सर्किट टोपोलॉजी
मुड़े हुए रैखिक बहुलक का सर्किट टोपोलॉजी इसके इंट्रा-आणविक संपर्कों की व्यवस्था को संदर्भित करता है। इंट्रा-आणविक संपर्क वाले रैखिक पॉलीमर के उदाहरण न्यूक्लिक अम्ल और प्रोटीन हैं। हाइड्रोजन बॉन्ड, डाइसल्फ़ाइड बॉन्ड और बीटा-बीटा इंटरैक्शन सहित विभिन्न प्रकृति के संपर्कों के निर्माण के माध्यम से प्रोटीन फोल्ड होते हैं।[1] जीनोम में संपर्क सीटीसीएफ और cohesin सहित प्रोटीन पुलों के माध्यम से स्थापित किए जाते हैं और गुणसूत्र रचना कैप्चर|हाय-सी सहित प्रौद्योगिकियों द्वारा मापा जाता है।[2] सर्किट टोपोलॉजी इन भौतिक संपर्कों की टोपोलॉजिकल व्यवस्था को वर्गीकृत करती है, जिन्हें हार्ड संपर्क कहा जाता है। इसके अलावा, जंजीरों को गाँठ (या नरम संपर्कों के गठन) के माध्यम से मोड़ा जा सकता है। सर्किट टोपोलॉजी सॉफ्ट और हार्ड कॉन्टैक्ट्स दोनों को वर्गीकृत करने के लिए एक समान भाषा का उपयोग करती है, और फोल्डेड लीनियर चेन का पूरा विवरण प्रदान करती है।
एक मुड़ी हुई श्रृंखला का एक सरल उदाहरण दो कठोर संपर्कों वाली एक श्रृंखला है। दो बाइनरी संपर्कों वाली एक श्रृंखला के लिए, तीन व्यवस्थाएँ उपलब्ध हैं: समानांतर (पी), श्रृंखला (एस) और पार (एक्स)। n संपर्कों वाली एक श्रृंखला के लिए, टोपोलॉजी को n द्वारा n मैट्रिक्स द्वारा वर्णित किया जा सकता है जिसमें प्रत्येक तत्व संपर्कों की एक जोड़ी के बीच संबंध को दिखाता है और तीन अवस्थाओं में से एक, P, S और X ले सकता है। बहुसंयोजक संपर्क भी हो सकते हैं कई बाइनरी संपर्कों में पूर्ण या अपघटन के माध्यम से वर्गीकृत। इसी तरह, सर्किट टोपोलॉजी श्रृंखला क्रॉसिंग और टेंगल्स की जोड़ीवार व्यवस्था के वर्गीकरण की अनुमति देती है, इस प्रकार मुड़ी हुई श्रृंखलाओं का एक पूर्ण 3डी विवरण प्रदान करती है। इसके अलावा, कोई जटिल फोल्ड उत्पन्न करने के लिए सॉफ्ट और हार्ड संपर्कों पर सर्किट टोपोलॉजी ऑपरेशंस लागू कर सकता है।
सर्किट टोपोलॉजी में फोल्डिंग कैनेटीक्स और आणविक विकास के लिए निहितार्थ हैं और इसे आणविक ओरिगेमी सहित इंजीनियर पॉलिमर पर लागू किया गया है।[3] सर्किट टोपोलॉजी संपर्क क्रम और आकार के साथ रैखिक पॉलिमर की तह दर के निर्धारक हैं।[4]
अग्रिम पठन
- B. Scalvini et al., Circuit topology analysis of cellular genome reveals signature motifs, conformational heterogeneity, and scaling. iScience (2022). link
- B. Scalvini et al., Topological principles of protein folding. PCCP (2021). link
- A. Golovnev at el., Generalized circuit topology of folded linear chains. iScience (2020). link
- M. Heidari et al., Circuit topology analysis of polymer folding reactions. ACS Central Science (2020) link
संदर्भ
- ↑ Mashaghi, Alireza; van Wijk, Roeland J.; Tans, Sander J. (2014). "प्रोटीन और न्यूक्लिक एसिड की सर्किट टोपोलॉजी". Structure. 22 (9): 1227–1237. doi:10.1016/j.str.2014.06.015. PMID 25126961.
- ↑ Scalvini, B. et al. (2022) ‘Circuit topology analysis of cellular genome reveals signature motifs, conformational heterogeneity, and scaling’, iScience, 25(3), p. 103866.
- ↑ Yasuyuki Tezuka and Tetsuo Deguchi, Topological Polymer Chemistry: Concepts and Practices (2022) ISBN 978-981-16-6806-7
- ↑ Mugler, Andrew; Tans, Sander J.; Mashaghi, Alireza (2014). "Circuit topology of self-interacting chains: implications for folding and unfolding dynamics". Phys. Chem. Chem. Phys. 16 (41): 22537–22544. Bibcode:2014PCCP...1622537M. doi:10.1039/C4CP03402C. PMID 25228051.
यह भी देखें
श्रेणी:आण्विक टोपोलॉजी
श्रेणी:आण्विक ज्यामिति
श्रेणी:सुपरमॉलेक्यूलर केमिस्ट्री
श्रेणी: टोपोलॉजी
श्रेणी:गणितीय रसायन
