नैनोआर्कियोटा

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नैनोआर्कियोटा कार्यक्षेत्र आर्किया[1] में एक प्रस्तावित संघ है, जिसमें वर्तमान में केवल एक प्रतिनिधि है,नैनोआर्कियम इक्वेटेंस , जिसे एक पनडुब्बी जलतापीय छिद्र में खोजा गया था और पहली बार 2002 में वर्णित किया गया था।[2]


वर्गीकरण

नैनोआर्कियोटा के सदस्य विभिन्न समूह जीवों और पर्यावरणीय परिस्थितियों से जुड़े हुए हैं। छोटे आकार, कम जीनोम और सीमित श्वसन के अतिरिक्त, नैनोआर्कियोटा के सदस्यों में असामान्य उपापचय विशेषताएं हैं। उदाहरण के लिए, N. समीकरण में एक जटिल और अत्यधिक विकसित अंतरकोशिकीय संचार प्रणाली है। [3]

नैनोआर्कियोटा के जातिवृत्त को इसके एकमात्र सुसंस्कृत प्रतिनिधि, नैनोआर्कियम प्रत्यारूढ़ी द्वारा नींव डाली गई है, जो अन्य आर्किया की तुलना में एक अलग विकासवादी समूह में एकत्र करता है,[4] जिन्हें अभी - अभी पुनर्वर्गीकृत किया गया है। आगे के विश्लेषण से पता चला है कि 16S RRNA अनुक्रम द्वारा इंगित किए गए अनुसार, आर्किया के विकास में N. प्रत्यारूढ़ी जल्दी से अलग हो गए है। इससे पता चलता है कि वे इस समूह के अन्दर एक गहरी शाखाओं वाली स्थिति पर अधिकृत कर लेते हैं। [5]

वर्तमान में स्वीकृत वर्गीकरण प्रोकैरियोटिक नामों की सूची के साथ नामावली में स्थित है (LPSN)[6] और जैव प्रौद्योगिकी सूचना के लिए राष्ट्रीय केंद्र (NCBI) पर आधारित है।[7]

Phylogeny of Nanoarchaeota[8][9][10]
 
 
"Tiddalikarchaeales"
"Tiddalikarchaeaceae"

"Ca. Tiddalikarchaeum anstoanum"

 
 
"Parvarchaeales"
"Parvarchaeaceae"
 

"Ca. Acidifodinimicrobium mancum"

 
"Ca. Parvarchaeum"
 

"Ca. P. acidiphilum"

 
 

"Ca. P. paracidiphilum"

 
 
 
 
 
 
 
 

"Pacearchaeales"

 
 

"Woesearchaeales"

 
 
 
"Nanoarchaeales"
"Nanoarchaeaceae"

"Nanoarchaeum equitans"

 
"Nanopusillaceae"
 

"Ca. Nanoclepta minuta"

 
 
 

Nanobdella aerobiophila

 
 
"Ca. Nanopusillus"
 

"Ca. N. acidilobi"

 
 

"Ca. N. stetteri"

 
 
 
 
 
 
 
 
 
  • क्लास "नैनोआर्किया" वाज़क्वेज़-कैम्पोस et al 2021,[11] ["नैनोआर्चिया" ह्यूबर et al 2011;[12] नैनोबडेलिया काटो et al 2022[13]] है।
    • ऑर्डर जिंगवीआर्चेलेस Rao et al 2023 है।
      • फैमिली हैयानार्चेएसी Rao et al 2023 है।
      • फैमिली जिंगवीआर्चेएसी Rao et al 2023 है।
    • ऑर्डर नैनोआर्कीलेस Huber et al 2011,[12] [नैनोबडेलेस Kato et al. 2022 है।[13]
      • फैमिली नैनोआर्कियासी Huber et al 2011 है।[12]
      • जीनस नैनोआर्कियम Huber et al 2002 है।[2]
      • "N. इक्विटन्स" Huber et al 2002 है।[2]
          • फैमिली नैनोपुसिलेसी Huber et al 2011,[2] [नैनोबडेलेसी Kato et al 2022 है।[12][13]
        • जीनस नैनोबडेला Kato et al 2022 है।[13]
        • एन एरोबियोफिला Kato et al 2022 है।[13]
        • जीनस "कैंडिडेटस नैनोक्लेप्टा" St. John et al 2019 है।[14]
          • "Ca. N. मिनुटा" St. John et al 2019 है।[14]
          • जीनस "कैंडिडैटस नैनोपुसिलस" वुर्च et al 2016 है।[15]
          • "Ca. N. एसिडिलोबी" वुर्च et al 2016 है।[15]
          • "Ca. N. स्टेटेरी" (कास्टेल et al. 2015) रिंकी et al 2020 है।[16]
    • ऑर्डर "टिड्डलिकरचैलेस" वाज़क्वेज़-कैम्पोस et al 2021 है।[11]
      • फैमिली "टिड्डलिकार्चेएसी" वाज़क्वेज़-कैम्पोस et al 2021 है।[11]
        • जीनस "कैंडिडैटस टिड्डालिकर्कायम" वाज़क्वेज़-कैम्पोस et al 2021 है।[11]
          • "Ca. T. एनस्टोनम" वाज़क्वेज़-कैम्पोस et al 2021 है।[11]
    • ऑर्डर "परवरचेलेस" रिंकी et al 2020 है।[16]
    • फैमिली "परवरचेएसी" रिंकी et al 2020,[16] ["एसिडिफोडिनीमाइक्रोबिएसी" Luo et al 2020 है।[17]]
        • जीनस "कैंडिडेटस रेहैराचियम फर्मेंटन्स" Rao et al 2023 है।
          • "Ca. R. फर्मेंटन्स" Rao et al 2023 है।
        • जीनस "कैंडिडैटस एसिडिफोडिनीमाइक्रोबियम" Luo et al 2020 है।[17]
        • "Ca. A. मैनकम" Luo et al 2020 है।[17]
        • जीनस "कैंडिडेटस परवरचेयम" Baker et al 2010 है।[18]
          • "Ca. P. टेंगचोंगेंस" Rao et al 2023 है।
          • "Ca. P. एसिडिफिलम" Baker et al 2010 है।[18]
          • "Ca. P. पैरासिडीफिलम" गलियारा। Baker et al 2010 है।[18]
नैनोआर्कियम इक्वेटेंस

विशेषताएं

N. समीकरण की कोशिकाएं लगभग 400 NM के व्यास के साथ गोलाकार होती हैं,[19] और केवल 490,885 आधार जोड़े वाले पूरे जीनोम के साथ एक बहुत ही छोटा और संक्षिप्त DNA अनुक्रम होता है।[4] जबकि उनके पास प्रसंस्करण और पुनर्निर्माण करने के लिए आनुवंशिक कोड है, वे वसा, अमीनो-एसिड, सहगुणक, या न्यूक्लियोटाइड संश्लेषण जैसी कुछ जैवसंश्लेषण और उपापचय प्रक्रियाओं को पूरा नहीं कर सकते हैं। [4] इसकी सीमित मशीनरी के कारण, यह एक बाध्यकारी परजीवी है, जो आर्किया में जाना जाने वाला एकमात्र परजीवी है।[4] उनके असामान्य SS RRNA अनुक्रमों के कारण, मानक पोलीमरेज़ चेन रिएक्शन विधियों का उपयोग करके उनका पता लगाना मुश्किल है।[20] N. समीकरण की कोशिकाओं में 15 NM जाली स्थिरांक के साथ छह गुना समरूपता के साथ एक सामान्य S-परत होती है।[20]


जीनोम संरचना

100 और 400 NM व्यास के बीच की छोटी कोशिकाएं और 0.491-0.606 MBP के अत्यधिक सुव्यवस्थित जीनोम नैनोआर्कियोट्स की विशेषता बताते हैं।[21] वर्णित नैनोआर्कियोट्स के जीनोम कमी की विभिन्न डिग्री प्रदर्शित करते हैं, जो एक पोषक निर्भर जीवन शैली के साथ संगत है।[22] कुछ नैनोआर्कियोट्स में अभी भी CRISPR-Cas सिस्टम, आर्कियल फ्लैगेला और ग्लूकोनियोजेनेसिस मार्ग के लिए जीन हैं।[23]


प्राकृतिक आवास

नैनोआर्कियोट्स बाध्यकारी त्वग्वसा हैं जो इग्नीकोकस के रूप में जाने जाने वाले पुरातन सूत्रधार से जुड़ते हैं।[24] दोनों स्थलीय गर्म झरनों और पानी के नीचे के जलतापीय छिद्रों ने प्रजाति नैनोआर्कियम में अलग-अलग कर दिया है।[27] चूंकि, इस बात के प्रमाण हैं कि नैनोआर्कियोट्स समुद्री तापीय छिद्रों के बाहर विभिन्न प्रकार के आवासों में रहते हैं।[3] नैनोआर्कियोटा के सदस्यों के लिए आनुवंशिक साक्ष्य स्थलीय गर्म झरनों और मेसोफिलिक हाइपरसैलिन आवासों में व्यापक होने के लिए खोजे गए हैं, जो 'नैनोआर्कियम इक्वेटेंस' के 16S rRNA जीन के अनुक्रम के आधार पर बनाए गए प्राइमरों का उपयोग करते हैं।[3] इसके अलावा, हाइड्रोथर्मल वेंट से दूर लिए गए फोटो-ज़ोन के पानी के नमूनों में राइबोसोमल अनुक्रमों की खोज इस संभावना को बढ़ाती है कि नैनोआर्कियोटा आर्किया का एक सर्वव्यापी और विविध समूह है जो विभिन्न प्रकार के तापमान और भू-रासायनिक सेटिंग्स वाले आवासों में रह सकता है।[3]






उपापचय

चूंकि नैनोआर्कियोटा के सदस्यों का अधिकांश उपापचय अज्ञात है, इसका सूत्रधार एक स्वपोषित है जो प्राथमिक सल्फर पर एक इलेक्ट्रॉन स्वीकर्ता के रूप में और H2 एक इलेक्ट्रॉन दाता के रूप में बढ़ता है। [27] बहुसंख्यक मान्यता प्राप्त उपापचय प्रक्रियाएं, जैसे अमीनो एसिड, न्यूक्लियोटाइड्स और कोएंजाइम जैसे मोनोमर्स का निर्माण, इस जीव में पहचानने योग्य प्रजाति की कमी है।

यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ See the NCBI webpage on Nanoarchaeota. Data extracted from the "NCBI taxonomy resources". National Center for Biotechnology Information. Retrieved 2007-03-19.
  2. ↑ 2.0 2.1 2.2 2.3 Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Fuchs, Tanja; Wimmer, Verena C.; Stetter, Karl O. (May 2002). "आर्किया का एक नया संघ एक नैनोसाइज्ड हाइपरथर्मोफिलिक सीबम द्वारा दर्शाया गया है". Nature (in English). 417 (6884): 63–67. Bibcode:2002Natur.417...63H. doi:10.1038/417063a. ISSN 1476-4687. PMID 11986665. S2CID 4395094.
  3. ↑ 3.0 3.1 3.2 3.3 Munson-McGee, Jacob H.; Field, Erin K.; Bateson, Mary; Rooney, Colleen; Stepanauskas, Ramunas; Young, Mark J. (2015-11-15). Wommack, K. E. (ed.). "Nanoarchaeota, Their Sulfolobales Host, and Nanoarchaeota Virus Distribution across Yellowstone National Park Hot Springs". Applied and Environmental Microbiology (in English). 81 (22): 7860–7868. Bibcode:2015ApEnM..81.7860M. doi:10.1128/AEM.01539-15. ISSN 0099-2240. PMC 4616950. PMID 26341207.
  4. ↑ 4.0 4.1 4.2 4.3 Waters, Elizabeth; Hohn, Michael J.; Ahel, Ivan; Graham, David E.; Adams, Mark D.; Barnstead, Mary; Beeson, Karen Y.; Bibbs, Lisa; Bolanos, Randall; Keller, Martin; Kretz, Keith; Lin, Xiaoying; Mathur, Eric; Ni, Jingwei; Podar, Mircea (2003-10-28). "The genome of Nanoarchaeum equitans: Insights into early archaeal evolution and derived parasitism". Proceedings of the National Academy of Sciences (in English). 100 (22): 12984–12988. Bibcode:2003PNAS..10012984W. doi:10.1073/pnas.1735403100. ISSN 0027-8424. PMC 240731. PMID 14566062.
  5. ↑ Garrett, Roger A.; Klenk, Hans-Peter, eds. (2006-12-08). आर्किया (in English). Malden, MA, USA: Blackwell Publishing Ltd. doi:10.1002/9780470750865. ISBN 978-0-470-75086-5.
  6. ↑ J.P. Euzéby. "संघ "उम्मीदवार नैनोआर्कियोटा"". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2021-11-17.
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  9. ↑ "ar53_r214.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2023.
  10. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 6 December 2021.
  11. ↑ 11.0 11.1 11.2 11.3 11.4 Vázquez-Campos, Xabier; Kinsela, Andrew S.; Bligh, Mark W.; Payne, Timothy E.; Wilkins, Marc R.; Waite, T. David (2021). "एक ऑस्ट्रेलियाई रेडियोधर्मी विरासत स्थल में रहने वाले आर्किया में जीनोमिक अंतर्दृष्टि". Frontiers in Microbiology. 12: 732575. doi:10.3389/fmicb.2021.732575. ISSN 1664-302X. PMC 8561730. PMID 34737728.
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  14. ↑ 14.0 14.1 St. John, Emily; Liu, Yitai; Podar, Mircea; Stott, Matthew B.; Meneghin, Jennifer; Chen, Zhiqiang; Lagutin, Kirill; Mitchell, Kevin; Reysenbach, Anna-Louise (2019-01-01). "न्यूजीलैंड के गर्म पानी के झरने से एक नया सहजीवी नैनोआर्कियोट (कैंडिडैटस नैनोक्लेप्टा माइनस) और इसका मेजबान (जेस्टोस्फेरा टिकिटेरेन्सिस जेन. नव., एसपी. नव.)". Systematic and Applied Microbiology. Taxonomy of uncultivated Bacteria and Archaea (in English). 42 (1): 94–106. doi:10.1016/j.syapm.2018.08.005. ISSN 0723-2020. OSTI 1470848. PMID 30195930. S2CID 52178746.
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  17. ↑ 17.0 17.1 17.2 Luo, Zhen-Hao; Li, Qi; Lai, Yan; Chen, Hao; Liao, Bin; Huang, Li-nan (2020). "एसिड माइन ड्रेनेज सेडिमेंट्स में एक उपन्यास परवरचाओटा परिवार की विविधता और जीनोमिक विशेषता". Frontiers in Microbiology. 11: 612257. doi:10.3389/fmicb.2020.612257. ISSN 1664-302X. PMC 7779479. PMID 33408709.
  18. ↑ 18.0 18.1 18.2 Baker, Brett J.; Comolli, Luis R.; Dick, Gregory J.; Hauser, Loren J.; Hyatt, Doug; Dill, Brian D.; Land, Miriam L.; VerBerkmoes, Nathan C.; Hettich, Robert L.; Banfield, Jillian F. (2010-05-11). "गूढ़, अतिसूक्ष्म, असंस्कृत आर्किया". Proceedings of the National Academy of Sciences (in English). 107 (19): 8806–8811. Bibcode:2010PNAS..107.8806B. doi:10.1073/pnas.0914470107. ISSN 0027-8424. PMC 2889320. PMID 20421484.
  19. ↑ Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Fuchs, Tanja; Wimmer, Verena C.; Stetter, Karl O. (May 2002). "आर्किया का एक नया संघ एक नैनोसाइज्ड हाइपरथर्मोफिलिक सीबम द्वारा दर्शाया गया है". Nature (in English). 417 (6884): 63–67. Bibcode:2002Natur.417...63H. doi:10.1038/417063a. ISSN 1476-4687. PMID 11986665. S2CID 4395094.
  20. ↑ 20.0 20.1 Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Fuchs, Tanja; Wimmer, Verena C.; Stetter, Karl O. (2002-05-02). "आर्किया का एक नया संघ एक नैनोसाइज्ड हाइपरथर्मोफिलिक सीबम द्वारा दर्शाया गया है". Nature (in English). 417 (6884): 63–67. Bibcode:2002Natur.417...63H. doi:10.1038/417063a. ISSN 0028-0836. PMID 11986665. S2CID 4395094.
  21. ↑ "Nanoarchaeota - an overview | ScienceDirect Topics". www.sciencedirect.com. Retrieved 2023-04-08.
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  23. ↑ "Nanoarchaeota - an overview | ScienceDirect Topics". www.sciencedirect.com. Retrieved 2023-04-08.
  24. ↑ Huber, Harald; Hohn, Michael J.; Rachel, Reinhard; Stetter, Karl O. (2006), Dworkin, Martin; Falkow, Stanley; Rosenberg, Eugene; Schleifer, Karl-Heinz (eds.), "Nanoarchaeota", The Prokaryotes: Volume 3: Archaea. Bacteria: Firmicutes, Actinomycetes (in English), New York, NY: Springer, pp. 274–280, doi:10.1007/0-387-30743-5_14, ISBN 978-0-387-30743-5, retrieved 2023-04-08


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