नैनोआर्कियोटा: Difference between revisions

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* "[[Parvarchaeota]]" <small>Rinke et al. 2013</small>
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नैनोआर्कियोटा (ग्रीक, बौना या छोटा प्राचीन एक) [[आर्किया]] डोमेन में एक प्रस्तावित फाइलम (जीव विज्ञान) ('कैंडिडेटस' नैनोआर्कियोटा) है<ref>See the [[National Center for Biotechnology Information|NCBI]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=192989 webpage on Nanoarchaeota].  Data extracted from the {{cite web | url=http://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/ | title=NCBI taxonomy resources | publisher=[[National Center for Biotechnology Information]] | access-date=2007-03-19}}</ref> वर्तमान में इसका केवल एक प्रतिनिधि है, [[ नैनोआर्कियम इक्वेटेंस ]], जिसे एक पनडुब्बी [[ हाइपोथर्मल वेंट ]] में खोजा गया था और पहली बार 2002 में वर्णित किया गया था।<ref name=":6" />
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नैनोआर्कियोटा (ग्रीक, बौना या छोटा प्राचीन एक) आर्किया डोमेन में एक प्रस्तावित फाइलम (जीव विज्ञान) ('कैंडिडेटस' नैनोआर्कियोटा) है[1] वर्तमान में इसका केवल एक प्रतिनिधि है, नैनोआर्कियम इक्वेटेंस , जिसे एक पनडुब्बी हाइपोथर्मल वेंट में खोजा गया था और पहली बार 2002 में वर्णित किया गया था।[2]


टैक्सोनॉमी

नैनोआर्कियोटा के सदस्य विभिन्न मेजबान जीवों और पर्यावरणीय परिस्थितियों से जुड़े हुए हैं। <रेफरी नाम = मुनसन-मैकगी 7860-7868>{{Cite journal |last1=Munson-McGee |first1=Jacob H. |last2=Field |first2=Erin K. |last3=Bateson |first3=Mary |last4=Rooney |first4=Colleen |last5=Stepanauskas |first5=Ramunas |last6=Young |first6=Mark J. |date=2015-11-15 |editor-last=Wommack |editor-first=K. E. |title=येलोस्टोन नेशनल पार्क हॉट स्प्रिंग्स में नैनोआर्कियोटा, उनका सल्फोलोबेल्स होस्ट, और नैनोआर्कियोटा वायरस वितरण|journal=Applied and Environmental Microbiology |language=en |volume=81 |issue=22 |pages=7860–7868 |bibcode=2015ApEnM..81.7860M |doi=10.1128/AEM.01539-15 |issn=0099-2240 |pmc=4616950 |pmid=26341207}</ref> छोटे आकार, एक कम जीनोम और सीमित श्वसन के बावजूद, नैनोआर्कियोटा के सदस्यों में असामान्य चयापचय विशेषताएं हैं। उदाहरण के लिए, एन। इक्विटन्स में एक जटिल और अत्यधिक विकसित अंतरकोशिकीय संचार प्रणाली है। रेफरी>Jarett, Jessica K.; Nayfach, Stephen; Podar, Mircea; Inskeep, William; Ivanova, Natalia N.; Munson-McGee, Jacob; Schulz, Frederik; Young, Mark; Jay, Zackary J.; Beam, Jacob P.; Kyrpides, Nikos C.; Malmstrom, Rex R.; Stepanauskas, Ramunas; Woyke, Tanja (2018-09-17). "सह-सॉर्ट किए गए नैनोआर्कियोटा के एकल-कोशिका जीनोमिक्स उपन्यास पुटेटिव होस्ट संघों और सहजीवन में शामिल प्रोटीन के विविधीकरण का सुझाव देते हैं". Microbiome. 6 (1): 161. doi:10.1186/s40168-018-0539-8. ISSN 2049-2618. PMC 6142677. PMID 30223889.</ref>

नैनोआर्कियोटा के फाइलोजेनी को इसके एकमात्र सुसंस्कृत प्रतिनिधि, नैनोआर्कियम इक्विटन्स द्वारा लंगर डाला गया है, जो अन्य आर्किया की तुलना में एक अलग विकासवादी समूह में क्लस्टर करता है, रेफरी>Castelle, Cindy J.; Banfield, Jillian F. (2018). "प्रमुख नए माइक्रोबियल समूह विविधता का विस्तार करते हैं और जीवन के वृक्ष की हमारी समझ को बदलते हैं". Cell. 172 (6): 1181–1197. doi:10.1016/j.cell.2018.02.016. ISSN 0092-8674.</ref>[3] जिन्हें हाल ही में पुनर्वर्गीकृत किया गया है। आगे के विश्लेषण से पता चला है कि 16S rRNA अनुक्रम द्वारा इंगित किए गए अनुसार, आर्किया के विकास में N. इक्विटन्स जल्दी से अलग हो गए। इससे पता चलता है कि वे इस समूह के भीतर एक गहरी शाखाओं में बँधे हुए हैं।[4] वर्तमान में स्वीकृत टैक्सोनॉमी नामकरण में स्थायी (LPSN) के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची पर आधारित है।[5] और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र (एनसीबीआई)।[6]

Phylogeny of Nanoarchaeota[7][8][9]
 
 
"Tiddalikarchaeales"
"Tiddalikarchaeaceae"

"Ca. Tiddalikarchaeum anstoanum"

 
 
"Parvarchaeales"
"Parvarchaeaceae"
 

"Ca. Acidifodinimicrobium mancum"

 
"Ca. Parvarchaeum"
 

"Ca. P. acidiphilum"

 
 

"Ca. P. paracidiphilum"

 
 
 
 
 
 
 
 

"Pacearchaeales"

 
 

"Woesearchaeales"

 
 
 
"Nanoarchaeales"
"Nanoarchaeaceae"

"Nanoarchaeum equitans"

 
"Nanopusillaceae"
 

"Ca. Nanoclepta minuta"

 
 
 

Nanobdella aerobiophila

 
 
"Ca. Nanopusillus"
 

"Ca. N. acidilobi"

 
 

"Ca. N. stetteri"

 
 
 
 
 
 
 
 
 
  • क्लास नैनोआर्किया Vazquez-Campos et al. 2021[10][नैनोआर्किया Huber et al. 2011;[11] नैनोबडेलिया Kato et al. 2022[12]]
    • ऑर्डर जिंगवीआर्चेलेस Rao et al. 2023
      • परिवार हैयानार्चेएसी Rao et al. 2023
        • लिंग? हैयानार्चियम के लिए एक उम्मीदवार Rao et al. 2023
          • सीए। एच। थर्मोफिलम Rao et al. 2023
      • परिवार जिंगवीआर्चेएसी Rao et al. 2023
    • ऑर्डर नैनोआर्कीलेस Huber et al. 2011[11][नैनोबडेलेस Kato et al. 2022[12]
      • फैमिली नैनोआर्कियासी Huber et al. 2011[11]**** जीनस नैनोआर्कियम Huber et al. 2002[2]
          • नैनोआर्कियम इक्वेटेंस|एन. equitans Huber et al. 2002[2]*** फैमिली नैनोपुसिलेसी Huber et al. 2011[11][नैनोबडेलेसी Kato et al. 2022[12]
        • जीनस नैनोबडेला Kato et al. 2022[12]***** एन एरोबियोफिला Kato et al. 2022[12]
        • उम्मीदवार जीनस नैनोक्लेप्टा St. John et al. 2019[13]
          • पसंद करना। एन मिनट St. John et al. 2019[13]**** जीनस कैंडिडा नैनोपुसिलस Wurch et al. 2016[14] ***** पसंद करना। एन एसिडिलोबी Wurch et al. 2016[14]
          • सीए एन स्टेटेरी (Castelle et al. 2015) Rinke et al. 2020[15]
    • ऑर्डर टिड्डलिकरचेलेस Vazquez-Campos et al. 2021[10]
      • परिवार Tiddalikarcaeaceae Vazquez-Campos et al. 2021[10]
        • वंश कैंडिडा Tiddalikarcchaeum Vazquez-Campos et al. 2021[10]
          • सीए। टी. एनस्टोनम Vazquez-Campos et al. 2021[10]
    • आदेश Parvarchaeales Rinke et al. 2020[15]*** परिवार Parvarchaeaceae Rinke et al. 2020[15][एसिडीफोडिनिमाइक्रोबिएसी Luo et al. 2020[16]]
        • लिंग? रेहैराचियम किण्वन के लिए एक उम्मीदवार Rao et al. 2023
          • सीए। आर किण्वक Rao et al. 2023
        • जीनस कैंडिडा एसिडीफोडिनिमाइक्रोबियम Luo et al. 2020[16]***** सीए। एक खाना Luo et al. 2020[16]**** उम्मीदवार जीनस परवरचेयम Baker et al. 2010[17]
          • ? यहाँ। पी. टेंगचोंगेंस Rao et al. 2023 ***** सीए। पी। एसिडिफिलम Baker et al. 2010 [17]
          • सीए पी पैरासिडीफिलम corrig. Baker et al. 2010 [17]
नैनोआर्कियम इक्वेटेंस

विशेषताएं

N. इक्वेटान की कोशिकाएँ गोलाकार होती हैं जिनका व्यास लगभग 400 nm होता है,[18] और केवल 490,885 आधार जोड़े वाले पूरे जीनोम के साथ एक बहुत ही छोटा और कॉम्पैक्ट डीएनए अनुक्रम है।[3]जबकि उनके पास प्रसंस्करण और मरम्मत करने के लिए आनुवंशिक कोड है, वे लिपिड, अमीनो-एसिड, कॉफ़ेक्टर या न्यूक्लियोटाइड संश्लेषण जैसी कुछ जैवसंश्लेषण और चयापचय प्रक्रियाओं को पूरा नहीं कर सकते हैं।[3]इसकी सीमित मशीनरी के कारण, यह एक बाध्यकारी परजीवी है, जो केवल आर्किया में जाना जाता है।[3]उनके असामान्य एसएस आरआरएनए अनुक्रमों के कारण, मानक पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन विधियों का उपयोग करके उनका पता लगाना मुश्किल है।[19] एन। इक्विटन्स की कोशिकाओं में 15 एनएम जाली स्थिरांक के साथ छह गुना समरूपता वाली सामान्य एस-परत होती है।[19]


जीनोम संरचना

100 और 400 एनएम व्यास के बीच की छोटी कोशिकाएं और 0.491-0.606 एमबीपी के अत्यधिक सुव्यवस्थित जीनोम नैनोआर्कियोट्स की विशेषता बताते हैं।[20] वर्णित नैनोआर्कियोट्स के जीनोम कमी की विभिन्न डिग्री प्रदर्शित करते हैं, जो एक मेजबान निर्भर जीवन शैली के साथ संगत है।[21] कुछ नैनोआर्कियोट्स में अभी भी CRISPR-Cas सिस्टम, आर्कियल फ्लैगेला और ग्लूकोनोजेनेसिस मार्ग के लिए जीन हैं।[22]


आवास

नैनोआर्कियोट्स बाध्यकारी सहजीवन हैं जो इग्नीकोकस के रूप में जाने वाले पुरातन मेजबान से जुड़े होते हैं।[23] दोनों स्थलीय गर्म झरनों और पानी के नीचे के जलतापीय झरोखों से जीनस नैनोआर्कियम में आइसोलेट्स निकले हैं। <रेफरी नाम = एमिल्स 2011 1106–1106 >{{Citation |last=Amils |first=Ricardo |title=Nanoarchaeota |date=2011 |url=https://doi.org/10.1007/978-3-642-11274-4_1040 |encyclopedia=Encyclopedia of Astrobiology |pages=1106 |editor-last=Gargaud |editor-first=Muriel |access-date=2023-04-08 |place=Berlin, Heidelberg |publisher=Springer |language=en |doi=10.1007/978-3-642-11274-4_1040 |isbn=978-3-642-11274-4 |editor2-last=Amils |editor2-first=Ricardo |editor3-last=Quintanilla |editor3-first=José Cernicharo |editor4-last=Cleaves |editor4-first=Henderson James (Jim)}</ref> हालांकि, इस बात के प्रमाण हैं कि नैनोआर्कियोट समुद्री थर्मल वेंट के बाहर विभिन्न प्रकार के आवासों में रहते हैं।[24]  नैनोआर्कियोटा के सदस्यों के लिए आनुवंशिक प्रमाण व्यापक रूप से पाए गए हैं नैनोआर्कियम इक्वेटन्स के 16S rRNA जीन के अनुक्रम के आधार पर बनाए गए प्राइमरों का उपयोग करते हुए स्थलीय गर्म झरने और मेसोफिलिक हाइपरसैलिन आवास। <रेफरी नाम = मुनसन-मैक्गी 7860-7868 /> इसके अलावा, फोटो-ज़ोन पानी के नमूनों में राइबोसोमल अनुक्रमों की खोज की गई हाइड्रोथर्मल वेंट से दूर इस संभावना को बढ़ाता है कि नैनोआर्कियोटा आर्किया का एक सर्वव्यापी और विविध समूह है जो विभिन्न प्रकार के तापमान और भू-रासायनिक सेटिंग्स वाले आवासों में रह सकता है।[24]

चयापचय

हालांकि नैनोआर्कियोटा के सदस्यों का अधिकांश चयापचय अज्ञात है, इसका मेजबान एक ऑटोट्रॉफ़ है जो एक इलेक्ट्रॉन स्वीकर्ता और एच के रूप में मौलिक सल्फर पर बढ़ता है।2 एक इलेक्ट्रॉन दाता के रूप में। <रेफरी नाम = एमिल्स 2011 1106-1106 /> अधिकांश मान्यता प्राप्त चयापचय प्रक्रियाएं, जैसे कि अमीनो एसिड, न्यूक्लियोटाइड्स और कोएंजाइम जैसे मोनोमर का निर्माण, इस जीव में पहचानने योग्य जीन की कमी है। <रेफरी नाम = एमिल्स 2011 1106–1106 />

यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ See the NCBI webpage on Nanoarchaeota. Data extracted from the "NCBI taxonomy resources". National Center for Biotechnology Information. Retrieved 2007-03-19.
  2. ↑ 2.0 2.1 2.2 Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Fuchs, Tanja; Wimmer, Verena C.; Stetter, Karl O. (May 2002). "आर्किया का एक नया संघ एक नैनोसाइज्ड हाइपरथर्मोफिलिक सीबम द्वारा दर्शाया गया है". Nature (in English). 417 (6884): 63–67. Bibcode:2002Natur.417...63H. doi:10.1038/417063a. ISSN 1476-4687. PMID 11986665. S2CID 4395094.
  3. ↑ 3.0 3.1 3.2 3.3 Waters, Elizabeth; Hohn, Michael J.; Ahel, Ivan; Graham, David E.; Adams, Mark D.; Barnstead, Mary; Beeson, Karen Y.; Bibbs, Lisa; Bolanos, Randall; Keller, Martin; Kretz, Keith; Lin, Xiaoying; Mathur, Eric; Ni, Jingwei; Podar, Mircea (2003-10-28). "The genome of Nanoarchaeum equitans: Insights into early archaeal evolution and derived parasitism". Proceedings of the National Academy of Sciences (in English). 100 (22): 12984–12988. Bibcode:2003PNAS..10012984W. doi:10.1073/pnas.1735403100. ISSN 0027-8424. PMC 240731. PMID 14566062.
  4. ↑ Garrett, Roger A.; Klenk, Hans-Peter, eds. (2006-12-08). आर्किया (in English). Malden, MA, USA: Blackwell Publishing Ltd. doi:10.1002/9780470750865. ISBN 978-0-470-75086-5.
  5. ↑ J.P. Euzéby. "संघ "उम्मीदवार नैनोआर्कियोटा"". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2021-11-17.
  6. ↑ Sayers; et al. "नैनोआर्कियोटा". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2021-06-05.
  7. ↑ "GTDB release 08-RS214". Genome Taxonomy Database. Retrieved 6 December 2021.
  8. ↑ "ar53_r214.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2023.
  9. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 6 December 2021.
  10. ↑ 10.0 10.1 10.2 10.3 10.4 Vázquez-Campos, Xabier; Kinsela, Andrew S.; Bligh, Mark W.; Payne, Timothy E.; Wilkins, Marc R.; Waite, T. David (2021). "एक ऑस्ट्रेलियाई रेडियोधर्मी विरासत स्थल में रहने वाले आर्किया में जीनोमिक अंतर्दृष्टि". Frontiers in Microbiology. 12: 732575. doi:10.3389/fmicb.2021.732575. ISSN 1664-302X. PMC 8561730. PMID 34737728.
  11. ↑ 11.0 11.1 11.2 11.3 Trujillo, Martha E; Dedysh, Svetlana; DeVos, Paul; Hedlund, Brian; Kämpfer, Peter; Rainey, Fred A; Whitman, William B, eds. (2015-04-17). आर्किया और बैक्टीरिया के सिस्टमैटिक्स के बर्गी मैनुअल (in English) (1 ed.). Wiley. doi:10.1002/9781118960608.obm00129. ISBN 978-1-118-96060-8.
  12. ↑ 12.0 12.1 12.2 12.3 12.4 Kato, Shingo; Ogasawara, Ayaka; Itoh, Takashi; Sakai, Hiroyuki D.; Shimizu, Michiru; Yuki, Masahiro; Kaneko, Masanori; Takashina, Tomonori; Ohkuma, MoriyaYR 2022 (2022). "नैनोबडेला एरोबियोफिला जीन। नव., सपा. नोव।, एक थर्मोएसिडोफिलिक, एक्टोसिम्बायोटिक आर्कियन को बाध्य करता है, और नैनोबडेलेसी ​​परिवार का प्रस्ताव। नव., नैनोबडेलेस ऑर्ड. नवम्बर और नैनोबडेलिया वर्ग। नवम्बर". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 72 (8): 005489. doi:10.1099/ijsem.0.005489. ISSN 1466-5034. PMID 35993221. S2CID 251720962. {{cite journal}}: zero width space character in |title= at position 122 (help)
  13. ↑ 13.0 13.1 St. John, Emily; Liu, Yitai; Podar, Mircea; Stott, Matthew B.; Meneghin, Jennifer; Chen, Zhiqiang; Lagutin, Kirill; Mitchell, Kevin; Reysenbach, Anna-Louise (2019-01-01). "न्यूजीलैंड के गर्म पानी के झरने से एक नया सहजीवी नैनोआर्कियोट (कैंडिडैटस नैनोक्लेप्टा माइनस) और इसका मेजबान (जेस्टोस्फेरा टिकिटेरेन्सिस जेन. नव., एसपी. नव.)". Systematic and Applied Microbiology. Taxonomy of uncultivated Bacteria and Archaea (in English). 42 (1): 94–106. doi:10.1016/j.syapm.2018.08.005. ISSN 0723-2020. OSTI 1470848. PMID 30195930. S2CID 52178746.
  14. ↑ 14.0 14.1 Wurch, Louie; Giannone, Richard J.; Belisle, Bernard S.; Swift, Carolyn; Utturkar, Sagar; Hettich, Robert L.; Reysenbach, Anna-Louise; Podar, Mircea (2016-07-05). "एक स्थलीय भूतापीय वातावरण से जीनोमिक्स-सूचित अलगाव और सहजीवी नैनोआर्कियोटा प्रणाली का लक्षण वर्णन". Nature Communications (in English). 7 (1): 12115. Bibcode:2016NatCo...712115W. doi:10.1038/ncomms12115. ISSN 2041-1723. PMC 4935971. PMID 27378076.
  15. ↑ 15.0 15.1 15.2 Rinke, Christian; Chuvochina, Maria; Mussig, Aaron J.; Chaumeil, Pierre-Alain; Davin, Adrian A.; Waite, David W.; Whitman, William B.; Parks, Donovan H.; Hugenholtz, Philip (2021-02-17). "रैंक-सामान्यीकृत जीनोम-आधारित टैक्सोनॉमी के आधार पर व्यापक अपूर्ण और असमान पुरातन वर्गीकरणों को हल करना". Nature Microbiology (in English): 2020.03.01.972265. doi:10.1101/2020.03.01.972265. S2CID 231984712.
  16. ↑ 16.0 16.1 16.2 Luo, Zhen-Hao; Li, Qi; Lai, Yan; Chen, Hao; Liao, Bin; Huang, Li-nan (2020). "एसिड माइन ड्रेनेज सेडिमेंट्स में एक उपन्यास परवरचाओटा परिवार की विविधता और जीनोमिक विशेषता". Frontiers in Microbiology. 11: 612257. doi:10.3389/fmicb.2020.612257. ISSN 1664-302X. PMC 7779479. PMID 33408709.
  17. ↑ 17.0 17.1 17.2 Baker, Brett J.; Comolli, Luis R.; Dick, Gregory J.; Hauser, Loren J.; Hyatt, Doug; Dill, Brian D.; Land, Miriam L.; VerBerkmoes, Nathan C.; Hettich, Robert L.; Banfield, Jillian F. (2010-05-11). "गूढ़, अतिसूक्ष्म, असंस्कृत आर्किया". Proceedings of the National Academy of Sciences (in English). 107 (19): 8806–8811. Bibcode:2010PNAS..107.8806B. doi:10.1073/pnas.0914470107. ISSN 0027-8424. PMC 2889320. PMID 20421484.
  18. ↑ Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Fuchs, Tanja; Wimmer, Verena C.; Stetter, Karl O. (May 2002). "आर्किया का एक नया संघ एक नैनोसाइज्ड हाइपरथर्मोफिलिक सीबम द्वारा दर्शाया गया है". Nature (in English). 417 (6884): 63–67. Bibcode:2002Natur.417...63H. doi:10.1038/417063a. ISSN 1476-4687. PMID 11986665. S2CID 4395094.
  19. ↑ 19.0 19.1 Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Fuchs, Tanja; Wimmer, Verena C.; Stetter, Karl O. (2002-05-02). "आर्किया का एक नया संघ एक नैनोसाइज्ड हाइपरथर्मोफिलिक सीबम द्वारा दर्शाया गया है". Nature (in English). 417 (6884): 63–67. Bibcode:2002Natur.417...63H. doi:10.1038/417063a. ISSN 0028-0836. PMID 11986665. S2CID 4395094.
  20. ↑ "Nanoarchaeota - an overview | ScienceDirect Topics". www.sciencedirect.com. Retrieved 2023-04-08.
  21. ↑ "Nanoarchaeota - an overview | ScienceDirect Topics". www.sciencedirect.com. Retrieved 2023-04-08.
  22. ↑ "Nanoarchaeota - an overview | ScienceDirect Topics". www.sciencedirect.com. Retrieved 2023-04-08.
  23. ↑ Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Stetter, Karl O. (2006), Dworkin, Martin; Falkow, Stanley; Rosenberg, Eugene; Schleifer, Karl-Heinz (eds.), "Nanoarchaeota", The Prokaryotes: Volume 3: Archaea. Bacteria: Firmicutes, Actinomycetes (in English), New York, NY: Springer, pp. 274–280, doi:10.1007/0-387-30743-5_14, ISBN 978-0-387-30743-5, retrieved 2023-04-08
  24. ↑ 24.0 24.1 Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named Munson-McGee


अग्रिम पठन

वैज्ञानिक पत्रिकाएँ

वैज्ञानिक पुस्तकें

वैज्ञानिक डेटाबेस

बाहरी संबंध

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