थर्मोटोगोटा

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colspan=2 style="text-align: center; background-color: rgb(220,235,245)" | थर्मोटोगोटा
colspan=2 style="min-width:15em; text-align: center; background-color: rgb(220,235,245)" | Scientific classification
Domain:
Bacteria
Superphylum:
Eurybacteria
Phylum:
Thermotogota

Reysenbach 2021[1]
Class:
Thermotogae

Reysenbach 2002
colspan=2 style="text-align: center; background-color: rgb(220,235,245)" | Orders
colspan=2 style="text-align: center; background-color: rgb(220,235,245)" | Synonyms
  • Thermotogota:
    • "Synthermota" Cavalier-Smith 2020
    • "Thermotogae" Reysenbach 2001
    • "Thermotogaeota" Oren et al. 2015
    • "Thermotogota" Whitman et al. 2018
  • Thermotogae:
    • "Thermotogia" Cavalier-Smith 2020
    • Togobacteria Cavalier-Smith 2002

थर्मोटोगोटा डोमेन (जीव विज्ञान) जीवाणु का एक समूह है। फाइलम थर्मोटोगोटा ग्राम नकारात्मक स्टेनिंग, अवायवीय जीव और ज्यादातर थर्मोफिलिक और हाइपरथर्मोफिलिक बैक्टीरिया से बना है।[2][3]

विशेषताएं

इस फाइलम का नाम इन प्रजातियों की कोशिकाओं के आसपास, विशेषता म्यान संरचना, या टोगा के साथ उच्च तापमान पर इनमें से कई जीवों के अस्तित्व से लिया गया है।[4] हाल ही में, मध्यम तापमान पर उपलब्ध कुछ थर्मोटोगोटा की भी पहचान की गई है।[5] चूंकि थर्मोटोगोटा प्रजातियां ग्राम-नकारात्मक धुंधलापन प्रदर्शित करती हैं, वे एकल-इकाई लिपिड मैम्ब्रेन से बंधी होती है, इसलिए वे मोनोडर्म बैक्टीरिया हैं।[3][6][7] कुछ थर्मोटोगोटा प्रजातियों की उच्च तापमान पर पनपने की क्षमता के कारण, उन्हें औद्योगिक प्रक्रियाओं में उपयोग के लिए आकर्षक लक्ष्य माना जाता है।[8] हाइड्रोजन गैस के उत्पादन के लिए तथा विभिन्न जटिल कार्बोहाइड्रेट का उपयोग करने के लिए थर्मोटोगोटा की चयापचय क्षमता ने इन प्रजातियों को जीवाश्म ईंधन के वैकल्पिक ऊर्जा के उत्पादन के लिए संभावित जैव प्रौद्योगिकी स्रोत के रूप में उद्धृत किया है।[9]

आणविक हस्ताक्षर

कुछ समय पहले तक, कोई भी जैव रासायनिक या आणविक मार्कर ज्ञात नहीं थे जो अन्य सभी जीवाणुओं से फाइलम थर्मोटोगोटा की प्रजातियों को भिन्न कर सकता है।[2] चूंकि, एक हालिया तुलनात्मक जीनोमिक अध्ययन ने महत्वपूर्ण प्रोटीनों में बड़ी संख्या में संरक्षित हस्ताक्षर इंडल्स (सीएसआई) की पहचान की है जो या तो सभी थर्मोटोगोटा प्रजातियों या इसके कई उपसमूहों के लिए विशिष्ट हैं।[3][10] महत्वपूर्ण हाउसकीपिंग प्रोटीन जैसे कि पोल 1, आरईसीए, और टीआरपीआरएस, और राइबोसोमल प्रोटीन L4, L7/L12, S8, S9, आदि में इनमें से कई सीएसआई इस संघ के लिए उपन्यास आणविक मार्कर प्रदान करने वाले विभिन्न अनुक्रमित थर्मोटोगोटा प्रजातियों में विशिष्ट रूप से उपस्थित हैं। इन अध्ययनों ने प्रत्येक आदेश और प्रत्येक परिवार के लिए विशिष्ट सीएसआई की पहचान की थी।[11] ये इंडेल्स थर्मोटोगोटा के वर्तमान टैक्सोनोमिक संगठन के लिए आधार हैं, और फाइलोजेनोमिक विश्लेषणों द्वारा दृढ़ता से समर्थित हैं।[3][10] इसके अतिरिक्त सीएसआई भी पाए गए हैं जो थर्मोटोगा, स्यूडोथर्मोटोगा, फ़र्विडोबैक्टीरियम और थर्मोसिफो के लिए विशिष्ट हैं। ये सीएसआई प्रत्येक संबंधित जीनस के भीतर सभी प्रजातियों के लिए विशिष्ट हैं, और अन्य सभी जीवाणुओं में अनुपस्थित हैं, इस प्रकार यह विशिष्ट मार्कर हैं।[3][10] पेट्रोटोगा मोबिलिस, कोसमोटोगा ओलेरिया, और थर्मोटोगल्स जीवाणु मेसजी1 की गहरी शाखाओं वाली प्रजातियों से युक्त एक क्लैड को भी सात सीएसआई द्वारा समर्थित किया गया था।[10] इसके अतिरिक्त, थर्मोटोगोटा और अन्य प्रोकैरियोटिक समूहों के बीच क्षैतिज जीन स्थानांतरण के साक्ष्य प्रदान करने वाले कुछ सीएसआई भी रिपोर्ट किए गए थे।[10] और इसके वर्गीकरण में भविष्य के संशोधन के लिए नवीनतम खोजे गए आणविक मार्कर, आणविक शर्तों में फ़ाइलम से प्रजातियों की पहचान और परिसीमन के लिए उपन्यास साधन प्रदान करते हैं।

इसके अतिरिक्त, एक 51 एए सम्मिलन सीएसआई की पहचान सभी थर्मोटोगल्स के साथ-साथ एक्वीफिकोटा के लिए विशिष्ट होने के लिए की गई थी, एक अन्य आदेश जिसमें हाइपरथर्मोफिलिक प्रजातियां सम्मलित हैं।[12] फाइलोजेनेटिक अध्ययनों ने प्रदर्शित किया कि जीवाणुओं के इन दो असंबंधित समूहों के भीतर एक ही सीएसआई की उपस्थिति पार्श्व जीन स्थानांतरण के कारण नहीं है, अपितु विकासवादी दबाव के कारण थर्मोफिल्स के इन दो समूहों में सीएसआई के स्वतंत्र रूप से विकसित होने की संभावना है।[12] सम्मिलन एडीपी / एटीपी की बाध्यकारी साइट के पास, एटीपीस डोमेन में प्रोटीन की सतह पर स्थित है। आणविक गतिशील उत्तेजनाओं ने पानी के अणुओं, सीएसआई के भीतर अवशेषों और एक एडीपी/एटीपी अणु के बीच बने हाइड्रोजन बांड के एक नेटवर्क को स्पष्ट किया है। ऐसा माना जाता है कि यह नेटवर्क उच्च तापमान पर सैकऐ प्रोटीन के लिए एडीपी/एटीपी बंधन को बनाए रखने में सहायता करता है, समग्र थर्मोस्टेबल फेनोटाइप कुछ थर्मोटोगल्स प्रजातियों में योगदान देता है।[12]







टैक्सोनॉमी

इस फाइलम में तथा वर्तमान में एक एकल वर्ग (थर्मोटोगे), चार ऑर्डर (थर्मोटोगल्स, कॉस्मोपॉलिटन, पेट्रोटोगल्स, और मेसोएसिडिगल) और पांच परिवार (थर्मेटोगैसी, फ़र्विडोबैक्टीरिया, कोस्मोटोगेसी, पेट्रोटोगैसी, और मेसोएसिडिटोगैसी) सम्मलित हैं।[2][3][4][10][13][14][11] इसमें कुल 15 पीढ़ी और 52 प्रजातियां सम्मलित हैं।[15] 16S आरआरएनए ट्री में, थर्मोटोगोटा को आर्कियल-जीवाणु शाखा बिंदु के निकट एक्विफिकोटा (हाइपरथर्मोफिलिक जीवों से युक्त एक अन्य संघ) के साथ शाखा में देखा गया है।[2][4] चूंकि, थर्मोटोगोटा का एक्वीफिकोटा से घनिष्ठ संबंध, और प्रजातियों के पश्चात वाले समूह की गहरी शाखाएं, अन्य जीन/प्रोटीन अनुक्रमों के आधार पर फाईलोजेनेटिक अध्ययन द्वारा समर्थित नहीं हैं।[3][16][17][18][19] और कई उच्च संरक्षित सार्वभौमिक प्रोटीनों में संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स द्वारा[20][21] थर्माटोगोटा की भी आर्किया जीवों के साथ कथित रूप से विपुल पार्श्व जीन स्थानांतरण के लिए जांच की गई है।[22][23] चूंकि, अधिक मजबूत कार्यप्रणाली पर आधारित हाल के अध्ययनों से पता चलता है कि थर्मोटोगोटा और आर्किया सहित अन्य समूहों के बीच एलजीटी की घटना उतनी अधिक नहीं है जितनी पहले के अध्ययनों में सुझाई गई थी।[24][25][10][26]

वर्तमान में स्वीकृत टैक्सोनॉमी प्रोकैरियोटिक नामों की सूची के साथ स्टैंडिंग इन नोमेनक्लेचर (एलपीएसएन)[27] और नेशनल सेंटर फॉर बायोटेक्नोलॉजी इन्फॉर्मेशन (एनसीबीआई) पर आधारित है।[28]


संदर्भ

  1. ↑ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987.
  2. ↑ 2.0 2.1 2.2 2.3 Huber R., Hannig M. (2006). "Thermotogales". प्रोकैरियोट्स. Vol. 7: Proteobacteria: Delta and Epsilon Subclasses. Deeply Rooting Bacteria. pp. 899–922. doi:10.1007/0-387-30747-8_38. ISBN 978-0-387-25497-5.
  3. ↑ 3.0 3.1 3.2 3.3 3.4 3.5 3.6 Gupta, RS (2014) The Phylum Thermotogae. The Prokaryotes 989-1015. Springer Berlin Heidelberg.
  4. ↑ 4.0 4.1 4.2 Reysenbach, A.-L. (2001) Phylum BII. Thermotogae phy. nov. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, pp. 369-387. Eds D. R. Boone, R. W. Castenholz. Springer-Verlag: Berlin.
  5. ↑ Nesbo C.L.; Kumaraswamy R.; Dlutek M.; Doolittle W.F. & Foght J. (2010). "Searching for mesophilic Thermotogales bacteria: "mesotogas" in the wild". Appl Environ Microbiol. 76 (14): 4896–4900. Bibcode:2010ApEnM..76.4896N. doi:10.1128/AEM.02846-09. PMC 2901743. PMID 20495053.
  6. ↑ Gupta R.S. (1998). "Protein phylogenies and signature sequences: A reappraisal of evolutionary relationships among archaebacteria, eubacteria, and eukaryotes". Microbiol Mol Biol Rev. 62 (4): 1435–1491. doi:10.1128/MMBR.62.4.1435-1491.1998. PMC 98952. PMID 9841678.
  7. ↑ Gupta R.S. (2011). "Origin of diderm (Gram-negative) bacteria: antibiotic selection pressure rather than endosymbiosis likely led to the evolution of bacterial cells with two membranes". Antonie van Leeuwenhoek. 100 (2): 171–182. doi:10.1007/s10482-011-9616-8. PMC 3133647. PMID 21717204.
  8. ↑ Eriksen N.T.; Riis M.L.; Holm N.K. & Iversen N. (2010). "H(2) synthesis from pentoses and biomass in Thermotoga spp" (PDF). Biotechnol Lett. 33 (2): 293–300. doi:10.1007/s10529-010-0439-x. PMID 20960218. S2CID 35392547.
  9. ↑ Conners S.B.; Mongodin E.F.; Johnson M.R.; Montero C.I.; Nelson K.E. & Kelly R.M. (2006). "माइक्रोबियल बायोकैमिस्ट्री, फिजियोलॉजी, और बायोटेक्नोलॉजी ऑफ हाइपरथर्मोफिलिक थर्मोटोगा प्रजाति". FEMS Microbiol Rev. 30 (6): 872–905. doi:10.1111/j.1574-6976.2006.00039.x. PMID 17064285.
  10. ↑ 10.0 10.1 10.2 10.3 10.4 10.5 10.6 Gupta R.S. & Bhandari V. (2011). "फाइलम थर्मोटोगे और इसके उपसमूहों के लिए फाइलोजेनी और आणविक हस्ताक्षर". Antonie van Leeuwenhoek. 100 (1): 1–34. doi:10.1007/s10482-011-9576-z. PMID 21503713. S2CID 24995263.
  11. ↑ 11.0 11.1 Bhandari V, Gupta RS (January 2014). "फ़ाइलम (वर्ग) थर्मोटोगे के लिए आणविक हस्ताक्षर और इसके विभाजन के लिए एक प्रस्ताव तीन आदेशों (थर्मोटोगेल्स, कोस्मोटोगल्स ऑर्ड। नोव। और पेट्रोटोगेल्स ऑर्ड। नोव।) जिसमें चार परिवार (थर्मोटोगैसी, फ़र्विडोबैक्टीरियासी फ़ैम। नव।, कोस्मोटोगैसी फ़ैम। नव।) शामिल हैं। और पेट्रोटोगेसी फैम। नव।) और एक नया जीनस स्यूडोथर्मोटोगा जीन। नवम्बर पांच नए संयोजनों के साथ". Antonie van Leeuwenhoek. 105 (1): 143–168. doi:10.1007/s10482-013-0062-7. PMID 24166034. S2CID 6547323.
  12. ↑ 12.0 12.1 12.2 Khadka, Bijendra; Persaud, Dhillon; Gupta, Radhey S. (2019-12-29). "Novel Sequence Feature of SecA Translocase Protein Unique to the Thermophilic Bacteria: Bioinformatics Analyses to Investigate Their Potential Roles". Microorganisms. 8 (1): 59. doi:10.3390/microorganisms8010059. ISSN 2076-2607. PMC 7023208. PMID 31905784.
  13. ↑ Oren A, Garrity GM (2015). "नए नामों और नए संयोजनों की सूची पहले प्रभावी रूप से प्रकाशित हुई थी, लेकिन वैध रूप से प्रकाशित नहीं हुई थी" (PDF). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 65 (7): 2017–2025. doi:10.1099/ijs.0.000317. PMID 28056215.
  14. ↑ Itoh T, Onishi M, Kato S, Iino T, Sakamoto M, Kudo T, Takashina T, Ohkuma M (December 2015). "अथलासोटोगा सैक्रोफिला जीन। नवम्बर सपा। नवम्बर जापान के एक अम्लीय स्थलीय गर्म पानी के झरने से पृथक, और मेसोएसिडिटोगल्स ऑर्ड का प्रस्ताव। नव।, मेसोएसिडिटोगेसी परिवार। नवम्बर संघ थर्मोटोगे में". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66 (2): 1045–1051. doi:10.1099/ijsem.0.000833. PMID 26651491.
  15. ↑ Euzeby JP. List of prokaryotic names with standing in nomenclature. http://www.bacterio.cict.fr/t/thermotogales[permanent dead link].
  16. ↑ Klenk H.P.; Meier T.D.; Durovic P.; et al. (1999). "RNA polymerase of Aquifex pyrophilus: Implications for the evolution of the bacterial rpoBC operon and extremely thermophilic bacteria". J Mol Evol. 48 (5): 528–541. Bibcode:1999JMolE..48..528K. doi:10.1007/pl00006496. PMID 10198119. S2CID 224169.
  17. ↑ Gupta R.S. (2000). "The phylogeny of Proteobacteria: relationships to other eubacterial phyla and eukaryotes". FEMS Microbiol Rev. 24 (4): 367–402. doi:10.1111/j.1574-6976.2000.tb00547.x. PMID 10978543.
  18. ↑ Ciccarelli F.D.; Doerks T.; von Mering C.; Creevey C.J.; Snel B. & Bork P. (2006). "जीवन के अत्यधिक सुलझे हुए वृक्ष के स्वत: पुनर्निर्माण की ओर". Science. 311 (5765): 1283–1287. Bibcode:2006Sci...311.1283C. CiteSeerX 10.1.1.381.9514. doi:10.1126/science.1123061. PMID 16513982. S2CID 1615592.
  19. ↑ Di Giulio M. (2003). "The universal ancestor was a thermophile or a hyperthermophile: Tests and further evidence". J Theor Biol. 221 (3): 425–436. Bibcode:2003JThBi.221..425G. doi:10.1006/jtbi.2003.3197. PMID 12642117.
  20. ↑ Bhandari V, Naushad HS, Gupta RS (2012). "प्रोटीन आधारित आणविक मार्कर प्रोकैरियोटिक फाइलोजेनी को समझने और विकास के डार्विनियन मोड का समर्थन करने के लिए विश्वसनीय साधन प्रदान करते हैं". Front Cell Infect Microbiol. 2: 98. doi:10.3389/fcimb.2012.00098. PMC 3417386. PMID 22919687.
  21. ↑ Griffiths E. & Gupta R.S. (2004). "विभिन्न प्रोटीनों में सिग्नेचर सीक्वेंस एक्विफिकल्स ऑर्डर के देर से विचलन के लिए सबूत प्रदान करते हैं।". International Microbiology. 7 (1): 41–52. PMID 15179606.
  22. ↑ Nelson K.E.; Clayton R.; Gill S.; et al. (1999). "'थर्मोटोगा मैरिटिमा' के जीनोम अनुक्रम से आर्किया और बैक्टीरिया के बीच पार्श्व जीन स्थानांतरण के लिए साक्ष्य". Nature. 399 (6734): 323–329. Bibcode:1999Natur.399..323N. doi:10.1038/20601. PMID 10360571. S2CID 4420157.
  23. ↑ Nesbo C.L.; L'Haridon S.; Stetter K.O. & Doolittle W.F. (2001). "'थर्मोटोगा मैरिटिमा' में दो "आर्कियल" जीनों के फाइलोजेनेटिक विश्लेषण से आर्किया और बैक्टीरिया के बीच कई स्थानान्तरण का पता चलता है". Mol Biol Evol. 18 (3): 362–375. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a003812. PMID 11230537.
  24. ↑ Ochman H.; Lawrence J.G. & Groisman E.A. (2000). "पार्श्व जीन स्थानांतरण और जीवाणु नवाचार की प्रकृति". Nature. 405 (6784): 299–304. Bibcode:2000Natur.405..299O. doi:10.1038/35012500. PMID 10830951. S2CID 85739173.
  25. ↑ Zhaxybayeva O.; Swithers K.S.; Lapierre P.; et al. (2009). "काइमेरिक प्रकृति पर, थर्मोफिलिक उत्पत्ति, और थर्मोटोगल्स के फाइलोजेनेटिक प्लेसमेंट". Proc Natl Acad Sci U S A. 106 (14): 5865–5870. Bibcode:2009PNAS..106.5865Z. doi:10.1073/pnas.0901260106. PMC 2667022. PMID 19307556.
  26. ↑ Kunisawa T (2011). "जीन ऑर्डर तुलना से फाइलम डेफेरिबैक्टर्स की फाइलोजेनेटिक स्थिति का निष्कर्ष". Antonie van Leeuwenhoek. 99 (2): 417–422. doi:10.1007/s10482-010-9492-7. PMID 20706870. S2CID 38697982.
  27. ↑ J.P. Euzéby. "प्रतिरोधी गर्मी". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2022-03-20.
  28. ↑ Sayers; et al. "थर्मोटोगे". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2022-03-20.
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