वेरुकोमाइक्रोबायोटा
वेरुकोमाइक्रोबायोटा ग्राम-ऋणात्मक जीवाणुओं का एक समूह है जिसमें केवल कुछ वर्णित प्रजातियां सम्मिलित हैं। पहचान की गई प्रजातियों को अलवण जल, समुद्री और मिट्टी के वातावरण और मानव मल से अलग किया गया है। सुकेंद्रकी होस्ट के सहयोग से कई अभी तक अनुपयोगी प्रजातियों की पहचान की गई है, जिसमें उनके युग्मकों में रहने वाले सूत्रकृमि के प्रोटिस्टों और अंतःसहजीवियों के बहिर्वेधी विस्फोटी बाह्य सहजीवी सम्मिलित हैं।[citation needed]
वेरुकोमाइक्रोबायोटा पर्यावरण में प्रचुर मात्रा में हैं, हालांकि अपेक्षाकृत निष्क्रिय हैं।[1] इस संघ को दो सह संघ माने जाते है- पीवीसी (PVC) उच्चसंघ के भीतर क्लैमाइडियोटा (पूर्व में क्लैमाइडिया) और लेंटिसफेरोटा (पूर्व में लेंटिसफेरा)।[2] कई संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स (सीएसआई) की उपस्थिति से पीवीसी समूह के भीतर वेरुकोमाइक्रोबायोटा संघ को पड़ोसी संघ से अलग किया जा सकता है।[3] ये सीएसआई (CSIs) अद्वितीय, सिनैपोमॉर्फिक विशेषताओं का प्रतिनिधित्व करते हैं जो वेरुकोमाइक्रोबायोटा के भीतर सामान्य वंश और अन्य जीवाणुओं के बीच एक स्वतंत्र वंश का सुझाव देते हैं।[4] सीएसआई भी पाए गए हैं जो वेरुकोमाइक्रोबायोटा और क्लैमाइडियोटा द्वारा विशेष रूप से अन्य सभी जीवाणुओं द्वारा साझा किए जाते हैं।[5] ये सीएसआई इस बात का प्रमाण देते हैं कि क्लैमाइडियोटा वेरुकोमाइक्रोबायोटा का निकटतम संबंधी है, और यह कि वे प्लैक्टोमाइसीटेल्स की तुलना में एक दूसरे से अधिक निकटता से संबंधित हैं।
वेरुकोमाइक्रोबायोटा क्लैड प्लेंक्टोबैक्टीरिया में बड़े क्लेड ग्रेसिलिक्यूट्स में हो सकता है।[6]
2008 में, मिथाइलएसिडिफिलम इन्फर्नोरम (2.3 एमबीपी) का पूरा जीनोम प्रकाशित किया गया था। एकल वृत्ताकार गुणसूत्र पर, 2473 पूर्वानुमानित प्रोटीन पाए गए, जिनमें से 731 में कोई पता लगाने योग्य समरूप नहीं थे। इन विश्लेषणों से स्यूडोमोनडोटा के साथ कई संभावित समरूपता का भी पता चला।[7][8]
जातिवृत्त
| 16S rRNA based LTP_01_2022[9][10][11] | 120 marker proteins based GTDB 07-RS207[12][13][14] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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वर्गीकरण पद्धति
वर्तमान में स्वीकृत वर्गीकरण पद्धति प्रोकैरियोटिक नामों की सूची के साथ स्टैंडिंग इन नोमेनक्लेचर (LPSN)[15] और नेशनल सेंटर फॉर बायोटेक्नोलॉजी इन्फॉर्मेशन (NCBI) पर आधारित है।[16]
- उपवंश "सीए (Ca.) एपिक्सेनोसोमा" बाउर एट अल। 2005
- उपवंश "सीए न्यूक्लियोकोकस" कॉरिग। सातो एट अल। 2014
- उपवंश "सीए ऑर्गेनिकेला" विलियम्स एट अल। 2021
- उपवंश "सीए राइजोस्फेरिया" नून्स दा रोचा 2010
- वर्ग ओपिटुए चू एट अल। 2007
- क्रम ओपिटुटेल्स चू एट अल। 2007
- वंश "सेरासिकोकेसी" पालेन, रोड्रिग्ज-आर और अलीखान 2022 [केसीटीसी (KCTC)-12870]
- उपवंश रूफिकोकस लिन एट अल। 2017
- उपवंश सेरासिकोकोकस यून एट अल। 2007
- वंश "कोरालियोमार्गेरिटेसी" पल्लेन, रोड्रिगेज-आर और अलीखान 2022 [डीएसएम (DSM)-45221]
- उपवंश "लेंटिमोनस" चू एंड चो 2006
- उपवंश कोरालियोमार्गरिटा यून एट अल। 2007
- वंश "मर्डौसियासी" पालेन, रोड्रिग्ज-आर और अलीखान 2022 [सीएजी (CAG)-312]
- उपवंश "सीए मर्डौसिया" गिलरॉय एट अल। 2021
- वंश "मोनीबैक्टीरिया" पालेन, रोड्रिगेज-आर और अलीखान 2022 [यूबीए (UBA)2987]
- उपवंश "सीए मोनिबैक्टर" कोरिग। वोसबर्ग, मार्टिजन और एट्टेमा 2018
- वंश ओपिटुटेसी चू एट अल। 2007
- उपवंश अल्टेरोकोकस शीह और जीन 1999
- उपवंश सेफलोटिककोकस लिन एट अल। 2016
- उपवंश "सीए डिडेम्निडिटुटस" कॉरिग। लोपेरा एट अल। 2017
- उपवंश एरेबोग्लोबस टेग्टमेयर एट अल। 2018
- उपवंश "जेमिनिस्फेरा" वर्ट्ज़ एट अल। 2018
- उपवंश "लैकुनिस्पेरा" रैस्ट एट अल। 2017
- उपवंश निब्रिकोकस बेक एट अल। 2019
- उपवंश ओलिहारेनिकोला रोचमैन एट अल। 2018
- उपवंश ओपिटुटस चिन एट अल। 2001
- उपवंश पेलागिकोकस यून एट अल. 2007
- उपवंश रारिग्लोबस पिट एट अल। 2020
- उपवंश सीए सिनोइकहाबिटन्स मूर्रे एट अल. 2021
- वंश पुनिसिकोकासेई चू एट अल। 2007
- उपवंश "सीए फ्यूसिवोरैक्स" ओरेलाना एट अल। 2022
- उपवंश "सीए मार्सेलियस" निक्सन एट अल। 2019
- उपवंश "सीए पेलागिस्फेरा" बार-शालोम एट अल। 2023
- उपवंश "सीए पिंगुइकोकस" सेरा एट अल। 2020
- उपवंश पुनिसिकोकस चू एट अल। 2007
- वंश "स्पाइराडोसोमैटेसी" पालेन, रोड्रिगेज-आर और अलीखान 2022 [यूबीए (UBA)953]
- जीनस "सीए स्पाइराडोसोमा" गिलरॉय एट अल। 2021
- वंश वेरुको-01
- उपवंश ओशिनिपुलक्रिटूडो फेंग एट अल। 2020
- वंश "सेरासिकोकेसी" पालेन, रोड्रिग्ज-आर और अलीखान 2022 [केसीटीसी (KCTC)-12870]
- क्रम ओपिटुटेल्स चू एट अल। 2007
- वर्ग "मिथाइलएसिडिफिलम"
- क्रम "मिथाइलएसिडिफिलेस" ओप डेन कैंप 2009 ["लिमिस्पेरालेस" पोडोसोकोर्स्काया एट अल। 2022]
- वंश मिथाइलएसिडिफिलेसी ओप डेन कैंप 2009
- उपवंश "मिथाइलएसिडिमाइक्रोबियम" वैन टीस्लिंग एट अल। 2014
- उपवंश "मिथाइलएसिडिफिलम" होउ एट अल। 2008
- उपवंश सीए "मिथाइलएसिडिथर्मस" पिकोन एट अल। 2021
- वंश "लिमिस्फेरेसी" पालेन, रोड्रिगेज-आर और अलीखान 2022 [एनजीएम (NGM)72-4]
- उपवंश लिमिसफेरा एंडर्स एट अल। 2015
- वंश "पेडोस्फेरेसिया"
- उपवंश "पेडोस्फेरा" ओज़्यूर्ट 2008
- वंश मिथाइलएसिडिफिलेसी ओप डेन कैंप 2009
- क्रम "मिथाइलएसिडिफिलेस" ओप डेन कैंप 2009 ["लिमिस्पेरालेस" पोडोसोकोर्स्काया एट अल। 2022]
- वर्ग टेरिमाइक्रोबिया गार्सिया-लोपेज़ एट अल। 2020
- क्रम टेरीमाइक्रोबियल्स गार्सिया-लोपेज़ एट अल। 2020 ["चथोनियोबैक्टेरेल्स" सांगवान एट अल। 2004]
- वंश "चथोनियोबैक्टीरिया" सांगवान एट अल। 2004
- उपवंश "चथोनियोबैक्टर" सांगवान एट अल। 2004
- वंश टेरिमाइक्रोबिएसी गार्सिया-लोपेज़ और अन्य। 2020
- उपवंश टेरिमाइक्रोबियम किउ एट अल। 2014
- वंश "उडेओबैक्टीरिया" पालेन, रोड्रिगेज-आर और अलीखान 2022 [UBA10450]
- उपवंश "सीए उडेओबैक्टर" ब्रेवर एट अल। 2016
- वंश "ज़िफिनेमेटोबैक्टीरिया"
- उपवंंश "सीए ज़िफ़िनेमेटोबैक्टर" वांडेकेर्कखोव एट अल। 2000
- वंश "चथोनियोबैक्टीरिया" सांगवान एट अल। 2004
- क्रम टेरीमाइक्रोबियल्स गार्सिया-लोपेज़ एट अल। 2020 ["चथोनियोबैक्टेरेल्स" सांगवान एट अल। 2004]
- वर्ग वेरुकोमाइक्रोबिया हेडलंड एट अल। 1998
- क्रम वेरुकोमाइक्रोबियल्स वार्ड-रेनी एट अल। 1996
- वंश एकरमैनसियासी हेडलंड एंड डेरियन 2012
- उपवंंश एकरमेंसिया डेरिएन एट अल। 2004
- उपवंंश हेलोफ़ेरूला यून एट अल। 2008
- उपवंंश ल्यूटियोलीबैक्टर यून एट अल। 2008
- उपवंंश "सीए मारियाकेरमेंसिया" ओरेलाना एट अल। 2022
- उपवंंश ओशिनिफेरुला जिन एट अल। 2022
- उपवंंश पर्सिसिरहबडस यून एट अल। 2008
- उपवंंश रोज़ीबैसिलस यून एट अल। 2008
- उपवंंश रूब्रिटालिया शेउर्मेयर एट अल। 2006
- वंश एसएलसीजे (SLCJ)01
- उपवंंश "सल्फ़ुरिरोसेकोकस" फेंग एट अल। 2022
- वंश वेरुकोमाइक्रोबिएसी वार्ड-रेनी एट अल। 1996
- उपवंश "फूकोफिलस" सकाई एट अल। 2001बी
- उपवंश ब्रेविफ़ोलिस ओत्सुका एट अल। 2013
- उपवंश फ्रैगमिटीबैक्टर ज़ुरोज़्की एट अल। 2021
- उपवंश प्रोस्थेकोबैक्टर स्टेली एट अल। 1976 पूर्व स्टेली एट अल। 1980
- उपवंश रोजीमाइक्रोबियम ओत्सुका एट अल। 2013
- उपवंश वेरुकोमाइक्रोबियम स्लेसनर 1988
- वंश एकरमैनसियासी हेडलंड एंड डेरियन 2012
- क्रम वेरुकोमाइक्रोबियल्स वार्ड-रेनी एट अल। 1996
यह भी देखें
- जीवाणु क्रमों की सूची
- जीवाणु प्रजातियों की सूची
संदर्भ
- ↑ White, Richard Allen; Bottos, Eric M.; Roy Chowdhury, Taniya; Zucker, Jeremy D.; Brislawn, Colin J.; Nicora, Carrie D.; Fansler, Sarah J.; Glaesemann, Kurt R.; Glass, Kevin; Jansson, Janet K. (2016-06-28). Langille, Morgan (ed.). "मॉलिक्यूलो लॉन्ग-रीड सीक्वेंसिंग फैसिलिटेट असेंबली एंड जीनोमिक बिनिंग फ्रॉम कॉम्प्लेक्स सॉइल मेटाजेनोम्स". mSystems (in English). 1 (3): mSystems.00045–16, e00045–16. doi:10.1128/mSystems.00045-16. ISSN 2379-5077. PMC 5069762. PMID 27822530.
- ↑ Cho J, Vergin K, Morris R, Giovannoni S (2004). "लेंटिस्पेरा अरनेओसा जीन। नव., सपा. नोव, समुद्री जीवाणु पैदा करने वाला एक पारदर्शी एक्सोपॉलीमर, और एक उपन्यास बैक्टीरियल फाइलम, लेंटिसफेरी का विवरण". Environ Microbiol. 6 (6): 611–21. doi:10.1111/j.1462-2920.2004.00614.x. PMID 15142250.
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- ↑ Hou, S; Makarova, KS; Saw, JH; Senin, P; Ly, BV; Zhou, Z; Ren, Y; Wang, J; Galperin, MY; Omelchenko, Marina V; Wolf, Yuri I; Yutin, Natalya; Koonin, Eugene V; Stott, Matthew B; Mountain, Bruce W; Crowe, Michelle A; Smirnova, Angela V; Dunfield, Peter F; Feng, Lu; Wang, Lei; Alam, Maqsudul (2008). "Complete genome sequence of the extremely acidophilic methanotroph isolate V4, Methylacidiphilum infernorum, a representative of the bacterial phylum Verrucomicrobia". Biology Direct. 3: 26. doi:10.1186/1745-6150-3-26. PMC 2474590. PMID 18593465.
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