हिस्टोन डीएसेटाइलेज

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Histone deacetylase
2vqj.png
Catalytic domain of human histone deacetylase 4 with bound inhibitor. PDB rendering based on 2vqj.[1]
Identifiers
EC no.3.5.1.98
CAS no.9076-57-7
Databases
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हिस्टोन डीएसेटाइलेज
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हिस्टोन डीएसेटाइलिस (EC 3.5.1.98 एंजाइम का एक वर्ग है जो एक हिस्टोन पर सिग्मा-एन एसिटाइल लाइसिन एमीनो अम्ल से एसिटाइल समूह (ओ=सी-सीएच3) को हटा देते हैं जिससे हिस्टोन डीएनए को अधिक कसकर लपेटने की अनुमति देता है।Cite error: Closing </ref> missing for <ref> tag

उच्च यूकेरियोट्स में एचडीएसी की कक्षाएं

एचडीएसी, खमीर मूल एंजाइमों और डोमेन संगठन के अनुक्रम समरूपता के आधार पर चार वर्गों में वर्गीकृत हैं। [2]

एचडीएसी में जिंक होता है और इसे जेडएन(जिंक) के रूप में जाना जाता है। [3] वे एक शास्त्रीय आर्गिनेज की सुविधा देते हैं और संरचनात्मक तथा यांत्रिक रूप से सिर्टुइनस से अलग होते हैं जो एक रॉसमैन फोल्ड में बदल जाते आश्रितह निकोटिनामाइड एडेनिन डाइन्यूक्लियोटाइड एनएडी आश्रित हैं। [4]


उपप्रकार

एचडीएसी प्रोटीन को कार्य और डीएनए को समानता के आधार पर चार वर्गों बांटा गया है। कक्षा एक, दो और चार को शास्त्रीय एचडीएसी माना जाता है जिनकी गतिविधियाँ ट्राइकोस्टैटिन ए (टीएसए) द्वारा बाधित होती हैं और उनमें जिंक पर निर्भर सक्रिय साइट होती है जबकि कक्षा तीन में एंजाइम एनएडी का एक परिवार है। जिन्हें प्रोटीन सिरूइन कहा जाता है और यह टीएसए से प्रभावित नहीं होते हैं।[5] खमीर में इन तीन समूहों के समरूप नाम पाए जाते हैं कम पोटेशियम (एचडीएरपीडी तीन) से मेल खाती है हिस्टोन डीएसेटाइलेज (एचडीए एक) कक्षा दो के अनुरूप और मूक सूचना नियामक कक्षा तीन के अनुरूप होता है कक्षा चार में केवल एक आइसोफॉर्म (एचडीएसी ग्यारह) होता है जो आरपीडी तीन या एचडीए एक खमीर एंजाइमों के साथ अत्यधिक सजातीय नहीं होता है।[6] इसलिए एचडीएसी ग्यारह को अपनी कक्षा में आसान किया गया है। कक्षा तीन के एंजाइमों को एक अलग प्रकार का एंजाइम माना जाता है और उनकी क्रिया का एक अलग तंत्र होता है ये एंजाइम एनएडी हैं जबकि अन्य वर्गों में एचडीएसी को जेडएन(जिंक) की आवश्यकता होती है यह एक सहकारक के रूप में पाया जाता है।[7]


विकास

एचडीएसी एस विकास के दौरान संरक्षित हैं सभी यूकेरियोट्स तथा आर्किया में ऑर्थोलॉग दिखाते हैं। कशेरुकियों पौधों और आर्थ्रोपोड्स सहित सभी ऊपरी यूकेरियोट्स में प्रति वर्ग एचडीएसी होता है जबकि अधिकांश कशेरुकी मछली की हड्डी के अपवाद के साथ ग्यारह कैनोनिकल एचडीएसी एस ले जाते हैं जिनमें एचडीएसी दो की कमी होती है लेकिन एचडीएसी ग्यारह की एक प्रति दिखाई देती है जिसे एचडीएसी बारह कहा जाता है। पौधे जानवरों की तुलना के अतिरिक्त एचडीएसी ले जाते हैं जो कि इन सीसाइल जीवों द्वारा जटिल ट्रांसक्रिप्शनल विनियम को पूरा करने के लिए होता है। एचडीएसी एस पैतृक एसिटाइल-बाइंडिंग डोमेन से व्युत्पन्न प्रतीत होते हैं क्योंकि एचडीएसी होमोलॉग जीवाणु में एसीटोन यूटिलाइजेशन प्रोटीन (एसीयूसी) प्रोटीन के रूप में पाए जाते हैं।[8] प्रोटीन परिवार के 226 सदस्यों का टोपोलॉजिकल फाइलोजेनेटिक ट्री द्वारा प्रतिनिधित्व करता है।[8]

उपकोशिकीय वितरण

कक्षा एक एचडीएसी के भीतर एक, दो और तीन नाभिक पाए जाते हैं जबकि एचडीएसी आठ में नाभिक और साइटोप्लाज्म दोनों पाए जाते हैं और ये झिल्ली से जुड़े भी होते हैं। क्लास दो एचडीएसी (एचडीएसी चार ,पांच , छ:,सात, नौ और दस) अलग-अलग संकेतों के आधार पर न्यूक्लियस के अंदर और बाहर शटल करने में सक्षम हैं।[9][10] एचडीएसी छ: एक साइटोप्लाज्मिक सूक्ष्म से जुड़ा एंजाइम है। एचडीएसी छ: ट्यूबुलिन, एचएसपी नब्बे और कोर्टेक्टिन को डिसेटाइलेट करता है यह प्रोटीन के साथ कॉम्प्लेक्स बनाता है और विभिन्न जैविक प्रक्रियाओं में सम्मिलित होता है।[11]


समारोह

हिस्टोन संशोधन

यह लाइसिन और आर्गनीन अमीनो अम्ल पर एकत्र अमीन समूहों के कारण हिस्टोन सकारात्मक रूप से चार्ज होती है। ये सकारात्मक चार्ज हिस्टोन को डीएनए बैकबोन पर नकारात्मक रूप से चार्ज किए गए फॉस्फेट समूहों के साथ बातचीत करने और बाँधने में मदद करते हैं। एसिटिलेशन, जो सामान्य रूप से एक कोशिका में होता है हिस्टोन पर धनात्मक आवेशों को अमीन्स एमाइडस में बदलकर हटा देता है और हिस्टोन की डीएनए से जुड़ने की क्षमता को कम कर देता है। यह बाइंडिंग क्रोमेटिन के विस्तार की अनुमति होती है जिससे जेनेटिक प्रतिलेखन (आनुवांशिकी) हो सकता है। हिस्टोन डीएसेटाइलिस उन एसिटाइल समूहों को हटाते हैं हिस्टोन सकारात्मक चार्ज को बढ़ाते हैं तथा हिस्टोन और डीएनए बैकबोन के बीच उच्च-संबंध को बढ़ाते हैं। तथा डीएनए बाइंडिंग डीएनए संरचना को संघनित करती है जो प्रतिलेखन को रोकती है।

हिस्टोन डीएसेटाइलेज़ जीवित प्रणाली के भीतर मार्गों की एक श्रृंखला में सम्मिलित है। जीन और जीनोम (केईजीजी) के क्योटो एनसाइक्लोपीडिया के अनुसार

न्यूक्लियोसोम पर कुछ सक्रियण संकेत। न्यूक्लियोसोम में कसकर इकट्ठे कोर क्षेत्र में हिस्टोन प्रोटीन के चार जोड़े होते हैं और साथ ही जुड़ी संगठित प्रत्येक हिस्टोन का 30 प्रतिशत तक (प्रत्येक जोड़ी की केवल एक पूंछ दिखाई जाती है)। गुणसूत्रों में हिस्टोन कोर प्रोटीन के चारों ओर डीएनए लपेटा जाता है। लाइसिन (के) को उनकी स्थिति दिखाने वाली संख्या के साथ नामित किया गया है, उदाहरण के लिए (के4), लाइसिन को हिस्टोन प्रोटीन में अमीनो (एन) छोर से चौथे अमीनो एसिड के रूप में दर्शाता है। मेथिलिकरण {मी}, और एसिटिलिकेशन [एसी] हिस्टोन पूंछ के लाइसिन पर आम अनुवाद के बाद का संशोधन हैं।
न्यूक्लियोसोम पर कुछ के संकेत।

हिस्टोन एसिटिलेशन जीन अभिव्यक्ति के नियमन में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। हाइपरसेटिलेटेड क्रोमैटिन ट्रांसक्रिप्शनल रूप से सक्रिय है और हाइपोसेटिलेटेड क्रोमैटिन चूहों पर किए गए एक अध्ययन में पाया गया कि एचडीएसी एक की अनुपस्थिति में चूहा जीन के एक विशिष्ट उपसमुच्चय (7प्रतिशत) को विनियमित किया गया था।[12] उनके अध्ययन में एचडीएसी एक और एचडीएसी दो के बीच एक नियामक क्रॉसस्टॉक भी पाया गया और एक ट्रांसक्रिप्शनल कोएक्टिवेटर के रूप में एचडीएसी एक के लिए एक उपन्यास समारोह का सुझाव दिया। एचडीएसी एक अभिव्यक्ति सिजोफ्रेनिया के प्रीफ्रंटकॉर्टेक्स में बढ़ी हुई पाई गई [13] जीएडी सरसठ की अभिव्यक्ति के साथ नकारात्मक रूप से सहसंबद्ध है।

न्यूरॉनस में हिस्टोन संशोधन

न्यूरॉन्स तंत्रिका तंत्र के भीतर विद्युत रूप से उत्तेजनीय कोशिकाएं हैं और तंत्रिका सर्किट में एक साथ व्यवस्थित होते हैं।[14] संस्कृति में समुद्री घोड़ा न्यूरॉन्स गतिविधि हिस्टोन डीएसेटाइलेज एचडीएसी चार के परमाणु का कारण बनने के लिए पर्याप्त था। सिनैप्टिक एनएमडीए रिसेप्टरस के माध्यम से कैल्शियम प्रवाह की उत्तेजना के बाद एक और हिस्टोन डीएसेटाइलेज एचडीएसी पांच को कोशिका द्रव्य में बदल दिया गया था।[15]कल्चर में चूहे के अग्रमस्तिष्क न्यूरॉन्स के कोशिका केंद्रक में पाए जाने वाले चार हजार चार सौ सात प्रोटीन में से, न्यूरॉन्स के सक्रियण के बाद न्यूक्लियोसाइटोप्लास्मिक शट्लिंग या प्रोटीन जैवसंश्लेषण या प्रोटीन के प्रोटियोलिसिस के कारण दो हजार आठ सौ साठ परमाणु एकाग्रता में बदल गए।[16] न्यूरोनल उत्तेजना के बाद सभी प्रोटीनों में एचडीएसी चार में नाभिक से बाहर निकलने के कारण सबसे बड़ी एकाग्रता में कमी आई थी।

एचडीएसी में कमी से हिस्टोन टेल्स पर हिस्टोन एसिटिलिकेशन और डीसेटिलेशन की अधिक उपस्थिति होगी। हिस्टोन एसिटिलेशन जीन के सक्रिय प्रतिलेखन से जुड़ा हुआ है,[17] एक हिस्टोन डीएसेटाविज्ञान कमी से जीन प्रतिलेखन (जीव विज्ञान) को बनाए रखने या बढ़ाने से एपिजेनेटिक्स प्रभाव कम होगा। न्यूरॉन सक्रियण के बाद एचडीएसी चार में बड़ी कमी न्यूरोनल समारोह पर समान रूप से बड़ा प्रभाव डाल सकती है।

गैर-हिस्टोन प्रभाव

हिस्टोन और क्रोमैटिन संरचना को संशोधित करके जीन प्रतिलेखन को विनियमित करने के बाद में एचडीएसी को पूरी तरह से मानना ​​एक गलती है जबकि यह प्रोटीन के कार्य, गतिविधि और स्थिरता को पोस्ट-ट्रांसलेशनल संशोधनों द्वारा नियंत्रित किया जा सकता है। प्रोटीन फास्फारिलीकरण व्यापक रूप से अध्ययन और समझा जाने वाला संशोधन है जिसमें कुछ अमीनो अम्ल अवशेषों को प्रोटीन किनेज की क्रिया द्वारा फास्फोराइलेट किया जाता है या फास्फेटेजों की क्रिया द्वारा डिफॉस्फोराइलेट किया जाता है। लाइसिन अवशेषों का एसिटिलेशन एक समान तंत्र के रूप में उभर रहा है जिसमें गैर-हिस्टोन प्रोटीन एसिटाइलिस और डीएसेटाइलिस द्वारा कार्य किया जाता है।[18] इस संदर्भ में एचडीएसी को विभिन्न प्रकार के गैर-हिस्टोन प्रोटीनों के साथ बातचीत करने के लिए पाया जा रहा है इनमें से कुछ प्रतिलेखन कारक हैं और ट्रांसक्रिप्शन कोरग्युलेटर सह-नियामक हैं। जो इस प्रकार हैं-

  • एचडीएसी छ: एग्रेसोम्स से जुड़ा है। मिसफोल्डेड प्रोटीन समुच्चय को सर्वव्यापकता द्वारा टैग किया जाता है और डायनेन मोटर्स द्वारा साइटोप्लाज्म से माइक्रोट्यूब्यूल नेटवर्क के माध्यम से एक ऑर्गेनेल को एग्रेसिव कहा जाता है। एचडीएसी छ: पॉलीयूबिक्विटिनेटेड मिसफोल्डेड प्रोटीन और डायनेइन मोटर्स से लिंक को बांधता है जिससे मिसफोल्ड किए गए प्रोटीन के विनाश के लिए चैपरोन और प्रोटीसोम में भौतिक रूप से ले जाया जा सकता है।[19] एचडीएसी छ: एसएसपी नब्बे समारोह का महत्वपूर्ण नियामक है और इसका अवरोधक चयापचय संबंधी विकारों के इलाज के लिए प्रस्तावित है।[20]
  • पीटीईएन (जीन) फॉस्फॉइनोसिटोल और एकेटी/पीआई3 किनेज पाथवे के माध्यम से सेल सिग्नलिंग में सम्मिलित एक महत्वपूर्ण फॉस्फेट है। फॉस्फोराइलेशन, सर्वव्यापकता, ऑक्सीकरण और एसिटिलीकरण के एसिटाइलट्रांसफेरेम नियंत्रण के अधीन है। हिस्टोन एसिटाइलट्रांसफेरेज द्वारा पीटीईएन का एसिटिलेशन इसकी गतिविधि को दबा सकता है इसके विपरीत, एसआईआरटीएक डीएसेटाइलेज द्वारा पीटीईएन का डीसेटाइलेशन और एचडीएसी एक द्वारा इसकी गतिविधि को उत्तेजित कर सकता है।[21][22]
  • एपीई एक (एपीईएक्स) डीएनए की मरम्मत एक्टिविटी और ऑक्सीडेटिव तनाव से जुड़ी ट्रांसक्रिप्शनल रेगुलेटरी एक्टिविटी दोनों को रखने वाला एक मल्टीफंक्शनल प्रोटीन है। यह कक्षा एचडीएसी एस के साथ स्थिर रूप से जुड़ा हुआ है और डीसेटाइलेट किया गया है। एसिटिलेशन डीएनए मरम्मत गतिविधि को प्रभावित नहीं करती है, लेकिन यह इसकी ट्रांसक्रिप्शनल गतिविधि को नियंत्रित करती है जैसे कि पीटीईएन प्रमोटर से जुड़ने की क्षमता और पैराथाएरॉएड हार्मोन जीन का ट्रांसक्रिप्शन आरंभ किया जाता है।[23][24]
  • एनएफ केबी एक प्रतिलेखन कारक और प्रभावकारक अणु है जो कोशिका तनाव के जवाब में सम्मिलित है जिसमें एसिटिलिकेशन द्वारा और एचडीएसी तीन और एचडीएसी छ: के माध्यम से डीसेटाइलेशन को नियंत्रित किया जाता है।[25]

ये एचडीएसी के लिए लगातार उभरती गैर-हिस्टोन, गैर-क्रोमैटिन भूमिकाओं के कुछ उदाहरण हैं।

न्यूरोडीजेनेरेटिव रोग

जीन एन्कोडिंग एफयूएस (जीन) एन्यूरोडीजेनेरेटिवक आरएनए/डीएनए बाध्यकारी प्रोटीन विरासत में मिला उत्परिवर्तन पेशीशोषी पार्श्व काठिन्य (एएलएस) से यथोचित रूप से जुड़ा हुआ है।[26] एफयूएस की डीएनए (स्वाभाविक रूप से होने वाली) प्रतिक्रिया में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है जिसमें हिस्टोन डीएसेटाइलेज के साथ इसका सीधा संपर्क है। एएलएस उत्परिवर्ती एफयूएस प्रोटीन डीएनए प्रतिक्रिया और सजातीय पुनर्संयोजन डीएनए मरम्मत में दोषपूर्ण हैं और एचडीएसी एक के साथ कम महत्वपूर्ण दिखाते हैं।[26]

गतिभंग रक्त वाहिनी विस्तार एटीएम सेरीन/थ्रेओनीन किनेज में उत्परिवर्तन के कारण होता है। वाइल्ड-टाइप एटीएम क्रोमैटिन रीमॉडेलिंग और एपिजेनेटिक्स में नियोजित एक प्रोटीन किनेज को एनकोड करता है जो डीएनए की मरम्मत के लिए आवश्यक होता है। डीएनए डबल-स्ट्रैंड ब्रेक की मरम्मत।[27] एटम म्यूटेशन के कारण न्यूरॉन्स परमाणु हिस्टोन डीएसेटाइलेज जमा करते हैं, जिसके परिणामस्वरूप हिस्टोन डीसेटाइलेशन और परिवर्तित न्यूरोनल जीन अभिव्यक्ति में वृद्धि होती है जो गतिभंग-टेलैंगिएक्टेसिया के स्नायविक अध: पतन विशेषताओं में योगदान देता है।[28]


एचडीएसी अवरोधक

Main article: Histone deacetylase inhibitor

हिस्टोन डीएसेटाइलेज़ इनहिबिटर्स (एचडीआई) का मनोरोग और न्यूरोलॉजी में मूड स्टेबलाइजर्स और एंटी-एपिलेप्टिक्स के रूप में एक लंबा इतिहास है उदाहरण वैल्प्रोइक एसिड इन्हीं दिनों में एचडीआई का न्यूरोडीजेनेरेटिव रोग के उपचार के रूप में अध्ययन किया जा रहा है।[29][30][31] कैंसर चिकित्सा के लिए एचडीआई विकसित करने का प्रयास किया गया है।[32][33] वोरिनोस्टैट (एसएएचए) त्वचीय टी सेल लिंफोमा (सीटीसीएल) वाले रोगियों में त्वचीय अभिव्यक्तियों के उपचार के लिए 2006 में अनुमोदित खाद्य और औषधि प्रशासन था जो पिछले उपचारों में विफल रहे हैं। सीटीसीएल के रोगियों के लिए 2009 में एक दूसरे एचडीआई, इस्टोडैक्स (भाग जाओ) को मंजूरी दी गई थी। सटीक तंत्र जिसके द्वारा यौगिक काम कर सकते हैं, अस्पष्ट हैं, लेकिन एपिजेनेटिक रास्ते प्रस्तावित हैं।[34] इसके अलावा, एक नैदानिक ​​परीक्षण संक्रमित व्यक्तियों में एचआईवी के अव्यक्त पूल पर वैल्प्रोइक एसिड के प्रभावों का अध्ययन कर रहा है।[35] एचडीआई की वर्तमान में साइटोटोक्सिक कीमोथेरेपी या विकिरण चिकित्सा के लिए रसायन संवेदक के रूप में या इन विट्रो तालमेल के आधार पर डीएनए मेथिलिकरण अवरोधकों के सहयोग से जांच की जा रही है।[36] आइसोफॉर्म चुनिंदा एचडीआई विकसित किए गए हैं जो व्यक्तिगत एचडीएसी आइसोफॉर्म की भूमिका को स्पष्ट करने में सहायता कर सकते हैं।[37][38][39][40] एचडीएसी अवरोधकों का गैर-हिस्टोन प्रोटीन पर प्रभाव पड़ता है जो एसिटिलेशन से संबंधित हैं। एचडीआई इन अणुओं के एसिटिलीकरण की डिग्री को बदल सकते हैं और इसलिए, उनकी गतिविधि को बढ़ा या दबा सकते हैं। गैर-हिस्टोन प्रोटीन पर काम करने वाले एचडीएसी पर ऊपर दिए गए चार उदाहरणों के लिए (फ़ंक्शन देखें), उनमें से प्रत्येक उदाहरण में एचडीएसी अवरोधक ट्राइकोस्टैटिन ए | ट्राइकोस्टैटिन ए (टीएसए) प्रभाव को अवरुद्ध करता है। एचडीआई को कई ट्रांसक्रिप्शन कारकों की गतिविधि को बदलने के लिए दिखाया गया है जिसमें न्यूक्लियर रिसेप्टर कोएक्टीवेटर 3, एम वाई बी(जीन), ई2एफ1, ईकेएलएफ, एफईएन1, जीएटीए, एचएनएफ4 ,एचएसपी90, केयू, एनएफकेबी, पीसीएनए, सम्मिलित हैं। रेटिनोब्लास्टोमा प्रोटीन।[41][42]कीटोन निकाय बीटा-हाइड्रॉक्सीब्यूट्रिक एसिड | बीटा-हाइड्रॉक्सीब्यूटाइरेट चूहों में हिस्टोन डीएसेटाइलस निषेध द्वारा जीन की अभिव्यक्ति को बढ़ाने के लिए दिखाया गया है।[43]हिस्टोन डीएसेटाइलेज कुछ वायरस की विलंबता को नियंत्रित कर सकते हैं, जिसके परिणामस्वरूप पुनर्सक्रियन होता है।[44] उदाहरण के लिए एक अव्यक्त मानव हर्पीसवायरस -6 संक्रमण के साथ।

हिस्टोन डीएसेटाइलस इनहिबिटर्स ने कुछ प्लास्मोडियम प्रजातियों और चरणों के खिलाफ गतिविधि दिखाई है जो संकेत दे सकते हैं कि उनमें मलेरिया के उपचार की क्षमता है। जो कि कक्षा एचडीएसी एस का डाउनस्ट्रीम लक्ष्य है।[45]


यह भी देखें

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बाहरी संबंध

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