रविष्टि विनिर्देश|सरलीकृत आणविक इनपुट रेखा प्रविष्टि विनिर्देश]] (एसएमआईएलईएस) सम्मिलित हैं। | ||
अणु संपादकों द्वारा उत्पन्न फ़ाइलें [[आणविक ग्राफिक्स]] उपकरण द्वारा प्रदर्शित की जा सकती हैं। | अणु संपादकों द्वारा उत्पन्न फ़ाइलें [[आणविक ग्राफिक्स]] उपकरण द्वारा प्रदर्शित की जा सकती हैं। | ||
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Revision as of 15:25, 19 April 2023
अणु संपादक रासायनिक संरचनाओं के प्रतिनिधित्व को बनाने और संशोधित करने के लिए एक कंप्यूटर प्रोग्राम है।
अणु संपादक क्रमशः 2डी कंप्यूटर ग्राफिक्स या 3डी कंप्यूटर ग्राफिक्स के माध्यम से एक सिम्युलेटेड द्वि-आयामी अंतरिक्ष या त्रि-आयामी स्पेस में रासायनिक संरचना प्रतिनिधित्व में हेरफेर कर सकते हैं। द्वि-आयामी आउटपुट का उपयोग चित्रण के रूप में या रासायनिक डेटाबेस को क्वेरी करने के लिए किया जाता है। आणविक मॉडलिंग सॉफ़्टवेयर पैकेज के भाग के रूप में सामान्यतः आणविक मॉडल बनाने के लिए त्रि-आयामी आउटपुट का उपयोग किया जाता है।
डेटाबेस आणविक संपादक जैसे लेदरफेस,[1] रिकैप,[2] और अणु स्लाइसर[3] बड़ी संख्या में अणुओं को 'डिप्रोटोनेट कार्बोक्जिलिक अम्ल' या 'ब्रेक एक्सोसाइक्लिक बॉन्ड' जैसे नियमों के अनुसार स्वचालित रूप से संशोधित करने की अनुमति देता है जिसे उपयोगकर्ता द्वारा निर्दिष्ट किया जा सकता है।
अणु संपादक सामान्यतः कम से कम एक फ़ाइल प्रारूप या रेखा अंकन पढ़ने और लिखने का समर्थन करते हैं। प्रत्येक के उदाहरणों में क्रमशः मोलफाइल और सरलीकृत आणविक इनपुट रेखा प्रविष्टि विनिर्देश (एसएमआईएलईएस) सम्मिलित हैं।
अणु संपादकों द्वारा उत्पन्न फ़ाइलें आणविक ग्राफिक्स उपकरण द्वारा प्रदर्शित की जा सकती हैं।
एकाकी प्रोग्राम
| प्रोग्राम | विकासक(एस) | लाइसेंस | प्लेटफार्म | जानकारी | |
|---|---|---|---|---|---|
| एसीडी/केमस्केच | एसीडी / लैब्स | Proprietary | विंडोज़ | एक रासायनिक रूप से बुद्धिमान आकृति इंटरफ़ेस जो जैविक, ऑर्गेनोमेटैलिक, पॉलिमर और मार्कुश संरचनाओं सहित लगभग किसी भी रासायनिक संरचना को चित्रित करने की अनुमति देता है। फ्रीवेयर संस्करण उपलब्ध है | |
| अमीरा (सॉफ्टवेयर) | विज़ेज इमेजिंग ज़्यूस संस्थान बर्लिन |
Proprietary | विंडोज़, मैक ओएस, लिनक्स | 14-दिवसीय परीक्षण संस्करण उपलब्ध है | |
| एस्कलाफ डिजाइनर | एजाइल अणु | GNU GPL | लिनक्स, विंडोज़ | फ्रीवेयर | |
| एवोगेड्रो | अवोगाद्रो प्रोजेक्ट टीम | GNU GPL | लिनक्स, मैकओएस, विंडोज | 3डी अणु संपादक, विजुअलाइज़र | |
| बॉलव्यू | बॉल परियोजना टीम | GNU GPL-LGPL | लिनक्स, मैकओएस, विंडोज | दर्शक, संपादक, सिमुलेशन उपकरण | |
| बायोक्लिप | बायोक्लिप्स डेवलपर्स | EPL | क्रॉस-प्लेटफॉर्म | जावा, एक्लिप्स रिच क्लाइंट प्लेटफॉर्म (आरसीपी) आधारित | |
| केमडूडल | आईकेमलैब्स | Proprietary | क्रॉस-प्लेटफॉर्म | जावा | |
| केमड्रा | पर्किनएल्मर | Proprietary | मैकओएस, विंडोज़ | रासायनिक संरचनाओं और प्रतिक्रियाओं को संपादित करें | |
| डेनेब | एटलग्राफिक्स | Proprietary | लिनक्स, विंडोज़ | परीक्षण संस्करण उपलब्ध; सिएस्टा, वीएएसपी, क्यूई, आदि पैकेजों के लिए ग्राफिकल यूजर इंटरफेस डेस्कटॉप का उपयोग करना आसान है। | |
| केमविंडो | विले | Proprietary | विंडोज | नोइटऑल सॉफ़्टवेयर वातावरण के भाग के रूप में उपलब्ध; शैक्षणिक अनुसंधान और शिक्षण के लिए फ्रीवेयर | |
| गैबडिट | अब्दुलरहमान अलौचे | BSD | लिनक्स, मैकओएस, विंडोज | 3डी अणु संपादक, विजुअलाइज़र | |
| जेकेमपेंट | GNU LGPL | क्रॉस-प्लेटफॉर्म | 2डी संरचनात्मक सूत्र संपादक जावा में लिखा गया है | ||
| आणविक परिचालन पर्यावरण (एमओई) | रासायनिक कंप्यूटिंग समूह | Proprietary | विंडोज, लिनक्स, मैक; एसवीएल प्रोग्रामिंग भाषा | 3डी आणविक स्केचिंग और संपादन, 2डी चित्रण, और 2डी से 3डी रूपांतरण के साथ आणविक मॉडलिंग / दवा खोज अनुप्रयोगों के लिए मंच। | |
| सैमसन | इरिया | Proprietary | विंडोज, लिनक्स, मैकओएस | एकीकृत कम्प्यूटेशनल नैनोसाइंस के लिए सॉफ्टवेयर प्लेटफॉर्म। सैमसन तत्वों के साथ अनुकूलित (सैमसन के लिए मॉड्यूल) | |
| स्पार्टन | वेवफंक्शन, इंक। | Proprietary | लिनक्स, मैकओएस, विंडोज | ||
| एक्सड्राकेम | GNU GPL | लिनक्स, मैकओएस, विंडोज | ओपनबेबेल पर आधारित |
जावा एप्लेट्स
| एप्लेट | विकासक(एस) | लाइसेंस | जानकारी |
|---|---|---|---|
| जेकेमपेंट | GNU LGPL | संपादक और दर्शक एप्लेट्स | |
| जेएमई अणु संपादक | पीटर एर्टल | Proprietary | मोलिन्सपिरेशन से फ्रीवेयर उपलब्ध; गैर-वाणिज्यिक उपयोग के लिए फ्रीवेयर |
जावास्क्रिप्ट एम्बेड करने योग्य संपादक
| प्रोग्राम | विकासक | डेस्कटॉप ब्राउज़र आईई6-7-8 | डेस्कटॉप ब्राउज़र अन्य | आईपैड | आईफ़ोन | एंड्रॉयड | विंडोज फोन | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| केकुले प्रोग्राम | केकुले.जेएस लैब | Yes | Yes | Unknown | Unknown | Unknown | Unknown | एमआईटी लाइसेंस के अनुसार प्रकाशित |
यह भी देखें
नोट्स और संदर्भ
- ↑ Kenny, Peter W.; Sadowski, Jens (2005). "Structure Modification in Chemical Databases". ड्रग डिस्कवरी में केमोइन्फॉर्मेटिक्स. Methods and Principles in Medicinal Chemistry. pp. 271–285. doi:10.1002/3527603743.ch11. ISBN 9783527307531.
- ↑ Lewell, Xiao Qing; Judd, Duncan B.; Watson, Stephen P.; Hann, Michael M. (1998). "RECAP-Retrosynthetic Combinatorial Analysis Procedure: A Powerful New Technique for Identifying Privileged Molecular Fragments with Useful Applications in Combinatorial Chemistry". Journal of Chemical Information and Computer Sciences. 38 (3): 511–522. doi:10.1021/ci970429i. PMID 9611787.
- ↑ Vieth, Michal; Siegel, Miles G.; Higgs, Richard E.; Watson, Ian A.; Robertson, Daniel H.; Savin, Kenneth A.; Durst, Gregory L.; Hipskind, Philip A. (2004). "विशेषता भौतिक गुण और विपणित मौखिक दवाओं के संरचनात्मक टुकड़े". Journal of Medicinal Chemistry. 47 (1): 224–232. doi:10.1021/jm030267j. PMID 14695836.
