वेरुकोमाइक्रोबायोटा: Difference between revisions
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Revision as of 00:44, 19 June 2023
वेरुकोमाइक्रोबायोटा ग्राम-ऋणात्मक जीवाणुओं का एक समूह है जिसमें केवल कुछ वर्णित प्रजातियां सम्मिलित हैं। पहचान की गई प्रजातियों को अलवण जल, समुद्री और मिट्टी के वातावरण और मानव मल से अलग किया गया है। सुकेंद्रकी होस्ट के सहयोग से कई अभी तक अनुपयोगी प्रजातियों की पहचान की गई है, जिसमें उनके युग्मकों में रहने वाले सूत्रकृमि के प्रोटिस्टों और अंतःसहजीवियों के बहिर्वेधी विस्फोटी बाह्य सहजीवी सम्मिलित हैं।[citation needed]
वेरुकोमाइक्रोबायोटा पर्यावरण में प्रचुर मात्रा में हैं, हालांकि अपेक्षाकृत निष्क्रिय हैं।[1] इस संघ को दो सह संघ माने जाते है- पीवीसी (PVC) उच्चसंघ के भीतर क्लैमाइडियोटा (पूर्व में क्लैमाइडिया) और लेंटिसफेरोटा (पूर्व में लेंटिसफेरा)।[2] कई संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स (सीएसआई) की उपस्थिति से पीवीसी समूह के भीतर वेरुकोमाइक्रोबायोटा संघ को पड़ोसी संघ से अलग किया जा सकता है।[3] ये सीएसआई (CSIs) अद्वितीय, सिनैपोमॉर्फिक विशेषताओं का प्रतिनिधित्व करते हैं जो वेरुकोमाइक्रोबायोटा के भीतर सामान्य वंश और अन्य जीवाणुओं के बीच एक स्वतंत्र वंश का सुझाव देते हैं।[4] सीएसआई भी पाए गए हैं जो वेरुकोमाइक्रोबायोटा और क्लैमाइडियोटा द्वारा विशेष रूप से अन्य सभी जीवाणुओं द्वारा साझा किए जाते हैं।[5] ये सीएसआई इस बात का प्रमाण देते हैं कि क्लैमाइडियोटा वेरुकोमाइक्रोबायोटा का निकटतम संबंधी है, और यह कि वे प्लैक्टोमाइसीटेल्स की तुलना में एक दूसरे से अधिक निकटता से संबंधित हैं।
वेरुकोमाइक्रोबायोटा क्लैड प्लेंक्टोबैक्टीरिया में बड़े क्लेड ग्रेसिलिक्यूट्स में हो सकता है।[6]
2008 में, मिथाइलएसिडिफिलम इन्फर्नोरम (2.3 एमबीपी) का पूरा जीनोम प्रकाशित किया गया था। एकल वृत्ताकार गुणसूत्र पर, 2473 पूर्वानुमानित प्रोटीन पाए गए, जिनमें से 731 में कोई पता लगाने योग्य समरूप नहीं थे। इन विश्लेषणों से स्यूडोमोनडोटा के साथ कई संभावित समरूपता का भी पता चला।[7][8]
जातिवृत्त
16S rRNA based LTP_01_2022[9][10][11] | 120 marker proteins based GTDB 07-RS207[12][13][14] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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वर्गीकरण पद्धति
वर्तमान में स्वीकृत वर्गीकरण पद्धति प्रोकैरियोटिक नामों की सूची के साथ स्टैंडिंग इन नोमेनक्लेचर (LPSN)[15] और नेशनल सेंटर फॉर बायोटेक्नोलॉजी इन्फॉर्मेशन (NCBI) पर आधारित है।[16]
- उपवंश "सीए (Ca.) एपिक्सेनोसोमा" बाउर एट अल। 2005
- उपवंश "सीए न्यूक्लियोकोकस" कॉरिग। सातो एट अल। 2014
- उपवंश "सीए ऑर्गेनिकेला" विलियम्स एट अल। 2021
- उपवंश "सीए राइजोस्फेरिया" नून्स दा रोचा 2010
- वर्ग ओपिटुए चू एट अल। 2007
- क्रम ओपिटुटेल्स चू एट अल। 2007
- वंश "सेरासिकोकेसी" पालेन, रोड्रिग्ज-आर और अलीखान 2022 [केसीटीसी (KCTC)-12870]
- उपवंश रूफिकोकस लिन एट अल। 2017
- उपवंश सेरासिकोकोकस यून एट अल। 2007
- वंश "कोरालियोमार्गेरिटेसी" पल्लेन, रोड्रिगेज-आर और अलीखान 2022 [डीएसएम (DSM)-45221]
- उपवंश "लेंटिमोनस" चू एंड चो 2006
- उपवंश कोरालियोमार्गरिटा यून एट अल। 2007
- वंश "मर्डौसियासी" पालेन, रोड्रिग्ज-आर और अलीखान 2022 [सीएजी (CAG)-312]
- उपवंश "सीए मर्डौसिया" गिलरॉय एट अल। 2021
- वंश "मोनीबैक्टीरिया" पालेन, रोड्रिगेज-आर और अलीखान 2022 [यूबीए (UBA)2987]
- उपवंश "सीए मोनिबैक्टर" कोरिग। वोसबर्ग, मार्टिजन और एट्टेमा 2018
- वंश ओपिटुटेसी चू एट अल। 2007
- उपवंश अल्टेरोकोकस शीह और जीन 1999
- उपवंश सेफलोटिककोकस लिन एट अल। 2016
- उपवंश "सीए डिडेम्निडिटुटस" कॉरिग। लोपेरा एट अल। 2017
- उपवंश एरेबोग्लोबस टेग्टमेयर एट अल। 2018
- उपवंश "जेमिनिस्फेरा" वर्ट्ज़ एट अल। 2018
- उपवंश "लैकुनिस्पेरा" रैस्ट एट अल। 2017
- उपवंश निब्रिकोकस बेक एट अल। 2019
- उपवंश ओलिहारेनिकोला रोचमैन एट अल। 2018
- उपवंश ओपिटुटस चिन एट अल। 2001
- उपवंश पेलागिकोकस यून एट अल. 2007
- उपवंश रारिग्लोबस पिट एट अल। 2020
- उपवंश सीए सिनोइकहाबिटन्स मूर्रे एट अल. 2021
- वंश पुनिसिकोकासेई चू एट अल। 2007
- उपवंश "सीए फ्यूसिवोरैक्स" ओरेलाना एट अल। 2022
- उपवंश "सीए मार्सेलियस" निक्सन एट अल। 2019
- उपवंश "सीए पेलागिस्फेरा" बार-शालोम एट अल। 2023
- उपवंश "सीए पिंगुइकोकस" सेरा एट अल। 2020
- उपवंश पुनिसिकोकस चू एट अल। 2007
- वंश "स्पाइराडोसोमैटेसी" पालेन, रोड्रिगेज-आर और अलीखान 2022 [यूबीए (UBA)953]
- जीनस "सीए स्पाइराडोसोमा" गिलरॉय एट अल। 2021
- वंश वेरुको-01
- उपवंश ओशिनिपुलक्रिटूडो फेंग एट अल। 2020
- वंश "सेरासिकोकेसी" पालेन, रोड्रिग्ज-आर और अलीखान 2022 [केसीटीसी (KCTC)-12870]
- क्रम ओपिटुटेल्स चू एट अल। 2007
- वर्ग "मिथाइलएसिडिफिलम"
- क्रम "मिथाइलएसिडिफिलेस" ओप डेन कैंप 2009 ["लिमिस्पेरालेस" पोडोसोकोर्स्काया एट अल। 2022]
- वंश मिथाइलएसिडिफिलेसी ओप डेन कैंप 2009
- उपवंश "मिथाइलएसिडिमाइक्रोबियम" वैन टीस्लिंग एट अल। 2014
- उपवंश "मिथाइलएसिडिफिलम" होउ एट अल। 2008
- उपवंश सीए "मिथाइलएसिडिथर्मस" पिकोन एट अल। 2021
- परिवार NGM72-4
- जीनस सीमा क्षेत्र Anders et al. 2015
- परिवार पेडोस्फेरेसिया
- जीनस पेडोस्फेरा Ozyurt 2008
- वंश मिथाइलएसिडिफिलेसी ओप डेन कैंप 2009
- क्रम "मिथाइलएसिडिफिलेस" ओप डेन कैंप 2009 ["लिमिस्पेरालेस" पोडोसोकोर्स्काया एट अल। 2022]
- क्लास टेरिमाइक्रोबिया García-López et al. 2020
- ऑर्डर Terrimicrobiales García-López et al. 2020
- परिवार Chthoniobacteraceae Sangwan et al. 2004
- वंश Chthoniobacter Sangwan et al. 2004
- फैमिली Terrimicrobiaceae García-López et al. 2020
- जीनस टेरिमाइक्रोबियम Qiu et al. 2014
- परिवार UBA10450
- जीनस सीए। Udaeobacter Brewer et al. 2016
- परिवार [[Xiphinematobacteraceae]]
- जीनस सीए। Xiphinematobacter Vandekerckhove et al. 2000
- परिवार Chthoniobacteraceae Sangwan et al. 2004
- ऑर्डर Terrimicrobiales García-López et al. 2020
- क्लास वेरुकोमिक्रोबिया Hedlund et al. 1998
- ऑर्डर वेरुकोमाइक्रोबियल्स Ward-Rainey et al. 1996
- फैमिली एकरमैनसियासी Hedlund & Derrien 2012
- जीनस एकरमैनसिया Derrien et al. 2004
- जीनस हेलोफेरुला Yoon et al. 2008
- जीनस ल्यूटोलिबैक्टर Yoon et al. 2008
- वंश Persicirhabdus Yoon et al. 2008
- जीनस रूब्रिटालिया Scheuermayer et al. 2006
- जीनस रोसिबैसिलस Yoon et al. 2008
- फैमिली वेरुकोमाइक्रोबिएसी Ward-Rainey et al. 1996
- जीनस फ्यूकोफिलस Sakai et al. 2001b
- जीनस ब्रेविफोलिस Otsuka et al. 2013
- जीनस ओशिनिफेरुला Jin et al. 2022
- वंश Phragmitibacter Szuróczki et al. 2021
- जीनस प्रोस्थेकोबैक्टर Staley et al. 1976 ex Staley et al. 1980
- जीनस रोजीमाइक्रोबियम Otsuka et al. 2013
- जीनस सल्फ्यूरोसेकोकस फेंग एट अल। 2022
- जीनस टेरिमाइक्रोबियम Qiu et al. 2014
- जीनस वेरुकोमिक्रोबियम Schlesner 1988
- फैमिली एकरमैनसियासी Hedlund & Derrien 2012
- ऑर्डर वेरुकोमाइक्रोबियल्स Ward-Rainey et al. 1996
यह भी देखें
- जीवाणु क्रमों की सूची
- जीवाणु प्रजातियों की सूची
संदर्भ
- ↑ White, Richard Allen; Bottos, Eric M.; Roy Chowdhury, Taniya; Zucker, Jeremy D.; Brislawn, Colin J.; Nicora, Carrie D.; Fansler, Sarah J.; Glaesemann, Kurt R.; Glass, Kevin; Jansson, Janet K. (2016-06-28). Langille, Morgan (ed.). "मॉलिक्यूलो लॉन्ग-रीड सीक्वेंसिंग फैसिलिटेट असेंबली एंड जीनोमिक बिनिंग फ्रॉम कॉम्प्लेक्स सॉइल मेटाजेनोम्स". mSystems (in English). 1 (3): mSystems.00045–16, e00045–16. doi:10.1128/mSystems.00045-16. ISSN 2379-5077. PMC 5069762. PMID 27822530.
- ↑ Cho J, Vergin K, Morris R, Giovannoni S (2004). "लेंटिस्पेरा अरनेओसा जीन। नव., सपा. नोव, समुद्री जीवाणु पैदा करने वाला एक पारदर्शी एक्सोपॉलीमर, और एक उपन्यास बैक्टीरियल फाइलम, लेंटिसफेरी का विवरण". Environ Microbiol. 6 (6): 611–21. doi:10.1111/j.1462-2920.2004.00614.x. PMID 15142250.
- ↑ Gupta RS, Bhandari V, Naushad HS (2012). "बैक्टीरिया के पीवीसी क्लैड (प्लैक्टोमाइसेट्स, वेरुकोमिक्रोबिया, क्लैमाइडिया, और लेंटिसफेरे) के लिए आणविक हस्ताक्षर उनके विकासवादी संबंधों में अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं". Front Microbiol. 3: 327. doi:10.3389/fmicb.2012.00327. PMC 3444138. PMID 23060863.
- ↑ Gupta RS (2016). "Impact of genomics on the understanding of microbial evolution and classification: the importance of Darwin's views on classification". FEMS Microbiol Rev. 40 (4): 520–53. doi:10.1093/femsre/fuw011. PMID 27279642.
- ↑ Griffiths E, Gupta RS (2007). "प्रोटीन में फाइलोजेनी और साझा संरक्षित आवेषण इस बात का प्रमाण देते हैं कि वेरुकोमिक्रोबिया क्लैमाइडिया के निकटतम ज्ञात मुक्त-जीवित रिश्तेदार हैं". Microbiology. 153 (Pt 8): 2648–54. doi:10.1099/mic.0.2007/009118-0. PMID 17660429. S2CID 2094762.
- ↑ Wagner, M; Horn, M (2006). "प्लैक्टोमाइसेट्स, वेरुकोमिक्रोबिया, क्लैमाइडिया और बहन फ़ाइला में जैव प्रौद्योगिकी और चिकित्सा प्रासंगिकता के साथ एक सुपरफिलम शामिल है।". Current Opinion in Biotechnology. 17 (3): 241–9. doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005. PMID 16704931.
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