स्यूडोमोनडोटा: Difference between revisions

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* [[Alphaproteobacteria]]<ref name=GarrityBellLilburn>{{cite book | author1 = Garrity, G.M. | author2 = Bell, J.A. | author3 = Lilburn, T. | chapter = Class&nbsp;I. ''Alphaproteobacteria'' class. nov. | editor1 = Brenner, D.J. | editor2 = Krieg, N.R. | editor3 = Staley, J.T. | editor4 = Garrity, G.M. | title = Bergey's Manual of Systematic Bacteriology |volume = 2: The ''Proteobacteria'', Part&nbsp;C (The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria | edition=2nd | publisher = Springer | year = 2005 | page=1 | doi=10.1002/9781118960608.cbm00041 | isbn = 9781118960608 }}</ref>
* [[Betaproteobacteria]]<ref name=Bodenetal2017>{{cite journal |author1=Boden, R. |author2=Hutt, L.P. |author3=Rae, A.W. |year=2017 |title=Reclassification of ''Thiobacillus aquaesulis'' {{small|(Wood & Kelly, 1995)}} as ''Annwoodia aquaesulis'' gen. nov., comb. nov., transfer of ''Thiobacillus'' {{small|(Beijerinck, 1904)}} from the ''Hydrogenophilales'' to the ''Nitrosomonadales'', proposal of ''Hydrogenophilalia'' class. nov. within the "''Proteobacteria''", and four new families within the orders ''Nitrosomonadales'' and ''Rhodocyclales'' |journal=International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology |volume=67 |issue=5 |pages=1191–1205 |doi=10.1099/ijsem.0.001927 |doi-access=free |pmid=28581923 |hdl=10026.1/8740}}</ref>
* [[Gammaproteobacteria]]<ref name=WilliamsKelly>{{cite journal |author1 = Williams, K.P. |author2 = Kelly, D.P. | year = 2013 | title = Proposal for a new class within the phylum ''Proteobacteria'', ''Acidithiobacillia'' classis nov., with the type order ''Acidithiobacillales'', and emended description of the class ''Gammaproteobacteria'' | journal = International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology | volume = 63 | issue = 8 | pages = 2901–2906 | doi = 10.1099/ijs.0.049270-0| pmid = 23334881 | s2cid = 39777860 | url = https://semanticscholar.org/paper/fa17a78b8e9f295665d111a43414bc344ef68485 }}</ref>
<!-- Deltaproteobacteria was reclassified as Myxococcota. -->
<!-- Epsilonproteobacteria was reclassified as Campylobacterota. -->
* [[Hydrogenophilalia]]<ref name=Bodenetal2017 />
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* [[Zetaproteobacteria]]<ref name="Emerson2007">{{cite journal | last1 = Emerson | first1 = D. | last2 = Rentz | first2 = J.A. | last3 = Lilburn | first3 = T.G. | last4 = Davis | first4 = R.E. | last5 = Aldrich | first5 = H. | last6 = Chan | first6 = C. | last7 = Moyer | first7 = C.L. | year = 2007 | title = A novel lineage of proteobacteria involved in formation of marine Fe-oxidizing microbial mat communities | journal = PLOS ONE | volume = 2 | issue = 8 | page = e667 | doi = 10.1371/journal.pone.0000667 | doi-access = free  | pmc = 1930151 | pmid = 17668050 |bibcode = 2007PLoSO...2..667E}}</ref>
| synonyms =
* "Proteobacteria" <small>Stackebrandt et al. 1988</small><ref name=stack>{{cite journal |last1=Stackebrandt |first1=E. |last2=Murray |first2=R.G.E. |last3=Truper |first3=H.G. |year=1988 |title=Proteobacteria classis nov., a name for the phylogenetic taxon that includes the "purple bacteria and their relatives" |journal=International Journal of Systematic Bacteriology |volume=38 |issue=3 |pages=321–325 |doi=10.1099/00207713-38-3-321 |doi-access=free}}</ref>
* "Proteobacteria" <small>Gray and Herwig 1996</small><ref>{{cite journal | vauthors = Gray JP, ((Herwig RP.)) | title = Phylogenetic analysis of the bacterial communities in marine sediments | journal = Appl Environ Microbiol | year = 1996 | volume = 62 | issue = 11 | pages = 4049–4059 | doi = 10.1128/aem.62.11.4049-4059.1996 | pmid = 8899989 | pmc = 168226| bibcode = 1996ApEnM..62.4049G }}</ref>
* "Proteobacteria" <small>Garrity et al. 2005</small><ref>{{cite book |author1=Garrity, G.M. |author2=Bell, J.A. |author3=Lilburn, T. |year=2005 |section=Phylum&nbsp;XIV. Proteobacteria phyl. nov. |title=Bergey's Manual of Systematic Bacteriology |edition=2nd |volume=2 (Proteobacteria), part&nbsp;B (Gammaproteobacteria) |page=1 |editor1=Brenner, D.J. |editor2=Krieg, N.R. |editor3=Staley, J.T. |editor4=Garrity, G.M. |place=New York, NY |publisher=Springer}}</ref>
* "Proteobacteria" <small>[[Cavalier-Smith]] 2002</small><ref>{{cite journal | author = Cavalier-Smith T. | title = The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification | journal = Int J Syst Evol Microbiol | year = 2002 | volume = 52 | issue = 1 | pages = 7–76 | doi = 10.1099/00207713-52-1-7 | pmid = 11837318| doi-access = free }}</ref>
* Alphaproteobacteraeota <small>Oren et al. 2015</small>
* "Alphaproteobacteriota" <small>Whitman et al. 2018</small>
* "Caulobacterota" <small>corrig. Garrity et al. 2021</small>
* "Neoprotei" <small>Pelletier 2012</small>
* Rhodobacteria <small>Cavalier-Smith 2002</small>
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स्यूडोमोनडोटा (पर्यायवाची प्रोटीनबैक्टीरिया) [[ग्राम-नकारात्मक जीवाणु]]ओं का एक प्रमुख समूह है। 2021 में स्यूडोमोनडोटा सहित कई प्रोकैरियोट फ़ाइला का नामकरण, सूक्ष्म जीवविज्ञानी के बीच विवादास्पद बना हुआ है, जिनमें से कई साहित्य में लंबे समय से पहले के नाम प्रोटोबैक्टीरिया का उपयोग करना जारी रखते हैं।<ref>{{cite web | url=https://www.the-scientist.com/news-opinion/newly-renamed-prokaryote-phyla-cause-uproar-69578 | title=Newly Renamed Prokaryote Phyla Cause Uproar }}</ref> फाइलम प्रोटोबैक्टीरिया में [[ Escherichia ]], साल्मोनेला, विब्रियो, यर्सिनिया, [[लीजोनेला]] और कई अन्य जैसे रोगजनक जेनेरा की एक विस्तृत विविधता शामिल है।<ref name="Slonczewski">Slonczewski JL, Foster JW, Foster E. Microbiology: An Evolving Science 5th Ed. WW Norton & Company; 2020.</ref> अन्य मुक्त-जीवित (गैर-परजीवीवाद) हैं और इसमें नाइट्रोजन स्थिरीकरण के लिए जिम्मेदार कई [[ जीवाणु ]] शामिल हैं।
स्यूडोमोनडोटा (पर्यायवाची प्रोटीनबैक्टीरिया) [[ग्राम-नकारात्मक जीवाणु]]ओं का एक प्रमुख समूह है। 2021 में स्यूडोमोनडोटा सहित कई प्रोकैरियोट फ़ाइला का नामकरण, सूक्ष्म जीवविज्ञानी के बीच विवादास्पद बना हुआ है, जिनमें से कई साहित्य में लंबे समय से पहले के नाम प्रोटोबैक्टीरिया का उपयोग करना जारी रखते हैं।<ref>{{cite web | url=https://www.the-scientist.com/news-opinion/newly-renamed-prokaryote-phyla-cause-uproar-69578 | title=Newly Renamed Prokaryote Phyla Cause Uproar }}</ref> फाइलम प्रोटोबैक्टीरिया में [[ Escherichia ]], साल्मोनेला, विब्रियो, यर्सिनिया, [[लीजोनेला]] और कई अन्य जैसे रोगजनक जेनेरा की एक विस्तृत विविधता शामिल है।<ref name="Slonczewski">Slonczewski JL, Foster JW, Foster E. Microbiology: An Evolving Science 5th Ed. WW Norton & Company; 2020.</ref> अन्य मुक्त-जीवित (गैर-परजीवीवाद) हैं और इसमें नाइट्रोजन स्थिरीकरण के लिए जिम्मेदार कई [[ जीवाणु ]] शामिल हैं।

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स्यूडोमोनडोटा (पर्यायवाची प्रोटीनबैक्टीरिया) ग्राम-नकारात्मक जीवाणुओं का एक प्रमुख समूह है। 2021 में स्यूडोमोनडोटा सहित कई प्रोकैरियोट फ़ाइला का नामकरण, सूक्ष्म जीवविज्ञानी के बीच विवादास्पद बना हुआ है, जिनमें से कई साहित्य में लंबे समय से पहले के नाम प्रोटोबैक्टीरिया का उपयोग करना जारी रखते हैं।[1] फाइलम प्रोटोबैक्टीरिया में Escherichia , साल्मोनेला, विब्रियो, यर्सिनिया, लीजोनेला और कई अन्य जैसे रोगजनक जेनेरा की एक विस्तृत विविधता शामिल है।[2] अन्य मुक्त-जीवित (गैर-परजीवीवाद) हैं और इसमें नाइट्रोजन स्थिरीकरण के लिए जिम्मेदार कई जीवाणु शामिल हैं।

कार्ल वोइस ने 1987 में इस समूह की स्थापना की, इसे अनौपचारिक रूप से बैंगनी बैक्टीरिया और उनके रिश्तेदार कहते हैं।[3] इस समूह में पाए जाने वाले रूपों की महान विविधता के कारण, इसे बाद में अनौपचारिक रूप से प्रोटियोबैक्टीरिया नाम दिया गया, रूप बदलनेवाला प्राणी के नाम पर, समुद्र का एक ग्रीक देवता जो कई अलग-अलग आकार ग्रहण करने में सक्षम था (प्रोटोबैक्टीरिया जीनस प्रोटीस (जीवाणु) के बाद नहीं)।[4][5] 2021 में प्रोकैरियोट्स के सिस्टमैटिक्स पर अंतर्राष्ट्रीय समिति ने पर्यायवाची स्यूडोमोनडोटा नामित किया।[6]


विशेषताएं

सभी स्यूडोमोनडोटा (प्रोटोबैक्टीरिया) विविध हैं। वे मुख्य रूप से ग्राम-नकारात्मक हैं, हालांकि व्यवहार में कुछ वास्तव में ग्राम-पॉजिटिव या ग्राम-चर को दाग सकते हैं। उनकी बैक्टीरियल बाहरी झिल्ली मुख्य रूप से lipopolysaccharide से बनी होती है। कई कशाभिका का उपयोग करने के बारे में चलते हैं, लेकिन कुछ गतिहीन होते हैं, या बैक्टीरियल ग्लाइडिंग पर भरोसा करते हैं।

स्यूडोमोनडोटा में विभिन्न प्रकार के चयापचय प्रकार होते हैं। अधिकांश ऐच्छिक रूप से या अनिवार्य रूप से अवायवीय जीव, केमोलिथोऑटोट्रॉफ़िक और परपोषी हैं, लेकिन कई अपवाद होते हैं। विभिन्न प्रकार के जेनेरा, जो एक-दूसरे से निकटता से संबंधित नहीं हैं, पारंपरिक प्रकाश संश्लेषण या एनोक्सीजेनिक प्रकाश संश्लेषण के माध्यम से प्रकाश से ऊर्जा को परिवर्तित करते हैं।

स्यूडोमोनडोटा महिलाओं के निचले प्रजनन पथ में महिलाओं के निचले प्रजनन पथ की माइक्रोबायोटा प्रजातियों की सूची के असंतुलन से जुड़े हैं। ये प्रजातियां सूजन से जुड़ी हैं।[7] कुछ अल्फाप्रोटोबैक्टीरिया पोषक तत्वों के बहुत कम स्तर पर बढ़ सकते हैं और डंठल और कलियों जैसी असामान्य आकारिकी होती है। अन्य में पौधों के साथ सहजीवन में नाइट्रोजन निर्धारण को प्रेरित करने में सक्षम कृषि संबंधी महत्वपूर्ण बैक्टीरिया शामिल हैं। प्रकार का क्रम कौलोबैक्टेरेल्स है, जिसमें डंठल बनाने वाले बैक्टीरिया जैसे कि कौलोबैक्टर शामिल हैं। यूकेरियोट्स के माइटोकॉन्ड्रिया को अल्फाप्रोटोबैक्टीरियम के वंशज माना जाता है।[8] बेटाप्रोटोबैक्टीरिया अत्यधिक चयापचय रूप से विविध हैं और इसमें केमोलिथोऑटोट्रॉफ़ ़्स, photoautotroph ़्स और सामान्यवादी परपोषी्स शामिल हैं। प्रकार का क्रम बर्कहोल्डरियल्स है, जिसमें अवसरवादी रोगजनकों सहित चयापचय विविधता की एक विशाल श्रृंखला शामिल है।

वैध रूप से प्रकाशित नामों वाली प्रजातियों के मामले में गैमप्रोटोबैक्टीरिया सबसे बड़ा वर्ग है। प्रकार का क्रम स्यूडोमोनडेल्स है, जिसमें जेनेरा स्यूडोमोनास और नाइट्रोजन-फिक्सिंग एजोटोबैक्टर शामिल हैं।

ज़ेटाप्रोटोबैक्टीरिया माइक्रोबियल मेटाबोलिज्म # फेरस आयरन (Fe2+) ऑक्सीकरण | आयरन-ऑक्सीडाइजिंग न्यूट्रोफिल केमोलिथोट्रोफिक हैं, जो दुनिया भर में ज्वारनदमुख और समुद्री आवासों में वितरित हैं। प्रकार का क्रम मेरीप्रोफुंडेल्स है।

हाइड्रोजनोफिलिया बाध्यकारी थर्मोफाइल हैं और इसमें हेटरोट्रॉफ़ और स्वपोषी ़ शामिल हैं। प्रकार क्रम Hydrogenophilles है।

एसिडिथियोबैसिलिया में केवल सल्फर, लोहा और यूरेनियम-ऑक्सीडाइजिंग ऑटोट्रॉफ़्स होते हैं। प्रकार का क्रम [[एसिडिथियोबैसिलस]] है, जिसमें आर्थिक रूप से महत्वपूर्ण जीव शामिल हैं जिनका उपयोग खनन उद्योग में किया जाता है जैसे कि एसिडिथियोबैसिलस एसपीपी।

टैक्सोनॉमी

वर्तमान में स्वीकृत टैक्सोनॉमी स्टैंडिंग इन नोमेनक्लेचर (LSPN) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची पर आधारित है।[9] और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र (एनसीबीआई)।[10] समूह को मुख्य रूप से राइबोसोमल आरएनए (आरआरएनए) अनुक्रमों के संदर्भ में परिभाषित किया गया है। स्यूडोमोनडोटा को कई वर्गों में विभाजित किया गया है। इन्हें पहले संघ के उपवर्गों के रूप में माना जाता था, लेकिन अब इन्हें वर्ग (जीव विज्ञान) के रूप में माना जाता है। ये वर्ग मोनोफेलटिक हैं।[11][12][13] जीनस एसिडिथियोबैसिलस, गैमप्रोटोबैक्टीरिया का हिस्सा है जब तक कि इसे 2013 में क्लास एसिडिथियोबैसिलिया में स्थानांतरित नहीं किया गया था।[14]पहले Phylogenomics अनुसार Betaproteobacteria के लिए paraphyly के रूप में माना जाता था।[15] 2017 में, बेटाप्रोटोबैक्टीरिया प्रमुख संशोधनों के अधीन था और हाइड्रोजनोफिलिया वर्ग को हाइड्रोजनोफिलेलेस के क्रम में शामिल करने के लिए बनाया गया था[16]

वैध रूप से प्रकाशित नामों वाले स्यूडोमोनडोटा वर्ग में कुछ प्रमुख वंश शामिल हैं:[17] उदा.:

according to ARB living tree, iTOL, Bergey's and others. 16S rRNA based LTP_12_2021[18][19][20] GTDB 07-RS207 by Genome Taxonomy Database[21][22][23]
 
 

Campylobacterota (outgroup)

 
Pseudomonadota
 

Alphaproteobacteria

 
 
 

Zetaproteobacteria

 
 
 

Gammaproteobacteria

 
 

Betaproteobacteria

 
 

Hydrogenophilalia

 
 
 
 
 
 
 

Alphaproteobacteria

 
 
 

"Mariprofundia" (Zetaproteobacteria)

 
"Chromatibacteria"
 

"Thiohalorhabdales"

 
 
 

Methylothermaceae 2

 
 
 
 
 

Algiphilaceae

 
 

Methylothermaceae

 
 
 

Acidithiobacillia

 
 
 

Gammaproteobacteria (nested Betaproteobacteria & Hydrogenophilalia)

 
 
 
 
 
 
 
 
 

"Magnetococcia"

 
 

"Caulobacteria" (Alphaproteobacteria)

 
 
 
 

"Mariprofundia" (Zetaproteobacteria)

 
"Pseudomonadia"
 

"Thiohalorhabdales"

 
 
 

"Acidithiobacillidae" (Acidithiobacillia)

 
 
 

"Neisseriidae" (Betaproteobacteria & nested Hydrogenophilalia)

 
 

"Pseudomonadidae" (Gammaproteobacteria)

 
 
 
 
 
 


परिवर्तन

परिवर्तन (आनुवंशिकी), एक प्रक्रिया जिसमें आनुवंशिक सामग्री एक जीवाणु से दूसरे जीवाणु में जाती है,[24] अल्फा, बीटा और गामा वर्गों में वितरित स्यूडोमोनडोटा की कम से कम 30 प्रजातियों में रिपोर्ट किया गया है।[25] प्राकृतिक आनुवंशिक परिवर्तन के संबंध में सबसे अच्छा अध्ययन किया गया स्यूडोमोनडोटा चिकित्सकीय रूप से महत्वपूर्ण मानव रोगजनकों नेइसेरिया गोनोरहोई (वर्ग बीटा) और हेमोफिलस इन्फ्लुएंजा (वर्ग गामा) हैं।[26] प्राकृतिक आनुवंशिक परिवर्तन एक यौन प्रक्रिया है जिसमें मध्यवर्ती माध्यम से एक जीवाणु कोशिका से दूसरे में डीएनए स्थानांतरण और प्राप्तकर्ता जीनोम में दाता अनुक्रम का एकीकरण शामिल है। रोगजनक स्यूडोमोनडोटा में, परिवर्तन एक डीएनए मरम्मत प्रक्रिया के रूप में कार्य करता प्रतीत होता है जो रोगजनक के डीएनए को उनके मेजबान के फागोसाइटिक सुरक्षा द्वारा हमले से बचाता है जो प्रतिक्रियाशील ऑक्सीजन प्रजातियों को नियोजित करता है।[26]


यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ "Newly Renamed Prokaryote Phyla Cause Uproar".
  2. ↑ Slonczewski JL, Foster JW, Foster E. Microbiology: An Evolving Science 5th Ed. WW Norton & Company; 2020.
  3. ↑ Woese, C.R. (1987). "जीवाणु विकास". Microbiological Reviews. 51 (2): 221–271. doi:10.1128/MMBR.51.2.221-271.1987. PMC 373105. PMID 2439888.
  4. ↑ Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named stack
  5. ↑ {{cite web |title=प्रोटीनबैक्टीरिया|website=Discover Life |series=Tree of Life |url=http://stri.discoverlife.org/mp/20m?tree=Proteobacteria&res=800 |access-date=2007-02-09}
  6. ↑ Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named Phynally
  7. ↑ Bennett, John; Dolin, Raphael; Blaser, Martin J. (11 September 2014). मंडेल, डगलस और बेनेट के सिद्धांत और संक्रामक रोगों का अभ्यास (8th ed.). Philadelphia, PA: Elsevier/Saunders. ISBN 978-145574801-3.
  8. ↑ Roger, A.J.; Muñoz-Gómez, S.A.; Kamikawa, R. (2017). "माइटोकॉन्ड्रिया की उत्पत्ति और विविधीकरण". Current Biology. 27 (21): R1177–R1192. doi:10.1016/j.cub.2017.09.015. PMID 29112874.
  9. ↑ Euzéby JP. "स्यूडोमोनडोटा". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2016-03-20.
  10. ↑ Sayers. "प्रोटोबैक्टीरिया". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-03-20.
  11. ↑ Krieg, Noel R.; Brenner, Don J.; Staley, James T. (2005). "The Proteobacteria". व्यवस्थित जीवाणु विज्ञान के Bergeys मैनुअल. Springer. ISBN 978-0-387-95040-2.
  12. ↑ Ciccarelli, F.D.; Doerks, T.; von Mering, C.; Creevey, C.J.; Snel, B.; Bork, P. (2006). "जीवन के अत्यधिक सुलझे हुए वृक्ष के स्वत: पुनर्निर्माण की ओर". Science. 311 (5765): 1283–1287. Bibcode:2006Sci...311.1283C. CiteSeerX 10.1.1.381.9514. doi:10.1126/science.1123061. PMID 16513982. S2CID 1615592.
  13. ↑ Yarza, P.; Ludwig, W.; Euzéby, J.; Amann, R.; Schleifer, K.H.; Glöckner, F.O.; Rosselló-Móra, R. (2010). "Update of the All-Species Living Tree Project based on 16S and 23S rRNA sequence analyses". Systematic and Applied Microbiology. 33 (6): 291–299. doi:10.1016/j.syapm.2010.08.001. PMID 20817437.
  14. ↑ Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named WilliamsKelly
  15. ↑ Williams, K.P.; Gillespie, J.J.; Sobral, B.W.S.; Nordberg, E.K.; Snyder, E. E.; Shallom, J.M.; Dickerman, A.W. (2010). "गैमप्रोटोबैक्टीरिया का फाइलोजेनी". Journal of Bacteriology. 192 (9): 2305–2314. doi:10.1128/JB.01480-09. PMC 2863478. PMID 20207755.
  16. ↑ Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named Bodenetal2017
  17. ↑ "जीवन का इंटरएक्टिव ट्री" (in English). Heidelberg, DE: European Molecular Biology Laboratory. Retrieved 23 February 2022.{{cite web}}: CS1 maint: url-status (link)
  18. ↑ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
  19. ↑ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
  20. ↑ "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2021.
  21. ↑ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  22. ↑ "ar53_r207.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  23. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  24. ↑ Johnston C, Martin B, Fichant G, Polard P, Claverys JP (2014). "Bacterial transformation: Distribution, shared mechanisms and divergent control". Nat. Rev. Microbiol. 12 (3): 181–196. doi:10.1038/nrmicro3199. PMID 24509783. S2CID 23559881.
  25. ↑ Johnsborg O, Eldholm V, Håvarstein LS (2007). "Natural genetic transformation: Prevalence, mechanisms and function". Res. Microbiol. 158 (10): 767–778. doi:10.1016/j.resmic.2007.09.004. PMID 17997281.
  26. ↑ 26.0 26.1 Michod RE, Bernstein H, Nedelcu AM (2008). "माइक्रोबियल रोगजनकों में सेक्स का अनुकूली मूल्य". Infect. Genet. Evol. 8 (3): 267–285. doi:10.1016/j.meegid.2008.01.002. PMID 18295550.


बाहरी संबंध

Wikispecies has information related to स्यूडोमोनडोटा.

Template:Gram-negative bacterial diseases

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