राइबोन्यूक्लिएज III

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Ribonuclease III domain
PDB 1yyw EBI.jpg
Ribonuclease III structure interacting with double stranded RNA.
Identifiers
SymbolRNase_III
PfamPF00636
InterProIPR000999
PROSITEPDOC00448
SCOP21jfz / SCOPe / SUPFAM
Available protein structures:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
PDB1o0wB:51-141 2a11A:41-134 1jfzA:37-121

1rc7A:37-121 1yywA:37-121 1i4sA:37-121 1rc5B:37-121 1yyoA:37-121 1yykB:37-121

1yz9A:37-121 2fflA:333-418 1u61A:10-111

राइबोन्यूक्लिज़ III (आरएनएसई III या आरएनएसई सी) [1] (बीआरईएनडीए 3.1.26.3) राइबोन्यूक्लिएज का एक प्रकार है जो आरएनए को पहचानता है और इसे विशिष्ट लक्षित स्थानों पर विभाजित करता है उन्हें परिपक्व आरएनए में परिवर्तित करें। [2] ये किण्वक एंडोरिबोन्यूक्लाइजेस का एक समूह है जो कि उनके राइबोन्यूक्लाइज कार्यछेत्र द्वारा विशेषता है, जिसे आरएनएस III कार्यछेत्र वर्गीकरण किया गया है। [3] वे कोशिका में सर्वव्यापी यौगिक हैं और आरएनए अग्रदूत संश्लेषण, आरएनए रव शामक और पीपीपी स्वनियामक तंत्र जैसे मार्गों में एक प्रमुख भूमिका निभाते हैं। [4][5]


आरएनएएसई III के प्रकार

आरएनएएसई III अधिकुल को चार ज्ञात वर्गों में विभाजित किया गया है: 1, 2, 3 और 4। प्रत्येक वर्ग को उसकी कार्यछेत्र संरचना द्वारा परिभाषित किया गया है। [6] कक्षा 1 आरएनएएसई III

  • कक्षा 1 आरएनएएसई III किण्वक में एक समरूप संरचना होती है जिसका कार्य डीएसआरएनए को कई सबयूनिट में विभाजित करना है। यह एक Mg2+-आश्रित एंडोन्यूक्लिएज है और काफी हद तक जीवाणु और जीवाणुभोजी में पाया जाता है। कक्षा 1 आरएनएएसई III ग्लोमेरोमाइकोटन कवक में पाया गया है, जिसके बारे में संदेह था कि यह साइनोबैक्टीरीया से क्षैतिज जीन स्थानांतरण का परिणाम है। [7] वर्ग आरएनएएस III में एशरिकिआ कोली से एमसी हैं। विशिष्ट रूप से, वर्ग I के किण्वकों में एक एकल आरएनएएसई III कार्यछेत्र (RIIID) होता है जिसके बाद एक डीएसआरएनए-बंधन कार्यछेत्र होता है (डीएसआरबीडी)। [6] वे राइबोसोमल आरएनए (आरआरएनए), छोटे परमाणु आरएनए (एसएनआरएनए) और छोटे न्यूक्लियर आरएनए (एसएनओआरएनए) के अग्रदूतों को संसाधित करते हैं। कक्षा 1 आरएनएएसई III का मूल डीएसआरएनए विखंडन कार्य उन अधिकांश जीवों में बना रहता है जिनमें यह उपस्थित होता है। हालाँकि, कई प्रजातियों में कार्य बदल गया है और विभिन्न या अतिरिक्त जैविक भूमिकाओं पर ले लिया है। [8]
आरएनसी (यूनीप्रोटकेबी P0A7Y0) - ई. कोलाई - यह आरएनएएसई III डीएसआरएनए पर कई क्षेत्रों के दरार के माध्यम से विषाणुज प्रतिलिपि और कुछ mRNAs के प्रसंस्करण में सम्मिलित है। यह दरार राइबोसोमल प्रोटीन की उपस्थिति से प्रभावित हो सकती है। [9]
श्रेणी 1 आरएनएएसई III के प्रसरण, मिनी-III कहलाते हैं, होमोडिमेरिक किण्वक होते हैं और केवल इनमें से आरएनएएसई III कार्यछेत्र होते हैं। [10]

कक्षा 2 आरएनएएसई III

Saccharomyces cerevisiae से कक्षा 2 राइबोन्यूक्लिज़ III (Rnt1p) डबल-स्ट्रैंडेड RNA के साथ जटिल में

* श्रेणी II को N-टर्मिनल कार्यछेत्र (NTD), RIIID, और a की उपस्थिति से डीएसआरबीडी परिभाषित किया गया है। वर्ग II कुछ कवक प्रजातियों में पाया जाता है। [6] वे आरआरएनए, एसएनआरएनए, और स्नोआरएनए के अग्रदूतों को संसाधित करते हैं।

कक्षा 2 आरएनएएसई III कार्यछेत्र के साथ यीस्ट न्यूक्लीज़:[11]
RNT1 (यूनीप्रोटकेबी Q02555) - एस. सेरेविसिया - यह आरएनएएसई III आरडीएनए के प्रतिलेख और प्रसंस्करण में सम्मिलित है, क्लीवेज के माध्यम से U2 snRNA का 3' अंत गठन टर्मिनल लूप, सेल वॉल तनाव प्रतिक्रिया और गिरावट, और मॉर्फोजेनेसिस चेकपॉइंट जीन का विनियमन है। [12]
Pac1 (यूनीप्रोटकेबी P22192) - एस. पोम्बे - यह आरएनएएसई III यीस्ट जीनोम के क्रोमोसोम II पर स्थित है और, जब अधिक व्यक्त किया जाता है, तो सीधे इसमें बाँझपन, संभोग दक्षता की कमी, असामान्य समसूत्री कोशिका चक्र और जीव का उत्परिवर्तन दमन सम्मिलित होता है। [13]

कक्षा 3 आरएनएएसई III

डीजीसीआर8 प्रोटीन के दो सी-टर्मिनल हेलिस के साथ जटिल मानव ड्रोसा राइबोन्यूक्लिएज किण्वक की क्रिस्टल संरचना।

* कक्षा 3 आरएनएएस III में माइक्रो आरएनए (एमआईआरएनए) के अग्रदूतों की परिपक्वता में कार्य करने के लिए जाने जाने वाले किण्वकों का ड्रोसा वर्ग सम्मिलित है। [14]

कक्षा 4 आरएनएएसई III

  • कक्षा 4 आरएनएएस III में आरएनए हस्तक्षेप (आरएनएआई) में कार्य करने के लिए जाने जाने वाले किण्वकों का डिसर वर्ग सम्मिलित है। [15] श्रेणी 4 III आरएनएएस S-आरएनएएसई घटक हैं। यह रोसेसी, सोलानेसी और प्लांटैजिनेसी में स्व-असंगति प्रणाली का एक घटक है। उन्हें विभिन्न पर्यावरणीय तनाव परिदृश्यों से निपटने के लिए भर्ती किया जाता है। रेफरी नाम = रोजास >रोजास, हेर्नान; फ्लोयड, ब्राईस; मॉरिस, स्टेफ़नी सी.; बाशम, डियान; मैकिनटोश, गुस्तावो सी.; गोल्डरेज़, एरियल (1 July 2015). "एनएनएसआर1, एक वर्ग III गैर एस-आरनेज़ विशेष रूप से फॉस्फेट की कमी के अंतर्गत निकोटियाना अल्टा में प्रेरित, एंडोप्लाज्मिक रेटिकुलम डिब्बों में स्थानीयकृत है". पादप विज्ञान. 236: 250–259. doi:10.1016/j.plantsci.2015.04.012. PMID 26025538.</ref>
  • डिसर किण्वक डीएसआरएनए किण्वभोज को लंबाई में 21-27 न्यूक्लियोटाइड्स से लेकर अलग-अलग आकार के छोटे RNA टुकड़ों में संसाधित करते हैं।

रेफरी नाम = मॅकरै >{{cite journal|last1=MacRae|first1=Ian J|last2=Doudna|first2=Jennifer A|title=राइबोन्यूक्लिज़ रिविजिटेड: स्ट्रक्चरल इनसाइट्स इन राइबोन्यूक्लिज़ III फैमिली किण्वक्स| journal=संरचनात्मक जीव विज्ञान में वर्तमान राय|दिनांक=फरवरी 2007|volume=17|issue=1|pages=138–145|doi=10.1016/j.sbi.2006.12.002|pmid=17194582}</ref> डाइसर के पास एक द्विश्रृंगी हेलिकेज़/एटीपीएएसई कार्यछेत्र के सक्रियण है जिसके बाद एक अज्ञात फलन का दूसरा कार्यछेत्र आता है। इसमें केंद्रीय रूप से स्थित पीएजेड कार्यछेत्र और एक सी-टर्मिनल समाकृति भी सम्मिलित है जिसमें डीएसआरबीडी और दो आरएनएएसई III उत्प्रेरक कार्यछेत्रएक सम्मिलित है। [16] डिसर की सहभागिता अन्य प्रोटीनों के साथ होती है, जिसमें टीआरबीपी, पीएसीटी और एजीओ2 सम्मिलित हैं। [17] आरएनएआई और संबंधित मार्गों के माध्यम से कॉग्नेट जीन की विशेष रव शामक के अनुक्रम के लिए डाइसर द्वारा उत्पादित आरएनए मार्गदर्शक के रूप में कार्य करते हैं।[18]


आरएनएएसई III कार्यछेत्र युक्त मानव प्रोटीन

गला घोंटना[20]


यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ Filippov, Valery; Solovyev, Victor; Filippova, Maria; Gill, Sarjeet S. (7 March 2000). "यूकेरियोट्स में एक उपन्यास प्रकार का RNase III परिवार प्रोटीन". Gene. 245 (1): 213–221. doi:10.1016/S0378-1119(99)00571-5. PMID 10713462.
  2. ↑ Zamore, Phillip D. (December 2001). "तैंतीस साल बाद, Ribonuclease III सक्रिय साइट पर एक झलक". Molecular Cell. 8 (6): 1158–1160. doi:10.1016/S1097-2765(01)00418-X. PMID 11885596.
  3. ↑ Conrad, Christian; Rauhut, Reinhard (February 2002). "Ribonuclease III: new sense from nuisance". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 34 (2): 116–129. doi:10.1016/S1357-2725(01)00112-1. PMID 11809414.
  4. ↑ Inada, T.; Nakamura, Y. (1995). "Escherichia कोलाई के SuhB प्रोटीन की अनुपस्थिति में राइबोन्यूक्लिज़ III की घातक डबल-फंसे आरएनए प्रसंस्करण गतिविधि". Biochimie. 77 (4): 294–302. doi:10.1016/0300-9084(96)88139-9. PMID 8589060.
  5. ↑ Park, Hongmarn; Yakhnin, Helen; Connolly, Michael; Romeo, Tony; Babitzke, Paul; Gourse, R. L. (15 December 2015). "CsrA चुनिंदा रूप से RNase III और PNPase द्वारा संसाधित किए गए प्रतिलेखों के अनुवाद को दबाकर PNPase ऑटोरेगुलेटरी तंत्र में भाग लेता है". Journal of Bacteriology. 197 (24): 3751–3759. doi:10.1128/JB.00721-15. PMC 4652041. PMID 26438818.
  6. ↑ 6.0 6.1 6.2 Liang Y-H, Lavoie M, Comeau M-A, Elela SA, Ji X. Structure of a Eukaryotic RNase III Post-Cleavage Complex Reveals a Double- Ruler Mechanism for Substrate Selection. Molecular cell. 2014;54(3):431-444. doi:10.1016/j.molcel.2014.03.006.
  7. ↑ Soon-Jae Lee, Mengxuan Kong, Paul Harrison, Mohamed Hijri; Conserved proteins of the RNA interference system in the arbuscular mycorrhizal fungus Rhizoglomus irregulare provide new insight into the evolutionary history of Glomeromycota, Genome Biology and Evolution, , evy002, https://doi.org/10.1093/gbe/evy002
  8. ↑ Kreuze, Jan F.; Savenkov, Eugene I.; Cuellar, Wilmer; Li, Xiangdong; Valkonen, Jari P. T. (1 June 2005). "वायरल क्लास 1 RNase III RNA साइलेंसिंग के दमन में शामिल है". Journal of Virology (in English). 79 (11): 7227–7238. doi:10.1128/JVI.79.11.7227-7238.2005. ISSN 0022-538X. PMC 1112141. PMID 15890961.
  9. ↑ "rnc - Ribonuclease 3 - Escherichia coli (strain K12) - rnc gene & protein". www.uniprot.org. UniProt Consortium. Retrieved 5 November 2016.
  10. ↑ Glow, D.; Pianka, D.; Sulej, A. A.; Kozlowski, Lukasz P.; Czarnecka, J.; Chojnowski, G.; Skowronek, K. J.; Bujnicki, J. M. (2015). "मिनी-III RNase द्वारा dsRNA का अनुक्रम-विशिष्ट विदलन". Nucleic Acids Research. 43 (5): 2864–2873. doi:10.1093/nar/gkv009. ISSN 0305-1048. PMC 4357697. PMID 25634891.
  11. ↑ Wu, Chang-Xian; Xu, Xian-Jin; Zheng, Ke; Liu, Fang; Yang, Xu-Dong; Chen, Chuang-Fu; Chen, Huan-Chun; Liu, Zheng-Fei (1 April 2016). "ब्रुसेला से राइबोन्यूक्लिज़ III का लक्षण वर्णन". Gene. 579 (2): 183–192. doi:10.1016/j.gene.2015.12.068. PMID 26778206.
  12. ↑ "RNT1/YMR239C Overview". www.yeastgenome.org. Stanford University. Retrieved 5 November 2016.
  13. ↑ "pac1 (SPBC119.11c)". www.pombase.org. EMBL-EBI. Retrieved 5 November 2016.
  14. ↑ Filippov V, Solovyev V, Filippova M, Gill SS (Mar 2000). "यूकेरियोट्स में एक उपन्यास प्रकार का RNase III परिवार प्रोटीन". Gene. 245 (1): 213–221. doi:10.1016/S0378-1119(99)00571-5. PMID 10713462.
  15. ↑ Bernstein E, Caudy AA, Hammond SM, Hannon GJ (2001). "आरएनए इंटरफेरेंस के दीक्षा चरण में बाइडेंटेट राइबोन्यूक्लिएज की भूमिका". Nature. 409 (6818): 363–6. doi:10.1038/35053110. PMID 11201747. S2CID 4371481. {{closed access}
  16. ↑ Redko, Yulia; Bechhofer, David H.; Condon, Ciarán (June 2008). "Mini-III, an unusual member of the RNase III family of enzymes, catalyses 23S ribosomal RNA maturation in B. subtilis". Molecular Microbiology. 68 (5): 1096–1106. doi:10.1111/j.1365-2958.2008.06207.x. PMID 18363798.
  17. ↑ Nicholson, Allen W. (January 2014). "डबल-फंसे आरएनए दरार के राइबोन्यूक्लिज़ III तंत्र". Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA. 5 (1): 31–48. doi:10.1002/wrna.1195. PMC 3867540. PMID 24124076.
  18. ↑ Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named MacRae
  19. ↑ "DICER1 - सारांश की ऊतक अभिव्यक्ति". www.proteinatlas.org. The Human Protein Atlas. Retrieved 5 November 2016.
  20. ↑ "ड्रोसा की ऊतक अभिव्यक्ति - सारांश". www.proteinatlas.org. The Human Protein Atlas. Retrieved 5 November 2016.
This article incorporates text from the public domain Pfam and InterPro: IPR000999


बाहरी संबंध

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