क्लोरोफ्लेक्सोटा: Difference between revisions

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== जातिवृत्त ==
वर्तमान में स्वीकृत वर्गीकरण नामकरण में स्थायी (एलपीएसएन)<ref>{{cite web|author=J.P. Euzéby |url=http://www.bacterio.net/-classifphyla.html#Chlorobi |title=क्लोरोफ्लेक्सी|publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN) |access-date=2018-07-20}}</ref> और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र (एनसीबीआई) के साथ प्राक्केंद्रकी नामों की सूची पर आधारित है।।<ref>{{cite web |author = Sayers| url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=200795&lvl=6&lin |title=क्लोरोफ्लेक्सी|access-date=2014-03-20 |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database |display-authors=etal}}</ref>


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! colspan=1 | 16एस आरआरएनए आधारित एलटीपी_12_2021<ref>{{cite web|title=The LTP |url=https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/#LTP| access-date=23 February 2021}}</ref><ref>{{cite web|title=LTP_all tree in newick format| url=https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/wp-content/uploads/ltp/Tree_LTP_all_12_2021.ntree |access-date=23 February 2021}}</ref><ref>{{cite web|title=LTP_12_2021 Release Notes| url=https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/wp-content/uploads/ltp/LTP_12_2021_release_notes.pdf |access-date=23 February 2021}}</ref>
! colspan=1 | 120 पर्णी प्रोटीन आधारित जीटीडीबी 08-आरएस214 (28 अप्रैल 2023)<ref name="about">{{cite web |title=GTDB release 08-RS214 |url=https://gtdb.ecogenomic.org/about#4%7C |website=[[Genome Taxonomy Database]]|access-date=10 May 2023}}</ref><ref name="tree">{{cite web |title=bac120_r214.sp_label |url=https://data.gtdb.ecogenomic.org/releases/release214/214.0/auxillary_files/bac120_r214.sp_labels.tree |website=[[Genome Taxonomy Database]]|access-date=10 May 2023}}</ref><ref name="taxon_history">{{cite web |title=Taxon History |url=https://gtdb.ecogenomic.org/taxon_history/ |website=[[Genome Taxonomy Database]]|access-date=10 May 2023}}</ref>
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== वर्गीकरण ==
== वर्गीकरण ==

Revision as of 15:38, 16 June 2023


क्लोरोफ्लेक्सोटा जीवाणुओं का एक समूह है जिसमें विभिन्न प्रकार के समलक्षणी वाले पृथक होते हैं, जिनमें वायवीय तापरागी वाले सदस्य सम्मिलित होते हैं, जो ऑक्सीजन का उपयोग करते हैं और उच्च तापमान में अच्छी तरह से बढ़ते हैं; एनोक्सीजेनिक फोटोट्रॉफ़्स, जो प्रकाश संश्लेषण के लिए प्रकाश (हरे गैर-सल्फर जीवाणु) का उपयोग करते हैं; और अवायवीय हेलोरेस्पिरर्स, जो इलेक्ट्रॉन अभिग्राही के रूप में हैलोजनित कार्बनिक (जैसे विषाक्त क्लोरीनयुक्त एथेन और बहुक्लोरीनित बाइफेनिल) का उपयोग करता है।

क्लोरोफ्लेक्सोटा संघ के सदस्य मोनोडर्म हैं (अर्थात्, एक कोशिका झिल्ली होती है जिसमें कोई बाहरी झिल्ली नहीं होती), लेकिन वे अधिकतम ग्रैम-अग्राही अभिरंजक होते हैं।[1] जीवाणु के कई अच्छी तरह से अध्ययन किए गए फ़ाइला डिडरम और अभिरंजक ग्रैम-अग्राही हैं, जबकि प्रचलित मोनोडर्म्स जो ग्रैम अभिरंजी को अभिरंजन करते हैं, उनमें फर्मिक्यूट्स (या बैसिलोटा) (निम्न G+C ग्रैम अभिरंजी) एक्टिनोमाइसिटोटा (उच्च-G+C ग्रैम अभिरंजी) और डीइनोकोकोटा (ठोस पेप्टिडोग्लाइकन के साथ ग्रैम अभिरंजी डिडरम्स) सम्मिलित हैं।

इतिहास

वर्गिकी नाम 2001 की व्यवस्थित जीवाणु विज्ञान की बर्गी पुस्तिका के खंड 1 के संस्करण में बनाया गया था और यह क्लोरोफ्लेक्सस नाम का लैटिन मिश्रित है, जो कि फाइलम के प्ररूप प्रजाति का नाम है, जो एक सामान्य जीवाणु वर्गीकरण है।[2]

1987 में, आणविक जातिवृत्त परिक्रमण के अग्रदूतों में से एक के रूप में प्रचलित कार्ल वोइस ने सुजीवाणु को 16S राइबोसोमल आरएनए (एसएसयू) अनुक्रमों के आधार पर 11 भागों में विभाजित किया और वंश क्लोरोफ्लेक्सस हर्पेटोसिफॉन और ताप-माइक्रोबियम को "हरे गैर-सल्फर जीवाणु और संबंधक" में समूहीकृत किया।[3][4] जिसे बर्गी के व्यवस्थित जीवाणु विज्ञान के पुस्तिका के पहले खंड में अस्थायी रूप से ''क्लोरोफ्लेक्सी'' नाम दिया गया था।[5]

क्लोरोफ्लेक्सोटा एक गहरी शाखाओं वाली फाइलम (जीवाणु फ़ाइला देखें) होने के कारण, बर्गी के व्यवस्थित जीवाणु विज्ञान के पुस्तिका के प्रथम खंड में समान नाम के साथ एक वर्ग को सम्मिलित करने पर विचार किया गया था।[5] हालाँकि, 2001 के बाद से, नई खोजी गई प्रजातियों के कारण नए वर्ग बनाए गए हैं, और फाइलम क्लोरोफ्लेक्सी को अब कई वर्गों में विभाजित किया गया है।

"डेहलोकोकाइडेटेस" एक परोक्षी नाम है जो ह्यूजेनहोल्ट्ज और स्टैकब्रांड्ट, 2004 द्वारा दिया गया है,[6] डेहलोकोकाइड्स एथेनोजेन्स" के बाद 1997 में आंशिक रूप से वर्णित एक प्रजाति है।[7] मोए एट अल द्वारा पूरी तरह से वर्णित पहली प्रजाति डेहलोजेनिमोनस लाइकेंथ्रोपोरेपेलेंस थी।[8] लेकिन उस प्रजाति के विवरण में वर्ग को आधिकारिक नहीं बनाया गया था और न ही वर्गों या क्रमों को निर्धारित किया गया था क्योंकि दो प्रजातियां केवल 90% 16S राइबोसोमल आरएनए पहचान साझा करती हैं, जिसका अर्थ है कि वे अलग-अलग वर्गों या यहां तक ​​​​कि क्रमों में आ सकते हैं।[9]

क्लोरोफ्लेक्सोटा के हाल के जातिवृत्तीय विश्लेषण ने वर्तमान में फाइलम का भाग विभिन्न वर्गों के एक साथ समूहीकरण के लिए बहुत दुर्बल समर्थन पाया है।[10] फाइलम बनाने वाले छह वर्गों ने प्रोटीन के बड़े डाटासेट के लिए अनुक्रमित अनुक्रमों के आधार पर जातिवृत्तीय वृक्ष में निरंतर एक अच्छी तरह से समर्थित क्लैड नहीं बनाया है, और कोई संरक्षित संकेत इंडेल की पहचान नहीं की गई थी जो पूरे फाइलम द्वारा विशिष्ट रूप से साझा की गई थी।[10] हालांकि, क्लोरोफ्लेक्सी और तापीय-माइक्रोबियल वर्गों को 50S राइबोसोमल प्रोटीन L19 और एंजाइम यूडीपी-ग्लूकोज 4-एपिमेरेज़ में सामान्य जातिवृत्तीय साधनों और साझा संरक्षित संकेत इंडेल की पहचान दोनों द्वारा निरंतर एक साथ समूह में पाया गया।[10]यह सुझाव दिया गया है कि फाइलम क्लोरोफ्लेक्सी सेंसु स्ट्रिक्टो में केवल क्लोरोफ्लेक्सी और तापीय-माइक्रोबियल वर्ग सम्मिलित होने चाहिए, और अन्य चार वर्ग (डेहलोकोकाइडेटेस, एनारोलिनिया, कैल्डिलिनिया और केडोनोजीवाणु) क्लोरोफ्लेक्सी के प्रतिवेश में एक या एक से अधिक स्वतंत्र फ़ाइला शाखाओं का प्रतिनिधित्व कर सकते हैं।[10]

वर्गीकरण

प्रजाति कैंडिडैटस कैलडीबैक्टर" कोरिग स्पिक एट अल 2020
प्रजाति कैंडिडैटस कैलडीबैक्टर" कोरिग स्पिक एट अल 2020 ["कैंडिडेटस क्लोरोथ्रिक्स" क्लैपेनबैक और पियर्सन 2004 गैर डायर 1921 गैर बर्जर-पेरोट 1982][11]
प्रजाति कैंडिडेटस नाइट्रोकाल्डेरा" स्पिक एट अल 2020
प्रजाति कैंडिडा नाइट्रोथेका स्पिक एट अल 2020
प्रजाति कैंडिडेटस पोरिफ्लेक्सस" कोगावा एट अल 2022
वर्ग लिमनोसिलिंड्रिया" मेहरशाद एट अल 2018

  • वर्ग लिम्नोसिलिंड्रालेस" मेहरशाद एट अल 2018
    • वर्ग लिमनोसिलिंड्रेसेई" मेहरशाद एट अल 2018 (एसएल56)
      • प्रजाति कैंडिडेटस एक्वीडुलसिस" कोरिग रोड्रिगेज-आर एट अल 2020
      • प्रजाति कैंडिडैटस लिमोनोसिलिंड्रस" मेहरशाद एट अल 2018

वर्ग केडोनोबैक्टीरिया कैवालेट्टी एट अल 2007 संशोधन याबे एट अल 2010

  • वर्ग तापीय-जेमाटिसपोरालेस याबे एट अल 2011
    • वर्ग थर्मोगेमाटिसोरेसी याबे एट अल 2011
      • प्रजाति थर्मोजेमाटिसपोरा याबे एट अल 2011[12]
  • वर्ग केटेडोनोबैक्टरलेस कैवालेट्टी एट अल 2007
  • वर्ग डिक्टियोबैक्टीरिया वांग एट अल 2019
  • प्रजाति डिक्टियोबैक्टर याबे एट अल 2017
  • प्रजाति टेंगुनोइबैक्टर वांग एट अल 2019
  • वर्ग केटेडोनोबैक्टीरियासी कैवालेट्टी एट अल 2007
  • प्रजाति केटेडोनोबैक्टर कॉरिग कैवेलेटी एट अल 2007
  • प्रजाति केटेडोनोस्पोरा याबे एट अल 2021
  • वर्ग केटेडोनोस्पोरोबैक्टीरिया यान एट अल 2020
  • प्रजाति केटेडोनोस्पोरोबैक्टर यान एट अल 2020
  • वर्ग रेटिकुलिबैक्टीरिया याबे एट अल 2021
  • प्रजाति रेटिकुलिबैक्टर याबे एट अल 2021
  • वर्ग थर्मोस्पोरोट्रिचैसी याबे एट अल 2010
  • प्रजाति थर्मोस्पोरोथ्रिक्स याबे एट अल 2010[13]

वर्ग उम्ब्रीसाइक्लोपिया" मेहरशाद एट अल 2018

  • कक्षा अम्ब्रीसाइक्लोपेल्स" मेहरशाद एट अल 2018
    • वर्ग अम्ब्रीसाइक्लोपेल्स" मेहरशाद एट अल 2018
      • कैंडिडेटस अम्ब्रिसाइक्लोप्स" मेहरशाद एट अल 2018 (टीके10)

वर्ग बाथोस्फेरिया" मेहरशाद एट अल 2018

  • क्रम बाथोस्फेरलेस" मेहरशाद एट अल 2018
    • वर्ग "बाथोस्फेरेसिया" मेहरशाद एट अल 2018
      • प्रजाति कैंडिडेटस बथोस्फेरा" मेहरशाद एट अल 2018 (जेजी 30-केएफ-सीएम66)

कक्षा टेपिडीफोर्मिया कोचेतकोवा एट अल 2020

  • वर्ग टेपिडिफॉर्मलेस कोचेतकोवा एट अल 2020
    • श्रेणी टेपिडीफोर्मेसी कोचेतकोवा एट अल 2020
      • प्रजाति टेपिडिफॉर्मा कोचेतकोवा एट अल 2020

वर्ग डेहलोंकॉकाइडेट्स लोफलर एट अल 2013

  • क्रम डेहलोंकॉकाइडेल्स लोफलर एट अल 2013
    • वर्ग डेहलोंकोकोइडेसी लोफलर एट अल 2013
      • प्रजाति डेहलोंकॉकाइड्स लोफलर एट अल 2013
      • प्रजाति डेहलोंकॉकाइड्स मो एट अल 2009

वर्ग थर्मोफोंटिया" कोरिग वार्ड एट अल 2018

  • वर्ग "फोटोट्रोफिकल्स" झेंग एट अल 2022
  • श्रेणी "फोटोट्रोफिकेसी" झेंग एट अल 2022
  • प्रजाति "फोटोट्रोफिकस" झेंग एट अल 2022
  • कक्षा अर्देंटिकेटेनिया कावाइची एट अल 2013
  • क्रम अर्देंटिकेनेलेस कावाइची एट अल 2013
  • श्रेणी अर्देंटिकेनेसिया कावाइची एट अल 2013
  • प्रजाति अर्देंटिकटेना कवाइची एट अल 2013
  • वर्ग "कैल्डिलिनिया" ओरेन, पार्टे और गैरीटी 2016 पूर्व कैवेलियर-स्मिथ 2020
  • क्रम कैल्डिलिनियल्स यामादा एट अल 2006
  • प्रजाति "कैंडिडैटस डिफ्लुविफिलम" नीरीक्लो एट अल 2019
  • श्रेणी "अमरोलिनेसी" औररसन एट अल 2019
  • प्रजाति "कैंडिडैटस अमरोलिनिया" औररसन एट अल 2019
  • वंश कैल्डिलीनएसी यामाडा एट अल 2006
  • प्रजाति कैल्डिलिनिया सेकिगुची एट अल 2003
  • प्रजाति लिटोरिलिनिया काले एट अल 2013
  • वर्ग थर्मोफ्लेक्सिया डोड्सवर्थ एट अल 2014
  • क्रम थर्मोफ्लेक्सलेस डोड्सवर्थ एट अल। 2014
    • वंश थर्मोफ्लेक्सेसी डोड्सवर्थ एट अल। 2014
      • प्रजाति कैंडिडैटस रोज़िलिनिया" थिएल एट अल। 2016
      • प्रजाति थर्मोफ्लेक्सस डोड्सवर्थ एट अल। 2014

कक्षा एनेरोलाइनी ओरेन, पार्टे और गैरीटी 2016

  • वर्ग प्रोफंडिसोलिटेरिएसी मेहरशाद एट अल 2018
    • प्रजाति कैंडिडेटस प्रोफंडिसोलिटेरियस" मेहरशाद एट अल 2018 (सीएल500-11)
  • श्रेणी प्रोमिनिफिललेस
  • **वर्ग प्रोमिनीफिलेसी
      • कैंडिडेटस प्रोमिनीफिलम" कोरिग। मैकइलरॉय एट अल 2016
      • क्रम एग्रीगेटिलिनियल्स नाकाहारा एट अल 2019
      • वंश एग्रीगेटिलिनेसी नाकाहारा एट अल 2019
      • प्रजाति एग्रीगेटिलिनिया नाकाहारा एट अल 2019
      • क्रम एनेरोलिनियल्स यामाडा एट अल 2006
      • वंश एनेरोलिनेसी यामाडा एट अल 2006
      • प्रजाति एनेरोलिनिया सेकिगुची एट अल 2003 संशोधन यमदा एट अल 2006
      • प्रजाति बेलिलिनिया यामादा एट अल 2007[14]
      • प्रजाति "ब्रेवेफिलम" मैकइलरॉय एट अल 2017
      • प्रजाति "कैंडिडेटस डेनिट्रोलिनिया" ओकुबो एट अल 2021
      • प्रजाति "डेसल्फ़ोलिनिया" वैन व्लियेट एट अल 2020
      • प्रजाति फ्लेक्सीलिनिया सन एट अल 2015
      • प्रजाति लेविलिनिया यामादा एट अल 2006[15]
      • प्रजाति लेप्टोलिनिया यामादा एट अल 2006[15]
      • प्रजाति लॉन्गिलिनिया यामादा एट अल 2007[14]
      • प्रजाति ऑर्नाटिलिनिया पोडोसोकोर्स्काया एट अल 2013
      • प्रजाति पेलोलिनिया इमाची एट अल 2014
      • प्रजाति थर्मोमेरिनिलिनिया नुनौरा एट अल 2013
      • प्रजाति "थर्मानेरोथ्रिक्स" ग्रेगोइरे एट अल 2011[16]
      • प्रजाति "कैंडिडैटस" विलिगरासिलिस नीरीचलो एट अल 2019
  • वर्ग थर्मोमाइक्रोबिया ओरेन, पार्टे और गैरिटी 2016
  • प्रजाति थर्मलबिबैक्टर झाओ एट अल। 2023
  • क्रम स्फेरोबैक्टेरेल्स स्टैकब्रांड्ट, राइनी और वार्ड-रेनी 1997
  • श्रेणी स्पैरोबैक्टीरिया स्टैकेब्रांड्ट, राइनी और वार्ड-रेनी 1997
  • प्रजाति नाइट्रोलेंसिया सोरोकिन एट अल 2014 ["नाइट्रोलैंसेटस" सोरोकिन एट अल। 2012]
  • प्रजाति स्फेरोबैक्टर डेमहार्टर एट अल। 1989
  • क्रम थर्मोमाइक्रोबियल्स गैरिटी और होल्ट 2002
  • वंश थर्मोमाइक्रोबिएसी गैरिटी और होल्ट 2002
  • प्रजाति थर्मोमाइक्रोबियम जैक्सन, रैमले और मेन्सचेन 1973
  • प्रजाति थर्मोरूडिस किंग और किंग 2014
  • वर्ग क्लोरोफ्लेक्सिया गुप्ता एट अल 2013
  • प्रजाति "डेहलोंबियम" वू एट अल 2002[17]
  • प्रजाति "कैंडिडेटस लिथोफ्लेक्सस" सघई एट अल 2020
  • प्रजाति "कैंडिडेटस सार्सिनिथ्रिक्स" नीरीक्लो एट अल 2019
  • क्रम "थर्मोबैक्युलस"
  • वंश "थर्मोबैकुलेसी"
  • प्रजाति "थर्मोबेकुलम" बोटेरो एट अल 2004
  • क्रम कल्लोटेनुअल्स कोल एट अल।2013
  • वंश Kallotenuaceae कोल एट अल 2013
  • प्रजाति कल्लोटेन्यू कोल एट अल 2013
  • क्रम Herpetosiphonales गुप्ता एट अल 2013
  • वंश हर्पेटोसिफॉनेसी गुप्ता एट अल 2013
  • प्रजाति "कैंडिडेटस एंथेकटिकोसिफॉन" वार्ड, फिशर और मैकग्लिन 2020
  • प्रजाति हर्पेटोसिफॉन होल्ट और लेविन 1968 [फ्लैविलिटोरिबैक्टर गार्सिया-लोपेज़ एट अल 2020]
  • क्रम क्लोरोफ्लेक्सलेस गुप्ता एट अल 2013
  • उपक्रम रोजीफ्लेक्सीनी गुप्ता एट अल 2013
  • वंश रोजीफ्लेक्सेसी गुप्ता एट अल 2013 ["कौलोट्रिचैसी" मेहरशाद एट अल। 2018]
  • प्रजाति "कौलोथ्रिक्स" कोहनो एट अल 2002
  • प्रजाति हेलियोथ्रिक्स पियर्सन एट अल 1986
  • प्रजाति रोजिफ्लेक्सस हनाडा एट अल 2002
  • उपक्रम क्लोरोफ्लेक्सिनी गुप्ता एट अल 2013
  • वंश क्लोरोफ्लेक्सेसी गुप्ता एट अल 2013
  • प्रजाति कैंडिडेटस क्लोरैनेरोफिलम थिएल एट अल 2016
  • प्रजाति क्लोरोफ्लेक्सस पियर्सन और कास्टेनहोल्ज़ 1974 ["क्लोरोक्रिनिस"]
  • वंश ऑसिलोक्लोरिडेसी गुप्ता एट अल 2013
  • प्रजाति कैंडिडेटस क्लोरोप्लोका गोरलेंको एट अल 2014
  • प्रजाति क्लोरोनेमा ♪ डबिनिना और गोरलेंको 1975
  • प्रजाति ऑसिलोक्लोरिस गोर्लेंको और पिवोवारोवा 1989
  • प्रजाति कैंडिडेटस विरिडिलिनिया ग्रोज़देव एट अल 2018


व्युत्पत्ति

क्लोरोफ्लेक्सी नाम क्लोरोफ्लेक्सस का एक नियोलेटिन नाममात्र का उद्योगी बहुल है, जो पहले वर्णित प्रजाति का नाम है। इसका नाम ग्रीक विशेषण क्लोरोस पर (χλωρός, -ά, -όν) का एक संयोजन है,[18] जिसका अर्थ हरित-पीला है, और लैटिन उद्योगी निष्क्रिय पूर्ण भाग फ्लेक्सस (फ्लेक्टो का)[19] का संयोजन है।[5] व्युत्पत्ति क्लोरीन से संबंधित नहीं है, एक तत्व जिसे 1810 में सर हम्फ्री डेवी द्वारा खोजा गया था और इसका नाम उसके हल्के हरे रंग के नाम पर रखा गया था। समान मूल वाला एक अन्य संघ क्लोरोबायोटा है, जबकि साइनोबैक्टीरीया के आधार सायनोस (κύανος) है, जिसका अर्थ नीला-हरा है।[20]

कुछ अन्य फाइला के विपरीत, क्लोरोफ्लेक्सोटा के वंश के नाम पर कोई विषय-आधारित नहीं है, और वास्तव में "क्लोरो-" से प्रारंभ होने वाले या "-क्लोरिस" में समाप्त होने वाले कई वंश या तो साइनोबैक्टीरिया या क्लोरोबी हैं।

संदर्भ

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  7. {{Cite journal | last1 = Maymo-Gatell | first1 = X. | last2 = Chien | first2 = Y. | last3 = Gossett | first3 = J. M. | last4 = Zinder | first4 = S. H. | title = एक जीवाणु का अलगाव जो टेट्राक्लोरोइथीन को कम करके ईथीन में बदल देता है| doi = 10.1126/science.276.5318.1568 | journal = Science | volume = 276 | issue = 5318 | pages = 1568–1571 | year = 1997 | pmid = 9171062}
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  9. Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named Dehalogenimonas
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  19. Lewis & Short...
  20. κύανος. Liddell, Henry George; Scott, Robert; A Greek–English Lexicon at the Perseus Project

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