न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरैमिडाइट: Difference between revisions

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[[Image:Phosphoramidite1.png|thumb|400px|संरक्षित 2'-डीऑक्सीन्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स।]][[ न्यूक्लीओसाइड ]] फॉस्फोरामाइडाइट प्राकृतिक या सिंथेटिक न्यूक्लियोसाइड के डेरिवेटिव हैं। वे [[[[oligonucleotide]] संश्लेषण]] ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स, [[ न्यूक्लिक अम्ल ]] के अपेक्षाकृत कम टुकड़े और उनके [[न्यूक्लिक एसिड एनालॉग्स]] के लिए उपयोग किए जाते हैं। न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स को पहली बार 1981 में ब्यूकेज और कारुथर्स द्वारा पेश किया गया था।<ref>{{cite journal|doi=10.1016/S0040-4039(01)90461-7|title=Deoxynucleoside phosphoramidites—A new class of key intermediates for deoxypolynucleotide synthesis|year=1981|author1=Beaucage, S.L. |author2=Caruthers M.H. |journal=Tetrahedron Letters|volume=22|issue=20|pages=1859–1862}}</ref> अवांछित पक्ष प्रतिक्रियाओं से बचने के लिए, प्राकृतिक या सिंथेटिक न्यूक्लियोसाइड में मौजूद प्रतिक्रियाशील हाइड्रॉक्सी और एक्सोसाइक्लिक अमीनो समूह उचित रूप से संरक्षित हैं। जब तक एक न्यूक्लियोसाइड एनालॉग में कम से कम एक हाइड्रॉक्सी समूह होता है, तब तक उपयुक्त सुरक्षा रणनीति का उपयोग किसी को संबंधित फॉस्फोरामाइडाइट में परिवर्तित करने और बाद वाले को सिंथेटिक न्यूक्लिक एसिड में शामिल करने की अनुमति देता है। फॉस्फोरैमिडाइट रणनीति का उपयोग करके ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला के बीच में शामिल होने के लिए, न्यूक्लियोसाइड एनालॉग में दो हाइड्रॉक्सी समूह या कम अक्सर, एक हाइड्रॉक्सी समूह और एक अन्य न्यूक्लियोफिलिक समूह (एमिनो या मर्कैप्टो) होना चाहिए। उदाहरणों में न्यूक्लिक एसिड एनालॉग्स, [[ बंद न्यूक्लिक एसिड ]], [[मोर्फोलिनो]], न्यूक्लियोसाइड 2'-स्थिति (ओएमई, संरक्षित एनएच) में संशोधित शामिल हैं, लेकिन इन तक सीमित नहीं हैं।<sub>2</sub>, एफ), गैर-विहित आधारों वाले न्यूक्लियोसाइड्स (हाइपोक्सैन्थिन और ज़ैंथिन प्राकृतिक न्यूक्लियोसाइड्स [[ आइनोसीन ]] और [[जैन्थोसिन]] में निहित हैं, क्रमशः ट्राइसाइक्लिक बेस जैसे जी-क्लैंप,<ref>{{cite journal|author=Lin, K.-Y., Matteucci, M. D.|journal=J. Am. Chem. Soc.|year=1998|volume=120|issue=33|pages=8531–8532|doi=10.1021/ja981286z|title=A cytosine analog capable of clamp-like binding to a guanine in helical nucleic acids}}</ref> आदि) या एक फ्लोरोसेंट समूह या एक लिंकर आर्म के साथ व्युत्पन्न आधार।
[[Image:Phosphoramidite1.png|thumb|400px|संरक्षित 2'-डीऑक्सीन्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स।]]'''[[ न्यूक्लीओसाइड |न्यूक्लीओसाइड]] फॉस्फोरामाइडाइट''' प्राकृतिक या सिंथेटिक न्यूक्लियोसाइड के डेरिवेटिव हैं। फॉस्फोरामिडाइट्स प्राकृतिक या सिंथेटिक न्यूक्लियोसाइड के व्युत्पन्न हैं। उनका उपयोग ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स, [[न्यूक्लिक एसिड डबल हेलिक्स|न्यूक्लिक एसिड]] के अपेक्षाकृत छोटे टुकड़े और उनके एनालॉग्स को संश्लेषित करने के लिए किया जाता है। न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स को पहली बार 1981 में ब्यूकेज और कारुथर्स द्वारा पेश किया गया था।<ref>{{cite journal|doi=10.1016/S0040-4039(01)90461-7|title=Deoxynucleoside phosphoramidites—A new class of key intermediates for deoxypolynucleotide synthesis|year=1981|author1=Beaucage, S.L. |author2=Caruthers M.H. |journal=Tetrahedron Letters|volume=22|issue=20|pages=1859–1862}}</ref> अवांछित साइड प्रतिक्रियाओं से बचने के लिए, प्राकृतिक या सिंथेटिक न्यूक्लियोसाइड में मौजूद प्रतिक्रियाशील हाइड्रॉक्सी और एक्सोसाइक्लिक अमीनो समूहों को उचित रूप से संरक्षित किया जाता है। जब तक न्यूक्लियोसाइड एनालॉग में कम से कम एक हाइड्रॉक्सी समूह होता है, उचित सुरक्षा रणनीति का उपयोग किसी को संबंधित फॉस्फोरामिडाइट में परिवर्तित करने और बाद वाले को सिंथेटिक न्यूक्लिक एसिड में सम्मिलित करने की अनुमति देता है। फॉस्फोरामिडाइट रणनीति का उपयोग करके ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला के बीच में सम्मिलित होने के लिए, न्यूक्लियोसाइड एनालॉग में दो हाइड्रॉक्सी समूह या, कम प्रायः, एक हाइड्रॉक्सी समूह और एक अन्य न्यूक्लियोफिलिक समूह (एमिनो या मर्कैप्टो) होना चाहिए। उदाहरणों में वैकल्पिक न्यूक्लियोटाइड, एलएनए, मॉर्फोलिनो, 2'-स्थिति (OMe, संरक्षित NH<sub>2</sub>, F) में संशोधित न्यूक्लियोसाइड, गैर-विहित आधार वाले न्यूक्लियोसाइड (प्राकृतिक न्यूक्लियोसाइड इनोसिन और ज़ैंथोसिन में निहित हाइपोक्सैन्थिन और ज़ैन्थिन) सम्मिलित हैं, लेकिन इन्हीं तक सीमित नहीं हैं। , क्रमशः, ट्राइसाइक्लिक बेस जैसे G-क्लैंप, आदि)<ref>{{cite journal|author=Lin, K.-Y., Matteucci, M. D.|journal=J. Am. Chem. Soc.|year=1998|volume=120|issue=33|pages=8531–8532|doi=10.1021/ja981286z|title=A cytosine analog capable of clamp-like binding to a guanine in helical nucleic acids}}</ref> या फ्लोरोसेंट समूह या लिंकर आर्म के साथ व्युत्पन्न आधार है।


== तैयारी ==
== तैयारी ==
न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरैमिडाइट्स की तैयारी के लिए तीन मुख्य विधियाँ हैं।
न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स की तैयारी के लिए तीन मुख्य विधियाँ हैं।[[File:Nucl Amidite Synthesis1.png|thumb|450px|डीएमटी = 4,4'-डाइमेथोक्सीट्रिटिल; बी = वैकल्पिक रूप से संरक्षित न्यूक्लिक बेस; आर = फॉस्फेट सुरक्षा समूह]]
*[[File:Nucl Amidite Synthesis1.png|thumb|450px|डीएमटी = 4,4'-डाइमेथोक्सीट्रिटिल; बी = वैकल्पिक रूप से संरक्षित न्यूक्लिक बेस; आर = फॉस्फेट सुरक्षा समूह]]सामान्य विधि में एक कमजोर एसिड की उत्प्रेरक क्रिया के तहत फॉस्फोरोडायमाइडाइट के साथ एक एकल मुक्त हाइड्रॉक्सी समूह वाले संरक्षित न्यूक्लियोसाइड का उपचार शामिल है।<ref>{{cite journal|author1=Nielsen, J. |author2=Marugg, J. E. |author3=Taagaard, M. |author4=Van Boom, J. H. |author5=Dahl, O. |journal=Recl. Trav. Chim. Pays-Bas|year=1986|volume=105|issue=1|pages=33–34|doi=10.1002/recl.19861050106
|title=Polymer-supported synthesis of deoxyoligonucleotides using in situ prepared deoxynucleoside 2-cyanoethyl phosphoramidites}}</ref><ref>{{cite journal|author1=Nielsen, J. |author2=Taagaard, M. |author3=Marugg, J. E. |author4=Van Boom, J. H. |author5=Dahl, O. |journal=Nucleic Acids Res.|year=1986|volume=14|issue=18|pages=7391–7403|doi=10.1093/nar/14.18.7391|title=Application of 2-cyanoethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite for in situ preparation of deoxyribonucleoside phosphoramidites and their use in polymer-supported synthesis of oligodeoxyribonucleotides|pmc=311758 |pmid=3763407}}</ref> हालाँकि कुछ बिसामिडिट्स को ऊष्मीय रूप से अस्थिर यौगिकों के रूप में सूचित किया गया था,<ref>{{cite journal|author1=Nielsen, J. |author2=Marugg, J. E. |author3=Van Boom, J. H. |author4=Honnens, J. |author5=Taagaard, M. |author6=Dahl, O. |journal=J. Chem Res. Synopses|year=1986|issue=1|pages=26–27|title=Thermal instability of some alkyl phosphorodiamidites}}</ref> 2-सायनोइथाइल एन, एन, एन', एन'-टेट्राइसोप्रोपाइलफॉस्फोरोडायमाइडाइट, वाणिज्यिक न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट तैयार करने के लिए इस्तेमाल किया जाने वाला एमिडाइट अपेक्षाकृत स्थिर है। इसे दो-चरण, एक-पॉट प्रक्रिया का उपयोग करके संश्लेषित किया जा सकता है और [[ खालीपन ]] [[आसवन]] द्वारा शुद्ध किया जा सकता है।<ref>{{cite journal|author1=Nielsen, J. |author2=Dahl, O. |journal=Nucleic Acids Res.|year=1987|volume=15|issue=8|page=3626|doi=10.1093/nar/15.8.3626|title=Improved synthesis of 2-cyanoethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite (iPr2N)2POCH2CH2CN)|pmc=340760|pmid=3575107}}</ref> एक उत्कृष्ट समीक्षा न्यूक्लियोसिडिक और गैर-न्यूक्लियोसिडिक फॉस्फोरामाइडाइट्स की तैयारी में बाद के अभिकर्मक के उपयोग को बहुत विस्तार से रेखांकित करती है।<ref>{{cite journal|author=Beaucage, S. L.|journal=E-EROS Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis|year=2001|doi=10.1002/047084289X.rn00312|title=2-Cyanoethyl Tetraisopropylphosphorodiamidite|isbn=0471936235}}</ref>


*[[File:Nucl Amidite Synthesis2.png|thumb|450px]]दूसरी विधि में, संरक्षित न्यूक्लियोसाइड को कार्बनिक आधार की उपस्थिति में फॉस्फोरोक्लोराइडाइट के साथ इलाज किया जाता है, आमतौर पर एन, एन-डायसोप्रोपाइलथाइलामाइन | एन-एथिल-एन, एन-डायसोप्रोपाइलमाइन (हनीग का आधार)।<ref>{{cite journal|author1=Sinha, N. D. |author2=Biernat, J. |author3=Koester, H. |journal=Tetrahedron Lett.|year=1983|volume=24|issue=52|pages=5843–5846|doi=10.1016/S0040-4039(00)94216-3
* सामान्य विधि में एक कमजोर एसिड की उत्प्रेरक क्रिया के तहत फॉस्फोरामिडाइट के साथ एक एकल मुक्त हाइड्रॉक्सी समूह वाले संरक्षित न्यूक्लियोसाइड का उपचार सम्मिलित होता है।<ref>{{cite journal|author1=Nielsen, J. |author2=Marugg, J. E. |author3=Taagaard, M. |author4=Van Boom, J. H. |author5=Dahl, O. |journal=Recl. Trav. Chim. Pays-Bas|year=1986|volume=105|issue=1|pages=33–34|doi=10.1002/recl.19861050106
|title=Polymer-supported synthesis of deoxyoligonucleotides using in situ prepared deoxynucleoside 2-cyanoethyl phosphoramidites}}</ref><ref>{{cite journal|author1=Nielsen, J. |author2=Taagaard, M. |author3=Marugg, J. E. |author4=Van Boom, J. H. |author5=Dahl, O. |journal=Nucleic Acids Res.|year=1986|volume=14|issue=18|pages=7391–7403|doi=10.1093/nar/14.18.7391|title=Application of 2-cyanoethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite for in situ preparation of deoxyribonucleoside phosphoramidites and their use in polymer-supported synthesis of oligodeoxyribonucleotides|pmc=311758 |pmid=3763407}}</ref> हालाँकि कुछ बिसामिडाइट्स को थर्मल रूप से अस्थिर यौगिकों के रूप में रिपोर्ट किया गया था,<ref>{{cite journal|author1=Nielsen, J. |author2=Marugg, J. E. |author3=Van Boom, J. H. |author4=Honnens, J. |author5=Taagaard, M. |author6=Dahl, O. |journal=J. Chem Res. Synopses|year=1986|issue=1|pages=26–27|title=Thermal instability of some alkyl phosphorodiamidites}}</ref> 2-साइनोइथाइल N,N,N',N'-टेट्राइसोप्रोपाइलफॉस्फोरोडायमिडाइट, वाणिज्यिक न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स तैयार करने के लिए इस्तेमाल किया जाने वाला एमिडाइट अपेक्षाकृत स्थिर है। इसे दो-चरण, एक-पॉट प्रक्रिया का उपयोग करके संश्लेषित किया जा सकता है और वैक्यूम आसवन द्वारा शुद्ध किया जा सकता है।<ref>{{cite journal|author1=Nielsen, J. |author2=Dahl, O. |journal=Nucleic Acids Res.|year=1987|volume=15|issue=8|page=3626|doi=10.1093/nar/15.8.3626|title=Improved synthesis of 2-cyanoethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite (iPr2N)2POCH2CH2CN)|pmc=340760|pmid=3575107}}</ref> एक उत्कृष्ट समीक्षा में न्यूक्लियोसाइड और गैर-न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स की तैयारी में बाद वाले अभिकर्मक के उपयोग की विस्तृत जानकारी दी गई है।<ref>{{cite journal|author=Beaucage, S. L.|journal=E-EROS Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis|year=2001|doi=10.1002/047084289X.rn00312|title=2-Cyanoethyl Tetraisopropylphosphorodiamidite|isbn=0471936235}}</ref>
 
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* दूसरी विधि में, संरक्षित न्यूक्लियोसाइड को कार्बनिक आधार की उपस्थिति में फॉस्फोरोक्लोराइड के साथ इलाज किया जाता है, जो साधारणतया N-एथिल-N, N-डायसोप्रोपाइलामाइन (हुनिग का आधार) होता है।<ref>{{cite journal|author1=Sinha, N. D. |author2=Biernat, J. |author3=Koester, H. |journal=Tetrahedron Lett.|year=1983|volume=24|issue=52|pages=5843–5846|doi=10.1016/S0040-4039(00)94216-3
|title=β-Cyanoethyl N,N-dialkylamino/N-morpholinomonochloro phosphoamidites, new phosphitylating agents facilitating ease of deprotection and work-up of synthesized oligonucleotides}}</ref>
|title=β-Cyanoethyl N,N-dialkylamino/N-morpholinomonochloro phosphoamidites, new phosphitylating agents facilitating ease of deprotection and work-up of synthesized oligonucleotides}}</ref>


*[[File:Nucl Amidite Synthesis3.png|thumb|400px]]तीसरी विधि में,<ref>{{cite journal|author1=Marugg, J. E. |author2=Burik, A. |author3=Tromp, M. |author4=Van der Marel, G. A. |author5=Van Boom, J. H. |name-list-style=amp |journal=Tetrahedron Lett.|year=1986|volume=24|issue=20|pages=2271–22274|doi=10.1016/S0040-4039(00)84506-2 |title=A new and versatile approach to the preparation of valuable deoxynucleoside 3'-phosphite intermediates}}</ref> संरक्षित न्यूक्लियोसाइड को सबसे पहले क्लोरो एन, एन, एन', एन'-टेट्राइसोप्रोपाइल फॉस्फोरोडायमाइडाइट के साथ कार्बनिक आधार की उपस्थिति में इलाज किया जाता है, आमतौर पर एन-एथिल-एन, एन-डायसोप्रोपाइलमाइन (हुनिग का आधार) एक संरक्षित न्यूक्लियोसाइड डायमाइट बनाने के लिए। उत्तरार्द्ध को कमजोर एसिड की उपस्थिति में वांछित फॉस्फेट सुरक्षा समूह से संबंधित अल्कोहल के साथ इलाज किया जाता है, उदाहरण के लिए, 2-साइनोएथेनॉल।
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[[सिलिका जेल]] पर [[कॉलम क्रोमैटोग्राफी]] द्वारा न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स को शुद्ध किया जाता है। फॉस्फोरैमिडाइट अंश की स्थिरता को सुनिश्चित करने के लिए, यह सलाह दी जाती है कि कॉलम को 3 से 5% ट्राइथाइलमाइन युक्त एलुएंट के साथ संतुलित करें और अलगाव के पूरे पाठ्यक्रम में इस एकाग्रता को एलुएंट में बनाए रखें। फॉस्फोरैमिडाइट की शुद्धता का आकलन किसके द्वारा किया जा सकता है? <sup>31</sup>पी [[एनएमआर स्पेक्ट्रोस्कोपी]]। जैसा कि न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरैमिडाइट में पी (III) परमाणु चिरल है, यह यौगिक के दो डायस्टेरोमर्स के अनुरूप लगभग 149 पीपीएम पर दो चोटियों को प्रदर्शित करता है। संभावित रूप से मौजूद फास्फाइट ट्राइस्टर अशुद्धता 138-140 पीपीएम पर चरम प्रदर्शित करती है। एच-फॉस्फोनेट अशुद्धियां 8 और 10 पीपीएम पर चोटियों को प्रदर्शित करती हैं।
* तीसरी विधि में,<ref>{{cite journal|author1=Marugg, J. E. |author2=Burik, A. |author3=Tromp, M. |author4=Van der Marel, G. A. |author5=Van Boom, J. H. |name-list-style=amp |journal=Tetrahedron Lett.|year=1986|volume=24|issue=20|pages=2271–22274|doi=10.1016/S0040-4039(00)84506-2 |title=A new and versatile approach to the preparation of valuable deoxynucleoside 3'-phosphite intermediates}}</ref> संरक्षित न्यूक्लियोसाइड को पहले कार्बनिक आधार की उपस्थिति में क्लोरो N,N,N',N'-टेट्राइसोप्रोपाइल फॉस्फोरोडायमिडाइट के साथ इलाज किया जाता है, साधारणतया N-एथिल-N, N-डायसोप्रोपाइलामाइन (हुनिग का आधार) ) एक संरक्षित न्यूक्लियोसाइड डायमिडाइट बनाने के लिए। उत्तरार्द्ध को कमजोर एसिड की उपस्थिति में वांछित फॉस्फाइट सुरक्षा समूह से संबंधित अल्कोहल के साथ इलाज किया जाता है, उदाहरण के लिए, 2-साइनोएथेनॉल है।
 
न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स को [[सिलिका जेल]] पर कॉलम क्रोमैटोग्राफी द्वारा शुद्ध किया जाता है। फॉस्फोरामिडाइट भाग की स्थिरता की गारंटी के लिए, स्तंभ को 3 से 5% ट्राइथाइलमाइन युक्त एलुएंट के साथ संतुलित करने और पृथक्करण के पूरे पाठ्यक्रम के दौरान एलुएंट में इस एकाग्रता को बनाए रखने की सलाह दी जाती है। फॉस्फोरामिडाइट की शुद्धता का आकलन <sup>31</sup>P एनएमआर स्पेक्ट्रोस्कोपी द्वारा किया जा सकता है। चूंकि न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट में पी (III) परमाणु चिरल है, यह यौगिक के दो डायस्टेरोमर्स के अनुरूप लगभग 149 पीपीएम पर दो शिखर प्रदर्शित करता है। संभावित रूप से मौजूद फॉस्फाइट ट्राइस्टर अशुद्धता 138-140 पीपीएम पर चरम पर प्रदर्शित होती है। एच-फ़ॉस्फ़ोनेट अशुद्धियाँ 8 और 10 पीपीएम पर शिखर पर प्रदर्शित होती हैं।


== फॉस्फोरैमिडाइट मोइटी के रासायनिक गुण ==
== फॉस्फोरैमिडाइट मोइटी के रासायनिक गुण ==
न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स लंबे समय तक [[हाफ लाइफ]] के साथ अपेक्षाकृत स्थिर यौगिक होते हैं जब 4 डिग्री सेल्सियस से कम तापमान पर हवा की अनुपस्थिति में निर्जल परिस्थितियों में पाउडर के रूप में संग्रहीत किया जाता है। एमिडाइट हल्के बुनियादी स्थितियों का सामना करते हैं। इसके विपरीत, हल्के अम्लों की उपस्थिति में भी, फॉस्फोरामाइडाइट लगभग तुरंत नष्ट हो जाते हैं। फॉस्फोरामाइडाइट्स तटस्थ परिस्थितियों में हाइड्रोलिसिस के लिए अपेक्षाकृत स्थिर हैं। उदाहरण के लिए, 2-साइनोइथाइल 5'-ओ-(4,4'-डाइमेथोक्सीट्रिटिल) [[ थाइमिडीन ]]-3'-ओ-(एन,एन-डायसोप्रोपाइलैमिनो) फॉस्फेट का आधा जीवन 25 डिग्री सेल्सियस पर 95% जलीय एसीटोनिट्रिल में 200 एच है .<ref>{{cite journal|author1=Guzaev, A. P. |author2=Manoharan, M. |journal=J. Am. Chem. Soc.|year=2001|volume=123|issue=5|pages=783–793|doi=10.1021/ja0016396
न्यूक्लियोसाइड फ़ॉस्फ़ोरमिडाइट्स लंबे समय तक शेल्फ-जीवन के साथ अपेक्षाकृत स्थिर यौगिक होते हैं जब उन्हें 4 डिग्री सेल्सियस से नीचे के तापमान पर हवा की अनुपस्थिति में निर्जल परिस्थितियों में पाउडर के रूप में संग्रहित किया जाता है। एमिडाइट्स हल्के बुनियादी परिस्थितियों का सामना करते हैं। इसके विपरीत, हल्के एसिड की उपस्थिति में भी, फॉस्फोरामिडाइट लगभग तुरंत ही नष्ट हो जाते हैं। फॉस्फोरामिडाइट्स तटस्थ परिस्थितियों में हाइड्रोलिसिस के लिए अपेक्षाकृत स्थिर होते हैं। उदाहरण के लिए, 25 डिग्री सेल्सियस पर 95% जलीय एसीटोनिट्राइल में 2-साइनोइथाइल 5'-''O''-(4,4'-डाइमेथोक्सीट्रिटिल) थाइमिडीन-3'-''O''-(N,N-डायसोप्रोपाइलमाइन) फॉस्फाइट का आधा जीवन 200 घंटे है।.<ref>{{cite journal|author1=Guzaev, A. P. |author2=Manoharan, M. |journal=J. Am. Chem. Soc.|year=2001|volume=123|issue=5|pages=783–793|doi=10.1021/ja0016396
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|title=2-Benzamidoethyl group - a novel type of phosphate protecting group for oligonucleotide synthesis|pmid=11456611 }}</ref>[[File:Nucl Amidite Nucleophiles.png|thumb|450px|एक्स = ओ, एस, एनएच।]]
*[[File:Nucl Amidite Nucleophiles.png|thumb|450px|एक्स = ओ, एस, एनएच।]]फॉस्फोरामिडाइट्स की सबसे महत्वपूर्ण विशेषता फॉस्फोरैमाइडाइट युग्मन प्रतिक्रिया से गुजरने की उनकी क्षमता है, जो कि एक अम्लीय [[एज़ोल]] उत्प्रेरक, टेट्राज़ोल की उपस्थिति में न्यूक्लियोफिलिक समूहों के साथ प्रतिक्रिया करने के लिए है।<ref>{{cite journal|doi=10.1080/15257779508014668
|date=Feb 1995|author1=Sproat, B. |author2=Colonna, F. |author3=Mullah, B. |author4=Tsou, D. |author5=Andrus, A. |author6=Hampel, A. |author7=Vinayak, R. |title=ओलिगोरिबोन्यूक्लियोटाइड्स के अलगाव और शुद्धिकरण के लिए एक कुशल विधि|volume=14|issue=1&2|pages=255–273|issn=0261-3166|journal=Nucleosides & Nucleotides}}</ref> 2-बेंज़िल थियो टेट्राज़ोल,<ref>{{cite journal|doi=10.1002/1522-2675(20000906)83:9<2477::aid-hlca2477>3.0.co;2-9|date=Sep 2000|author1=Stutz, A. |author2=Hobartner, C. |author3=Pitsch, S. |title=Novel fluoride-labile nucleobase-protecting groups for the synthesis of 3'(2')-O-amino-acylated RNA sequences|volume=83|issue=9|pages=2477–2503|issn=0018-019X|journal=Helv. Chim. Acta}}</ref><ref>{{cite journal|doi=10.1016/S0040-4039(01)02274-2
|date=Jan 2002|author1=Welz, R. |author2=Muller, S. |title=5-(Benzylmercapto)-1H-tetrazole as activator for 2'-O-TBDMS phosphoramidite building blocks in RNA synthesis|volume=43|issue=5|pages=795–797|issn=0040-4039|journal=Tetrahedron Letters}}</ref> 4,5-डाइसानो[[ imidazole ]],<ref>{{cite journal|doi=10.1093/nar/26.4.1046
|year=1998|author1=Vargeese, C. |author2=Carter, J. |author3=Yegge, J. |author4=Krivjansky, S. |author5=Settle, A. |author6=Kropp, E. |author7=Peterson, K. |author8=Pieken, W. |title=Efficient activation of nucleoside phosphoramidites with 4,5-dicyanoimidazole during oligonucleotide synthesis|volume=26|issue=4|pages=1046–1050|issn=0305-1048|journal=Nucleic Acids Res.|pmid=9461466|pmc=147346}}</ref> या इसी तरह के कई यौगिक। प्रतिक्रिया बहुत तेजी से आगे बढ़ती है। यह बहुत ही विशेषता ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइड्स को उपयोगी मध्यवर्ती बनाती है। त्रिविम रासायनिक रूप से, फॉस्फोरैमिडाइट युग्मन पी (III) चिरल केंद्र पर [[epimerisation]] ([[diastereomers]] का गठन) की ओर जाता है।
जब पानी को न्यूक्लियोफाइल के रूप में परोसा जाता है, तो उत्पाद एच-फॉस्फोनेट डायस्टर होता है जैसा कि ऊपर की योजना में दिखाया गया है। सॉल्वैंट्स और अभिकर्मकों में अवशिष्ट पानी की उपस्थिति के कारण, बाद वाले यौगिक का गठन फॉस्फोरैमिडाइट्स के प्रारंभिक उपयोग में सबसे आम जटिलता है, विशेष रूप से ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में।


*[[File:Nucl Amidite Oxidation.png|thumb|450px|सी = सी, से।]]फॉस्फोरामाइड्स कमजोर ऑक्सीडेटिंग अभिकर्मकों के साथ आसानी से ऑक्सीकृत होते हैं, उदाहरण के लिए, कमजोर आधारों की उपस्थिति में या [[हाइड्रोजन पेरोक्साइड]] के साथ जलीय आयोडीन के साथ<ref name="sagi">{{cite journal|author1=Gacs-Baitz, E. |author2=Sipos, F. |author3=Egyed, O. |author4=Sagi, G. |journal=Chirality|year=2009|volume=21|issue=7|pages=663–673|doi=10.1002/chir.20653
* फॉस्फोरामिडाइट्स की सबसे महत्वपूर्ण विशेषता फॉस्फोरामिडाइट युग्मन प्रतिक्रिया से गुजरने की उनकी क्षमता है, जो कि एक अम्लीय एजोल उत्प्रेरक, 1 एच-टेट्राजोल, 2-एथिलथियोटेट्राजोल<ref>{{cite journal|doi=10.1080/15257779508014668
|title=Synthesis and structural study of variously oxidized diastereomeric 5'-dimethoxytrityl-thymidine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]-phosphoramidite derivatives. Comparison of the effects of the P=O, P=S, and P=Se functions on the NMR spectral and chromatographic properties.|pmid=18937288 }}</ref> संबंधित फॉस्फोरामिडेट बनाने के लिए।
|date=Feb 1995|author1=Sproat, B. |author2=Colonna, F. |author3=Mullah, B. |author4=Tsou, D. |author5=Andrus, A. |author6=Hampel, A. |author7=Vinayak, R. |title=ओलिगोरिबोन्यूक्लियोटाइड्स के अलगाव और शुद्धिकरण के लिए एक कुशल विधि|volume=14|issue=1&2|pages=255–273|issn=0261-3166|journal=Nucleosides & Nucleotides}}</ref> 2-बेंज़िलथियोटेट्राजोल,<ref>{{cite journal|doi=10.1002/1522-2675(20000906)83:9<2477::aid-hlca2477>3.0.co;2-9|date=Sep 2000|author1=Stutz, A. |author2=Hobartner, C. |author3=Pitsch, S. |title=Novel fluoride-labile nucleobase-protecting groups for the synthesis of 3'(2')-O-amino-acylated RNA sequences|volume=83|issue=9|pages=2477–2503|issn=0018-019X|journal=Helv. Chim. Acta}}</ref><ref>{{cite journal|doi=10.1016/S0040-4039(01)02274-2
|date=Jan 2002|author1=Welz, R. |author2=Muller, S. |title=5-(Benzylmercapto)-1H-tetrazole as activator for 2'-O-TBDMS phosphoramidite building blocks in RNA synthesis|volume=43|issue=5|pages=795–797|issn=0040-4039|journal=Tetrahedron Letters}}</ref> की उपस्थिति में न्यूक्लियोफिलिक समूहों के साथ प्रतिक्रिया करने की क्षमता है। 4,5-डिसियानोइमिडाज़ोल,<ref>{{cite journal|doi=10.1093/nar/26.4.1046
|year=1998|author1=Vargeese, C. |author2=Carter, J. |author3=Yegge, J. |author4=Krivjansky, S. |author5=Settle, A. |author6=Kropp, E. |author7=Peterson, K. |author8=Pieken, W. |title=Efficient activation of nucleoside phosphoramidites with 4,5-dicyanoimidazole during oligonucleotide synthesis|volume=26|issue=4|pages=1046–1050|issn=0305-1048|journal=Nucleic Acids Res.|pmid=9461466|pmc=147346}}</ref> या इसी तरह के कई यौगिक। प्रतिक्रिया अत्यंत तीव्र गति से होती है। यही विशेषता ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में न्यूक्लियोसाइड फ़ॉस्फ़ोरमिडाइट्स को उपयोगी मध्यवर्ती बनाती है। स्टीरियोकेमिकल रूप से, फॉस्फोरामिडाइट युग्मन पी (III) चिरल केंद्र पर एपिमेराइजेशन (डायस्टेरेमर्स का निर्माण) की ओर ले जाता है।
 
जब पानी को न्यूक्लियोफाइल के रूप में परोसा जाता है, तो उत्पाद एक एच-फॉस्फोनेट डायस्टर होता है जैसा कि ऊपर दी गई योजना में दिखाया गया है। सॉल्वैंट्स और अभिकर्मकों में अवशिष्ट पानी की उपस्थिति के कारण, बाद वाले यौगिक का निर्माण फॉस्फोरामिडाइट्स के प्रारंभिक उपयोग में सबसे आम जटिलता है, विशेष रूप से ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में है।[[File:Nucl Amidite Oxidation.png|thumb|450px|सी = सी, से।]]
 
* फॉस्फोरामाइड्स कमजोर ऑक्सीडेटिंग अभिकर्मकों के साथ आसानी से ऑक्सीकृत होते हैं, उदाहरण के लिए, कमजोर आधारों की उपस्थिति में या [[हाइड्रोजन पेरोक्साइड]] के साथ जलीय आयोडीन के साथ<ref name="sagi">{{cite journal|author1=Gacs-Baitz, E. |author2=Sipos, F. |author3=Egyed, O. |author4=Sagi, G. |journal=Chirality|year=2009|volume=21|issue=7|pages=663–673|doi=10.1002/chir.20653
|title=Synthesis and structural study of variously oxidized diastereomeric 5'-dimethoxytrityl-thymidine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]-phosphoramidite derivatives. Comparison of the effects of the P=O, P=S, and P=Se functions on the NMR spectral and chromatographic properties.|pmid=18937288 }}</ref> संबंधित फॉस्फोरामिडेट बनाने के लिए है।


इसी तरह, फॉस्फोरामाइडाइट्स अन्य [[काल्कोजन]] के साथ प्रतिक्रिया करते हैं। जब सल्फर के घोल के संपर्क में लाया जाता है<ref name="sagi" /><ref name="ogilvie">{{cite journal|author1=Nemer, M. J. |author2=Ogilvie, K. K. |journal=Tetrahedron Lett.|year=1980|volume=21|issue=43|pages=4153–4154|doi=10.1016/s0040-4039(00)93675-x
इसी तरह, फॉस्फोरामाइडाइट्स अन्य [[काल्कोजन]] के साथ प्रतिक्रिया करते हैं। जब सल्फर के घोल के संपर्क में लाया जाता है<ref name="sagi" /><ref name="ogilvie">{{cite journal|author1=Nemer, M. J. |author2=Ogilvie, K. K. |journal=Tetrahedron Lett.|year=1980|volume=21|issue=43|pages=4153–4154|doi=10.1016/s0040-4039(00)93675-x
|title=Phosphoramidate analogs of diribonucleoside monophosphates.}}</ref> या कई यौगिकों को सामूहिक रूप से ओलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण #सल्फराइजेशन एजेंट के रूप में संदर्भित किया जाता है,<ref>{{cite journal|author1=Wilk, A. |author2=Uznanski, B. |author3=Stec, W. J. |journal=Nucleosides & Nucleotides|year=1991|volume=10|issue=1–3|pages=319–322|doi=10.1080/07328319108046469
|title=Phosphoramidate analogs of diribonucleoside monophosphates.}}</ref> या कई यौगिकों को सामूहिक रूप से ओलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण सल्फराइजेशन एजेंट के रूप में संदर्भित किया जाता है,<ref>{{cite journal|author1=Wilk, A. |author2=Uznanski, B. |author3=Stec, W. J. |journal=Nucleosides & Nucleotides|year=1991|volume=10|issue=1–3|pages=319–322|doi=10.1080/07328319108046469
|title=Assignment of absolute configuration at phosphorus in dithymidylyl(3',5')phosphormorpholidates and -phosphormorpholidothioates.}}</ref><ref>{{cite journal|doi=10.1016/j.tetlet.2010.11.086|title=Reactivity of 3H-1,2,4-dithiazole-3-thiones and 3H-1,2-dithiole-3-thiones as sulfurizing agents for oligonucleotide synthesis |year=2011|author=Guzaev, A. P.|journal=Tetrahedron Letters|volume=52|issue=3 |pages=434–437}}</ref> फॉस्फोरामाइडाइट्स मात्रात्मक रूप से फॉस्फोरोथियोएमिडेट्स बनाते हैं। सेलेनियम के साथ प्रतिक्रिया<ref name="sagi" /><ref name="ogilvie" />या सेलेनियम डेरिवेटिव<ref>{{cite journal|author1=Holloway, G. A. |author2=Pavot, C. |author3=Scaringe, S. A. |author4=Lu, Y. |author5=Rauchfuss, T. B. |journal=ChemBioChem|year=2002|volume=3|issue=11|pages=1061–1065|doi=10.1002/1439-7633(20021104)3:11<1061::aid-cbic1061>3.0.co;2-9
|title=Assignment of absolute configuration at phosphorus in dithymidylyl(3',5')phosphormorpholidates and -phosphormorpholidothioates.}}</ref><ref>{{cite journal|doi=10.1016/j.tetlet.2010.11.086|title=Reactivity of 3H-1,2,4-dithiazole-3-thiones and 3H-1,2-dithiole-3-thiones as sulfurizing agents for oligonucleotide synthesis |year=2011|author=Guzaev, A. P.|journal=Tetrahedron Letters|volume=52|issue=3 |pages=434–437}}</ref> फॉस्फोरामाइडाइट्स मात्रात्मक रूप से फॉस्फोरोथियोएमिडेट्स बनाते हैं। सेलेनियम के साथ प्रतिक्रिया<ref name="sagi" /><ref name="ogilvie" />या सेलेनियम डेरिवेटिव<ref>{{cite journal|author1=Holloway, G. A. |author2=Pavot, C. |author3=Scaringe, S. A. |author4=Lu, Y. |author5=Rauchfuss, T. B. |journal=ChemBioChem|year=2002|volume=3|issue=11|pages=1061–1065|doi=10.1002/1439-7633(20021104)3:11<1061::aid-cbic1061>3.0.co;2-9
|title=फॉस्फोरोसेलेनोएट युक्त ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के लिए एक ऑर्गोनोमेटेलिक मार्ग।|pmid=12404630 |s2cid=18797616 }}</ref> फॉस्फोरोसेलेनोमाइडेट्स का उत्पादन करता है। इस प्रकार की सभी अभिक्रियाओं में फॉस्फोरस परमाणु का विन्यास बना रहता है।
|title=फॉस्फोरोसेलेनोएट युक्त ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के लिए एक ऑर्गोनोमेटेलिक मार्ग।|pmid=12404630 |s2cid=18797616 }}</ref> फॉस्फोरोसेलेनोमाइडेट्स का उत्पादन करता है। इस प्रकार की सभी अभिक्रियाओं में फॉस्फोरस परमाणु का विन्यास बना रहता है।[[File:Nucl Amidite Arbuzov.png|thumb|450px]]न्यूक्लियोसाइड फ़ॉस्फ़ोरमिडाइट्स संबंधित फ़ॉस्फ़ोनैमिडेट्स बनाने के लिए माइकलिस-आर्बुज़ोव प्रतिक्रिया से गुजरते हैं। एक उदाहरण में एक्रिलोनिट्राइल की उपस्थिति में फॉस्फोनामाइडेट की तैयारी का वर्णन किया गया है।<ref>{{cite journal|doi=10.1021/op030035u
 
|title=Stereoselective Synthesis of Alkylphosphonates: A Facile Rearrangement of Cyanoethyl-Protected Nucleoside Phosphoramidites|year=2004|author1=Ravikumar, V. T. |author2=Kumar, R. K. |journal=Org. Process Res. Dev.|volume=8|issue=4|pages=603–608}}</ref> कथित तौर पर, कमरे के तापमान पर प्रतिक्रिया फॉस्फोरस केंद्र पर विन्यास के प्रतिधारण के साथ स्टीरियोसेलेक्टिव होती है। इसके विपरीत, जब 55 डिग्री सेल्सियस पर किया जाता है, तो प्रतिक्रिया रेसमाइज्ड उत्पादों की ओर ले जाती है।
*[[File:Nucl Amidite Arbuzov.png|thumb|450px]]न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट संबंधित फॉस्फोनामिडेट्स बनाने के लिए [[माइकलिस-अर्बुज़ोव प्रतिक्रिया]] से गुजरते हैं। एक उदाहरण एक्रिलोनिट्राइल की उपस्थिति में फॉस्फोनैमिडेट्स की तैयारी का वर्णन करता है।<ref>{{cite journal|doi=10.1021/op030035u
|title=Stereoselective Synthesis of Alkylphosphonates: A Facile Rearrangement of Cyanoethyl-Protected Nucleoside Phosphoramidites|year=2004|author1=Ravikumar, V. T. |author2=Kumar, R. K. |journal=Org. Process Res. Dev.|volume=8|issue=4|pages=603–608}}</ref> कथित तौर पर, कमरे के तापमान पर प्रतिक्रिया फॉस्फोरस केंद्र में विन्यास की अवधारण के साथ त्रिविम चयनात्मक होती है। इसके विपरीत, जब 55 °C पर किया जाता है, तो प्रतिक्रिया रेसमीकरण उत्पादों की ओर ले जाती है।
 
* इसी तरह फॉस्फीन और तृतीयक फॉस्फेट के लिए, फॉस्फोरामाइडाइट आसानी से [[स्टुडिंगर प्रतिक्रिया]] से गुजरते हैं।
* इसी तरह फॉस्फीन और तृतीयक फॉस्फेट के लिए, फॉस्फोरामाइडाइट आसानी से [[स्टुडिंगर प्रतिक्रिया]] से गुजरते हैं।
(आरओ)<sub>2</sub>पी एन आर<sup>1</sup>)<sub>2</sub> + आर<sup>2</sup>-एन<sub>3</sub> + एच<sub>2</sub>ऊओ (बी)<sub>2</sub>पी (= ओ) - एन (आर)।<sup>1</sup>)<sub>2</sub> + आर<sup>2</sup>-छोटा<sub>2</sub> + एन<sub>2</sub>;
(RO)<sub>2</sub>P-N(R<sup>1</sup>)<sub>2</sub> + R<sup>2</sup>-N<sub>3</sub> + H<sub>2</sub>O ---- (RO)<sub>2</sub>P(=O)-N(R<sup>1</sup>)<sub>2</sub> + R<sup>2</sup>-NH<sub>2</sub> + N<sub>2</sub>;


== सुरक्षा रणनीति ==
== सुरक्षा रणनीति ==
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* 5'-हाइड्रॉक्सिल समूह एक एसिड-लेबाइल प्रोटेक्टिंग ग्रुप #DMT (4,4'-डाइमिथोक्सीट्रिटिल) समूह द्वारा संरक्षित है।
* 5'-हाइड्रॉक्सिल समूह एक एसिड-लेबाइल प्रोटेक्टिंग ग्रुप #DMT (4,4'-डाइमिथोक्सीट्रिटिल) समूह द्वारा संरक्षित है।
* [[थाइमिन]] और [[यूरैसिल]], क्रमशः थाइमिडीन और [[यूरिडीन]] के न्यूक्लिक बेस, में एक्सोसायक्लिक अमीनो समूह नहीं होते हैं और इसलिए उन्हें किसी सुरक्षा की आवश्यकता नहीं होती है। इसके विपरीत, न्यूक्लिक बेस [[एडीनाइन]], [[साइटोसिन]] और [[गुआनिन]] एक्सोसायक्लिक अमीनो समूहों को सहन करते हैं, जो युग्मन प्रतिक्रिया की शर्तों के तहत सक्रिय फॉस्फोरामाइडाइट्स के साथ प्रतिक्रियाशील होते हैं। हालांकि, सिंथेटिक चक्र में अतिरिक्त चरणों की कीमत पर, असुरक्षित अमीनो समूहों के साथ फॉस्फोरामाइडाइट्स का उपयोग करके ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला असेंबली की जा सकती है,<ref>{{cite journal|author1=Gryaznov, S. M. |author2=Letsinger, R. L. |journal=J. Am. Chem. Soc.|year=1991|volume=113|issue=15|pages=5876–5877|doi=10.1021/ja00015a059|title=Synthesis of oligonucleotides via monomers with unprotected bases}}</ref> अक्सर इन्हें ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला असेंबली की पूरी लंबाई में स्थायी रूप से संरक्षित रखा जाता है। एक्सोसायक्लिक अमीनो समूहों की सुरक्षा 5'-हाइड्रॉक्सी समूह की ओर्थोगोनल होनी चाहिए क्योंकि बाद वाले को प्रत्येक सिंथेटिक चक्र के अंत में हटा दिया जाता है। लागू करने के लिए सबसे सरल और इसलिए सबसे व्यापक रूप से स्वीकृत वह रणनीति है जहां एक्सोसाइक्लिक अमीनो समूह एक बेस-लेबाइल सुरक्षा धारण करते हैं। सबसे अधिक बार, दो सुरक्षा योजनाओं का उपयोग किया जाता है।
* [[थाइमिन]] और [[यूरैसिल]], क्रमशः थाइमिडीन और [[यूरिडीन]] के न्यूक्लिक बेस, में एक्सोसायक्लिक अमीनो समूह नहीं होते हैं और इसलिए उन्हें किसी सुरक्षा की आवश्यकता नहीं होती है। इसके विपरीत, न्यूक्लिक बेस [[एडीनाइन]], [[साइटोसिन]] और [[गुआनिन]] एक्सोसायक्लिक अमीनो समूहों को सहन करते हैं, जो युग्मन प्रतिक्रिया की शर्तों के तहत सक्रिय फॉस्फोरामाइडाइट्स के साथ प्रतिक्रियाशील होते हैं। हालांकि, सिंथेटिक चक्र में अतिरिक्त चरणों की कीमत पर, असुरक्षित अमीनो समूहों के साथ फॉस्फोरामाइडाइट्स का उपयोग करके ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला असेंबली की जा सकती है,<ref>{{cite journal|author1=Gryaznov, S. M. |author2=Letsinger, R. L. |journal=J. Am. Chem. Soc.|year=1991|volume=113|issue=15|pages=5876–5877|doi=10.1021/ja00015a059|title=Synthesis of oligonucleotides via monomers with unprotected bases}}</ref> प्रायः इन्हें ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला असेंबली की पूरी लंबाई में स्थायी रूप से संरक्षित रखा जाता है। एक्सोसायक्लिक अमीनो समूहों की सुरक्षा 5'-हाइड्रॉक्सी समूह की ओर्थोगोनल होनी चाहिए क्योंकि बाद वाले को प्रत्येक सिंथेटिक चक्र के अंत में हटा दिया जाता है। लागू करने के लिए सबसे सरल और इसलिए सबसे व्यापक रूप से स्वीकृत वह रणनीति है जहां एक्सोसाइक्लिक अमीनो समूह एक बेस-लेबाइल सुरक्षा धारण करते हैं। सबसे अधिक बार, दो सुरक्षा योजनाओं का उपयोग किया जाता है।
* पहले में, मानक और अधिक मजबूत योजना (चित्र), ए, डीए, सी, डीसी, जी, और डीजी के लिए सुरक्षा समूह#Bz (बेंज़ॉयल) सुरक्षा का उपयोग किया जाता है, जो isobutyryl समूह से सुरक्षित है। हाल ही में, चित्र में दिखाए गए अनुसार समूह # एसी (एसिटाइल) समूह की रक्षा करना अक्सर सी और डीसी की रक्षा के लिए प्रयोग किया जाता है।<ref name="reddy">{{cite journal|author1=Reddy, M. P. |author2=Hanna, N. B. |author3=Farooqui, F. |journal=Nucleosides & Nucleotides|year=1997|volume=16|pages=1589–1598|doi=10.1080/07328319708006236|title=Ultrafast Cleavage and Deprotection of Oligonucleotides Synthesis and Use of C<sup>Ac</sup> Derivatives|issue=7–9 }}</ref>
* पहले में, मानक और अधिक मजबूत योजना (चित्र), A, dA, C, dC, G, और dG के लिए किया जाता है, जो आइसोब्यूटिरिल समूह से संरक्षित हैं। हाल ही में, एसी (एसिटाइल) समूह का उपयोग प्रायः सी और डीसी की सुरक्षा के लिए किया जाता है जैसा कि चित्र में दिखाया गया है।<ref name="reddy">{{cite journal|author1=Reddy, M. P. |author2=Hanna, N. B. |author3=Farooqui, F. |journal=Nucleosides & Nucleotides|year=1997|volume=16|pages=1589–1598|doi=10.1080/07328319708006236|title=Ultrafast Cleavage and Deprotection of Oligonucleotides Synthesis and Use of C<sup>Ac</sup> Derivatives|issue=7–9 }}</ref>
* दूसरे में, हल्की सुरक्षा योजना, A और dA isobutyryl से सुरक्षित हैं<ref>{{cite journal|doi=10.1016/S0040-4039(97)00568-6|title=Synthesis of oligonucleotides containing 3'-alkyl amines using N-isobutyryl protected deoxyadenosine phosphoramidite|year=1997|author=McMinn, D.|journal=Tetrahedron Lett.|volume=38|issue=18|page=3123}}</ref> या फेनोक्सीसेटाइल समूह (पीएसी)।<ref>{{cite journal|author1=Schulhof, J. C. |author2=Molko, D. |author3=Teoule, R. |title=ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में अंतिम डीप्रोटेक्शन चरण को लेबिल बेस-प्रोटेक्टिंग समूहों का उपयोग करके हल्के और तेजी से अमोनिया उपचार में कम किया जाता है।|journal=Nucleic Acids Res.|year=1987|volume=15|pages=397–416|doi=10.1093/nar/15.2.397|pmid=3822812|issue=2|pmc=340442}}</ref> सी और डीसी भालू एसिटाइल संरक्षण,<ref name="reddy"/>और G और dG 4-आइसोप्रोपिलफेनोक्सीसेटाइल (i-Pr-PAC) से सुरक्षित हैं<ref>{{cite journal|doi=10.1016/S0960-894X(01)00161-5|title=फास्ट-डीप्रोटेक्टिंग फॉस्फोरामाइडाइट्स और अल्ट्रा-माइल्ड डीप्रोटेक्शन का उपयोग करके तैयार किए गए ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के एन-एसिटिलेशन का निरीक्षण और उन्मूलन|year=2001|author=Zhu, Q.|journal=Bioorg. Med. Chem. Lett.|volume=11|issue=9|pages=1105–7|pmid=11354354}}</ref> या डाइमिथाइलफोर्मिडिनो (डीएमएफ)<ref>{{cite journal|doi=10.1021/ja00268a052|title=Nucleotide chemistry. 16. Amidine protecting groups for oligonucleotide synthesis|year=1986|author=McBride, L. J.|journal=J. Am. Chem. Soc.|volume=108|page=2040|last2=Kierzek|first2=R.|last3=Beaucage|first3=S. L.|last4=Caruthers|first4=M. H.|issue=8}}</ref> समूह। मानक सुरक्षा समूहों की तुलना में हल्के सुरक्षा समूहों को अधिक आसानी से हटा दिया जाता है। हालांकि, समाधान में संग्रहीत होने पर इन समूहों को प्रभावित करने वाले फॉस्फोरामाइड कम स्थिर होते हैं।
* दूसरे में, हल्की सुरक्षा योजना, A और dA isobutyryl से सुरक्षित हैं<ref>{{cite journal|doi=10.1016/S0040-4039(97)00568-6|title=Synthesis of oligonucleotides containing 3'-alkyl amines using N-isobutyryl protected deoxyadenosine phosphoramidite|year=1997|author=McMinn, D.|journal=Tetrahedron Lett.|volume=38|issue=18|page=3123}}</ref> या फेनोक्सीसेटाइल समूह (PAC)।<ref>{{cite journal|author1=Schulhof, J. C. |author2=Molko, D. |author3=Teoule, R. |title=ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में अंतिम डीप्रोटेक्शन चरण को लेबिल बेस-प्रोटेक्टिंग समूहों का उपयोग करके हल्के और तेजी से अमोनिया उपचार में कम किया जाता है।|journal=Nucleic Acids Res.|year=1987|volume=15|pages=397–416|doi=10.1093/nar/15.2.397|pmid=3822812|issue=2|pmc=340442}}</ref> सी और डीसी भालू एसिटाइल संरक्षण,<ref name="reddy"/>और G और dG 4-आइसोप्रोपिलफेनोक्सीसेटाइल (i-Pr-PAC) से सुरक्षित हैं<ref>{{cite journal|doi=10.1016/S0960-894X(01)00161-5|title=फास्ट-डीप्रोटेक्टिंग फॉस्फोरामाइडाइट्स और अल्ट्रा-माइल्ड डीप्रोटेक्शन का उपयोग करके तैयार किए गए ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के एन-एसिटिलेशन का निरीक्षण और उन्मूलन|year=2001|author=Zhu, Q.|journal=Bioorg. Med. Chem. Lett.|volume=11|issue=9|pages=1105–7|pmid=11354354}}</ref> या डाइमिथाइलफोर्मिडिनो (dmf)<ref>{{cite journal|doi=10.1021/ja00268a052|title=Nucleotide chemistry. 16. Amidine protecting groups for oligonucleotide synthesis|year=1986|author=McBride, L. J.|journal=J. Am. Chem. Soc.|volume=108|page=2040|last2=Kierzek|first2=R.|last3=Beaucage|first3=S. L.|last4=Caruthers|first4=M. H.|issue=8}}</ref> समूह। मानक सुरक्षा समूहों की तुलना में हल्के सुरक्षा समूहों को अधिक आसानी से हटा दिया जाता है। हालांकि, समाधान में संग्रहीत होने पर इन समूहों को प्रभावित करने वाले फॉस्फोरामाइड कम स्थिर होते हैं।
* फास्फाइट समूह एक बेस-लैबाइल प्रोटेक्टिंग ग्रुप #CNEt|2-सायनोइथाइल समूह द्वारा संरक्षित है।<ref name="sinha">{{cite journal|author1=Sinha, N. D. |author2=Biernat, J. |author3=McManus, J. |author4=Koester, H. |title=Polymer support oligonucleotide synthesis. XVIII: use of β-cyanoethyl-N,N-dialkylamino-/N-morpholino phosphoramidite of deoxynucleosides for the synthesis of DNA fragments simplifying deprotection and isolation of the final product|journal=Nucleic Acids Res|year=1984|volume=12|pages=4539–4557|doi=10.1093/nar/12.11.4539|pmid=6547529|issue=11|pmc=318857}}</ref> एक बार एक फॉस्फोरैमिडाइट को ठोस समर्थन-बाध्य ओलिगोन्यूक्लियोटाइड के साथ जोड़ा गया है और फॉस्फेट मोएट्स को पी (वी) प्रजातियों में परिवर्तित कर दिया गया है, आगे युग्मन प्रतिक्रियाओं के सफल आयोजन के लिए फॉस्फेट संरक्षण की उपस्थिति अनिवार्य नहीं है।<ref>{{cite journal|author1=Guzaev, A. P. |author2=Manoharan, M. |journal=J. Org. Chem.|year=2001|volume=66|issue=5|pages=1798–1804|doi=10.1021/jo001591e|title=असुरक्षित इंटरन्यूक्लिओसिडिक फॉस्फेट मोएटीज़ को प्रभावित करने वाले ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के लिए फॉस्फोरामाइडाइट युग्मन|pmid=11262130}}</ref>
* फास्फाइट समूह एक बेस-लैबाइल प्रोटेक्टिंग ग्रुप #CNEt|2-सायनोइथाइल समूह द्वारा संरक्षित है।<ref name="sinha">{{cite journal|author1=Sinha, N. D. |author2=Biernat, J. |author3=McManus, J. |author4=Koester, H. |title=Polymer support oligonucleotide synthesis. XVIII: use of β-cyanoethyl-N,N-dialkylamino-/N-morpholino phosphoramidite of deoxynucleosides for the synthesis of DNA fragments simplifying deprotection and isolation of the final product|journal=Nucleic Acids Res|year=1984|volume=12|pages=4539–4557|doi=10.1093/nar/12.11.4539|pmid=6547529|issue=11|pmc=318857}}</ref> एक बार एक फॉस्फोरैमिडाइट को ठोस समर्थन-बाध्य ओलिगोन्यूक्लियोटाइड के साथ जोड़ा गया है और फॉस्फेट मोएट्स को पी (वी) प्रजातियों में परिवर्तित कर दिया गया है, आगे युग्मन प्रतिक्रियाओं के सफल आयोजन के लिए फॉस्फेट संरक्षण की उपस्थिति अनिवार्य नहीं है।<ref>{{cite journal|author1=Guzaev, A. P. |author2=Manoharan, M. |journal=J. Org. Chem.|year=2001|volume=66|issue=5|pages=1798–1804|doi=10.1021/jo001591e|title=असुरक्षित इंटरन्यूक्लिओसिडिक फॉस्फेट मोएटीज़ को प्रभावित करने वाले ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के लिए फॉस्फोरामाइडाइट युग्मन|pmid=11262130}}</ref>


[[File:Rnaamidite.png|thumb|450px|2'-ओ-संरक्षित राइबोन्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स।]]* आरएनए संश्लेषण में, 2'-हाइड्रॉक्सी समूह को प्रोटेक्टिंग ग्रुप #TBDMS (t-butyldimethylsilyl) समूह से सुरक्षित किया जाता है।<ref>{{cite journal|author1=Ogilvie, K. K. |author2=Theriault, N. |author3=Sadana, K. L. |journal= J. Am. Chem. Soc.|year=1977|volume=99|issue=23|pages=7741–7743|doi=10.1021/ja00465a073|title=ऑलिगोरिबोन्यूक्लियोटाइड्स का संश्लेषण|pmid=915168 }}</ref><ref>{{cite journal|author1=Usman, N. |author2=Ogilvie, K. K. |author3=Jiang, M. Y. |author4=Cedergren, R. J. |journal= J. Am. Chem. Soc.|year=1987|volume=109|issue=25|pages=7845–7854|doi=10.1021/ja00259a037|title=The automated chemical synthesis of long oligoribuncleotides using 2'-O-silylated ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites on a controlled-pore glass support: synthesis of a 43-nucleotide sequence similar to the 3'-half molecule of an Escherichia coli formylmethionine tRNA}}</ref><ref>{{cite journal|author1=Usman, N. |author2=Pon, R. T. |author3=Ogilvie, K. K. |journal= Tetrahedron Lett.|year=1985|volume=26|issue=38|pages=4567–4570|doi=10.1016/S0040-4039(00)98753-7|title=Preparation of ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites and their application to the automated solid phase synthesis of oligonucleotides }}</ref><ref>{{cite journal|author1=Scaringe, S. A. |author2=Francklyn, C. |author3=Usman, N. |journal= Nucleic Acids Res.|year=1990|volume=18|issue=18|pages=5433–5441|doi=10.1093/nar/18.18.5433|title= Chemical synthesis of biologically active oligoribonucleotides using β-cyanoethyl protected ribonucleoside phosphoramidites|pmc=332221 |pmid=2216717}}</ref> या प्रोटेक्टिंग ग्रुप#TOM (ट्राई-आइसो-प्रोपिलसिलीलॉक्सिमिथाइल) ग्रुप के साथ,<ref>{{cite journal|author1=Pitsch, S. |author2=Weiss, P. A. |author3=Wu, X. |author4=Ackermann, D. |author5=Honegger, T. |journal= Helv. Chim. Acta |year=1999|volume=82|issue=10|pages=1753–1761|doi=10.1002/(SICI)1522-2675(19991006)82:10<1753::AID-HLCA1753>3.0.CO;2-Y |title= Fast and reliable automated synthesis of RNA and partially 2'-O-protected precursors ("caged RNA") based on two novel, orthogonal 2'-O-protecting groups}}</ref><ref>{{cite journal|author1=Pitsch, S. |author2=Weiss, P. A. |author3=Jenny, L. |author4=Stutz, A. |author5=Wu, X. |journal= Helv. Chim. Acta |year=2001|volume=84|issue=12|pages=3773–3795|doi=10.1002/1522-2675(20011219)84:12<3773::AID-HLCA3773>3.0.CO;2-E|title=Reliable chemical synthesis of oligoribonucleotides (RNA) with 2'-O-[(triisopropylsilyl)oxy]methyl(2'-O-tom)-protected phosphoramidites}}</ref> दोनों फ्लोराइड आयन के साथ उपचार द्वारा हटाने योग्य हैं।
[[File:Rnaamidite.png|thumb|450px|2'-ओ-संरक्षित राइबोन्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स।]]
* फास्फाइट भाग में डायसोप्रोपाइलैमिनो (iPr<sub>2</sub>एन) समूह अम्लीय परिस्थितियों में प्रतिक्रियाशील। सक्रियण पर, डायसोप्रोपाइलैमिनो समूह छोड़ देता है, जिसे समर्थन-बद्ध ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड के 5'-हाइड्रॉक्सी समूह द्वारा प्रतिस्थापित किया जाता है।
 
* आरएनए संश्लेषण में, 2'-हाइड्रॉक्सी समूह को टीबीडीएमएस (टी-ब्यूटिल्डिमिथाइलसिलिल) समूह द्वारा संरक्षित किया जाता है।<ref>{{cite journal|author1=Ogilvie, K. K. |author2=Theriault, N. |author3=Sadana, K. L. |journal= J. Am. Chem. Soc.|year=1977|volume=99|issue=23|pages=7741–7743|doi=10.1021/ja00465a073|title=ऑलिगोरिबोन्यूक्लियोटाइड्स का संश्लेषण|pmid=915168 }}</ref><ref>{{cite journal|author1=Usman, N. |author2=Ogilvie, K. K. |author3=Jiang, M. Y. |author4=Cedergren, R. J. |journal= J. Am. Chem. Soc.|year=1987|volume=109|issue=25|pages=7845–7854|doi=10.1021/ja00259a037|title=The automated chemical synthesis of long oligoribuncleotides using 2'-O-silylated ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites on a controlled-pore glass support: synthesis of a 43-nucleotide sequence similar to the 3'-half molecule of an Escherichia coli formylmethionine tRNA}}</ref><ref>{{cite journal|author1=Usman, N. |author2=Pon, R. T. |author3=Ogilvie, K. K. |journal= Tetrahedron Lett.|year=1985|volume=26|issue=38|pages=4567–4570|doi=10.1016/S0040-4039(00)98753-7|title=Preparation of ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites and their application to the automated solid phase synthesis of oligonucleotides }}</ref><ref>{{cite journal|author1=Scaringe, S. A. |author2=Francklyn, C. |author3=Usman, N. |journal= Nucleic Acids Res.|year=1990|volume=18|issue=18|pages=5433–5441|doi=10.1093/nar/18.18.5433|title= Chemical synthesis of biologically active oligoribonucleotides using β-cyanoethyl protected ribonucleoside phosphoramidites|pmc=332221 |pmid=2216717}}</ref> या टीओएम (ट्राई-आइसो-प्रोपाइलसिलोक्सीमिथाइल) समूह के साथ,<ref>{{cite journal|author1=Pitsch, S. |author2=Weiss, P. A. |author3=Wu, X. |author4=Ackermann, D. |author5=Honegger, T. |journal= Helv. Chim. Acta |year=1999|volume=82|issue=10|pages=1753–1761|doi=10.1002/(SICI)1522-2675(19991006)82:10<1753::AID-HLCA1753>3.0.CO;2-Y |title= Fast and reliable automated synthesis of RNA and partially 2'-O-protected precursors ("caged RNA") based on two novel, orthogonal 2'-O-protecting groups}}</ref><ref>{{cite journal|author1=Pitsch, S. |author2=Weiss, P. A. |author3=Jenny, L. |author4=Stutz, A. |author5=Wu, X. |journal= Helv. Chim. Acta |year=2001|volume=84|issue=12|pages=3773–3795|doi=10.1002/1522-2675(20011219)84:12<3773::AID-HLCA3773>3.0.CO;2-E|title=Reliable chemical synthesis of oligoribonucleotides (RNA) with 2'-O-[(triisopropylsilyl)oxy]methyl(2'-O-tom)-protected phosphoramidites}}</ref> दोनों को फ्लोराइड आयन के साथ उपचार द्वारा हटाया जा सकता है।
 
* फ़ॉस्फाइट अंश अम्लीय परिस्थितियों में प्रतिक्रियाशील डायसोप्रोपाइलामिनो (''i''Pr<sub>2</sub>N) समूह को भी धारण करता है। सक्रियण पर, डायसोप्रोपाइलामिनो समूह निकल जाता है, जिसे समर्थन-बाउंड ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड के 5'-हाइड्रॉक्सी समूह द्वारा प्रतिस्थापित किया जाता है।


== यह भी देखें ==
== यह भी देखें ==

Revision as of 18:41, 10 July 2023

संरक्षित 2'-डीऑक्सीन्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स।

न्यूक्लीओसाइड फॉस्फोरामाइडाइट प्राकृतिक या सिंथेटिक न्यूक्लियोसाइड के डेरिवेटिव हैं। फॉस्फोरामिडाइट्स प्राकृतिक या सिंथेटिक न्यूक्लियोसाइड के व्युत्पन्न हैं। उनका उपयोग ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स, न्यूक्लिक एसिड के अपेक्षाकृत छोटे टुकड़े और उनके एनालॉग्स को संश्लेषित करने के लिए किया जाता है। न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स को पहली बार 1981 में ब्यूकेज और कारुथर्स द्वारा पेश किया गया था।[1] अवांछित साइड प्रतिक्रियाओं से बचने के लिए, प्राकृतिक या सिंथेटिक न्यूक्लियोसाइड में मौजूद प्रतिक्रियाशील हाइड्रॉक्सी और एक्सोसाइक्लिक अमीनो समूहों को उचित रूप से संरक्षित किया जाता है। जब तक न्यूक्लियोसाइड एनालॉग में कम से कम एक हाइड्रॉक्सी समूह होता है, उचित सुरक्षा रणनीति का उपयोग किसी को संबंधित फॉस्फोरामिडाइट में परिवर्तित करने और बाद वाले को सिंथेटिक न्यूक्लिक एसिड में सम्मिलित करने की अनुमति देता है। फॉस्फोरामिडाइट रणनीति का उपयोग करके ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला के बीच में सम्मिलित होने के लिए, न्यूक्लियोसाइड एनालॉग में दो हाइड्रॉक्सी समूह या, कम प्रायः, एक हाइड्रॉक्सी समूह और एक अन्य न्यूक्लियोफिलिक समूह (एमिनो या मर्कैप्टो) होना चाहिए। उदाहरणों में वैकल्पिक न्यूक्लियोटाइड, एलएनए, मॉर्फोलिनो, 2'-स्थिति (OMe, संरक्षित NH2, F) में संशोधित न्यूक्लियोसाइड, गैर-विहित आधार वाले न्यूक्लियोसाइड (प्राकृतिक न्यूक्लियोसाइड इनोसिन और ज़ैंथोसिन में निहित हाइपोक्सैन्थिन और ज़ैन्थिन) सम्मिलित हैं, लेकिन इन्हीं तक सीमित नहीं हैं। , क्रमशः, ट्राइसाइक्लिक बेस जैसे G-क्लैंप, आदि)[2] या फ्लोरोसेंट समूह या लिंकर आर्म के साथ व्युत्पन्न आधार है।

तैयारी

न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स की तैयारी के लिए तीन मुख्य विधियाँ हैं।

डीएमटी = 4,4'-डाइमेथोक्सीट्रिटिल; बी = वैकल्पिक रूप से संरक्षित न्यूक्लिक बेस; आर = फॉस्फेट सुरक्षा समूह
  • सामान्य विधि में एक कमजोर एसिड की उत्प्रेरक क्रिया के तहत फॉस्फोरामिडाइट के साथ एक एकल मुक्त हाइड्रॉक्सी समूह वाले संरक्षित न्यूक्लियोसाइड का उपचार सम्मिलित होता है।[3][4] हालाँकि कुछ बिसामिडाइट्स को थर्मल रूप से अस्थिर यौगिकों के रूप में रिपोर्ट किया गया था,[5] 2-साइनोइथाइल N,N,N',N'-टेट्राइसोप्रोपाइलफॉस्फोरोडायमिडाइट, वाणिज्यिक न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स तैयार करने के लिए इस्तेमाल किया जाने वाला एमिडाइट अपेक्षाकृत स्थिर है। इसे दो-चरण, एक-पॉट प्रक्रिया का उपयोग करके संश्लेषित किया जा सकता है और वैक्यूम आसवन द्वारा शुद्ध किया जा सकता है।[6] एक उत्कृष्ट समीक्षा में न्यूक्लियोसाइड और गैर-न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स की तैयारी में बाद वाले अभिकर्मक के उपयोग की विस्तृत जानकारी दी गई है।[7]
Nucl Amidite Synthesis2.png
  • दूसरी विधि में, संरक्षित न्यूक्लियोसाइड को कार्बनिक आधार की उपस्थिति में फॉस्फोरोक्लोराइड के साथ इलाज किया जाता है, जो साधारणतया N-एथिल-N, N-डायसोप्रोपाइलामाइन (हुनिग का आधार) होता है।[8]
Nucl Amidite Synthesis3.png
  • तीसरी विधि में,[9] संरक्षित न्यूक्लियोसाइड को पहले कार्बनिक आधार की उपस्थिति में क्लोरो N,N,N',N'-टेट्राइसोप्रोपाइल फॉस्फोरोडायमिडाइट के साथ इलाज किया जाता है, साधारणतया N-एथिल-N, N-डायसोप्रोपाइलामाइन (हुनिग का आधार) ) एक संरक्षित न्यूक्लियोसाइड डायमिडाइट बनाने के लिए। उत्तरार्द्ध को कमजोर एसिड की उपस्थिति में वांछित फॉस्फाइट सुरक्षा समूह से संबंधित अल्कोहल के साथ इलाज किया जाता है, उदाहरण के लिए, 2-साइनोएथेनॉल है।

न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट्स को सिलिका जेल पर कॉलम क्रोमैटोग्राफी द्वारा शुद्ध किया जाता है। फॉस्फोरामिडाइट भाग की स्थिरता की गारंटी के लिए, स्तंभ को 3 से 5% ट्राइथाइलमाइन युक्त एलुएंट के साथ संतुलित करने और पृथक्करण के पूरे पाठ्यक्रम के दौरान एलुएंट में इस एकाग्रता को बनाए रखने की सलाह दी जाती है। फॉस्फोरामिडाइट की शुद्धता का आकलन 31P एनएमआर स्पेक्ट्रोस्कोपी द्वारा किया जा सकता है। चूंकि न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामिडाइट में पी (III) परमाणु चिरल है, यह यौगिक के दो डायस्टेरोमर्स के अनुरूप लगभग 149 पीपीएम पर दो शिखर प्रदर्शित करता है। संभावित रूप से मौजूद फॉस्फाइट ट्राइस्टर अशुद्धता 138-140 पीपीएम पर चरम पर प्रदर्शित होती है। एच-फ़ॉस्फ़ोनेट अशुद्धियाँ 8 और 10 पीपीएम पर शिखर पर प्रदर्शित होती हैं।

फॉस्फोरैमिडाइट मोइटी के रासायनिक गुण

न्यूक्लियोसाइड फ़ॉस्फ़ोरमिडाइट्स लंबे समय तक शेल्फ-जीवन के साथ अपेक्षाकृत स्थिर यौगिक होते हैं जब उन्हें 4 डिग्री सेल्सियस से नीचे के तापमान पर हवा की अनुपस्थिति में निर्जल परिस्थितियों में पाउडर के रूप में संग्रहित किया जाता है। एमिडाइट्स हल्के बुनियादी परिस्थितियों का सामना करते हैं। इसके विपरीत, हल्के एसिड की उपस्थिति में भी, फॉस्फोरामिडाइट लगभग तुरंत ही नष्ट हो जाते हैं। फॉस्फोरामिडाइट्स तटस्थ परिस्थितियों में हाइड्रोलिसिस के लिए अपेक्षाकृत स्थिर होते हैं। उदाहरण के लिए, 25 डिग्री सेल्सियस पर 95% जलीय एसीटोनिट्राइल में 2-साइनोइथाइल 5'-O-(4,4'-डाइमेथोक्सीट्रिटिल) थाइमिडीन-3'-O-(N,N-डायसोप्रोपाइलमाइन) फॉस्फाइट का आधा जीवन 200 घंटे है।.[10]

एक्स = ओ, एस, एनएच।
  • फॉस्फोरामिडाइट्स की सबसे महत्वपूर्ण विशेषता फॉस्फोरामिडाइट युग्मन प्रतिक्रिया से गुजरने की उनकी क्षमता है, जो कि एक अम्लीय एजोल उत्प्रेरक, 1 एच-टेट्राजोल, 2-एथिलथियोटेट्राजोल[11] 2-बेंज़िलथियोटेट्राजोल,[12][13] की उपस्थिति में न्यूक्लियोफिलिक समूहों के साथ प्रतिक्रिया करने की क्षमता है। 4,5-डिसियानोइमिडाज़ोल,[14] या इसी तरह के कई यौगिक। प्रतिक्रिया अत्यंत तीव्र गति से होती है। यही विशेषता ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में न्यूक्लियोसाइड फ़ॉस्फ़ोरमिडाइट्स को उपयोगी मध्यवर्ती बनाती है। स्टीरियोकेमिकल रूप से, फॉस्फोरामिडाइट युग्मन पी (III) चिरल केंद्र पर एपिमेराइजेशन (डायस्टेरेमर्स का निर्माण) की ओर ले जाता है।

जब पानी को न्यूक्लियोफाइल के रूप में परोसा जाता है, तो उत्पाद एक एच-फॉस्फोनेट डायस्टर होता है जैसा कि ऊपर दी गई योजना में दिखाया गया है। सॉल्वैंट्स और अभिकर्मकों में अवशिष्ट पानी की उपस्थिति के कारण, बाद वाले यौगिक का निर्माण फॉस्फोरामिडाइट्स के प्रारंभिक उपयोग में सबसे आम जटिलता है, विशेष रूप से ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में है।

सी = सी, से।
  • फॉस्फोरामाइड्स कमजोर ऑक्सीडेटिंग अभिकर्मकों के साथ आसानी से ऑक्सीकृत होते हैं, उदाहरण के लिए, कमजोर आधारों की उपस्थिति में या हाइड्रोजन पेरोक्साइड के साथ जलीय आयोडीन के साथ[15] संबंधित फॉस्फोरामिडेट बनाने के लिए है।

इसी तरह, फॉस्फोरामाइडाइट्स अन्य काल्कोजन के साथ प्रतिक्रिया करते हैं। जब सल्फर के घोल के संपर्क में लाया जाता है[15][16] या कई यौगिकों को सामूहिक रूप से ओलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण सल्फराइजेशन एजेंट के रूप में संदर्भित किया जाता है,[17][18] फॉस्फोरामाइडाइट्स मात्रात्मक रूप से फॉस्फोरोथियोएमिडेट्स बनाते हैं। सेलेनियम के साथ प्रतिक्रिया[15][16]या सेलेनियम डेरिवेटिव[19] फॉस्फोरोसेलेनोमाइडेट्स का उत्पादन करता है। इस प्रकार की सभी अभिक्रियाओं में फॉस्फोरस परमाणु का विन्यास बना रहता है।

Nucl Amidite Arbuzov.png

न्यूक्लियोसाइड फ़ॉस्फ़ोरमिडाइट्स संबंधित फ़ॉस्फ़ोनैमिडेट्स बनाने के लिए माइकलिस-आर्बुज़ोव प्रतिक्रिया से गुजरते हैं। एक उदाहरण में एक्रिलोनिट्राइल की उपस्थिति में फॉस्फोनामाइडेट की तैयारी का वर्णन किया गया है।[20] कथित तौर पर, कमरे के तापमान पर प्रतिक्रिया फॉस्फोरस केंद्र पर विन्यास के प्रतिधारण के साथ स्टीरियोसेलेक्टिव होती है। इसके विपरीत, जब 55 डिग्री सेल्सियस पर किया जाता है, तो प्रतिक्रिया रेसमाइज्ड उत्पादों की ओर ले जाती है।

(RO)2P-N(R1)2 + R2-N3 + H2O ---- (RO)2P(=O)-N(R1)2 + R2-NH2 + N2;

सुरक्षा रणनीति

स्वाभाविक रूप से पाए जाने वाले न्यूक्लियोटाइड्स (न्यूक्लियोसाइड-3'- या 5'-फॉस्फेट) और उनके फॉस्फोडिएस्टर एनालॉग्स उच्च पैदावार में ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स की एक त्वरित सिंथेटिक तैयारी को वहन करने के लिए अपर्याप्त रूप से प्रतिक्रियाशील हैं। न्यूक्लियोसाइड्स (न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स) के 3'-O-(N,N-diisopropyl phosphoramidite) डेरिवेटिव का उपयोग करके इंटरन्यूक्लियोसिडिक लिंकेज के गठन की चयनात्मकता और दर में नाटकीय रूप से सुधार किया जाता है जो फॉस्फेट ट्राइस्टर पद्धति में बिल्डिंग ब्लॉक के रूप में काम करता है। अवांछित पक्ष प्रतिक्रियाओं को रोकने के लिए, न्यूक्लियोसाइड्स में मौजूद अन्य सभी कार्यात्मक समूहों को सुरक्षात्मक समूहों को जोड़कर अप्राप्य (संरक्षित) प्रदान किया जाना चाहिए। ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला असेंबली के पूरा होने पर, सभी सुरक्षा समूहों को वांछित ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स प्राप्त करने के लिए हटा दिया जाता है। नीचे, व्यावसायिक रूप से उपलब्ध वर्तमान में उपयोग किए जाने वाले सुरक्षा समूह[21][22][23][24][25] और सबसे आम न्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरैमिडाइट बिल्डिंग ब्लॉक्स की संक्षिप्त समीक्षा की गई है:

  • 5'-हाइड्रॉक्सिल समूह एक एसिड-लेबाइल प्रोटेक्टिंग ग्रुप #DMT (4,4'-डाइमिथोक्सीट्रिटिल) समूह द्वारा संरक्षित है।
  • थाइमिन और यूरैसिल, क्रमशः थाइमिडीन और यूरिडीन के न्यूक्लिक बेस, में एक्सोसायक्लिक अमीनो समूह नहीं होते हैं और इसलिए उन्हें किसी सुरक्षा की आवश्यकता नहीं होती है। इसके विपरीत, न्यूक्लिक बेस एडीनाइन, साइटोसिन और गुआनिन एक्सोसायक्लिक अमीनो समूहों को सहन करते हैं, जो युग्मन प्रतिक्रिया की शर्तों के तहत सक्रिय फॉस्फोरामाइडाइट्स के साथ प्रतिक्रियाशील होते हैं। हालांकि, सिंथेटिक चक्र में अतिरिक्त चरणों की कीमत पर, असुरक्षित अमीनो समूहों के साथ फॉस्फोरामाइडाइट्स का उपयोग करके ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला असेंबली की जा सकती है,[26] प्रायः इन्हें ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड श्रृंखला असेंबली की पूरी लंबाई में स्थायी रूप से संरक्षित रखा जाता है। एक्सोसायक्लिक अमीनो समूहों की सुरक्षा 5'-हाइड्रॉक्सी समूह की ओर्थोगोनल होनी चाहिए क्योंकि बाद वाले को प्रत्येक सिंथेटिक चक्र के अंत में हटा दिया जाता है। लागू करने के लिए सबसे सरल और इसलिए सबसे व्यापक रूप से स्वीकृत वह रणनीति है जहां एक्सोसाइक्लिक अमीनो समूह एक बेस-लेबाइल सुरक्षा धारण करते हैं। सबसे अधिक बार, दो सुरक्षा योजनाओं का उपयोग किया जाता है।
  • पहले में, मानक और अधिक मजबूत योजना (चित्र), A, dA, C, dC, G, और dG के लिए किया जाता है, जो आइसोब्यूटिरिल समूह से संरक्षित हैं। हाल ही में, एसी (एसिटाइल) समूह का उपयोग प्रायः सी और डीसी की सुरक्षा के लिए किया जाता है जैसा कि चित्र में दिखाया गया है।[27]
  • दूसरे में, हल्की सुरक्षा योजना, A और dA isobutyryl से सुरक्षित हैं[28] या फेनोक्सीसेटाइल समूह (PAC)।[29] सी और डीसी भालू एसिटाइल संरक्षण,[27]और G और dG 4-आइसोप्रोपिलफेनोक्सीसेटाइल (i-Pr-PAC) से सुरक्षित हैं[30] या डाइमिथाइलफोर्मिडिनो (dmf)[31] समूह। मानक सुरक्षा समूहों की तुलना में हल्के सुरक्षा समूहों को अधिक आसानी से हटा दिया जाता है। हालांकि, समाधान में संग्रहीत होने पर इन समूहों को प्रभावित करने वाले फॉस्फोरामाइड कम स्थिर होते हैं।
  • फास्फाइट समूह एक बेस-लैबाइल प्रोटेक्टिंग ग्रुप #CNEt|2-सायनोइथाइल समूह द्वारा संरक्षित है।[32] एक बार एक फॉस्फोरैमिडाइट को ठोस समर्थन-बाध्य ओलिगोन्यूक्लियोटाइड के साथ जोड़ा गया है और फॉस्फेट मोएट्स को पी (वी) प्रजातियों में परिवर्तित कर दिया गया है, आगे युग्मन प्रतिक्रियाओं के सफल आयोजन के लिए फॉस्फेट संरक्षण की उपस्थिति अनिवार्य नहीं है।[33]
2'-ओ-संरक्षित राइबोन्यूक्लियोसाइड फॉस्फोरामाइडाइट्स।
  • आरएनए संश्लेषण में, 2'-हाइड्रॉक्सी समूह को टीबीडीएमएस (टी-ब्यूटिल्डिमिथाइलसिलिल) समूह द्वारा संरक्षित किया जाता है।[34][35][36][37] या टीओएम (ट्राई-आइसो-प्रोपाइलसिलोक्सीमिथाइल) समूह के साथ,[38][39] दोनों को फ्लोराइड आयन के साथ उपचार द्वारा हटाया जा सकता है।
  • फ़ॉस्फाइट अंश अम्लीय परिस्थितियों में प्रतिक्रियाशील डायसोप्रोपाइलामिनो (iPr2N) समूह को भी धारण करता है। सक्रियण पर, डायसोप्रोपाइलामिनो समूह निकल जाता है, जिसे समर्थन-बाउंड ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड के 5'-हाइड्रॉक्सी समूह द्वारा प्रतिस्थापित किया जाता है।

यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ Beaucage, S.L.; Caruthers M.H. (1981). "Deoxynucleoside phosphoramidites—A new class of key intermediates for deoxypolynucleotide synthesis". Tetrahedron Letters. 22 (20): 1859–1862. doi:10.1016/S0040-4039(01)90461-7.
  2. ↑ Lin, K.-Y., Matteucci, M. D. (1998). "A cytosine analog capable of clamp-like binding to a guanine in helical nucleic acids". J. Am. Chem. Soc. 120 (33): 8531–8532. doi:10.1021/ja981286z.{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  3. ↑ Nielsen, J.; Marugg, J. E.; Taagaard, M.; Van Boom, J. H.; Dahl, O. (1986). "Polymer-supported synthesis of deoxyoligonucleotides using in situ prepared deoxynucleoside 2-cyanoethyl phosphoramidites". Recl. Trav. Chim. Pays-Bas. 105 (1): 33–34. doi:10.1002/recl.19861050106.
  4. ↑ Nielsen, J.; Taagaard, M.; Marugg, J. E.; Van Boom, J. H.; Dahl, O. (1986). "Application of 2-cyanoethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite for in situ preparation of deoxyribonucleoside phosphoramidites and their use in polymer-supported synthesis of oligodeoxyribonucleotides". Nucleic Acids Res. 14 (18): 7391–7403. doi:10.1093/nar/14.18.7391. PMC 311758. PMID 3763407.
  5. ↑ Nielsen, J.; Marugg, J. E.; Van Boom, J. H.; Honnens, J.; Taagaard, M.; Dahl, O. (1986). "Thermal instability of some alkyl phosphorodiamidites". J. Chem Res. Synopses (1): 26–27.
  6. ↑ Nielsen, J.; Dahl, O. (1987). "Improved synthesis of 2-cyanoethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite (iPr2N)2POCH2CH2CN)". Nucleic Acids Res. 15 (8): 3626. doi:10.1093/nar/15.8.3626. PMC 340760. PMID 3575107.
  7. ↑ Beaucage, S. L. (2001). "2-Cyanoethyl Tetraisopropylphosphorodiamidite". E-EROS Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis. doi:10.1002/047084289X.rn00312. ISBN 0471936235.
  8. ↑ Sinha, N. D.; Biernat, J.; Koester, H. (1983). "β-Cyanoethyl N,N-dialkylamino/N-morpholinomonochloro phosphoamidites, new phosphitylating agents facilitating ease of deprotection and work-up of synthesized oligonucleotides". Tetrahedron Lett. 24 (52): 5843–5846. doi:10.1016/S0040-4039(00)94216-3.
  9. ↑ Marugg, J. E.; Burik, A.; Tromp, M.; Van der Marel, G. A. & Van Boom, J. H. (1986). "A new and versatile approach to the preparation of valuable deoxynucleoside 3'-phosphite intermediates". Tetrahedron Lett. 24 (20): 2271–22274. doi:10.1016/S0040-4039(00)84506-2.
  10. ↑ Guzaev, A. P.; Manoharan, M. (2001). "2-Benzamidoethyl group - a novel type of phosphate protecting group for oligonucleotide synthesis". J. Am. Chem. Soc. 123 (5): 783–793. doi:10.1021/ja0016396. PMID 11456611.
  11. ↑ Sproat, B.; Colonna, F.; Mullah, B.; Tsou, D.; Andrus, A.; Hampel, A.; Vinayak, R. (Feb 1995). "ओलिगोरिबोन्यूक्लियोटाइड्स के अलगाव और शुद्धिकरण के लिए एक कुशल विधि". Nucleosides & Nucleotides. 14 (1&2): 255–273. doi:10.1080/15257779508014668. ISSN 0261-3166.
  12. ↑ Stutz, A.; Hobartner, C.; Pitsch, S. (Sep 2000). "Novel fluoride-labile nucleobase-protecting groups for the synthesis of 3'(2')-O-amino-acylated RNA sequences". Helv. Chim. Acta. 83 (9): 2477–2503. doi:10.1002/1522-2675(20000906)83:9<2477::aid-hlca2477>3.0.co;2-9. ISSN 0018-019X.
  13. ↑ Welz, R.; Muller, S. (Jan 2002). "5-(Benzylmercapto)-1H-tetrazole as activator for 2'-O-TBDMS phosphoramidite building blocks in RNA synthesis". Tetrahedron Letters. 43 (5): 795–797. doi:10.1016/S0040-4039(01)02274-2. ISSN 0040-4039.
  14. ↑ Vargeese, C.; Carter, J.; Yegge, J.; Krivjansky, S.; Settle, A.; Kropp, E.; Peterson, K.; Pieken, W. (1998). "Efficient activation of nucleoside phosphoramidites with 4,5-dicyanoimidazole during oligonucleotide synthesis". Nucleic Acids Res. 26 (4): 1046–1050. doi:10.1093/nar/26.4.1046. ISSN 0305-1048. PMC 147346. PMID 9461466.
  15. ↑ Jump up to: 15.0 15.1 15.2 Gacs-Baitz, E.; Sipos, F.; Egyed, O.; Sagi, G. (2009). "Synthesis and structural study of variously oxidized diastereomeric 5'-dimethoxytrityl-thymidine-3'-O-[O-(2-cyanoethyl)-N,N-diisopropyl]-phosphoramidite derivatives. Comparison of the effects of the P=O, P=S, and P=Se functions on the NMR spectral and chromatographic properties". Chirality. 21 (7): 663–673. doi:10.1002/chir.20653. PMID 18937288.
  16. ↑ Jump up to: 16.0 16.1 Nemer, M. J.; Ogilvie, K. K. (1980). "Phosphoramidate analogs of diribonucleoside monophosphates". Tetrahedron Lett. 21 (43): 4153–4154. doi:10.1016/s0040-4039(00)93675-x.
  17. ↑ Wilk, A.; Uznanski, B.; Stec, W. J. (1991). "Assignment of absolute configuration at phosphorus in dithymidylyl(3',5')phosphormorpholidates and -phosphormorpholidothioates". Nucleosides & Nucleotides. 10 (1–3): 319–322. doi:10.1080/07328319108046469.
  18. ↑ Guzaev, A. P. (2011). "Reactivity of 3H-1,2,4-dithiazole-3-thiones and 3H-1,2-dithiole-3-thiones as sulfurizing agents for oligonucleotide synthesis". Tetrahedron Letters. 52 (3): 434–437. doi:10.1016/j.tetlet.2010.11.086.
  19. ↑ Holloway, G. A.; Pavot, C.; Scaringe, S. A.; Lu, Y.; Rauchfuss, T. B. (2002). "फॉस्फोरोसेलेनोएट युक्त ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के लिए एक ऑर्गोनोमेटेलिक मार्ग।". ChemBioChem. 3 (11): 1061–1065. doi:10.1002/1439-7633(20021104)3:11<1061::aid-cbic1061>3.0.co;2-9. PMID 12404630. S2CID 18797616.
  20. ↑ Ravikumar, V. T.; Kumar, R. K. (2004). "Stereoselective Synthesis of Alkylphosphonates: A Facile Rearrangement of Cyanoethyl-Protected Nucleoside Phosphoramidites". Org. Process Res. Dev. 8 (4): 603–608. doi:10.1021/op030035u.
  21. ↑ "बीटा-साइनोइथाइल फॉस्फोरामाइड्स". Products.appliedbiosystems.com. Retrieved 2009-05-12.
  22. ↑ "बायोसर्च टेक्नोलॉजीज". Biosearchtech.com. Retrieved 2009-05-12.
  23. ↑ "केमजीन कॉर्पोरेशन, एक बायोटेक्नोलॉजी कंपनी". Chemgenes.com. Retrieved 2009-05-12.
  24. ↑ M. Powell (2008-01-17). "एप्लाइड बायोसिस्टम्स इंस्ट्रूमेंट्स". Glenresearch.com. Retrieved 2009-05-12.
  25. ↑ "न्यूक्लिक एसिड संश्लेषण और लेबलिंग". Thermo.com. 2008-08-16. Archived from the original on February 28, 2009. Retrieved 2009-05-12.
  26. ↑ Gryaznov, S. M.; Letsinger, R. L. (1991). "Synthesis of oligonucleotides via monomers with unprotected bases". J. Am. Chem. Soc. 113 (15): 5876–5877. doi:10.1021/ja00015a059.
  27. ↑ Jump up to: 27.0 27.1 Reddy, M. P.; Hanna, N. B.; Farooqui, F. (1997). "Ultrafast Cleavage and Deprotection of Oligonucleotides Synthesis and Use of CAc Derivatives". Nucleosides & Nucleotides. 16 (7–9): 1589–1598. doi:10.1080/07328319708006236.
  28. ↑ McMinn, D. (1997). "Synthesis of oligonucleotides containing 3'-alkyl amines using N-isobutyryl protected deoxyadenosine phosphoramidite". Tetrahedron Lett. 38 (18): 3123. doi:10.1016/S0040-4039(97)00568-6.
  29. ↑ Schulhof, J. C.; Molko, D.; Teoule, R. (1987). "ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड संश्लेषण में अंतिम डीप्रोटेक्शन चरण को लेबिल बेस-प्रोटेक्टिंग समूहों का उपयोग करके हल्के और तेजी से अमोनिया उपचार में कम किया जाता है।". Nucleic Acids Res. 15 (2): 397–416. doi:10.1093/nar/15.2.397. PMC 340442. PMID 3822812.
  30. ↑ Zhu, Q. (2001). "फास्ट-डीप्रोटेक्टिंग फॉस्फोरामाइडाइट्स और अल्ट्रा-माइल्ड डीप्रोटेक्शन का उपयोग करके तैयार किए गए ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के एन-एसिटिलेशन का निरीक्षण और उन्मूलन". Bioorg. Med. Chem. Lett. 11 (9): 1105–7. doi:10.1016/S0960-894X(01)00161-5. PMID 11354354.
  31. ↑ McBride, L. J.; Kierzek, R.; Beaucage, S. L.; Caruthers, M. H. (1986). "Nucleotide chemistry. 16. Amidine protecting groups for oligonucleotide synthesis". J. Am. Chem. Soc. 108 (8): 2040. doi:10.1021/ja00268a052.
  32. ↑ Sinha, N. D.; Biernat, J.; McManus, J.; Koester, H. (1984). "Polymer support oligonucleotide synthesis. XVIII: use of β-cyanoethyl-N,N-dialkylamino-/N-morpholino phosphoramidite of deoxynucleosides for the synthesis of DNA fragments simplifying deprotection and isolation of the final product". Nucleic Acids Res. 12 (11): 4539–4557. doi:10.1093/nar/12.11.4539. PMC 318857. PMID 6547529.
  33. ↑ Guzaev, A. P.; Manoharan, M. (2001). "असुरक्षित इंटरन्यूक्लिओसिडिक फॉस्फेट मोएटीज़ को प्रभावित करने वाले ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स के लिए फॉस्फोरामाइडाइट युग्मन". J. Org. Chem. 66 (5): 1798–1804. doi:10.1021/jo001591e. PMID 11262130.
  34. ↑ Ogilvie, K. K.; Theriault, N.; Sadana, K. L. (1977). "ऑलिगोरिबोन्यूक्लियोटाइड्स का संश्लेषण". J. Am. Chem. Soc. 99 (23): 7741–7743. doi:10.1021/ja00465a073. PMID 915168.
  35. ↑ Usman, N.; Ogilvie, K. K.; Jiang, M. Y.; Cedergren, R. J. (1987). "The automated chemical synthesis of long oligoribuncleotides using 2'-O-silylated ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites on a controlled-pore glass support: synthesis of a 43-nucleotide sequence similar to the 3'-half molecule of an Escherichia coli formylmethionine tRNA". J. Am. Chem. Soc. 109 (25): 7845–7854. doi:10.1021/ja00259a037.
  36. ↑ Usman, N.; Pon, R. T.; Ogilvie, K. K. (1985). "Preparation of ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites and their application to the automated solid phase synthesis of oligonucleotides". Tetrahedron Lett. 26 (38): 4567–4570. doi:10.1016/S0040-4039(00)98753-7.
  37. ↑ Scaringe, S. A.; Francklyn, C.; Usman, N. (1990). "Chemical synthesis of biologically active oligoribonucleotides using β-cyanoethyl protected ribonucleoside phosphoramidites". Nucleic Acids Res. 18 (18): 5433–5441. doi:10.1093/nar/18.18.5433. PMC 332221. PMID 2216717.
  38. ↑ Pitsch, S.; Weiss, P. A.; Wu, X.; Ackermann, D.; Honegger, T. (1999). "Fast and reliable automated synthesis of RNA and partially 2'-O-protected precursors ("caged RNA") based on two novel, orthogonal 2'-O-protecting groups". Helv. Chim. Acta. 82 (10): 1753–1761. doi:10.1002/(SICI)1522-2675(19991006)82:10<1753::AID-HLCA1753>3.0.CO;2-Y.
  39. ↑ Pitsch, S.; Weiss, P. A.; Jenny, L.; Stutz, A.; Wu, X. (2001). "Reliable chemical synthesis of oligoribonucleotides (RNA) with 2'-O-[(triisopropylsilyl)oxy]methyl(2'-O-tom)-protected phosphoramidites". Helv. Chim. Acta. 84 (12): 3773–3795. doi:10.1002/1522-2675(20011219)84:12<3773::AID-HLCA3773>3.0.CO;2-E.


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