क्लोरोफ्लेक्सोटा

क्लोरोफ्लेक्सोटा जीवाणु का एक समूह है जिसमें विभिन्न प्रकार के फेनोटाइप वाले आइसोलेट्स होते हैं, जिनमें सदस्य शामिल हैं जो एरोबिक जीव थर्मोफिल्स हैं, जो ऑक्सीजन का उपयोग करते हैं और उच्च तापमान में अच्छी तरह से बढ़ते हैं; एनोक्सीजेनिक phototroph, जो प्रकाश संश्लेषण के लिए प्रकाश का उपयोग करते हैं (हरे गैर-सल्फर बैक्टीरिया); और अवायवीय जीव halorespirator, जो इलेक्ट्रॉन स्वीकर्ता के रूप में हैलोजेनेटेड ऑर्गेनिक्स (जैसे जहरीले क्लोरीनयुक्त एथेन्स और पॉलीक्लोराइनेटेड बाइफिनाइल) का उपयोग करता है।

जाति क्लोरोफ्लेक्सोटा के सदस्य मोनोडर्म हैं (अर्थात, बिना बाहरी झिल्ली वाली एक कोशिका झिल्ली होती है), लेकिन वे ज्यादातर ग्राम-नकारात्मक दाग लगाते हैं। बैक्टीरिया के कई अच्छी तरह से अध्ययन किए गए फ़ाइला डिडरम और दाग ग्राम-नकारात्मक हैं, जबकि जाने-माने मोनोडर्म जो ग्राम-पॉजिटिव को दागते हैं उनमें फर्मिक्यूट्स (या बैसिलोटा) (जीसी-सामग्री | कम जी + सी ग्राम-पॉजिटिव), एक्टिनोमाइसेटोटा (उच्च-जी) शामिल हैं। + सी ग्राम-पॉजिटिव) और डाइनोकोकस (मोटी पेप्टिडोग्लाइकन के साथ ग्राम-पॉजिटिव diderms)।

इतिहास

See also: Bacterial taxonomy and Bacterial phyla

टैक्सोन नाम 2001 के बर्गी के मैनुअल ऑफ सिस्टेमैटिक बैक्टीरियोलॉजी के वॉल्यूम 1 के संस्करण में बनाया गया था और यह क्लोरोफ्लेक्सस नाम का लैटिन बहुवचन है, जो कि फाइलम के टाइप प्रजाति जीनस का नाम है, एक जीवाणु वर्गीकरण है। 1987 में, आणविक फाइलोजेनी क्रांति के अग्रदूतों में से एक के रूप में माने जाने वाले कार्ल वोइस ने 16S राइबोसोमल आरएनए (एसएसयू) अनुक्रमों के आधार पर यूबैक्टीरिया को 11 डिवीजनों में विभाजित किया और जेनेरा क्लोरोफ्लेक्सस, हर्पेटोसिफॉन और थर्मोमाइक्रोबियम को हरे गैर-सल्फर बैक्टीरिया और रिश्तेदारों में बांटा। , जिसे बर्गी के व्यवस्थित जीवाणु विज्ञान के मैनुअल के पहले खंड में अस्थायी रूप से क्लोरोफ्लेक्सी नाम दिया गया था।

क्लोरोफ्लेक्सोटा एक गहरी शाखाओं वाली फाइलम (जीवाणु फ़ाइला देखें) होने के नाते, बर्गी के व्यवस्थित जीवाणु विज्ञान के मैनुअल के वॉल्यूम वन में एक ही नाम के साथ एक वर्ग को शामिल करने पर विचार किया गया था। हालाँकि, 2001 के बाद से, नई खोजी गई प्रजातियों की बदौलत नए वर्ग बनाए गए हैं, और फ़िलम क्लोरोफ्लेक्सी को अब कई वर्गों में विभाजित किया गया है।

Dehalococcoidetes एक प्लेसहोल्डर नाम है जो ह्यूजेनहोल्ट्ज़ और स्टैकेब्रांट, 2004 द्वारा दिया गया है, Dehalococcoides ethenogenes के बाद 1997 में आंशिक रूप से वर्णित एक प्रजाति। मोए एट अल द्वारा पूरी तरह से वर्णित पहली प्रजाति डेहलोजेनिमोनस लाइकेंथ्रोपोरेपेलेंस थी। 2009, रेफ नाम = देहलोजेनिमोनस>{{Cite journal | last1 = Moe | first1 = W. M. | last2 = Yan | first2 = J. | last3 = Nobre | first3 = M. F. | last4 = Da Costa | first4 = M. S. | last5 = Rainey | first5 = F. A. | title = देहलोजेनिमोनस लाइकेंथ्रोपोरेपेलेंस जीन। नवम्बर, सपा. नवंबर, क्लोरीनयुक्त विलायक-दूषित भूजल से अलग किया गया एक रिडक्टिवली डीहैलोजनिंग जीवाणु| journal = International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology | volume = 59 | issue = 11 | pages = 2692–2697 | year = 2009 | doi = 10.1099/ijs.0.011502-0 | pmid=19625421| doi-access = free }</रेफ> लेकिन उस प्रजाति के विवरण में वर्ग को आधिकारिक नहीं बनाया गया था और न ही परिवारों या आदेशों को निर्धारित किया गया था क्योंकि दो प्रजातियां केवल 90% 16S राइबोसोमल आरएनए पहचान साझा करती हैं, जिसका अर्थ है कि वे अलग-अलग परिवारों या यहां तक ​​​​कि आदेशों में पड़ सकते हैं।

क्लोरोफ्लेक्सोटा के हाल के फाइलोजेनेटिक विश्लेषण ने वर्तमान में फाइलम का हिस्सा विभिन्न वर्गों के एक साथ समूहीकरण के लिए बहुत कमजोर समर्थन पाया है। फाइलम बनाने वाले छह वर्गों ने प्रोटीन के बड़े डेटासेट के लिए अनुक्रमित अनुक्रमों के आधार पर फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ों में लगातार एक अच्छी तरह से समर्थित क्लैड नहीं बनाया है, और कोई संरक्षित हस्ताक्षर इंडल्स की पहचान नहीं की गई थी जो पूरे फाइलम द्वारा विशिष्ट रूप से साझा की गई थी।हालांकि, क्लास क्लोरोफ्लेक्सी और थर्मोमिक्रोबिया को 50S राइबोसोमल प्रोटीन L19 और एंजाइम UDP-ग्लूकोज 4-एपिमेरेज़ में सामान्य फ़ाइलोजेनेटिक साधनों और साझा संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स की पहचान दोनों द्वारा लगातार एक साथ समूह में पाया गया।यह सुझाव दिया गया है कि फाइलम क्लोरोफ्लेक्सी सेंसु स्ट्रिक्टो में केवल क्लोरोफ्लेक्सी और थर्मोमिक्रोबिया वर्ग शामिल होने चाहिए, और अन्य चार वर्ग (डेहलोकोकाइडेटेस, एनारोलिनिया, कैल्डिलिनिया और केडोनोबैक्टीरिया) क्लोरोफ्लेक्सी के पड़ोस में एक या एक से अधिक स्वतंत्र फ़ाइला शाखाओं का प्रतिनिधित्व कर सकते हैं।

फाइलोजेनी

वर्तमान में स्वीकृत टैक्सोनॉमी नामकरण में स्थायी (LPSN) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची पर आधारित है। और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र (एनसीबीआई)।

16S rRNA based LTP_12_2021

120 marker proteins based GTDB 08-RS214 (28th April 2023).

Tepidiformia Tepidiformales Tepidiformaceae Tepidiforma       Dehalococcoidia Dehalococcoidales Dehalococcoidaceae   Dehalococcoides     Dehalogenimonas               "Caldilineia" Caldilineales Caldilineaceae   Litorilinea     Caldilinea             Ardenticatenia Ardenticatenales Ardenticatenaceae Ardenticatena       "Anaerolineia" Anaerolineales Anaerolineaceae   Aggregatilinea       Thermomarinilinea         Anaerolinea     Flexilinea         Pelolinea       Bellilinea       Leptolinea       Longilinea       Levilinea     Ornatilinea                                 Ktedonobacteria Thermogemmatisporales Thermogemmatisporaceae Thermogemmatispora     Ktedonobacteriales   Thermosporotrichaceae Thermosporothrix         Ktedonobacteraceae Ktedonobacter         Ktedonosporobacteraceae Ktedonosporobacter       Reticulibacteraceae Reticulibacter   Dictyobacteraceae   Tengunoibacter     Dictyobacter                     Thermoflexia Thermoflexales Thermoflexaceae Thermoflexus           "Thermomicrobiia" Sphaerobacterales Sphaerobacteraceae   Nitrolancea     Sphaerobacter       Thermomicrobiales Thermomicrobiaceae   Thermomicrobium     Thermorudis         Chloroflexia   Kallotenuales Kallotenuaceae Kallotenue         Herpetosiphonales Herpetosiphonaceae Herpetosiphon     Chloroflexales Roseiflexaceae Roseiflexus   Chloroflexaceae   Heliothrix       Oscillochloris     Chloroflexus

"Limnocylindria" "Limnocylindrales" "Limnocylindraceae" "Ca Aquidulcis"             Ktedonobacteria Ktedonobacteriales Ktedonobacteriaceae   Thermogemmatispora       Ktedonosporobacter         Ktedonobacter     Thermosporothrix         Tengunoibacter     Dictyobacter                     Dehalococcoidia Tepidiformales Tepidiformaceae Tepidiforma     Dehalococcoidales Dehalococcoidaceae   Dehalococcoides     Dehalogenimonas             "Caldilineia"   Chloroflexia   "Thermobaculales" "Thermobaculaceae" Thermobaculum     Thermomicrobiales Thermomicrobiaceae     Nitrolancea     Sphaerobacter         Thermomicrobium     Thermorudis             Chloroflexales   Herpetosiphonaceae Herpetosiphon       Roseiflexaceae   "Kouleothrix"     Roseiflexus     Chloroflexaceae   Chloroflexus       Oscillochloris       "Ca. Chloroploca"     "Ca. Viridilinea"

टैक्सोनॉमी

जीनस कैंडिडेटस कैलडीबैक्टर corrig. Spieck et al. 2020
जीनस कैंडिडेटस क्लोरोट्रीकोइड्स corrig. Oren et al. 2020 [क्लोरोथ्रिक्स उम्मीदवार (जीवाणु) Klappenbach & Pierson 2004 non Dyar 1921 non Berger-Perrot 1982]
कैंडिडा जीनस Nitrocaldera Spieck et al. 2020
जीनस कैंडिडा Nitrotheca Spieck et al. 2020
जीनस कैंडिडा पोरिफ्लेक्सस Kogawa et al. 2022
क्लास लिम्नोसिलिंड्रिया Mehrshad et al. 2018

• Limnocylindrales ऑर्डर करें Mehrshad et al. 2018
  • पारिवारिक Limnocylindraceae Mehrshad et al. 2018 (एसएल56)
    • जीनस कैंडिडा मीठा जल corrig. Rodriguez-R et al. 2020
    • जीनस कैंडिडा Limnocylindrus Mehrshad et al. 2018

क्लास केटेडोनोबैक्टीरिया Cavaletti et al. 2007 emend. Yabe et al. 2010

• तारमोगेमेटिसपोरालेस ऑर्डर करें Yabe et al. 2011
  • पारिवारिक Thermogemmatisporaceae Yabe et al. 2011
    • जीनस Thermogemmatispora Yabe et al. 2011<रेफरी नाम = doi10.1099/ice.0.024877-0>Yabe, S.; Aiba, Y.; Sakai, Y.; Hazaka, M.; Yokota, A. (2010). " थर्मोगैममेटिसपोरा ओनिकोबेंसिस जीन। नव., सपा. नवम्बर और थर्मोगेमाटिसपोरा फोलियोरम एसपी। नव।, भूतापीय मिट्टी पर गिरी हुई पत्तियों से अलग, और थर्मोगैमेटिसपोरेसी फैम का विवरण। नवम्बर और Thermogemmatisporales ord। नवंबर वर्ग केटेडोनोबैक्टीरिया के भीतर". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (4): 903–910. doi:10.1099/ijs.0.024877-0. PMID 20495028.</ref>
• आदेश केटेडोनोबैक्टेरेल्स Cavaletti et al. 2007
  • परिवार डिक्टियोबैक्टीरिया Wang et al. 2019
    • जीनस डिक्टियोबैक्टर Yabe et al. 2017
    • जीनस टेंगुनोबैक्टर Wang et al. 2019
  • परिवार केटेडोनोबैक्टीरियासी Cavaletti et al. 2007
    • जीनस केटेडोनोबैक्टर corrig. Cavaletti et al. 2007
    • जीनस केटेडोनोस्पोरा Yabe et al. 2021
  • परिवार केटेडोनोस्पोरोबैक्टीरिया Yan et al. 2020
    • जीनस केटेडोनोस्पोरोबैक्टर Yan et al. 2020
  • परिवार रेटिकुलीबैक्टीरिया Yabe et al. 2021
    • जीनस रेटिकुलीबैक्टर Yabe et al. 2021
  • परिवार थर्मोस्पोरोट्रिचैसी Yabe et al. 2010
    • जीनस थर्मोस्पोरोथ्रिक्स Yabe et al. 2010

क्लास उम्ब्रीसाइक्लोपिया Mehrshad et al. 2018

• ऑर्डर Umbricyclopales Mehrshad et al. 2018
  • पारिवारिक अम्ब्रिसाइक्लोपेसिया Mehrshad et al. 2018
    • जीनस कैंडिडेटस Umbricyclops Mehrshad et al. 2018 (टीके10)

क्लास बथोस्फेरिया Mehrshad et al. 2018

• बाथोस्फेरलेस ऑर्डर करें Mehrshad et al. 2018
  • पारिवारिक बाथोस्फेरेसिया Mehrshad et al. 2018
    • जीनस कैंडिडा बथोस्फेरा Mehrshad et al. 2018 (JG30-KF-CM66)

क्लास टेपिडीफोर्मिया Kochetkova et al. 2020

• tepidiformes ऑर्डर करें Kochetkova et al. 2020
  • फैमिली टेपिडीफॉर्मेसी Kochetkova et al. 2020
    • जीनस टेपिडीफॉर्मा Kochetkova et al. 2020

वर्ग देहलोकॉकाइडेट्स Löffler et al. 2013

• आदेश देहलोकॉकाइडेल्स Löffler et al. 2013
  • देहलोकोकोइडेसी परिवार Löffler et al. 2013
    • जीनस देहलोकॉकाइड्स Löffler et al. 2013
    • जीनस Dehalogenimon Moe et al. 2009

वर्ग हीटर corrig. Ward et al. 2018

• फोटोट्रोफिकल्स ऑर्डर करें Zheng et al. 2022
  • फैमिली फोटोट्रोफिकेसी Zheng et al. 2022
    • जीनस फोटोट्रोफिकस Zheng et al. 2022

क्लास अर्देंटिकेटेनिया Kawaichi et al. 2013

• अर्देंटिकेनेलेस ऑर्डर करें Kawaichi et al. 2013
  • पारिवारिक अर्देंटिकेटेनेसी Kawaichi et al. 2013
    • जीनस आर्देंटिकेटेना Kawaichi et al. 2013

क्लास Caldilineae Oren, Parte & Garrity 2016 ex Cavalier-Smith 2020

• आदेश Caldilineales Yamada et al. 2006
  • जीनस कैंडिडेटस डिफ्लुविफिलम Nierychlo et al. 2019
  • फैमिली अमरोलिनिएसी Andersen et al. 2019
    • जीनस कैंडिडा अमरोलिनिया Andersen et al. 2019
  • परिवार Caldilineaceae Yamada et al. 2006
    • जीनस कैल्डिलिनिया Sekiguchi et al. 2003
    • जीनस समुद्र तट Kale et al. 2013

क्लास थर्मोफ्लेक्सिया Dodsworth et al. 2014

• थर्मोफ्लेक्सलेस ऑर्डर करें Dodsworth et al. 2014
  • फैमिली थर्मोफ्लेक्सेसी Dodsworth et al. 2014
    • जीनस कैंडिडा रोजीलाइन Thiel et al. 2016
    • जीनस थर्मोफ्लेक्सस Dodsworth et al. 2014

क्लास एनेरोलाइनी Oren, Parte & Garrity 2016

• फैमिली प्रोफंडिसोलिटेरिएसी Mehrshad et al. 2018
  • जीनस गहरा अलगाववादी कैंडिडेट Mehrshad et al. 2018 (CL500-11)
• प्रोमिनिफिललेस ऑर्डर करें
  • पारिवारिक प्रोमिनीफिलेसी
    • जीनस कैंडिडा प्रोमिनीफिलम corrig. McIlroy et al. 2016
• ऑडर समुच्चय Nakahara et al. 2019
  • परिवार एग्रीगेटिलिनेसी Nakahara et al. 2019
    • जीनस समग्र रेखा Nakahara et al. 2019
• आदेश Anaerolineales Yamada et al. 2006
  • परिवार एनेरोलिनेसी Yamada et al. 2006
    • जीनस अनारोलिनिया Sekiguchi et al. 2003 emend. Yamada et al. 2006
    • जीनस बेलिलिनिया Yamada et al. 2007<रेफरी नाम = doi10.1099/ijs.0.65098-0 />
    • जीनस ब्रेवेफिलस McIlroy et al. 2017
    • उम्मीदवार जीनस डेनिट्रोलिनिया Okubo et al. 2021
    • जीनस डेसल्फोलिनिया Van Vliet et al. 2020
    • जीनस फ्लेक्सीलिनिया Sun et al. 2015
    • जीनस लेविलिनिया Yamada et al. 2006<रेफरी नाम = doi10.1099/ice.0.64169-0 />
    • जीनस लेप्टोलिनिया Yamada et al. 2006<रेफरी नाम = doi10.1099/ijs.0.64169-0 />
    • जीनस लंबी रेखा Yamada et al. 2007<रेफरी नाम = doi10.1099/ijs.0.65098-0 />
    • जीनस सजावटी रेखा Podosokorskaya et al. 2013
    • जीनस पेलोलिनिया Imachi et al. 2014
    • जीनस थर्मोमेरिनिलिनिया Nunoura et al. 2013
    • जीनस थर्मोनेरोथ्रिक्स Gregoire et al. 2011
    • जीनस कैंडिडा विल्लिग्रासिलिस Nierychlo et al. 2019

क्लास थर्मोमाइक्रोबिया Oren, Parte & Garrity 2016

• जीनस थर्मल बाइबैक्टर Zhao et al. 2023
• ऑर्डर स्पैरोबैक्टेरेल्स Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997
  • फैमिली स्फेरोबैक्टीरिया Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997
    • जीनस नाइट्रोलेंसिया Sorokin et al. 2014 [[[नाइट्रोलैंसेटस]] Sorokin et al. 2012]
    • जीनस स्पैरोबैक्टर Demharter et al. 1989
• थर्मोमाइक्रोबियल ऑर्डर करें Garrity & Holt 2002
  • फैमिली थर्मोमाइक्रोबिएसी Garrity & Holt 2002
    • जीनस थर्मोमाइक्रोबियम Jackson, Ramaley & Meinschein 1973
    • जीनस थर्मोरुडिस King & King 2014

क्लास क्लोरोफ्लेक्सिया Gupta et al. 2013

• जीनस देहलोबियम Wu et al. 2002
• जीनस कैंडिडेटस लिथोफ्लेक्सस Saghai et al. 2020
• जीनस कैंडिडेटस सार्सीनिथ्रिक्स Nierychlo et al. 2019
• थर्मोबैक्युलस ऑर्डर करें
  • फैमिली थर्मोबेक्यूलेसी
    • जीनस थर्मोबेकुलम Botero et al. 2004
• कॉलोटेनुअल्स ऑर्डर करें Cole et al. 2013
  • कुल कल्लोटेनुएसी Cole et al. 2013
    • जीनस कल्लोटिनये Cole et al. 2013
• हर्पेटोसिफोनेलेस ऑर्डर करें Gupta et al. 2013
  • पारिवारिक हर्पेटोसिफॉनेसी Gupta et al. 2013
    • उम्मीदवार जीनस Anthektikosiphon Ward, Fischer & McGlynn 2020
    • जीनस हर्पेटोसिफॉन Holt & Lewin 1968 [[[फ्लेविलिटोरिबैक्टर]] García-López et al. 2020]
• क्लोरोफ्लेक्सलेस ऑर्डर करें Gupta et al. 2013
  • सबऑर्डर रोजीफ्लेक्सीनी Gupta et al. 2013
    • परिवार रोजीफ्लेक्सेसी Gupta et al. 2013 [ कुलेओट्रिचैसी Mehrshad et al. 2018]
      • जीनस कुलोथ्रिक्स Kohno et al. 2002
      • जीनस हेलियोथ्रिक्स Pierson et al. 1986
      • जीनस रोजीफ्लेक्सस Hanada et al. 2002
  • सबऑर्डर क्लोरोफ्लेक्सिनी Gupta et al. 2013
    • परिवार क्लोरोफ्लेक्सेसी Gupta et al. 2013
      • जीनस कैंडिडा क्लोरैनेरोफिलम Thiel et al. 2016
      • जीनस क्लोरोफ्लेक्सस Pierson & Castenholz 1974 [[[क्लोरोक्रिनिस]]]
    • परिवार ओसिल्लोक्लोरिडेसी Gupta et al. 2013
      • उम्मीदवार जीनस क्लोरोप्लोका Gorlenko et al. 2014
      • वंश क्लोरोनेमा ♪ Dubinina & Gorlenko 1975
      • जीनस ऑसिलोक्लोरिस Gorlenko & Pivovarova 1989
      • जीनस कैंडिडा विरिडिलिनिया Grouzdev et al. 2018

व्युत्पत्ति

क्लोरोफ्लेक्सी नाम क्लोरोफ्लेक्सस का एक नियोलेटिन नाममात्र का मर्दाना बहुवचन है, जो पहले वर्णित जीनस का नाम है। संज्ञा ग्रीक विशेषण क्लोरोस, -ए, ऑन (χλωρός, -ά, -όν) का एक संयोजन है, जिसका अर्थ है हरा-पीला, और लैटिन पुल्लिंग पैसिव पर्फेक्ट पार्टिसिपल फ्लेक्सस (फ्लेक्टो का), अर्थ झुका हुआ।व्युत्पत्ति क्लोरीन से संबंधित नहीं है, एक तत्व जिसे 1810 में सर हम्फ्री डेवी द्वारा खोजा गया था और इसका नाम उसके हल्के हरे रंग के नाम पर रखा गया था। इसी जड़ वाला एक अन्य संघ क्लोरोबायोटा है, जबकि साइनोबैक्टीरीया की जड़ सायनोस (κύανος) है, जिसका अर्थ है नीला-हरा। कुछ अन्य फिला के विपरीत, क्लोरोफ्लेक्सोटा की पीढ़ी के नाम पर कोई थीम रूट नहीं है, और वास्तव में क्लोरो- या क्लोरिस में समाप्त होने वाले कई जेनेरा या तो सायनोबैक्टीरिया या क्लोरोबी हैं।