गार्ड मॉडल: Difference between revisions
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[[ जीवोत्पत्ति |जीवोत्पत्ति]] के संदर्भ में, लिपिड-दुनिया सरल अणुओं की असेंबली का सुझाव देती है, जैसे कि [[लिपिड]], सूचनाओं को संग्रहीत और प्रसारित कर सकते हैं, इस प्रकार विकास से गुजरते हैं।<ref>{{cite journal |last1=Segre |first1=D. |last2=Ben-Eli |first2=D. |last3=Deamer |first3=D. |last4=Lancet |first4=D. |s2cid=10959497 |year=2001 |title=लिपिड दुनिया|journal=Orig Life Evol Biosph |volume=31 |issue=1–2 |pages=119–145 |doi=10.1023/A:1006746807104 |pmid=11296516 |bibcode=2001OLEB...31..119S}}</ref> | |||
जीवन की उत्पत्ति में भूमिका निभाने के लिए इन 'रचनात्मक सभाओं' का सुझाव दिया गया है। विचार यह है कि सूचनाओं को पीढ़ी दर पीढ़ी हस्तांतरित किया जा रहा है, यह संरचनागत जानकारी है - एक विधानसभा के भीतर विभिन्न प्रकार और अणुओं की मात्रा। यह आरएनए या [[डीएनए]] में एन्कोडेड जानकारी से अलग है, जो कि ऐसे अणु में आधारों का विशिष्ट अनुक्रम है। इस प्रकार, मॉडल को आरएनए विश्व परिकल्पना के विकल्प या पूर्वज के रूप में देखा जाता है। | जीवन की उत्पत्ति में भूमिका निभाने के लिए इन 'रचनात्मक सभाओं' का सुझाव दिया गया है। विचार यह है कि सूचनाओं को पीढ़ी दर पीढ़ी हस्तांतरित किया जा रहा है, यह संरचनागत जानकारी है - एक विधानसभा के भीतर विभिन्न प्रकार और अणुओं की मात्रा। यह आरएनए या [[डीएनए]] में एन्कोडेड जानकारी से अलग है, जो कि ऐसे अणु में आधारों का विशिष्ट अनुक्रम है। इस प्रकार, मॉडल को आरएनए विश्व परिकल्पना के विकल्प या पूर्वज के रूप में देखा जाता है। | ||
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एक असेंबली का रचना वेक्टर | एक असेंबली का रचना वेक्टर <math>v=n_1\cdots n_{N_G}</math> के रूप में लिखा जाता है। जहां <math> n_1\cdots n_{N_G} </math> असेंबली के भीतर लिपिड टाइप के आणविक मायने हैं और NG कितने अलग-अलग लिपिड प्रकार सम्मिलित हैं (प्रदर्शनों की सूची आकार)। | ||
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<math>k_f</math> और <math>k_b</math> बेसल फॉरवर्ड (जॉइनिंग) और बैकवर्ड (छोड़ने) दर स्थिरांक हैं | <math>k_f</math> और <math>k_b</math> बेसल फॉरवर्ड (जॉइनिंग) और बैकवर्ड (छोड़ने) दर स्थिरांक हैं βij एक गैर-नकारात्मक दर वृद्धि है जो पर्यावरण से प्रकार '''i''' पर असेंबली के भीतर अणु प्रकार '''j''' द्वारा लगाई गई है और ρ प्रत्येक अणु की पर्यावरणीय सांद्रता है प्रकार। β को निर्देशित, भारित, [[जटिल नेटवर्क]] के रूप में देखा जाता है। | ||
असेंबली वर्तमान आकार <math>N=\sum_{i=1}^{N_G}n_i</math> है। असेंबली एक अधिकतम आकार, एनएमएक्स, आमतौर पर एनजी के क्रम में पहुंचने के बाद सिस्टम को विखंडन क्रिया लगाकर संतुलन से दूर रखा जाता है। यह विभाजन क्रिया एक ही आकार की दो संतान पैदा करती है, और जिनमें से एक को फिर से उगाया जाता है। | |||
[[गिलेस्पी एल्गोरिथम]] का उपयोग करते हुए मॉडल को [[ मोंटे कार्लो एल्गोरिथ्म ]] आधारित सिमुलेशन के अधीन किया गया है। | [[गिलेस्पी एल्गोरिथम]] का उपयोग करते हुए मॉडल को [[ मोंटे कार्लो एल्गोरिथ्म |मोंटे कार्लो एल्गोरिथ्म]] आधारित सिमुलेशन के अधीन किया गया है। | ||
== चयन == | == चयन == | ||
2010 में, [[Eors Szathmary]] और सहयोगियों ने | 2010 में, [[Eors Szathmary|एर्स ज़ाथमरी]] और सहयोगियों ने गार्ड को एक आदर्श चयापचय-प्रथम अहसास के रूप में चुना है।<ref>{{cite journal |last1=Vasas |first1=Vera |last2=Szathmáry |first2=Eörs |last3=Santos |first3=Mauro |title=आत्मनिर्भर ऑटोकैटलिटिक नेटवर्क में विकास की कमी जीवन की उत्पत्ति के लिए चयापचय-पहला परिदृश्यों को बाधित करती है|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America |date=26 January 2010 |volume=107 |issue=4 |pages=1470–1475 |doi=10.1073/pnas.0912628107 |pmid=20080693 |pmc=2824406 |bibcode=2010PNAS..107.1470V |doi-access=free }}</ref> उन्होंने मॉडल में चयन गुणांक पेश किया है, जो असेंबली की वृद्धि दर को बढ़ाता या घटाता है, यह इस बात पर निर्भर करता है कि वे किसी दिए गए लक्ष्य के समान या असमान हैं। उन्होंने पाया कि विधानसभाओं की रैंकिंग चयन के दबाव से अप्रभावित है, और निष्कर्ष निकाला कि गार्ड डार्विनियन विकास को प्रदर्शित नहीं करता है। | ||
2012 में यह दिखाया गया था कि यह आलोचना गलत है और [[डोरोन लैंसेट]] और [[ओमर मार्कोविच]] द्वारा इसका खंडन किया गया | 2012 में यह दिखाया गया था कि यह आलोचना गलत है और [[डोरोन लैंसेट]] और [[ओमर मार्कोविच]] द्वारा इसका खंडन किया गया था।<ref>{{cite journal |last1=Markovitch |first1=O. |last2=Lancet |first2=D. |s2cid=5236043 |year=2012 |title=प्रभावी विकास के लिए अतिरिक्त म्युचुअल कटैलिसीस आवश्यक है|journal=Artificial Life |volume=18 |issue=3 |pages=243–266 |doi=10.1162/artl_a_00064 |pmid=22662913}}</ref> 2010 के पेपर की दो प्रमुख कमियां थीं: (1) उन्होंने एक सामान्य सभा पर ध्यान केंद्रित किया है, न कि एक संयोजन या कॉम्पोटाइप पर (क्रमशः ईमानदारी से प्रतिकृति और अर्ध-प्रजातियां) (2) उन्होंने चयन क्षमता का परीक्षण करने के लिए केवल एक, यादृच्छिक, सिमुलेशन का प्रदर्शन किया है। | ||
== क्वासिस्पीज == | == क्वासिस्पीज == | ||
[[अर्ध-प्रजाति मॉडल]] उन प्रतिकृतियों की आबादी का वर्णन करता है जो अपेक्षाकृत उच्च उत्परिवर्तन के साथ दोहराते हैं। म्यूटेशन और बैक म्यूटेशन के कारण जनसंख्या अंततः एक मास्टर-रेप्लिकेटर (मास्टर अनुक्रम) के आसपास केंद्रित हो जाती है। | [[अर्ध-प्रजाति मॉडल]] उन प्रतिकृतियों की आबादी का वर्णन करता है जो अपेक्षाकृत उच्च उत्परिवर्तन के साथ दोहराते हैं। म्यूटेशन और बैक म्यूटेशन के कारण जनसंख्या अंततः एक मास्टर-रेप्लिकेटर (मास्टर अनुक्रम) के आसपास केंद्रित हो जाती है। गार्ड की आबादी को एक मास्टर-कंपोटाइप के चारों ओर एक अर्ध-प्रजाति बनाने के लिए दिखाया गया था और आरएनए वायरस जैसे शास्त्रीय अर्ध-प्रजातियों के समान एक त्रुटि तबाही प्रदर्शित करने के लिए दिखाया गया था।<ref>{{cite journal |last1=Gross |first1=Renan |last2=Fouxon |first2=Itzhak |last3=Lancet |first3=Doron |last4=Markovitch |first4=Omer |title=रचनात्मक विधानसभाओं की जनसंख्या में क्वासिसिस|journal=BMC Evolutionary Biology |date=30 December 2014 |volume=14 |issue=1 |page=265 |doi=10.1186/s12862-014-0265-1 |pmid=25547629 |pmc=4357159 }}</ref> | ||
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* | *गार्ड10 MATLAB code (see Markovitch and Lancet, 2012): [https://github.com/ModelingOriginsofLife/GARD https://github.com/ModelingOriginsofLife/गार्ड] | ||
*Doron Lancet [http://www.weizmann.ac.il/molgen/members/lancet.html homepage] at [[Weizmann Institute of Science]], who is the inventor of | *Doron Lancet [http://www.weizmann.ac.il/molgen/members/lancet.html homepage] at [[Weizmann Institute of Science]], who is the inventor of गार्ड. | ||
*Origin of life ([http://ool.weizmann.ac.il OOL] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20070710121329/http://ool.weizmann.ac.il/ |date=2007-07-10 }}) at the Weizmann Institute. | *Origin of life ([http://ool.weizmann.ac.il OOL] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20070710121329/http://ool.weizmann.ac.il/ |date=2007-07-10 }}) at the Weizmann Institute. | ||
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Revision as of 16:55, 24 May 2023
विकासवादी जीव विज्ञान में, गार्ड मॉडल (क्रमिक स्व-उत्प्रेरण प्रतिकृति डोमेन मॉडल) होमोस्टैटिक-ग्रोथ और संघटनात्मक-असेंबली के विखंडन के लिए एक सामान्य गतिक मॉडल है, जिसमें लिपिड के लिए विशिष्ट अनुप्रयोग है।[1]
जीवोत्पत्ति के संदर्भ में, लिपिड-दुनिया सरल अणुओं की असेंबली का सुझाव देती है, जैसे कि लिपिड, सूचनाओं को संग्रहीत और प्रसारित कर सकते हैं, इस प्रकार विकास से गुजरते हैं।[2]
जीवन की उत्पत्ति में भूमिका निभाने के लिए इन 'रचनात्मक सभाओं' का सुझाव दिया गया है। विचार यह है कि सूचनाओं को पीढ़ी दर पीढ़ी हस्तांतरित किया जा रहा है, यह संरचनागत जानकारी है - एक विधानसभा के भीतर विभिन्न प्रकार और अणुओं की मात्रा। यह आरएनए या डीएनए में एन्कोडेड जानकारी से अलग है, जो कि ऐसे अणु में आधारों का विशिष्ट अनुक्रम है। इस प्रकार, मॉडल को आरएनए विश्व परिकल्पना के विकल्प या पूर्वज के रूप में देखा जाता है।
मॉडल
एक असेंबली का रचना वेक्टर के रूप में लिखा जाता है। जहां असेंबली के भीतर लिपिड टाइप के आणविक मायने हैं और NG कितने अलग-अलग लिपिड प्रकार सम्मिलित हैं (प्रदर्शनों की सूची आकार)।
अणु प्रकार i की गिनती में परिवर्तन द्वारा वर्णित है:
और बेसल फॉरवर्ड (जॉइनिंग) और बैकवर्ड (छोड़ने) दर स्थिरांक हैं βij एक गैर-नकारात्मक दर वृद्धि है जो पर्यावरण से प्रकार i पर असेंबली के भीतर अणु प्रकार j द्वारा लगाई गई है और ρ प्रत्येक अणु की पर्यावरणीय सांद्रता है प्रकार। β को निर्देशित, भारित, जटिल नेटवर्क के रूप में देखा जाता है।
असेंबली वर्तमान आकार है। असेंबली एक अधिकतम आकार, एनएमएक्स, आमतौर पर एनजी के क्रम में पहुंचने के बाद सिस्टम को विखंडन क्रिया लगाकर संतुलन से दूर रखा जाता है। यह विभाजन क्रिया एक ही आकार की दो संतान पैदा करती है, और जिनमें से एक को फिर से उगाया जाता है।
गिलेस्पी एल्गोरिथम का उपयोग करते हुए मॉडल को मोंटे कार्लो एल्गोरिथ्म आधारित सिमुलेशन के अधीन किया गया है।
चयन
2010 में, एर्स ज़ाथमरी और सहयोगियों ने गार्ड को एक आदर्श चयापचय-प्रथम अहसास के रूप में चुना है।[3] उन्होंने मॉडल में चयन गुणांक पेश किया है, जो असेंबली की वृद्धि दर को बढ़ाता या घटाता है, यह इस बात पर निर्भर करता है कि वे किसी दिए गए लक्ष्य के समान या असमान हैं। उन्होंने पाया कि विधानसभाओं की रैंकिंग चयन के दबाव से अप्रभावित है, और निष्कर्ष निकाला कि गार्ड डार्विनियन विकास को प्रदर्शित नहीं करता है।
2012 में यह दिखाया गया था कि यह आलोचना गलत है और डोरोन लैंसेट और ओमर मार्कोविच द्वारा इसका खंडन किया गया था।[4] 2010 के पेपर की दो प्रमुख कमियां थीं: (1) उन्होंने एक सामान्य सभा पर ध्यान केंद्रित किया है, न कि एक संयोजन या कॉम्पोटाइप पर (क्रमशः ईमानदारी से प्रतिकृति और अर्ध-प्रजातियां) (2) उन्होंने चयन क्षमता का परीक्षण करने के लिए केवल एक, यादृच्छिक, सिमुलेशन का प्रदर्शन किया है।
क्वासिस्पीज
अर्ध-प्रजाति मॉडल उन प्रतिकृतियों की आबादी का वर्णन करता है जो अपेक्षाकृत उच्च उत्परिवर्तन के साथ दोहराते हैं। म्यूटेशन और बैक म्यूटेशन के कारण जनसंख्या अंततः एक मास्टर-रेप्लिकेटर (मास्टर अनुक्रम) के आसपास केंद्रित हो जाती है। गार्ड की आबादी को एक मास्टर-कंपोटाइप के चारों ओर एक अर्ध-प्रजाति बनाने के लिए दिखाया गया था और आरएनए वायरस जैसे शास्त्रीय अर्ध-प्रजातियों के समान एक त्रुटि तबाही प्रदर्शित करने के लिए दिखाया गया था।[5]
यह भी देखें
- अजीवात् जीवोत्पत्ति
- प्रोटो कोशिकाए
संदर्भ
- ↑ Segré, Daniel; Ben-Eli, Dafna; Lancet, Doron (11 April 2000). "Compositional genomes: Prebiotic information transfer in mutually catalytic noncovalent assemblies". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (8): 4112–4117. Bibcode:2000PNAS...97.4112S. doi:10.1073/pnas.97.8.4112. PMC 18166. PMID 10760281.
- ↑ Segre, D.; Ben-Eli, D.; Deamer, D.; Lancet, D. (2001). "लिपिड दुनिया". Orig Life Evol Biosph. 31 (1–2): 119–145. Bibcode:2001OLEB...31..119S. doi:10.1023/A:1006746807104. PMID 11296516. S2CID 10959497.
- ↑ Vasas, Vera; Szathmáry, Eörs; Santos, Mauro (26 January 2010). "आत्मनिर्भर ऑटोकैटलिटिक नेटवर्क में विकास की कमी जीवन की उत्पत्ति के लिए चयापचय-पहला परिदृश्यों को बाधित करती है". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (4): 1470–1475. Bibcode:2010PNAS..107.1470V. doi:10.1073/pnas.0912628107. PMC 2824406. PMID 20080693.
- ↑ Markovitch, O.; Lancet, D. (2012). "प्रभावी विकास के लिए अतिरिक्त म्युचुअल कटैलिसीस आवश्यक है". Artificial Life. 18 (3): 243–266. doi:10.1162/artl_a_00064. PMID 22662913. S2CID 5236043.
- ↑ Gross, Renan; Fouxon, Itzhak; Lancet, Doron; Markovitch, Omer (30 December 2014). "रचनात्मक विधानसभाओं की जनसंख्या में क्वासिसिस". BMC Evolutionary Biology. 14 (1): 265. doi:10.1186/s12862-014-0265-1. PMC 4357159. PMID 25547629.
बाहरी संबंध
- गार्ड10 MATLAB code (see Markovitch and Lancet, 2012): https://github.com/ModelingOriginsofLife/गार्ड
- Doron Lancet homepage at Weizmann Institute of Science, who is the inventor of गार्ड.
- Origin of life (OOL Archived 2007-07-10 at the Wayback Machine) at the Weizmann Institute.
