एट्रीबैक्टीरोटा: Difference between revisions

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'''''एट्रीबैक्टीरोटा''''' एक जीवाणु संघ है, जो [[मीथेन]] से भरपूर आनॉक्सीय [[अवसादों]] में सामान्य हैं। वे दुनिया भर में वितरित किए जाते हैं और कुछ स्थितियों अवायवीय समुद्री अवसादों, [[भूतापीय स्प्रिंग्स]] और [[तेल जमा|तेल भंड़ार]] में प्रचुर मात्रा में होते हैं। आनुवंशिक विश्लेषण एक विषमपोषी चयापचय का सुझाव देते हैं जो [[एसीटेट]], [[इथेनॉल]] और {{CO2|link=yes}} जैसे [[किण्वन]] उत्पादों को जन्म देता है। ये उत्पाद बदले में तलछट माइक्रोबियल समुदाय के भीतर मेथैनजन का समर्थन कर सकते हैं और मीथेन युक्त आनॉक्सीय अवसादों में एट्रीबैक्टेरोटा की लगातार उपस्थिति की व्याख्या कर सकते हैं।<ref>Nobu, M. K., Dodsworth, J. A., Murugapiran, S. K., Rinke, C., Gies, E. A., Webster, G., ... & Jørgensen, B. B. (2016) [http://www.nature.com/ismej/journal/v10/n2/full/ismej201597a.html Phylogeny and physiology of candidate phylum 'Atribacteria' (OP9/JS1) inferred from cultivation-independent genomics]. The ISME journal, 10(2), 273-286.</ref><ref>Carr, S. A., Orcutt, B. N., Mandernack, K. W., & Spear, J. R. (2015). [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4549626/ Abundant Atribacteria in deep marine sediment from the Adélie Basin, Antarctica]. Frontiers in microbiology, 6.</ref> वंशावली विश्लेषण के अनुसार, एट्रीबैक्टेरोटा [[टेराबैक्टीरिया]] के भीतर कई ऊष्मास्‍नेही संघो से संबंधित प्रतीत होता है<ref>Christian Rinke et al 2013. [http://www.nature.com/nature/journal/v499/n7459/full/nature12352.html Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter.] Nature Volume: 499, Pages: 431–437 doi:10.1038/nature12352</ref> या [[ धन्यवाद | ग्रेसिलिक्यूट्स]] के आधार में हो सकता है।<ref>Hug, L. A. et al. 2016, [https://www.nature.com/articles/nmicrobiol201648 A new view of the tree of life]. Nature Microbiology, 1, 16048.</ref> शोध के अनुसार, एट्रिबैक्टेरोटा जीन अभिव्यक्तियों की अभिरचना  दिखाता है जिसमें किण्वक, एसिटोजेनिक चयापचय होता है। ये अभिव्यक्तियाँ एट्रीबैक्टेरोटा को[[ अपचयी | अपचयी]] और [[उपचय]] कार्यों को बनाने में सक्षम बनाती हैं जो कोशिकीय प्रजनन उत्पन्न करने के लिए आवश्यक हैं, तब भी जब समुद्र के पानी, ताजे पानी या भूजल के क्षेत्रों में घुलित ऑक्सीजन की कमी के कारण ऊर्जा का स्तर सीमित होता है।<ref>{{Cite journal|last1=Vuillemin|first1=Aurèle|last2=Vargas|first2=Sergio|last3=Coskun|first3=Ömer K.|last4=Pockalny|first4=Robert|last5=Murray|first5=Richard W.|last6=Smith|first6=David C.|last7=D’Hondt|first7=Steven|last8=Orsi|first8=William D.|date=2020-07-11|title=एट्रीबैक्टीरिया अटलांटिक रसातल उपसमुद्र तल में लाखों वर्षों से प्रजनन कर रहा है|url=http://dx.doi.org/10.1101/2020.07.10.198200|access-date=2021-03-26|journal=mBio|volume=11 |issue=5 |doi=10.1101/2020.07.10.198200 |pmid=33024037 |pmc=7542362 }}</ref>  
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|phylum_authority = Katayama 2021<ref>{{cite journal | vauthors = Oren A, Garrity GM | title = Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes | journal = Int J Syst Evol Microbiol | year = 2021 | volume = 71 | issue = 10 | pages = 5056 | doi = 10.1099/ijsem.0.005056 | pmid = 34694987 | s2cid = 239887308 | doi-access = free }}</ref>
|synonyms =
* Candidate phylum OP9
* Candidate phylum JS1
* "''Candidatus'' Atribacteria" <small>Dodsworth ''et al''. 2013</small>
* "''Atribacterota''" <small>Katayama ''et al''. 2020</small>
}}


'' एट्रीबैक्टेरोटा '' एक जीवाणु संघ है, जो [[मीथेन]] से भरपूर हाइपोक्सिया (पर्यावरणीय) [[अवसादों]] में आम हैं। वे दुनिया भर में वितरित किए जाते हैं और कुछ मामलों में हाइपोक्सिया (पर्यावरणीय) समुद्री तलछट, [[भूतापीय स्प्रिंग्स]] और [[तेल जमा]] में प्रचुर मात्रा में होते हैं। आनुवंशिक विश्लेषण एक विषमपोषी चयापचय का सुझाव देते हैं जो [[एसीटेट]], [[इथेनॉल]] और जैसे [[किण्वन]] उत्पादों को जन्म देता है {{CO2|link=yes}}. ये उत्पाद बदले में तलछट माइक्रोबियल समुदाय के भीतर मेथनोगेंस का समर्थन कर सकते हैं और मीथेन युक्त एनोक्सिक अवसादों में एट्रीबैक्टेरोटा की लगातार घटना की व्याख्या कर सकते हैं।<ref>Nobu, M. K., Dodsworth, J. A., Murugapiran, S. K., Rinke, C., Gies, E. A., Webster, G., ... & Jørgensen, B. B. (2016) [http://www.nature.com/ismej/journal/v10/n2/full/ismej201597a.html Phylogeny and physiology of candidate phylum 'Atribacteria' (OP9/JS1) inferred from cultivation-independent genomics]. The ISME journal, 10(2), 273-286.</ref><ref>Carr, S. A., Orcutt, B. N., Mandernack, K. W., & Spear, J. R. (2015). [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4549626/ Abundant Atribacteria in deep marine sediment from the Adélie Basin, Antarctica]. Frontiers in microbiology, 6.</ref> फाइलोजेनेटिक विश्लेषण के अनुसार, एट्रीबैक्टेरोटा [[टेराबैक्टीरिया]] के भीतर कई थर्मोफिलिक फाइला से संबंधित प्रतीत होता है<ref>Christian Rinke et al 2013. [http://www.nature.com/nature/journal/v499/n7459/full/nature12352.html Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter.] Nature Volume: 499, Pages: 431–437 doi:10.1038/nature12352</ref> या [[ धन्यवाद ]] के आधार में हो सकता है।<ref>Hug, L. A. et al. 2016, [https://www.nature.com/articles/nmicrobiol201648 A new view of the tree of life]. Nature Microbiology, 1, 16048.</ref> शोध के अनुसार, एट्रिबैक्टेरोटा जीन अभिव्यक्तियों के पैटर्न दिखाता है जिसमें किण्वक, एसिटोजेनिक चयापचय होता है। ये अभिव्यक्तियाँ एट्रीबैक्टेरोटा को [[ अपचयी ]] और [[उपचय]] कार्यों को बनाने में सक्षम बनाती हैं जो सेलुलर प्रजनन उत्पन्न करने के लिए आवश्यक हैं, तब भी जब समुद्र के पानी, ताजे पानी या भूजल के क्षेत्रों में घुलित ऑक्सीजन की कमी के कारण ऊर्जा का स्तर सीमित होता है।<ref>{{Cite journal|last1=Vuillemin|first1=Aurèle|last2=Vargas|first2=Sergio|last3=Coskun|first3=Ömer K.|last4=Pockalny|first4=Robert|last5=Murray|first5=Richard W.|last6=Smith|first6=David C.|last7=D’Hondt|first7=Steven|last8=Orsi|first8=William D.|date=2020-07-11|title=एट्रीबैक्टीरिया अटलांटिक रसातल उपसमुद्र तल में लाखों वर्षों से प्रजनन कर रहा है|url=http://dx.doi.org/10.1101/2020.07.10.198200|access-date=2021-03-26|journal=mBio|volume=11 |issue=5 |doi=10.1101/2020.07.10.198200 |pmid=33024037 |pmc=7542362 }}</ref>


== वर्गीकरण ==
राष्ट्रीय जैव प्रौद्योगिकी सूचना केंद्र (एन सी आई बी)<ref>{{cite web |author = Sayers|display-authors = et al.| url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=67818&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock |title=एट्रीबैक्टीरोटा|access-date=2021-03-20 |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}}</ref> वर्गीकरण और नामकरण में स्थायी (एल पी एस एन) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची<ref>{{cite web | author=J.P. Euzéby | url=https://lpsn.dsmz.de/phylum/atribacterota | title=एट्रीबैक्टीरोटा| publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN)| access-date=2021-06-27 }}</ref> नामकरण प्राथमिकताओं को स्थापित करने के लिए प्राथमिक टैक्सोनोमिक प्राधिकरण के रूप में उपयोग किया गया था।  जीटीडीबी रिलीज़ 06-RS202.<ref name="GTDB">{{cite web |title=GTDB release 06-RS202 |url=https://gtdb.ecogenomic.org/about#4%7C |website=[[Genome Taxonomy Database]]}}</ref> का उपयोग करने वाली [[एनोट्री]] वेबसाइट<ref name="Mendler">{{cite journal |last1=Mendler|first1=K|last2=Chen|first2=H|last3=Parks|first3=DH|last4=Hug|first4=LA|last5=Doxey|first5=AC |date=2019 |title=AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life |journal=Nucleic Acids Research |volume=47  |issue=9| pages=4442–4448 |url=http://annotree.uwaterloo.ca/app/ |doi=10.1093/nar/gkz246|pmid=31081040|pmc=6511854|doi-access=free}}</ref> से भी परामर्श किया गया।


== टैक्सोनॉमी ==
* '''क्लास एट्रीबैक्टीरिया''' कात्यामा एट अल<small>. 2021</small>
राष्ट्रीय जैव प्रौद्योगिकी सूचना केंद्र (NCBI)<ref>{{cite web |author = Sayers|display-authors = et al.| url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=67818&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock |title=एट्रीबैक्टीरोटा|access-date=2021-03-20 |publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) taxonomy database}}</ref> वर्गीकरण और नामकरण में स्थायी (LPSN) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची<ref>{{cite web | author=J.P. Euzéby | url=https://lpsn.dsmz.de/phylum/atribacterota | title=एट्रीबैक्टीरोटा| publisher=[[List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature]] (LPSN)| access-date=2021-06-27 }}</ref> नामकरण प्राथमिकताओं को स्थापित करने के लिए प्राथमिक टैक्सोनोमिक प्राधिकरण के रूप में उपयोग किया गया था। साथ ही [[एनोट्री]] वेबसाइट,<ref name="Mendler">{{cite journal |last1=Mendler|first1=K|last2=Chen|first2=H|last3=Parks|first3=DH|last4=Hug|first4=LA|last5=Doxey|first5=AC |date=2019 |title=AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life |journal=Nucleic Acids Research |volume=47  |issue=9| pages=4442–4448 |url=http://annotree.uwaterloo.ca/app/ |doi=10.1093/nar/gkz246|pmid=31081040|pmc=6511854|doi-access=free}}</ref> जो GTDB रिलीज़ 06-RS202 का उपयोग करता है।<ref name="GTDB">{{cite web |title=GTDB release 06-RS202 |url=https://gtdb.ecogenomic.org/about#4%7C |website=[[Genome Taxonomy Database]]}}</ref> परामर्श किया गया।
** ऑर्डर [[एट्रीबैक्टेरेल्स]] <small>कात्यामा एट अल. 2021</small>
 
*** फ़ैमिली [[एट्रीबैक्टीरिया]] <small>कात्यामा एट अल. 2021</small>
* क्लास एट्रीबैक्टीरिया <small>Katayama et al. 2021</small>
**** जीनस [[एट्रीबैक्टर]] <small>कात्यामा एट अल. 2021</small>
** ऑर्डर [[एट्रीबैक्टेरेल्स]] <small>Katayama et al. 2021</small>
***** प्रजाति ए लैमिनाटस <small>कात्यामा एट अल. 2021</small>
*** परिवार [[एट्रीबैक्टीरिया]] <small>Katayama et al. 2021</small>
*** परिवार "[[Caldatribacteriaceae|कैल्डेट्रिबैक्टीरिया]]<small></small>[[Caldatribacteriaceae|सी"]]
**** जीनस [[एट्रीबैक्टर]] <small>Katayama et al. 2021</small>
**** जीनस [[कैल्डेट्रिबैक्टीरियम|"कैंडिडैटस कैल्डेट्रिबैक्टीरियम"]] <small>डोड्सवर्थ एट अल. 2013</small>
***** प्रजाति ए लैमिनाटस <small>Katayama et al. 2021</small>
***** प्रजाति <nowiki>''</nowiki>सीए. सी. कैलिफोर्निया" <small>कोरिग. डोड्सवर्थ एट अल. 2013</small>
*** परिवार [[Caldatribacteriaceae]] <small></small>
***** प्रजाति सीए। सी सैक्रोफेरमेंटंस <small>डोड्सवर्थ एट अल. 2013</small>
**** जीनस कैंडिडेटस [[कैल्डेट्रिबैक्टीरियम]] <small>Dodsworth et al. 2013</small>
***** प्रजाति सीए। सी कैलिफोर्निया <small>corrig. Dodsworth et al. 2013</small>
***** प्रजाति सीए। सी सैक्रोफेरमेंटंस <small>Dodsworth et al. 2013</small>




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Latest revision as of 16:17, 20 June 2023

एट्रीबैक्टीरोटा

एट्रीबैक्टीरोटा एक जीवाणु संघ है, जो मीथेन से भरपूर आनॉक्सीय अवसादों में सामान्य हैं। वे दुनिया भर में वितरित किए जाते हैं और कुछ स्थितियों अवायवीय समुद्री अवसादों, भूतापीय स्प्रिंग्स और तेल भंड़ार में प्रचुर मात्रा में होते हैं। आनुवंशिक विश्लेषण एक विषमपोषी चयापचय का सुझाव देते हैं जो एसीटेट, इथेनॉल और CO2 जैसे किण्वन उत्पादों को जन्म देता है। ये उत्पाद बदले में तलछट माइक्रोबियल समुदाय के भीतर मेथैनजन का समर्थन कर सकते हैं और मीथेन युक्त आनॉक्सीय अवसादों में एट्रीबैक्टेरोटा की लगातार उपस्थिति की व्याख्या कर सकते हैं।[1][2] वंशावली विश्लेषण के अनुसार, एट्रीबैक्टेरोटा टेराबैक्टीरिया के भीतर कई ऊष्मास्‍नेही संघो से संबंधित प्रतीत होता है[3] या ग्रेसिलिक्यूट्स के आधार में हो सकता है।[4] शोध के अनुसार, एट्रिबैक्टेरोटा जीन अभिव्यक्तियों की अभिरचना दिखाता है जिसमें किण्वक, एसिटोजेनिक चयापचय होता है। ये अभिव्यक्तियाँ एट्रीबैक्टेरोटा को अपचयी और उपचय कार्यों को बनाने में सक्षम बनाती हैं जो कोशिकीय प्रजनन उत्पन्न करने के लिए आवश्यक हैं, तब भी जब समुद्र के पानी, ताजे पानी या भूजल के क्षेत्रों में घुलित ऑक्सीजन की कमी के कारण ऊर्जा का स्तर सीमित होता है।[5]


वर्गीकरण

राष्ट्रीय जैव प्रौद्योगिकी सूचना केंद्र (एन सी आई बी)[6] वर्गीकरण और नामकरण में स्थायी (एल पी एस एन) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची[7] नामकरण प्राथमिकताओं को स्थापित करने के लिए प्राथमिक टैक्सोनोमिक प्राधिकरण के रूप में उपयोग किया गया था। जीटीडीबी रिलीज़ 06-RS202.[8] का उपयोग करने वाली एनोट्री वेबसाइट[9] से भी परामर्श किया गया।


यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ Nobu, M. K., Dodsworth, J. A., Murugapiran, S. K., Rinke, C., Gies, E. A., Webster, G., ... & Jørgensen, B. B. (2016) Phylogeny and physiology of candidate phylum 'Atribacteria' (OP9/JS1) inferred from cultivation-independent genomics. The ISME journal, 10(2), 273-286.
  2. ↑ Carr, S. A., Orcutt, B. N., Mandernack, K. W., & Spear, J. R. (2015). Abundant Atribacteria in deep marine sediment from the Adélie Basin, Antarctica. Frontiers in microbiology, 6.
  3. ↑ Christian Rinke et al 2013. Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. Nature Volume: 499, Pages: 431–437 doi:10.1038/nature12352
  4. ↑ Hug, L. A. et al. 2016, A new view of the tree of life. Nature Microbiology, 1, 16048.
  5. ↑ Vuillemin, Aurèle; Vargas, Sergio; Coskun, Ömer K.; Pockalny, Robert; Murray, Richard W.; Smith, David C.; D’Hondt, Steven; Orsi, William D. (2020-07-11). "एट्रीबैक्टीरिया अटलांटिक रसातल उपसमुद्र तल में लाखों वर्षों से प्रजनन कर रहा है". mBio. 11 (5). doi:10.1101/2020.07.10.198200. PMC 7542362. PMID 33024037. Retrieved 2021-03-26.
  6. ↑ Sayers; et al. "एट्रीबैक्टीरोटा". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2021-03-20.
  7. ↑ J.P. Euzéby. "एट्रीबैक्टीरोटा". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2021-06-27.
  8. ↑ "GTDB release 06-RS202". Genome Taxonomy Database.
  9. ↑ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). "AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life". Nucleic Acids Research. 47 (9): 4442–4448. doi:10.1093/nar/gkz246. PMC 6511854. PMID 31081040.

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