वेरुकोमाइक्रोबायोटा

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वेरुकोमाइक्रोबायोटा ग्राम-ऋणात्मक जीवाणुओं का एक समूह है जिसमें केवल कुछ वर्णित प्रजातियां सम्मिलित हैं। पहचान की गई प्रजातियों को अलवण जल, समुद्री और मिट्टी के वातावरण और मानव मल से अलग किया गया है। सुकेंद्रकी होस्ट के सहयोग से कई अभी तक अनुपयोगी प्रजातियों की पहचान की गई है, जिसमें उनके युग्मकों में रहने वाले सूत्रकृमि के प्रोटिस्टों और अंतःसहजीवियों के बहिर्वेधी विस्फोटी बाह्य सहजीवी सम्मिलित हैं।[citation needed]

वेरुकोमाइक्रोबायोटा पर्यावरण में प्रचुर मात्रा में हैं, हालांकि अपेक्षाकृत निष्क्रिय हैं।[1] इस संघ को दो सह संघ माने जाते है- पीवीसी (PVC) उच्चसंघ के भीतर क्लैमाइडियोटा (पूर्व में क्लैमाइडिया) और लेंटिसफेरोटा (पूर्व में लेंटिसफेरा)।[2] कई संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स (सीएसआई) की उपस्थिति से पीवीसी समूह के भीतर वेरुकोमाइक्रोबायोटा संघ को पड़ोसी संघ से अलग किया जा सकता है।[3] ये सीएसआई (CSIs) अद्वितीय, सिनैपोमॉर्फिक विशेषताओं का प्रतिनिधित्व करते हैं जो वेरुकोमाइक्रोबायोटा के भीतर सामान्य वंश और अन्य जीवाणुओं के बीच एक स्वतंत्र वंश का सुझाव देते हैं।[4] सीएसआई भी पाए गए हैं जो वेरुकोमाइक्रोबायोटा और क्लैमाइडियोटा द्वारा विशेष रूप से अन्य सभी जीवाणुओं द्वारा साझा किए जाते हैं।[5] ये सीएसआई इस बात का प्रमाण देते हैं कि क्लैमाइडियोटा वेरुकोमाइक्रोबायोटा का निकटतम संबंधी है, और यह कि वे प्लैक्टोमाइसीटेल्स की तुलना में एक दूसरे से अधिक निकटता से संबंधित हैं।

वेरुकोमाइक्रोबायोटा क्लैड प्लेंक्टोबैक्टीरिया में बड़े क्लेड ग्रेसिलिक्यूट्स में हो सकता है।[6]

2008 में, मिथाइलएसिडिफिलम इन्फर्नोरम (2.3 एमबीपी) का पूरा जीनोम प्रकाशित किया गया था। एकल वृत्ताकार गुणसूत्र पर, 2473 पूर्वानुमानित प्रोटीन पाए गए, जिनमें से 731 में कोई पता लगाने योग्य समरूप नहीं थे। इन विश्लेषणों से स्यूडोमोनडोटा के साथ कई संभावित समरूपता का भी पता चला।[7][8]

जातिवृत्त

16S rRNA आधारित LTP_01_2022[9][10][11] 120 मार्कर प्रोटीन आधारित जीटीडीबी 07-आरएस207[12][13][14]

वर्गीकरण पद्धति

वर्तमान में स्वीकृत वर्गीकरण पद्धति प्रोकैरियोटिक नामों की सूची के साथ स्टैंडिंग इन नोमेनक्लेचर (LPSN)[15] और नेशनल सेंटर फॉर बायोटेक्नोलॉजी इन्फॉर्मेशन (NCBI) पर आधारित है।[16]

यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ White, Richard Allen; Bottos, Eric M.; Roy Chowdhury, Taniya; Zucker, Jeremy D.; Brislawn, Colin J.; Nicora, Carrie D.; Fansler, Sarah J.; Glaesemann, Kurt R.; Glass, Kevin; Jansson, Janet K. (2016-06-28). Langille, Morgan (ed.). "मॉलिक्यूलो लॉन्ग-रीड सीक्वेंसिंग फैसिलिटेट असेंबली एंड जीनोमिक बिनिंग फ्रॉम कॉम्प्लेक्स सॉइल मेटाजेनोम्स". mSystems (in English). 1 (3): mSystems.00045–16, e00045–16. doi:10.1128/mSystems.00045-16. ISSN 2379-5077. PMC 5069762. PMID 27822530.
  2. ↑ Cho J, Vergin K, Morris R, Giovannoni S (2004). "लेंटिस्पेरा अरनेओसा जीन। नव., सपा. नोव, समुद्री जीवाणु पैदा करने वाला एक पारदर्शी एक्सोपॉलीमर, और एक उपन्यास बैक्टीरियल फाइलम, लेंटिसफेरी का विवरण". Environ Microbiol. 6 (6): 611–21. doi:10.1111/j.1462-2920.2004.00614.x. PMID 15142250.
  3. ↑ Gupta RS, Bhandari V, Naushad HS (2012). "बैक्टीरिया के पीवीसी क्लैड (प्लैक्टोमाइसेट्स, वेरुकोमिक्रोबिया, क्लैमाइडिया, और लेंटिसफेरे) के लिए आणविक हस्ताक्षर उनके विकासवादी संबंधों में अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं". Front Microbiol. 3: 327. doi:10.3389/fmicb.2012.00327. PMC 3444138. PMID 23060863.
  4. ↑ Gupta RS (2016). "Impact of genomics on the understanding of microbial evolution and classification: the importance of Darwin's views on classification". FEMS Microbiol Rev. 40 (4): 520–53. doi:10.1093/femsre/fuw011. PMID 27279642.
  5. ↑ Griffiths E, Gupta RS (2007). "प्रोटीन में फाइलोजेनी और साझा संरक्षित आवेषण इस बात का प्रमाण देते हैं कि वेरुकोमिक्रोबिया क्लैमाइडिया के निकटतम ज्ञात मुक्त-जीवित रिश्तेदार हैं". Microbiology. 153 (Pt 8): 2648–54. doi:10.1099/mic.0.2007/009118-0. PMID 17660429. S2CID 2094762.
  6. ↑ Wagner, M; Horn, M (2006). "प्लैक्टोमाइसेट्स, वेरुकोमिक्रोबिया, क्लैमाइडिया और बहन फ़ाइला में जैव प्रौद्योगिकी और चिकित्सा प्रासंगिकता के साथ एक सुपरफिलम शामिल है।". Current Opinion in Biotechnology. 17 (3): 241–9. doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005. PMID 16704931.
  7. ↑ Hou, S; Makarova, KS; Saw, JH; Senin, P; Ly, BV; Zhou, Z; Ren, Y; Wang, J; Galperin, MY; Omelchenko, Marina V; Wolf, Yuri I; Yutin, Natalya; Koonin, Eugene V; Stott, Matthew B; Mountain, Bruce W; Crowe, Michelle A; Smirnova, Angela V; Dunfield, Peter F; Feng, Lu; Wang, Lei; Alam, Maqsudul (2008). "Complete genome sequence of the extremely acidophilic methanotroph isolate V4, Methylacidiphilum infernorum, a representative of the bacterial phylum Verrucomicrobia". Biology Direct. 3: 26. doi:10.1186/1745-6150-3-26. PMC 2474590. PMID 18593465.
  8. ↑ Ludwig, W., Euzéby, J., & Whitman W.B. (2008). "Bergey's Taxonomic Outlines: Volume 4 - Draft Taxonomic Outline of the Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi, and Gemmatimonadetes" (PDF). Bergey's Manual Trust: 15. Archived from the original (PDF) on 2016-11-08. Retrieved 2011-06-22.{{cite journal}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  9. ↑ "The LTP". Retrieved 23 February 2022.
  10. ↑ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2022.
  11. ↑ "LTP_01_2022 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2022.
  12. ↑ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  13. ↑ "bac120_r207.sp_labels". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  14. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  15. ↑ J.P. Euzéby. "वेरुकोमाइक्रोबायोटा". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2022-09-09.
  16. ↑ Sayers; et al. "वेरुकोमिक्रोबिया". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2022-09-09.
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