स्पाइक-ट्रिगर औसत: Difference between revisions

Revision as of 09:14, 2 August 2023

स्पाइक-ट्रिगर औसत (एसटीए) न्यूरॉन के समय-परिवर्तनशील प्रेरक प्रतिक्रिया की विशेषताओं का विश्लेषण करने के लिए एक उपकरण है जो समय-बदलते प्रेरक के प्रतिक्रिया में उत्पन्न स्पाइक का उपयोग करता है। एसटीए एक न्यूरॉन के ग्रहणशील क्षेत्र का का एक अनुमान प्रदान करता है जो एक रेखीय क्षेत्र के रूप में भी जाना जाता है। यह इलेक्ट्रोफिजियोलॉजी डेटा के विश्लेषण के लिए एक उपयुक्त तकनीक है। गणितीय रूप से, एसटीए स्पाइक से पहले की औसत प्रेरक है।^[1]^[2]^[3]^[4] एसटीए की गणना करने के लिए, प्रत्येक स्पाइक से पहले की समय विंडो में प्रेरक निकाली जाती है, और परिणामी प्रेरको का औसत निकाला जाता है (आरेख देखें)। एसटीए न्यूरॉन के ग्रहणशील क्षेत्र का नि-पक्षीय अनुमान प्रदान करता है केवल जब प्रेरक वितरण समग्री गोलाकार रूपरेखीय होता है (उदाहरण के लिए, (उदाहरण के लिए, गॉसियन श्वेत ध्वनि)।^[3]^[5]^[6]

एसटीए का उपयोग रेटिनल गैंग्लियन कोशिकाओं, पार्श्व जीनिकुलेट नाभिक में न्यूरॉन्स और स्ट्रिएट कॉर्टेक्स (वी1) में सरल कोशिकाओ को चिह्नित करने के लिए किया गया है। इसका उपयोग रेखीय-अरेखीय-पॉइसन कैस्केड प्रारूप (एलएनपी) प्रकार के प्रारूप के रेखीय स्तर का अनुमान लगाने के लिए भी किया जा सकता है। यह तकनीक अनुलेखन लिप्यंतरण फैक्टर गतिविधि का अध्ययन करने के लिए भी प्रयोग किया गया है जो एकल कोशों में जीन नियंत्रण को कैसे नियंत्रित करती है।^[7]

स्पाइक-ट्रिगर औसत को सामान्यतः "रिवर्स सहसंबंध" या "श्वेत ध्वनि विश्लेषण" के रूप में भी जाना जाता है। एसटीए को वोल्टेरा कर्नल या वीनर कर्नल शृंखला विस्तार में पहली पदार्थ के रूप में भी परिचित जाना जाता है।^[8] यह रैखिक प्रतिगमन से निकटता से संबंधित है, और सामान्य परिस्थितियों में इससे एक जैसा होता है।

गणितीय परिभाषा

मानक एसटीए

यदि $\mathbf {x_{i}}$ समय-स्थानिक प्रेरक सदिश को दर्शाएं जो $i$ 'वें समय बिन के पूर्व आता है, और $y_{i}$ उस बिन में स्पाइक की गिनती को दर्शाता है। प्रेरक संवेगों का ध्यान रखते हुए, हम मान सकते हैं कि प्रेरक सदिश का शून्य मान अर्थात्, $E[\mathbf {x} ]=0$ ). यदि नहीं, तो इसे प्रत्येक सदिश से औसत प्रेरक को घटाकर शून्य-माध्य में बदला जा सकता है। एसटीए निम्नलिखित दिया गया ह

\mathrm {STA} ={\tfrac {1}{n_{sp}}}\sum _{i=1}^{T}y_{i}\mathbf {x_{i}} ,

यहाँ $n_{sp}=\sum y_{i}$ , स्पाइक्स की कुल संख्या।

यह समीकरण सरलतम रूप से आव्यूह रूप में व्यक्त किया जा सकता है: हम इसे इस तरह से लिख सकते हैं: चलो $X$ एक आव्यूह को निरूपित करें जिसका $i$ 'वीं पंक्ति प्रेरक सदिश $\mathbf {x_{i}^{T}}$ है और $\mathbf {y}$ एक कॉलम सदिश को निरूपित करें जिसका $i$ वां तत्व है $y_{i}$ . है तब एसटीए निम्नलिखित रूप में लिखा जा सकता है:

\mathrm {STA} ={\tfrac {1}{n_{sp}}}X^{T}\mathbf {y} .

श्वेत एसटीए

यदि प्रेरक श्वेत ध्वनि नहीं है, बल्कि अंतरिक्ष या समय में गैर-शून्य सहसंबंध है, तो मानक एसटीए रैखिक ग्रहणशील क्षेत्र का एक पक्षपाती अनुमान प्रदान करता है।^[5] इसलिए प्रेरक सहप्रसरण आव्यूह के व्युत्क्रम द्वारा एसटीए को श्वेत करना उचित हो सकता है। यह स्थानिक निर्भरता के विषय को हल करता है, यद्यपि हम अभी भी मानते हैं कि प्रेरक अस्थायी रूप से स्वतंत्र है। परिणामी अनुमानक को श्वेत एसटीए के रूप में जाना जाता है, जो कि दिया जाता है

\mathrm {STA} _{w}=\left({\tfrac {1}{T}}\sum _{i=1}^{T}\mathbf {x_{i}} \mathbf {x_{i}} ^{T}\right)^{-1}\left({\tfrac {1}{n_{sp}}}\sum _{i=1}^{T}y_{i}\mathbf {x_{i}} \right),

जहां पहला पद प्राकृतिक प्रेरको का व्युत्क्रम सहप्रसरण आव्यूह है और दूसरा मानक एसटीए है। तो यह आव्यूह निम्नलिखित रूप में लिखा जा सकता है

\mathrm {STA} _{w}={\tfrac {T}{n_{sp}}}\left(X^{T}X\right)^{-1}X^{T}\mathbf {y} .

श्वेत एसटीए केवल तभी निष्पक्ष होता है जब प्रोत्साहन वितरण को सहसंबद्ध गाऊसी वितरण द्वारा वर्णित किया जा सकता है ^[6]सहसंबद्ध गाऊसी वितरण दीर्घवृत्त के रूप में सममित होते हैं, अर्थात एक रैखिक परिवर्तन द्वारा गोलाकार रूप से सममित बनाया जा सकता है, परंतु सभी दीर्घवृत्त सममित वितरण गाऊसी नहीं होते हैं। यह गोलाकार समरूपता की तुलना में कमज़ोर स्थिति मे होते है।

श्वेत एसटीए प्रेरक वितरण के विरुद्ध एक रैखिक न्यूनतम-वर्ग प्रतिगमन है जिसमें प्रेरक सदिशों के बीच एक रेखीय संबंध का अनुमान लगाया जाता है जो स्पाइक ट्रेन के साथ सम्बन्धित होता है।

नियमित एसटीए

व्यवहारतः, श्वेत एसटीए को नियमित करना आवश्यक हो सकता है, क्योंकि श्वेतकरण प्रेरक विमानों के द्वारा कम अन्वेषित आयामों के साथ ध्वनि को बढ़ाता है अर्थात, अक्ष जिसके साथ प्रेरक में कम विचरण होता है। इस समस्या का सामान्य समाधान रिज प्रतिगमन हो सकता है। रिज प्रतिगमन का उपयोग करके नियमित एसटीए को निम्नलिखित रूप में लिखा जा सकता है:

\mathrm {STA} _{ridge}={\tfrac {T}{n_{sp}}}\left(X^{T}X+\lambda I\right)^{-1}X^{T}\mathbf {y} ,

यहाँ $I$ पहचान आव्यूह को दर्शाता है और $\lambda$ रिज पैरामीटर है जो नियमित करने के मात्रा को नियंत्रित करता है। इस प्रक्रिया की एक सरल बायेसियन व्याख्या रखती है: रिज प्रतिगमन एसटीए तत्वों पर पूर्व लगाने के बराबर है जिसमें वृद्धि आव्यूह के आनुपातिक सहप्रसरण के साथ शून्य-माध्य गाऊसी से पहले रिज पैरामीटर इस पूर्व के व्युत्क्रम विचरण को सेट करता है, और सामान्यतः क्रॉस-वैलिडेशन या अनुभवजन्य बेयस विधि द्वारा फिट किया जाता है।

सांख्यिकीय गुण

एलएनपी प्रारूप के अनुसार उत्पन्न प्रतिक्रियाओं के लिए, श्वेत एसटीए रैखिक ग्रहणशील क्षेत्र द्वारा फैले उप-स्थान का अनुमान प्रदान करता है। इस अनुमान के गुण इस प्रकार हैं

संगति

श्वेत एसटीए एक सुसंगत अनुमानक है, अर्थात, यह वास्तविक रैखिक उप-स्थान में परिवर्तित हो जाता है, यदि

प्रोत्साहन वितरण $P(\mathbf {x} )$ दीर्घाकार वितरण है, उदाहरण के लिए, गाऊसी वितरण।
अपेक्षित एसटीए शून्य नहीं है अर्थात, गैर-रैखिकता स्पाइक-ट्रिगर प्रेरको में बदलाव लाती है।^[5]

इष्टतमता

श्वेत एसटीए एक स्पर्शोन्मुख रूप से कुशल अनुमानक है यदि

प्रोत्साहन वितरण $P(\mathbf {x} )$ गॉसियन है
न्यूरॉन का अरेखीय प्रतिक्रिया फलन, $exp(x)$ .^[5]घातीय है

यादृच्छिक प्रेरको के लिए, एसटीए सामान्यतः सुसंगत या कुशल नहीं होता है। ऐसे स्थितियों के लिए, अधिकतम संभावना और पारस्परिक जानकारी सूचना-आधारित अनुमानक ^[5]^[6]^[9] ऐसे विकसित किए गए हैं जो सुसंगत और कुशल दोनों हैं।

यह भी देखें

स्पाइक-ट्रिगर सहप्रसरण
रेखीय -अरेखीय -पॉइसन कैस्केड प्रारूप
स्लाइस्ड इनवर्स प्रतिगमन
रिवर्स सहसंबंध तकनीक

संदर्भ

↑ de Boer and Kuyper (1968) Triggered Correlation. IEEE Transact. Biomed. Eng., 15:169-179
↑ Marmarelis, P. Z. and Naka, K. (1972). White-noise analysis of a neuron chain: an application of the Wiener theory. Science, 175:1276-1278
↑ ^3.0 ^3.1 Chichilnisky, E. J. (2001). A simple white noise analysis of neuronal light responses. Network: Computation in Neural Systems, 12:199-213
↑ Simoncelli, E. P., Paninski, L., Pillow, J. & Swartz, O. (2004). "Characterization of neural responses with stochastic stimuli". In M. Gazzaniga (Ed.) The Cognitive Neurosciences, III (pp. 327-338). MIT press.
↑ ^5.0 ^5.1 ^5.2 ^5.3 ^5.4 Paninski, L. (2003). Convergence properties of some spike-triggered analysis techniques. Network: Computation in Neural Systems 14:437-464
↑ ^6.0 ^6.1 ^6.2 Sharpee, T.O., Rust, N.C., & Bialek, W. (2004). Analyzing neural responses to natural signals: Maximally informative dimensions. Neural Computation 16:223-250
↑ Lin, Yihan (2015). "सापेक्ष पल्स टाइमिंग के मॉड्यूलेशन द्वारा कॉम्बिनेटोरियल जीन विनियमन". Nature. 527 (7576): 54–58. Bibcode:2015Natur.527...54L. doi:10.1038/nature15710. PMC 4870307. PMID 26466562.
↑ Lee and Schetzen (1965). Measurement of the Wiener kernels of a non- linear system by cross-correlation. International Journal of Control, First Series, 2:237-254
↑ Kouh M. & Sharpee, T.O. (2009). Estimating linear-nonlinear models using Rényi divergences, Network: Computation in Neural Systems 20(2): 49–68

बाहरी संबंध

Matlab code for computing the STA

[deBoer68-1] Boer and Kuyper (1968) Triggered Correlation. IEEE Transact. Biomed. Eng., 15:169-179

[Marmarelis72-2] Marmarelis, P. Z. and Naka, K. (1972). White-noise analysis of a neuron chain: an application of the Wiener theory. Science, 175:1276-1278

[Chichilnisky01-3] 3.0 ^3.1 Chichilnisky, E. J. (2001). A simple white noise analysis of neuronal light responses. Network: Computation in Neural Systems, 12:199-213

[simoncelli-4] Simoncelli, E. P., Paninski, L., Pillow, J. & Swartz, O. (2004). "Characterization of neural responses with stochastic stimuli". In M. Gazzaniga (Ed.) The Cognitive Neurosciences, III (pp. 327-338). MIT press.

[Paninski03-5] 5.0 ^5.1 ^5.2 ^5.3 ^5.4 Paninski, L. (2003). Convergence properties of some spike-triggered analysis techniques. Network: Computation in Neural Systems 14:437-464

[SharpeeRustBialek04-6] 6.0 ^6.1 ^6.2 Sharpee, T.O., Rust, N.C., & Bialek, W. (2004). Analyzing neural responses to natural signals: Maximally informative dimensions. Neural Computation 16:223-250

[7] Lin, Yihan (2015). "सापेक्ष पल्स टाइमिंग के मॉड्यूलेशन द्वारा कॉम्बिनेटोरियल जीन विनियमन". Nature. 527 (7576): 54–58. Bibcode:2015Natur.527...54L. doi:10.1038/nature15710. PMC 4870307. PMID 26466562.

[8] Lee and Schetzen (1965). Measurement of the Wiener kernels of a non- linear system by cross-correlation. International Journal of Control, First Series, 2:237-254

[KouhSharpee09-9] Kouh M. & Sharpee, T.O. (2009). Estimating linear-nonlinear models using Rényi divergences, Network: Computation in Neural Systems 20(2): 49–68

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 '''स्पाइक-ट्रिगर औसत''' (एसटीए) न्यूरॉन के समय-परिवर्तनशील प्रेरक प्रतिक्रिया की विशेषताओं का विश्लेषण करने के लिए एक उपकरण है जो समय-बदलते प्रेरक के प्रतिक्रिया में उत्पन्न स्पाइक का उपयोग करता है। एसटीए एक न्यूरॉन के ग्रहणशील क्षेत्र का का एक अनुमान प्रदान करता है जो एक रेखीय क्षेत्र के रूप में भी जाना जाता है। यह [[इलेक्ट्रोफिजियोलॉजी]] डेटा के विश्लेषण के लिए एक उपयुक्त तकनीक है। गणितीय रूप से, एसटीए स्पाइक से पहले की औसत प्रेरक  है।<ref name="deBoer68">de Boer and Kuyper (1968) Triggered Correlation. ''IEEE Transact. Biomed. Eng.'', 15:169-179</ref><ref name="Marmarelis72">Marmarelis, P. Z. and Naka, K. (1972). White-noise analysis of a neuron chain: an application of the Wiener theory.  ''Science'', 175:1276-1278</ref><ref name="Chichilnisky01">Chichilnisky, E. J. (2001).  A simple white noise analysis of neuronal light responses. ''Network: Computation in Neural Systems'', 12:199-213</ref><ref name="simoncelli">Simoncelli, E. P., Paninski, L., Pillow, J. & Swartz, O. (2004).  [http://www.cns.nyu.edu/~lcv/pubs/makeAbs.php?loc=Simoncelli03c "Characterization of neural responses with stochastic stimuli"].  In M. Gazzaniga (Ed.) ''The Cognitive Neurosciences, III'' (pp. 327-338). MIT press.</ref> एसटीए की गणना करने के लिए, प्रत्येक स्पाइक से पहले की समय विंडो में प्रेरक  निकाली जाती है, और परिणामी प्रेरको  का औसत निकाला जाता है (आरेख देखें)। एसटीए न्यूरॉन के  ग्रहणशील क्षेत्र का नि-पक्षीय अनुमान प्रदान करता है केवल जब प्रेरक वितरण समग्री गोलाकार रूपरेखीय होता है (उदाहरण के लिए, ([[गाऊसी शोर|उदाहरण के लिए, गॉसियन श्वेत ध्वनि]])।<ref name="Chichilnisky01" /><ref name="Paninski03">Paninski, L. (2003). Convergence properties of some spike-triggered analysis techniques. ''Network: Computation in Neural Systems'' 14:437-464</ref><ref name="SharpeeRustBialek04">Sharpee, T.O., Rust, N.C., & Bialek, W. (2004). Analyzing neural responses to natural signals: Maximally informative dimensions. ''Neural Computation'' 16:223-250</ref>
-एसटीए का उपयोग रेटिनल गैंग्लियन कोशिकाओं, [[पार्श्व जीनिकुलेट नाभिक]] में न्यूरॉन्स और स्ट्रिएट कॉर्टेक्स (वी1) में [[सरल कोशिका|सरल कोशिकाओ]]  को चिह्नित करने के लिए किया गया है। इसका उपयोग [[लीनियर-नॉनलाइनियर-पॉइसन कैस्केड मॉडल|रेखीय-अरेखीय-पॉइसन कैस्केड मॉडल]] (एलएनपी) प्रकार के मॉडल के रेखीय स्तर का अनुमान लगाने के लिए भी किया जा सकता है। यह तकनीक अनुलेखन लिप्यंतरण फैक्टर गतिविधि का अध्ययन करने के लिए भी प्रयोग किया गया है जो एकल कोशों में जीन नियंत्रण को कैसे नियंत्रित करती है।<ref>{{cite journal |last1=Lin |first1=Yihan |title=सापेक्ष पल्स टाइमिंग के मॉड्यूलेशन द्वारा कॉम्बिनेटोरियल जीन विनियमन|journal=Nature |date=2015 |volume=527 |issue=7576 |pages=54–58 |doi=10.1038/nature15710 |pmid=26466562 |pmc=4870307 |bibcode=2015Natur.527...54L }}</ref>
+एसटीए का उपयोग रेटिनल गैंग्लियन कोशिकाओं, [[पार्श्व जीनिकुलेट नाभिक]] में न्यूरॉन्स और स्ट्रिएट कॉर्टेक्स (वी1) में [[सरल कोशिका|सरल कोशिकाओ]]  को चिह्नित करने के लिए किया गया है। इसका उपयोग [[लीनियर-नॉनलाइनियर-पॉइसन कैस्केड मॉडल|रेखीय-अरेखीय-पॉइसन कैस्केड प्रारूप]] (एलएनपी) प्रकार के प्रारूप के रेखीय स्तर का अनुमान लगाने के लिए भी किया जा सकता है। यह तकनीक अनुलेखन लिप्यंतरण फैक्टर गतिविधि का अध्ययन करने के लिए भी प्रयोग किया गया है जो एकल कोशों में जीन नियंत्रण को कैसे नियंत्रित करती है।<ref>{{cite journal |last1=Lin |first1=Yihan |title=सापेक्ष पल्स टाइमिंग के मॉड्यूलेशन द्वारा कॉम्बिनेटोरियल जीन विनियमन|journal=Nature |date=2015 |volume=527 |issue=7576 |pages=54–58 |doi=10.1038/nature15710 |pmid=26466562 |pmc=4870307 |bibcode=2015Natur.527...54L }}</ref>
 स्पाइक-ट्रिगर औसत को सामान्यतः "रिवर्स सहसंबंध" या "श्वेत ध्वनि विश्लेषण" के रूप में भी जाना जाता है। एसटीए को वोल्टेरा कर्नल या वीनर कर्नल शृंखला विस्तार में पहली पदार्थ के रूप में भी परिचित जाना जाता है।<ref>Lee and Schetzen (1965). Measurement of the Wiener kernels of a non- linear system by cross-correlation. ''International Journal of Control, First Series'', 2:237-254</ref> यह रैखिक प्रतिगमन से निकटता से संबंधित है, और सामान्य परिस्थितियों में इससे एक जैसा होता है।
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 ==सांख्यिकीय गुण==
-एक लीनियर-नॉनलाइनियर-पॉइसन कैस्केड मॉडल मॉडल के अनुसार उत्पन्न प्रतिक्रियाओं के लिए, श्वेत  एसटीए रैखिक ग्रहणशील क्षेत्र द्वारा फैलाए गए उप-स्थान का अनुमान प्रदान करता है। इस अनुमान के गुण इस प्रकार हैं
+एलएनपी प्रारूप के अनुसार उत्पन्न प्रतिक्रियाओं के लिए, श्वेत एसटीए रैखिक ग्रहणशील क्षेत्र द्वारा फैले उप-स्थान का अनुमान प्रदान करता है। इस अनुमान के गुण इस प्रकार हैं
-एलएनपी मॉडल के अनुसार उत्पन्न प्रतिक्रियाओं के लिए, सफ़ेद एसटीए रैखिक ग्रहणशील क्षेत्र द्वारा फैले उप-स्थान का अनुमान प्रदान करता है। इस अनुमान के गुण इस प्रकार हैं
 ===संगति===
-श्वेत  एसटीए एक [[सुसंगत अनुमानक]] है, अर्थात, यह वास्तविक रैखिक उप-स्थान में परिवर्तित हो जाता है, यदि
+श्वेत एसटीए एक [[सुसंगत अनुमानक]] है, अर्थात, यह वास्तविक रैखिक उप-स्थान में परिवर्तित हो जाता है, यदि
-# प्रोत्साहन वितरण <math>P(\mathbf{x})</math> [[अण्डाकार वितरण]] है, उदाहरण के लिए, [[गाऊसी वितरण]]। (बुसगैंग प्रमेय|बुसगैंग प्रमेय)
+# प्रोत्साहन वितरण <math>P(\mathbf{x})</math>दीर्घाकार [[अण्डाकार वितरण|वितरण]] है, उदाहरण के लिए, [[गाऊसी वितरण]]।
-# अपेक्षित एसटीए शून्य नहीं है, यानी, गैर-रैखिकता स्पाइक-ट्रिगर प्रेरको  में बदलाव लाती है।<ref name="Paninski03"/>
+# अपेक्षित एसटीए शून्य नहीं है अर्थात, गैर-रैखिकता स्पाइक-ट्रिगर प्रेरको में बदलाव लाती है।<ref name="Paninski03"/>
 ===इष्टतमता===
-श्वेत  एसटीए एक असिम्प्टोटिक रूप से [[कुशल अनुमानक]] है यदि
+श्वेत एसटीए एक स्पर्शोन्मुख रूप से [[कुशल अनुमानक]] है यदि
 # प्रोत्साहन वितरण <math>P(\mathbf{x})</math> गॉसियन है
-# न्यूरॉन का अरेखीय प्रतिक्रिया कार्य घातीय है, <math>exp(x)</math>.<ref name="Paninski03"/>
+# न्यूरॉन का अरेखीय प्रतिक्रिया फलन, <math>exp(x)</math>.<ref name="Paninski03"/>घातीय है
-मनमानी प्रेरको  के लिए, एसटीए आम तौर पर सुसंगत या कुशल नहीं होता है। ऐसे मामलों के लिए, अधिकतम संभावना और पारस्परिक जानकारी|सूचना-आधारित अनुमानक <ref name="Paninski03"/><ref name ="SharpeeRustBialek04"/><ref name ="KouhSharpee09">Kouh M. & Sharpee, T.O. (2009). Estimating linear-nonlinear models using Rényi divergences, ''Network: Computation in Neural Systems'' 20(2): 49–68</ref> ऐसे विकसित किए गए हैं जो सुसंगत और कुशल दोनों हैं।
+यादृच्छिक प्रेरको के लिए, एसटीए सामान्यतः सुसंगत या कुशल नहीं होता है। ऐसे स्थितियों के लिए, अधिकतम संभावना और पारस्परिक जानकारी सूचना-आधारित अनुमानक <ref name="Paninski03"/><ref name ="SharpeeRustBialek04"/><ref name ="KouhSharpee09">Kouh M. & Sharpee, T.O. (2009). Estimating linear-nonlinear models using Rényi divergences, ''Network: Computation in Neural Systems'' 20(2): 49–68</ref> ऐसे विकसित किए गए हैं जो सुसंगत और कुशल दोनों हैं।
 ==यह भी देखें==
 * [[स्पाइक-ट्रिगर सहप्रसरण]]
-* लीनियर-नॉनलीनियर-पॉइसन कैस्केड मॉडल
+* रेखीय -अरेखीय -पॉइसन कैस्केड प्रारूप
-* [[कटा हुआ उलटा प्रतिगमन]]
+* [[कटा हुआ उलटा प्रतिगमन|स्लाइस्ड इनवर्स प्रतिगमन]]
 *रिवर्स सहसंबंध तकनीक

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गणितीय परिभाषा

मानक एसटीए

श्वेत एसटीए

नियमित एसटीए

सांख्यिकीय गुण

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इष्टतमता

यह भी देखें

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मानक एसटीए

श्वेत एसटीए

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