वेरुकोमाइक्रोबायोटा: Difference between revisions
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'''वेरुकोमाइक्रोबायोटा''' [[ग्राम-नकारात्मक जीवाणु|ग्राम-ऋणात्मक जीवाणुओं]] का एक समूह है जिसमें केवल कुछ वर्णित प्रजातियां सम्मिलित हैं। पहचान की गई प्रजातियों को अलवण जल, समुद्री और [[मिट्टी]] के वातावरण और मानव [[मल]] से अलग किया गया है। सुकेंद्रकी होस्ट के सहयोग से कई अभी तक अनुपयोगी प्रजातियों की पहचान की गई है, जिसमें उनके [[युग्मक|युग्मकों]] में रहने वाले [[ निमेटोड |सूत्रकृमि]] के [[ protist |प्रोटिस्टों]] और अंतःसहजीवियों के बहिर्वेधी विस्फोटी [[ectosymbionts|बाह्य सहजीवी]] सम्मिलित हैं।{{Citation needed|date=June 2020}} | |||
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वेरुकोमाइक्रोबायोटा क्लैड [[प्लेक्टोबैक्टीरिया|प्लेंक्टोबैक्टीरिया]] में बड़े [[क्लेड]] [[ धन्यवाद |ग्रेसिलिक्यूट्स]] में हो सकता है।<ref>{{cite journal | last1= Wagner | first1= M | last2= Horn | first2= M | title= प्लैक्टोमाइसेट्स, वेरुकोमिक्रोबिया, क्लैमाइडिया और बहन फ़ाइला में जैव प्रौद्योगिकी और चिकित्सा प्रासंगिकता के साथ एक सुपरफिलम शामिल है।| journal= Current Opinion in Biotechnology | volume= 17 | issue= 3 | pages= 241–9 | year= 2006 | pmid= 16704931 | doi= 10.1016/j.copbio.2006.05.005}}</ref> | |||
2008 में, [[नर्क का मिथाइलसिडीफिलस|''मिथाइलएसिडिफिलम इन्फर्नोरम'']] (2.3 एमबीपी) का पूरा [[जीनोम]] प्रकाशित किया गया था। एकल वृत्ताकार गुणसूत्र पर, 2473 पूर्वानुमानित प्रोटीन पाए गए, जिनमें से 731 में कोई पता लगाने योग्य समरूप नहीं थे। इन विश्लेषणों से [[स्यूडोमोनडोटा]] के साथ कई संभावित समरूपता का भी पता चला।<ref>{{cite journal | last1 = Hou | first1 = S | last2 = Makarova | first2 = KS | last3 = Saw | first3 = JH | last4 = Senin | first4 = P | last5 = Ly | first5 = BV | last6 = Zhou | first6 = Z | last7 = Ren | first7 = Y | last8 = Wang | first8 = J | last9 = Galperin | first9 = MY | last10 = Omelchenko | first10 = Marina V | last11 = Wolf | first11 = Yuri I | last12 = Yutin | first12 = Natalya | last13 = Koonin | first13 = Eugene V | last14 = Stott | first14 = Matthew B | last15 = Mountain | first15 = Bruce W | last16 = Crowe | first16 = Michelle A | last17 = Smirnova | first17 = Angela V | last18 = Dunfield | first18 = Peter F | last19 = Feng | first19 = Lu | last20 = Wang | first20 = Lei | last21 = Alam | first21 = Maqsudul | title = Complete genome sequence of the extremely acidophilic methanotroph isolate V4, Methylacidiphilum infernorum, a representative of the bacterial phylum Verrucomicrobia | journal = Biology Direct | volume = 3 | pages = 26 | year = 2008 | pmid = 18593465 | pmc = 2474590 | doi = 10.1186/1745-6150-3-26}}</ref><ref>{{Cite journal |author=Ludwig, W., Euzéby, J., & Whitman W.B. |year=2008 |title=Bergey's Taxonomic Outlines: Volume 4 - Draft Taxonomic Outline of the Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi, and Gemmatimonadetes |journal=Bergey's Manual Trust |pages=15 |url=http://bergeys.org/outlines/Bergeys_Vol_4_Outline.pdf |access-date=2011-06-22 |archive-date=2016-11-08 |archive-url=https://web.archive.org/web/20161108184838/http://www.bergeys.org/outlines/Bergeys_Vol_4_Outline.pdf |url-status=dead }}</ref> | |||
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Revision as of 22:32, 18 June 2023
वेरुकोमाइक्रोबायोटा ग्राम-ऋणात्मक जीवाणुओं का एक समूह है जिसमें केवल कुछ वर्णित प्रजातियां सम्मिलित हैं। पहचान की गई प्रजातियों को अलवण जल, समुद्री और मिट्टी के वातावरण और मानव मल से अलग किया गया है। सुकेंद्रकी होस्ट के सहयोग से कई अभी तक अनुपयोगी प्रजातियों की पहचान की गई है, जिसमें उनके युग्मकों में रहने वाले सूत्रकृमि के प्रोटिस्टों और अंतःसहजीवियों के बहिर्वेधी विस्फोटी बाह्य सहजीवी सम्मिलित हैं।[citation needed]
वेरुकोमाइक्रोबायोटा पर्यावरण में प्रचुर मात्रा में हैं, हालांकि अपेक्षाकृत निष्क्रिय हैं।[1] इस संघ को दो सह संघ माने जाते है- पीवीसी (PVC) उच्चसंघ के भीतर क्लैमाइडियोटा (पूर्व में क्लैमाइडिया) और लेंटिसफेरोटा (पूर्व में लेंटिसफेरा)।[2] कई संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स (सीएसआई) की उपस्थिति से पीवीसी समूह के भीतर वेरुकोमाइक्रोबायोटा संघ को पड़ोसी संघ से अलग किया जा सकता है।[3] ये सीएसआई (CSIs) अद्वितीय, सिनैपोमॉर्फिक विशेषताओं का प्रतिनिधित्व करते हैं जो वेरुकोमाइक्रोबायोटा के भीतर सामान्य वंश और अन्य जीवाणुओं के बीच एक स्वतंत्र वंश का सुझाव देते हैं।[4] सीएसआई भी पाए गए हैं जो वेरुकोमाइक्रोबायोटा और क्लैमाइडियोटा द्वारा विशेष रूप से अन्य सभी जीवाणुओं द्वारा साझा किए जाते हैं।[5] ये सीएसआई इस बात का प्रमाण देते हैं कि क्लैमाइडियोटा वेरुकोमाइक्रोबायोटा का निकटतम संबंधी है, और यह कि वे प्लैक्टोमाइसीटेल्स की तुलना में एक दूसरे से अधिक निकटता से संबंधित हैं।
वेरुकोमाइक्रोबायोटा क्लैड प्लेंक्टोबैक्टीरिया में बड़े क्लेड ग्रेसिलिक्यूट्स में हो सकता है।[6]
2008 में, मिथाइलएसिडिफिलम इन्फर्नोरम (2.3 एमबीपी) का पूरा जीनोम प्रकाशित किया गया था। एकल वृत्ताकार गुणसूत्र पर, 2473 पूर्वानुमानित प्रोटीन पाए गए, जिनमें से 731 में कोई पता लगाने योग्य समरूप नहीं थे। इन विश्लेषणों से स्यूडोमोनडोटा के साथ कई संभावित समरूपता का भी पता चला।[7][8]
फाइलोजेनी
| 16S rRNA based LTP_01_2022[9][10][11] | 120 marker proteins based GTDB 07-RS207[12][13][14] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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टैक्सोनॉमी
वर्तमान में स्वीकृत टैक्सोनॉमी नामकरण में स्थायी (LPSN) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची पर आधारित है।[15] और राष्ट्रीय जैव प्रौद्योगिकी सूचना केंद्र (NCBI)[16]
- वंश? सीए। एपिजेनोसोम Bauer et al. 2005
- जाति ? मेथिलोएसिडा Islam et al. 2008
- लिंग? न्यूक्लियोकोकस Sato et al. 2014
- क्लास ओपिटुए Choo et al. 2007
- आदेश Opitutales Choo et al. 2007
- परिवार सीएजी-312
- जीनस सीए। मर्डौसिया Gilroy et al. 2021
- परिवार UBA953
- जीनस सीए। स्पाइराडोसोमा Gilroy et al. 2021
- परिवार केसीटीसी-12870
- जीनस रूफिकोकस Lin et al. 2017
- जीनस Cerasicoccus Yoon et al. 2007
- परिवार DSM-45221
- जीनस लेंटिमोनस Choo & Cho 2006
- जीनस Coraliomargarita Yoon et al. 2007
- पनीसीकोकासेई परिवार Choo et al. 2007
- जीनस सीए। फ्यूसिवोरैक्स Orellana et al. 2022
- जीनस सीए। मार्सेलस Nixon et al. 2019
- जीनस ओशनिक ब्यूटी Feng et al. 2020
- जीनस सीए। पिंगुइकोकस Serra et al. 2020
- जीनस पुनिसिकोकस Choo et al. 2007
- परिवार UBA2987
- जीनस सीए। मोनिबैक्टर corrig. Vosseberg, Martijn & Ettema 2018
- परिवार ओपिटुटेसी Choo et al. 2007
- जीनस अल्टेरोकोकस Shieh and Jean 1999
- जीनस सेफालोटिकोकस Lin et al. 2016
- जीनस सीए। क्षतिपूरित corrig. Lopera et al. 2017
- जीनस एरेबोग्लोबस Tegtmeier et al. 2018
- जीनस Geminisphere Wertz et al. 2018
- जीनस लैकुनिस्फेयर Rast et al. 2017
- जीनस शीतदंश Baek et al. 2019
- जीनस ओलेरिनिकोला Rochman et al. 2018
- जीनस पाठ Chin et al. 2001
- जीनस पेलाजिकोकोकस Yoon et al. 2007
- जीनस रारिग्लोबस Pitt et al. 2020
- जीनस सीए। सिनोइकहैबिटेंट Murray et al. 2021
- परिवार सीएजी-312
- आदेश Opitutales Choo et al. 2007
- क्लास मिथाइलएसिडिफिलेस
- ऑर्डर मिथाइलकोबालामिन Op den Camp 2009
- परिवार मिथाइलएसिडिफिलेसी Op den Camp 2009
- जीनस मिथाइलएसिडीमाइक्रोबियम van Teeseling et al. 2014
- जीनस मिथाइलएसिडीफिलम Hou et al. 2008
- जीनस सीए। मिथाइलएसिडिथर्मस Picone et al. 2021
- परिवार NGM72-4
- जीनस सीमा क्षेत्र Anders et al. 2015
- परिवार पेडोस्फेरेसिया
- जीनस पेडोस्फेरा Ozyurt 2008
- परिवार मिथाइलएसिडिफिलेसी Op den Camp 2009
- ऑर्डर मिथाइलकोबालामिन Op den Camp 2009
- क्लास टेरिमाइक्रोबिया García-López et al. 2020
- ऑर्डर Terrimicrobiales García-López et al. 2020
- परिवार Chthoniobacteraceae Sangwan et al. 2004
- वंश Chthoniobacter Sangwan et al. 2004
- फैमिली Terrimicrobiaceae García-López et al. 2020
- जीनस टेरिमाइक्रोबियम Qiu et al. 2014
- परिवार UBA10450
- जीनस सीए। Udaeobacter Brewer et al. 2016
- परिवार [[Xiphinematobacteraceae]]
- जीनस सीए। Xiphinematobacter Vandekerckhove et al. 2000
- परिवार Chthoniobacteraceae Sangwan et al. 2004
- ऑर्डर Terrimicrobiales García-López et al. 2020
- क्लास वेरुकोमिक्रोबिया Hedlund et al. 1998
- ऑर्डर वेरुकोमाइक्रोबियल्स Ward-Rainey et al. 1996
- फैमिली एकरमैनसियासी Hedlund & Derrien 2012
- जीनस एकरमैनसिया Derrien et al. 2004
- जीनस हेलोफेरुला Yoon et al. 2008
- जीनस ल्यूटोलिबैक्टर Yoon et al. 2008
- वंश Persicirhabdus Yoon et al. 2008
- जीनस रूब्रिटालिया Scheuermayer et al. 2006
- जीनस रोसिबैसिलस Yoon et al. 2008
- फैमिली वेरुकोमाइक्रोबिएसी Ward-Rainey et al. 1996
- जीनस फ्यूकोफिलस Sakai et al. 2001b
- जीनस ब्रेविफोलिस Otsuka et al. 2013
- जीनस ओशिनिफेरुला Jin et al. 2022
- वंश Phragmitibacter Szuróczki et al. 2021
- जीनस प्रोस्थेकोबैक्टर Staley et al. 1976 ex Staley et al. 1980
- जीनस रोजीमाइक्रोबियम Otsuka et al. 2013
- जीनस सल्फ्यूरोसेकोकस फेंग एट अल। 2022
- जीनस टेरिमाइक्रोबियम Qiu et al. 2014
- जीनस वेरुकोमिक्रोबियम Schlesner 1988
- फैमिली एकरमैनसियासी Hedlund & Derrien 2012
- ऑर्डर वेरुकोमाइक्रोबियल्स Ward-Rainey et al. 1996
यह भी देखें
- बैक्टीरियल ऑर्डर की सूची
- बैक्टीरिया पीढ़ी की सूची
संदर्भ
- ↑ White, Richard Allen; Bottos, Eric M.; Roy Chowdhury, Taniya; Zucker, Jeremy D.; Brislawn, Colin J.; Nicora, Carrie D.; Fansler, Sarah J.; Glaesemann, Kurt R.; Glass, Kevin; Jansson, Janet K. (2016-06-28). Langille, Morgan (ed.). "मॉलिक्यूलो लॉन्ग-रीड सीक्वेंसिंग फैसिलिटेट असेंबली एंड जीनोमिक बिनिंग फ्रॉम कॉम्प्लेक्स सॉइल मेटाजेनोम्स". mSystems (in English). 1 (3): mSystems.00045–16, e00045–16. doi:10.1128/mSystems.00045-16. ISSN 2379-5077. PMC 5069762. PMID 27822530.
- ↑ Cho J, Vergin K, Morris R, Giovannoni S (2004). "लेंटिस्पेरा अरनेओसा जीन। नव., सपा. नोव, समुद्री जीवाणु पैदा करने वाला एक पारदर्शी एक्सोपॉलीमर, और एक उपन्यास बैक्टीरियल फाइलम, लेंटिसफेरी का विवरण". Environ Microbiol. 6 (6): 611–21. doi:10.1111/j.1462-2920.2004.00614.x. PMID 15142250.
- ↑ Gupta RS, Bhandari V, Naushad HS (2012). "बैक्टीरिया के पीवीसी क्लैड (प्लैक्टोमाइसेट्स, वेरुकोमिक्रोबिया, क्लैमाइडिया, और लेंटिसफेरे) के लिए आणविक हस्ताक्षर उनके विकासवादी संबंधों में अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं". Front Microbiol. 3: 327. doi:10.3389/fmicb.2012.00327. PMC 3444138. PMID 23060863.
- ↑ Gupta RS (2016). "Impact of genomics on the understanding of microbial evolution and classification: the importance of Darwin's views on classification". FEMS Microbiol Rev. 40 (4): 520–53. doi:10.1093/femsre/fuw011. PMID 27279642.
- ↑ Griffiths E, Gupta RS (2007). "प्रोटीन में फाइलोजेनी और साझा संरक्षित आवेषण इस बात का प्रमाण देते हैं कि वेरुकोमिक्रोबिया क्लैमाइडिया के निकटतम ज्ञात मुक्त-जीवित रिश्तेदार हैं". Microbiology. 153 (Pt 8): 2648–54. doi:10.1099/mic.0.2007/009118-0. PMID 17660429. S2CID 2094762.
- ↑ Wagner, M; Horn, M (2006). "प्लैक्टोमाइसेट्स, वेरुकोमिक्रोबिया, क्लैमाइडिया और बहन फ़ाइला में जैव प्रौद्योगिकी और चिकित्सा प्रासंगिकता के साथ एक सुपरफिलम शामिल है।". Current Opinion in Biotechnology. 17 (3): 241–9. doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005. PMID 16704931.
- ↑ Hou, S; Makarova, KS; Saw, JH; Senin, P; Ly, BV; Zhou, Z; Ren, Y; Wang, J; Galperin, MY; Omelchenko, Marina V; Wolf, Yuri I; Yutin, Natalya; Koonin, Eugene V; Stott, Matthew B; Mountain, Bruce W; Crowe, Michelle A; Smirnova, Angela V; Dunfield, Peter F; Feng, Lu; Wang, Lei; Alam, Maqsudul (2008). "Complete genome sequence of the extremely acidophilic methanotroph isolate V4, Methylacidiphilum infernorum, a representative of the bacterial phylum Verrucomicrobia". Biology Direct. 3: 26. doi:10.1186/1745-6150-3-26. PMC 2474590. PMID 18593465.
- ↑ Ludwig, W., Euzéby, J., & Whitman W.B. (2008). "Bergey's Taxonomic Outlines: Volume 4 - Draft Taxonomic Outline of the Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi, and Gemmatimonadetes" (PDF). Bergey's Manual Trust: 15. Archived from the original (PDF) on 2016-11-08. Retrieved 2011-06-22.
{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link) - ↑ "The LTP". Retrieved 23 February 2022.
- ↑ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2022.
- ↑ "LTP_01_2022 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2022.
- ↑ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
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- ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
- ↑ J.P. Euzéby. "वेरुकोमाइक्रोबायोटा". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2022-09-09.
- ↑ Sayers; et al. "वेरुकोमिक्रोबिया". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2022-09-09.
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