अणु संपादक
एक अणु संपादक रासायनिक संरचनाओं के प्रतिनिधित्व को बनाने और संशोधित करने के लिए एक कंप्यूटर प्रोग्राम है। अणु संपादक क्रमशः 2डी कंप्यूटर ग्राफिक्स या 3 डी कंप्यूटर ग्राफिक्स के माध्यम से एक सिम्युलेटेड द्वि-आयामी अंतरिक्ष या तीन-आयामी अंतरिक्ष में रासायनिक संरचना प्रतिनिधित्व में हेरफेर कर सकते हैं। द्वि-आयामी आउटपुट का उपयोग चित्रण के रूप में या रासायनिक डेटाबेस को क्वेरी करने के लिए किया जाता है। आणविक मॉडलिंग सॉफ़्टवेयर पैकेज के भाग के रूप में आमतौर पर आणविक मॉडल बनाने के लिए त्रि-आयामी आउटपुट का उपयोग किया जाता है।
डेटाबेस आणविक संपादक जैसे लेदरफेस,[1] रिकैप,[2] और अणु स्लाइसर[3] बड़ी संख्या में अणुओं को 'डिप्रोटोनेट कार्बोक्जिलिक एसिड' या 'ब्रेक एक्सोसाइक्लिक बॉन्ड' जैसे नियमों के अनुसार स्वचालित रूप से संशोधित करने की अनुमति देता है जिसे उपयोगकर्ता द्वारा निर्दिष्ट किया जा सकता है।
अणु संपादक आमतौर पर कम से कम एक फ़ाइल प्रारूप या रेखा अंकन पढ़ने और लिखने का समर्थन करते हैं। प्रत्येक के उदाहरणों में क्रमशः मोलफाइल और सरलीकृत आणविक इनपुट लाइन प्रविष्टि विनिर्देश (SMILES) शामिल हैं।
अणु संपादकों द्वारा उत्पन्न फ़ाइलें आणविक ग्राफिक्स टूल द्वारा प्रदर्शित की जा सकती हैं।
स्टैंडअलोन प्रोग्राम
| Program | Developer(s) | License | Platforms | Info | |
|---|---|---|---|---|---|
| ACD/ChemSketch | ACD/Labs | Proprietary | Windows | A chemically intelligent drawing interface that allows drawing almost any chemical structure including organics, organometallics, polymers, and Markush structures. freeware version available | |
| Amira (software) | Visage Imaging Zuse Institute Berlin |
Proprietary | Windows, macOS, Linux | 14-day trial version available | |
| Ascalaph Designer | Agile Molecule | GNU GPL | Linux, Windows | freeware | |
| Avogadro | Avogadro project team | GNU GPL | Linux, macOS, Windows | 3D molecule editor, visualizer | |
| BALLView | BALL project team | GNU GPL-LGPL | Linux, macOS, Windows | viewer, editor, simulation tool | |
| Bioclipse | Bioclipse Developers | EPL | cross-platform | Java, Eclipse Rich Client Platform (RCP) based | |
| ChemDoodle | iChemLabs | Proprietary | cross-platform | Java | |
| ChemDraw | PerkinElmer | Proprietary | macOS, Windows | Edit chemical structures and reactions | |
| Deneb | AtelGraphics | Proprietary | Linux, Windows | Trial version available; easy to use graphical user interface desktop for packages SIESTA, VASP, QE, etc. | |
| ChemWindow | Wiley | Proprietary | Windows | available as part of the KnowItAll software environment; Freeware for academic research and teaching | |
| Gabedit | Abdulrahman Allouche | BSD | Linux, macOS, Windows | 3D molecule editor, visualizer | |
| JChemPaint | GNU LGPL | cross-platform | 2D structural formula editor written in Java | ||
| Molecular Operating Environment (MOE) | Chemical Computing Group | Proprietary | Windows, Linux, Mac; SVL programming language | Platform for molecular modelling / drug discovery applications, with 3D molecular sketching and editing, 2D depiction, and 2D to 3D conversion. | |
| SAMSON | Inria | Proprietary | Windows, Linux, macOS | Software platform for integrated computational nanoscience. Customized with SAMSON Elements (modules for SAMSON) | |
| Spartan | Wavefunction, Inc. | Proprietary | Linux, macOS, Windows | ||
| XDrawChem | GNU GPL | Linux, macOS, Windows | based on OpenBabel |
जावा एप्लेट्स
| Applet | Developer(s) | License | Info |
|---|---|---|---|
| JChemPaint | GNU LGPL | Editor and viewer applets | |
| JME Molecule Editor | Peter Ertl | Proprietary | freeware available from Molinspiration; Freeware for noncommercial use |
जावास्क्रिप्ट एम्बेड करने योग्य संपादक
| Program | Developer | Desktop Browser IE6-7-8 | Desktop Browser other | iPad | iPhone | Android | Windows Phone | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Kekulé Program | Kekule.js Lab | Yes | Yes | Unknown | Unknown | Unknown | Unknown | Published under the MIT License |
यह भी देखें
नोट्स और संदर्भ
- ↑ Kenny, Peter W.; Sadowski, Jens (2005). "Structure Modification in Chemical Databases". ड्रग डिस्कवरी में केमोइन्फॉर्मेटिक्स. Methods and Principles in Medicinal Chemistry. pp. 271–285. doi:10.1002/3527603743.ch11. ISBN 9783527307531.
- ↑ Lewell, Xiao Qing; Judd, Duncan B.; Watson, Stephen P.; Hann, Michael M. (1998). "RECAP-Retrosynthetic Combinatorial Analysis Procedure: A Powerful New Technique for Identifying Privileged Molecular Fragments with Useful Applications in Combinatorial Chemistry". Journal of Chemical Information and Computer Sciences. 38 (3): 511–522. doi:10.1021/ci970429i. PMID 9611787.
- ↑ Vieth, Michal; Siegel, Miles G.; Higgs, Richard E.; Watson, Ian A.; Robertson, Daniel H.; Savin, Kenneth A.; Durst, Gregory L.; Hipskind, Philip A. (2004). "विशेषता भौतिक गुण और विपणित मौखिक दवाओं के संरचनात्मक टुकड़े". Journal of Medicinal Chemistry. 47 (1): 224–232. doi:10.1021/jm030267j. PMID 14695836.
