फाइब्रोबैक्टीरोटा

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  • "Fibrobacteraeota" Oren et al. 2015
  • "Fibrobacteres" Garrity and Holt 2001
  • "Fibrobacterota" Whitman et al. 2018
  • "Raymondbacteria" Anantharaman et al. 2016

फाइब्रोबैक्टीरोटा एक छोटा बैक्टीरियल फ़ाइलम (जीव विज्ञान) है जिसमें कई प्रमुख रूमेण जीवाणु शामिल हैं, जो जुगाली करने वाले जानवरों में पौधे-आधारित सेल्यूलोज के क्षरण की अनुमति देते हैं। इस फाइलम के सदस्यों को अन्य फाइला में वर्गीकृत किया गया था। जीनस 'फाइब्रोबैक्टर' (फाइब्रोबैक्टीरोटा का एकमात्र जीनस) को 1988 में जीनस 'बैक्टेरॉइड्स' से हटा दिया गया था।[2]


फाइलोजेनी और तुलनात्मक जीनोमिक अध्ययन

यद्यपि फाइब्रोबैक्टेरोटा, जिसमें एक एकल जीनस फाइब्रोबैक्टर होता है जिसमें दो प्रजातियां होती हैं, को वर्तमान में एक अलग फाइलम के रूप में पहचाना जाता है, आरपीओसी और गाइरेस बी प्रोटीन अनुक्रमों पर आधारित फाइलोजेनेटिक अध्ययनों से संकेत मिलता है कि फाइब्रोबैक्टर सक्सिनोजेन्स फाइला बैक्टेरोएडेट्स और क्लोरोबी की प्रजातियों से निकटता से संबंधित है।[3] इन तीन फ़ाइला की प्रजातियां भी कई महत्वपूर्ण प्रोटीनों में संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स के आधार पर एक ही स्थिति में शाखा करती हैं।[4] अंत में और सबसे महत्वपूर्ण, तुलनात्मक जीनोमिक अध्ययनों ने दो संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स (RpoC प्रोटीन में 5-7 अमीनो एसिड इंसर्ट और सेरीन हाइड्रॉक्सीमिथाइलट्रांसफेरेज़ में 13-16 एमिनो एसिड इंसर्शन) और एक सिग्नेचर प्रोटीन (PG00081) की पहचान की है जो विशिष्ट रूप से साझा किए गए हैं। इन तीनों संघों की सभी प्रजातियाँ।[5] ये सभी परिणाम सम्मोहक साक्ष्य प्रदान करते हैं कि इन तीनों संघों की प्रजातियों ने एक सामान्य पूर्वज को अन्य सभी जीवाणुओं से अलग रखा है और यह प्रस्तावित किया गया है कि वे सभी एक "एफसीबी" सुपरफाइलम के हिस्से के रूप में पहचाने जाने चाहिए।[3][5]


फाइलोजेनी

फाइब्रोबैक्टीरोटा का फाइलोजेनी।

16S rRNA based LTP_12_2021[6][7][8] GTDB 07-RS207 by Genome Taxonomy Database[9][10][11]
Chitinivibrionia
Chitinispirillaceae

Chitinispirillum alkaliphilum

 
Chitinivibrionaceae

Chitinivibrio alkaliphilus

 
Chitinivibrionales
Fibrobacteria
Fibrobacteraceae
Fibrobacter succinogenes
 

F. s. elongatus

 
 

F. s. succinogenes

 
 
Hallerella
 

H. porci

 
 
 

H. succinigenes

 
 

Fibrobacter intestinalis

 
 
 
 
Fibrobacterales
 
Chitinivibrionia
Chitinispirillaceae

Chitinispirillum alkaliphilum

 
Chitinivibrionaceae

Chitinivibrio alkaliphilus

 
Chitinivibrionales
 
 

"Raymondbacteria" (RIF7)

 
Fibrobacteria
Fibrobacteraceae
 

"Ca. Fibromonas termitidis"

 
 
 

Fibrobacter succinogenes

 
Hallerella
 

H. succinigenes

 
 
 

H. porci

 
 

Fibrobacter intestinalis

 
 
 
 
 
Fibrobacterales
 
 


टैक्सोनॉमी

वर्तमान में स्वीकृत टैक्सोनॉमी स्टैंडिंग इन नोमेनक्लेचर (LSPN) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची पर आधारित है।[12] और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र (एनसीबीआई)।[13]

  • क्लास चिटिनीस्पिरिला Sorokin et al. 2016
  • क्लास चिटिनीविब्रिओनिया Sorokin et al. 2014
  • क्लास फ़ाइब्रोबैक्टीरिया Spain et al. 2012
    • आर्डर फाइब्रोबैक्टीरियल Spain et al. 2012 [फाइब्रोमोनाडेल्स Abdul Rahman et al. 2016]
      • फैमिली फाइब्रोबैक्टीरिया Spain et al. 2012 [फाइब्रोमोनाडेसी Abdul Rahman et al. 2016]
        • जीनस हैलेरेला Wylensek et al. 2020
          • प्रजाति हेलरेला पोर्सी|एच. पोर्सी Wylensek et al. 2021
          • प्रजाति हैलेरेला सक्सिनिजेंसटी|एच. succinigenes Wylensek et al. 2020
        • जीनस कैंडिडा फाइब्रोमोनास Abdul Rahman et al. 2016
          • प्रजाति सीए। फ़िब्रोमोनास टर्मिटिडिस | एफ। टर्मिटिडिस Abdul Rahman et al. 2016
        • जीनस फाइब्रोबैक्टर Montgomery et al. 1988
          • प्रजातियां फाइब्रोबैक्टर आंतों | एफ। आंतों Montgomery et al. 1988
          • प्रजातियां फाइब्रोबैक्टर सक्सिनोजेन्स|एफ। सक्सिनोजेन्स (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
            • उप-प्रजाति फाइब्रोबैक्टर सक्सिनोजेन्स इलांगटस|एफ। एस। elongatus Montgomery et al. 1988
            • उप-प्रजाति फाइब्रोबैक्टर सक्सिनोजेन्स सक्सिनोजेन्स|एफ। एस। सक्सिनोजेन्स (Hungate 1950) Montgomery et al. 1988
फाइलम फाइब्रोबैक्टीरोटा और इसके कुछ फाइलोजेनेटिक पड़ोसी

वितरण

फाइलम फाइब्रोबैक्टीरोटा को सीएफबी [साइटोफैगा-फ्लैविबैक्टीरियम-बैक्टीरियोडोटा] से निकटता से संबंधित माना जाता है।[5]इस फाइलम में एकमात्र जीनस फाइब्रोबैक्टर है जिसमें मवेशियों और सूअरों सहित कई स्तनधारियों की हिम्मत से तनाव होता है।[14] इस जीनस में वर्णित दो प्रजातियां, फाइब्रोबैक्टर सक्सिनोजेन्स और फाइब्रोबैक्टर आंतों स्तनधारी हिम्मत में फाइब्रोलाइटिक समुदायों के महत्वपूर्ण सदस्य हैं और हाल के दशकों में पौधे के फाइबर को कम करने में सक्षम लंबे समय तक रुचि रखने वाले रोगाणुओं के कारण बहुत अधिक ध्यान आकर्षित किया है।

विभिन्न वातावरणों से 16rRNA जीन के प्रवर्धन पर आधारित आणविक साक्ष्य बताते हैं कि यह संघ पहले की तुलना में कहीं अधिक व्यापक है।[15][16] स्तनधारी वातावरण समूह के अधिकांश क्लोनों के साथ-साथ ज्ञात आइसोलेट्स जिन्हें सबफाइलम 1 कहा जाता है।[16]हालाँकि, उपफाइलम 2 के सदस्य अब तक केवल दीमक की आंत में पाए गए हैं।[16][17] और कुछ कूड़ा-करकट खाने वाले तिलचट्टों में।[18] वुड-फीडिंग नासुतिरमेस हॉर्निगर के हिंडगट में सेल्युलोलिटिक फाइबर से जुड़े बैक्टीरिया समुदायों में सबफाइलम 2 की प्रबलता से पता चलता है कि वे उच्च दीमक में पौधों की सामग्री के टूटने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं।[19]


यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. S2CID 239887308.
  2. ↑ Montgomery L, Flesher B, Stahl D (1988). "'बैक्टेरॉइड्स सक्सिनोजेन्स' (हंगेट) का 'फाइब्रोबैक्टर' जीन में स्थानांतरण। नवम्बर फाइब्रोबैक्टर सक्सिनोजेन्स कंघी के रूप में। नवम्बर और 'फाइब्रोबैक्टर इंटेस्टाइनलिस' एसपी का विवरण। नवंबर". Int. J. Syst. Bacteriol. 38 (4): 430–435. doi:10.1099/00207713-38-4-430.
  3. ↑ 3.0 3.1 Gupta, R. S. (2004). "फाइब्रोबैक्टीरस, क्लोरोबी और बैक्टेरॉइडेटस के फाइलोजेनी और सिग्नेचर सीक्वेंस विशेषताएँ". Critical Reviews in Microbiology. 30 (2): 123–140. doi:10.1080/10408410490435133. PMID 15239383. S2CID 24565648.
  4. ↑ Griffiths, E; Gupta, RS (2001). "The use of signature sequences in different proteins to determine the relative branching order of bacterial divisions: evidence that Fibrobacter diverged at a similar time to Chlamydia and the Cytophaga- Flavobacterium-Bacteroides division". Microbiology. 147 (9): 2611–22. doi:10.1099/00221287-147-9-2611. PMID 11535801.
  5. ↑ 5.0 5.1 5.2 Gupta, R. S.; Lorenzini, E. (2007). "फाइलोजेनी और आणविक हस्ताक्षर (संरक्षित प्रोटीन और इंडल्स) जो बैक्टीरिया और क्लोरोबी प्रजातियों के लिए विशिष्ट हैं". BMC Evolutionary Biology. 7: 71. doi:10.1186/1471-2148-7-71. PMC 1887533. PMID 17488508.
  6. ↑ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
  7. ↑ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
  8. ↑ "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2021.
  9. ↑ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  10. ↑ "ar53_r207.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  11. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  12. ↑ Euzéby JP. "फाइब्रोबैक्टीरिया". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2021-03-20.
  13. ↑ Sayers. "फाइब्रोबैक्टीरिया". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2021-03-20.
  14. ↑ Qi, M.; Nelson, K.E.; Daugherty, S.C.; Nelson, W.C.; Hance, I.R.; Morrison, M.; Forsberg, C.W. (2005). "फाइब्रोलाइटिक इंटेस्टाइनल बैक्टीरिया फाइब्रोबैक्टर इंटेस्टाइनेलिस की नई आणविक विशेषताएं फाइब्रोबैक्टर सक्सिनोजेन्स के साथ साझा नहीं की गई हैं, जैसा कि दमनकारी सबट्रैक्टिव हाइब्रिडाइजेशन द्वारा निर्धारित किया गया है।". Journal of Bacteriology. 187 (11): 3739–3751. doi:10.1128/jb.187.11.3739-3751.2005. PMC 1112041. PMID 15901698.
  15. ↑ McDonald, JE; Lockhart, RJ; Cox, MJ; Allison, HE; McCarthy, AJ (2008). "Detection of novel Fibrobacter populations in landfill sites and determination of their relative abundance via quantitative PCR". Environmental Microbiology. 10 (5): 1310–1319. doi:10.1111/j.1462-2920.2007.01544.x. PMID 18266756.
  16. ↑ 16.0 16.1 16.2 Hongoh, Y.; Deevong, P.; Hattori, S.; Inoue, T.; Noda, S.; Noparatnaraporn, N.; Kudo, T.; Ohkuma, M. (2006). "Phylogenetic diversity, localization, and cell morphologies of members of the candidate phylum TG3 and a subphylum in the phylum Fibrobacteres, recently discovered bacterial groups dominant in termite guts". Applied and Environmental Microbiology. 72 (10): 6780–6788. Bibcode:2006ApEnM..72.6780H. doi:10.1128/aem.00891-06. PMC 1610327. PMID 17021231.
  17. ↑ Mikaelyan, A.; Dietrich, C.; Köhler, T.; Poulsen, M.; Sillam-Dussès, D.; Brune, A. (2015). "आहार उच्च दीमक की आंत में जीवाणु समुदाय संरचना का प्राथमिक निर्धारक है". Molecular Ecology. 24 (20): 5824–5895. doi:10.1111/mec.13376. PMID 26348261. S2CID 206182668.
  18. ↑ Mikaelyan, A.; Köhler, T.; Lampert, N.; Rohland, J.; Boga, H.; Meuser, K.; Brune, A. (2015). "Classifying the bacterial gut microbiota of termites and cockroaches: A curated phylogenetic reference database (DictDb)". Systematic and Applied Microbiology. 38 (7): 472–482. doi:10.1016/j.syapm.2015.07.004. PMID 26283320.
  19. ↑ Mikaelyan, A.; Strassert, J.; Tokuda, G.; Brune, A. (2014). "लकड़ी खाने वाले उच्च दीमक (नासुटिटरमेस एसपीपी।)". Environmental Microbiology. 16 (9): 2711–2722. doi:10.1111/1462-2920.12425.
  • Holt JG, ed. (1994). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (9th ed.). Williams & Wilkins. ISBN 978-0-683-00603-2.


बाहरी संबंध

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