सिनर्जिस्टोटा: Difference between revisions

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Revision as of 15:04, 20 June 2023

सिनर्जिस्टोटा अवायवीय जीव बैक्टीरिया के जाति का है जो ग्राम-नकारात्मक अभिरंजना प्रदर्शित करता हैं और इसका आकार रॉड / वाइब्रियोइड कोशिका जैसा होता है।[1][2] यद्यपि सिनर्जिस्टोटा में डाइडर्म कोशिका आवरण होता है,[3][4] लिपोपॉलेसेकेराइड जैवसंश्लेषण में सम्मलित विभिन्न प्रोटीनों के जीन अभी तक सिनर्जिस्टोटा में नहीं पाए गए हैं, यह दर्शाता है कि उनके पास एटिपिकल बाहरी कोशिका आवरण हो सकता है।[3][4]सिनर्जिस्टोटा जानवरों के गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल ट्रैक्ट्स, मिट्टी, तेल कुओं और अपशिष्ट जल उपचार संयंत्रों के साथ ही अधिकांश अवायवीय वातावरण में निवास करते हैं और वे मानव रोगों जैसे अल्सर, फोड़े और पेरियोडोंटल रोग के क्षेत्रों में भी उपस्थित होते हैं।[5][6] बीमारी से संबंधित स्थलों पर उनकी उपस्थिति के कारण, सिनर्जिस्टोटा को अवसरवादी रोगजनक होने का सुझाव दिया जाता है, लेकिन वे नाभि के माइक्रोबायोम और साधारणतया योनि वनस्पतियों में भी पाए जा सकते हैं।[6][7] इस समुदाय के अंतर्गत की प्रजातियों को पेरियोडोंटल बीमारी,[8] जठरांत्र संबंधी संक्रमण और कोमल ऊतक संक्रमण के रूप में भी जाना जाता हैं।[6] इस समुदाय की अन्य प्रजातियों को अवायवीय पाचको में बायोगैस के उत्पादन के लिए कीचड़ के क्षरण में महत्वपूर्ण योगदानकर्ता के रूप में पहचाना गया है और हाइड्रोजन गैस के उत्पादन के माध्यम से नवीकरणीय ऊर्जा उत्पादन में उपयोग के लिए संभावित पदान्वेषी हैं।[9] सभी ज्ञात सिनर्जिस्टोटा प्रजातियाँ और जेनेरा वर्तमान में एकल वर्ग (सिनर्जिस्टिया), क्रम (सिनर्जिस्टियालेस) और समूह (सिनर्जिस्टेसिया) का भाग हैं।[2]

तुलनात्मक संजिनी और आणविक संकेत

अनुक्रमित सिनर्जिस्टोटा जीनोम के वर्त्तमान के ही तुलनात्मक विश्लेषणों ने प्रोटीन अनुक्रमों में बड़ी संख्या में संरक्षित संकेत अलोप्य(सीएसआई) की पहचान की है जो की सभी अनुक्रमित सिनर्जिस्टोटा प्रजातियों या उनके कुछ उप-वर्गों के लिए विशिष्ट हैं जो कि जातिवृतिय पेड़ों में देखे गए हैं।[10] जिन सीएसआई की पहचान की गई, उनमें से 32 व्यापक रूप से वितरित प्रोटीन जैसे आरपिओबी, आरपिओसी, युवीआरडी, जीवाईआरए, पिओएलए, पिओएलसी, एम्आरएडब्लू, एनएडीडी, पिवाईआरइ, आरपिएसए, आरपिएसएच, ऍफ़टीएसए, आरएडीए, आदि में बड़े >300 aa अन्तर्निहित के साथ ही आरपिओसी प्रोटीन में, विभिन्न सिनर्जिस्टोटा प्रजातियों में उपस्थित हैं, लेकिन पृथक जीवाणुओं को छोड़कर, ये सीएसआई अन्य सभी जीवों के प्रोटीन समरूपों में नहीं पाए जाते हैं। ये सीएसआई अन्य सभी जीवाणुओं से सिनर्जिस्टोटा प्रजातियों को अलग करने के लिए नविन आणविक चिन्ह प्रदान करते हैं।[10]आरपिओबी में 13 aa के साथ ही महत्वपूर्ण प्रोटीनों में सात अन्य सीएसआई, जोन्क्वेटेला, पिरामिडोबैक्टर और डेथियोसल्फ़ोविब्रियो प्रजातियों में विशिष्ट रूप से उपस्थित पाए गए, जो इन जीवाणुओं के बीच घनिष्ठ और विशिष्ट संबंध का संकेत देते हैं, जो कि जातिवृतिय पेड़ों द्वारा भी दृढ़ता से प्रमाणित है। पंद्रह अतिरिक्त सीएसआई जो केवल जोंकेटेला और पिरामिडोबैक्टर में उपस्थित थे, इन दो प्रजातियों के बीच घनिष्ठ संबंध का संकेत देते हैं।[10]अंत में, अमीनोमोनस और थर्मोनाएरोविब्रियो प्रजातियों के बीच घनिष्ठ संबंध को भी 9 चिन्हित सीएसआई द्वारा प्रमाणित किया गया है। पहचान किए गए आणविक चिन्ह, जातिवृत सिनर्जिस्टोटा से प्रजातियों के विभाजन के लिए विश्वसनीय साधन जैसे समूहों और क्रमो जैसे मध्यवर्ती वर्गीकरणात्मक श्रेणी प्रदान करते हैं।[10]

जातिवृत

See also: जीवाण्विक वर्गिकी
16S rRNA बेस्ड LTP_12_2021[11][12][13] GTDB 07-RS207 जीनोम टैक्सोनॉमी डेटाबेस द्वारा[14][15][16]

वर्गिकी

वर्तमान में स्वीकृत वर्गिकी, नाम पद्धति में उपस्थिति (एलएसपीएन) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची[17] और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र (एनसीबीआई) पर आधारित है।[18]

  • संघ सिनर्जिस्टोटा जुमास -बिलक et al. 2021
    • वर्ग सिनर्जिस्टोटा जुमास -बिलक et al. 2009
      • ऑर्डर सिनर्जिस्टेल्स जुमास -बिलक et al. 2009
        • समूह सिनर्जिस्टेसी जुमास -बिलक et al. 2009 [क्लोस्ट्रीडियल्स समूह एक्स वी; थर्मोसिनर्जिस्टेसी Yang et al. 2021]
          • जीन्स एसिटोमाइक्रोबियम साउटस्चेक et al. 1985 [[[अवायवीय]] Rees et al. 1997]
            • प्रजाति एसिटोमाइक्रोबियम ए. फ्लेविडम साउटस्चेक et al. 1985
            • प्रजातियां एनारोबेकुलम ए. हाइड्रोजनीफॉर्मन्स (मौन तथा टैनर 2012) बेन हैनिया et al. 2016
            • प्रजाति एसीटोमाइक्रोबियम ए. अस्थिर (मेंस तथा म्यूक्सी 2002) बेन हैनिया et al. 2016
            • प्रजाति एसिटोमाइक्रोबियम ए. थर्मोटेरेनम (रिस et al. 1997) बेन हैनिया et al. 2016
          • जीन्स एमिनिफिलस डायज et al. 2007
            • प्रजाति एमिनिफिलस ए. सर्कमस्क्रिप्टस| डायज et al. 2007
          • जीन्स अमिनिविब्रियो हौंडा et al. 2013
            • प्रजाति अमिनिवब्रियो ए. पाइरुवाइटिफिलस| हौंडा et al. 2013
          • जीन्स अमीनोबैक्टीरियम| बेना et al. 1999
            • प्रजाति अमीनोबैक्टीरियम ए. कोलोम्बेयेन्स| बेना et al. 1999 (टाइप एसपी।)
            • प्रजाति अमीनोबैक्टीरियम ए. अस्थिर| बेना et al. 2000
            • प्रजातियां अमीनोबैक्टीरियम ए. टनारियम हैमडी et al. 2015
          • जीन्स अमिनोमोनस बेना et al. 1999
            • प्रजाति अमीनोमोनस ए. पॉसीवोरेंस| बेना et al. 1999
          • जीन्स कैंडिडेटस कैकोकोला गिलरॉय et al. 2021
            • प्रजाति "सीए कैकोकोला सी. फेसिगैलिनेरम| गिलरॉय et al. 2021
            • प्रजाति "सीए कैकोकोला सी. फ़ेसिपुलोरम | गिलरॉय et al. 2021
          • जीन्स क्लोएसिबैसिलस गनेसनet al. 2008 emend. लूफ्ट et al. 2013
            • प्रजाति क्लोएसिबैसिलस सी. इव्रेन्सिस| गनेसन et al. 2008
            • प्रजाति क्लोएसिबैसिलस सी. पोरकोरम| लूफ्ट et al. 2013
          • जीन्स डेथिओसुल्फोविब्रिओ मैगॉट et al. 1997
            • प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो डी.सालसुगिनिस| डायज़-कार्डेन्स et al. 2010
            • प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो डी. पेप्टिडोवोरांस| मैगॉट et al. 1997 (टाइप एसपी।)
            • प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो डी. एसिडएमिनोवोरांस| सर्कोव et al. 2001
            • प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो डी. मारीनस सर्कोव et al. 2001
            • प्रजातियां डेथियोसल्फोविब्रियो डी. रसेंसिस|सर्कोव et al. 2001
          • जीन्स फ्रेटीबैक्टीरियम वरतोकियन et al. 2013
            • प्रजातियां फ्रेटिबैक्टीरियम एफ. फास्टिडिओसम | वरतोकियन et al. 2013
          • जीन्स जोंक्यूटेला जुमास -बिलक et al. 2007
            • प्रजाति जे. एन्थ्रोपि।जुमास -बिलक et al. 2007
          • जीन्स लैक्टिविब्रियो किउ et al. 2014
            • प्रजाति लैक्टिविब्रियो एल. एल्कोहलिकस| किउ et al. 2014
          • जीन्स पकाएला नदोंगो et al. 2017
            • प्रजाति पकाएला पी. मसिलिएन्सिस| नदोंगो et al. 2017
          • जीन्स पाईरामिडोबैक्टर डोनेस et al. 2009
            • प्रजाति पाईरामिडोबैक्टर पी. पिस्कोलेंस| डोनेस et al. 2009
            • प्रजाति पाईरामिडोबैक्टर पी. पोर्सी| वैलेंसक et al. 2021
          • जीन्स रारिमाइक्रोबियम जुमास -बिलक et al. 2015
            • प्रजाति रारिमाइक्रोबियम आर. होमिनिस| जुमास -बिलक et al. 2015
          • जीन्स सिनर्जिस्ट्स एलिसन et al. 1993
            • प्रजाति सिनर्जिस्ट्स एस. जोन्सी| एलिसन et al. 1993
          • जीन्स "कैंडिडेटस टैमेला हानगॉ et al. 2007
            • प्रजाति "सीए टी. कैड्यूसियस| हानगॉ et al. 2007
          • जीन्स थर्मोनेरोविब्रियो बेना et al. 1999 emend. पैल्लानीपन et al. 2013
            • प्रजातियां टी. एसिडएमिनोवोरांस| (गुआंगशेंग et al. 1997) बेना et al. 1999 [सेलेनोमोनास एसिडमिनोवोरेंस गुआंगशेंग et al. 1997] (टाइप एसपी।)
            • प्रजाति टी. वेलॉक्स| जैवरजिना et al. 2000
          • जीन्स थर्मोसिनर्जिस्ट्स यांग et al. 2021
            • प्रजाति टी. पाइरूवेटिवोरंस| यांग et al. 2021
          • जीन्स थर्मोविर्गा डैले तथा बिर्कलैंड 2006
            • प्रजाति टी. लैनी| डैले तथा बिर्कलैंड 2006

संदर्भ

  1. ↑ Hugenholtz, P., Hooper, S.D., and Kyrpides, N.C. (2009). Focus: Synergistetes. Environ. Microbiol. 11, 1327–1329.
  2. ↑ 2.0 2.1 Jumas-Bilak, E.; Roudiere, L.; Marchandin, H. (2009). "'सिनर्जिस्टेट' फाइल का विवरण। नवम्बर और फ़ाइलम 'डिफ़रीबैक्टीरेस' और सिंट्रोफ़ोमोनाडेसी परिवार, फ़ाइलम 'फ़र्मिक्यूट्स' का संशोधित विवरण". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59: 1028–1035. doi:10.1099/ijs.0.006718-0.
  3. ↑ 3.0 3.1 Gupta, R. S. (2011) Origin of Diderm (Gram-negative) Bacteria: Antibiotic Selection Pressure Rather than Endosymbiosis Likely led to the Evolution of Bacterial Cells with Two Membranes. Antonie van Leeuwenhoek. 100: 171–182
  4. ↑ 4.0 4.1 Sutcliffe, I.C. (2010). "बैक्टीरियल सेल एनवेलप आर्किटेक्चर पर एक फाइलम स्तर का परिप्रेक्ष्य". Trends Microbiol. 18: 464–470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.
  5. ↑ Jumas-Bilak, E.; Carlier, J.P.; Jean-Pierre, H.; Citron, D.; Bernard, K.; Damay, A.; Gay, B.; Teyssier, C.; Campos, J.; Marchandin, H. (2007). " जोंक्वेटेला एंथ्रोपी जीन। नव., सपा. नव., उम्मीदवार संघ 'सिनर्जिस्टेटेस' का पहला सदस्य जो मनुष्य से पृथक है". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57: 2743–2748. doi:10.1099/ijs.0.65213-0. PMID 18048718.
  6. ↑ 6.0 6.1 6.2 Vartoukian, S.R., Palmer, R.M., and Wade, W.G. (2007). The division "Synergistes". Anaerobe. 13, 99–106.
  7. ↑ Marchandin, H., Damay, A., Roudiere, L., Teyssier, C., Zorgniotti, I., Dechaud, H., Jean-Pierre, H., and Jumas-Bilak, E. (2010). Phylogeny, diversity and host specialization in the phylum Synergistetes with emphasis on strains and clones of human origin. Res. Microbiol. 161, 91–100.
  8. ↑ Horz, H.P.; D.M. Citron; Y.A. Warren; E.J. Goldstein; G. Conrads (August 2006). "मानव मूल के सिनर्जिस्ट समूह जीव". Journal of Clinical Microbiology. 44 (8): 2914–2920. doi:10.1128/JCM.00568-06. PMC 1594628. PMID 16891512.
  9. ↑ Riviere, D., Desvignes, V., Pelletier, E., Chaussonnerie, S., Guermazi, S., Weissenbach, J., Li, T., Camacho, P., and Sghir, A. (2009). Towards the definition of a core of microorganisms involved in anaerobic digestion of sludge. ISME. J. 3, 700–714.
  10. ↑ 10.0 10.1 10.2 10.3 Bhandari, V.; Gupta, R. S. (2012). "फाइलम सिनर्जिस्टेट्स और इसके कुछ उपवर्गों के लिए आणविक हस्ताक्षर". Antonie van Leeuwenhoek. 102: 517–40. doi:10.1007/s10482-012-9759-2. PMID 22711299.
  11. ↑ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
  12. ↑ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
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  14. ↑ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  15. ↑ "ar53_r207.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
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  17. ↑ J.P. Euzéby. "सहयोग". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2016-03-20.
  18. ↑ Sayers; et al. "सहयोग". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-03-20.
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