जीवाणुनाशक

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Bacteroides biacutis
Bacteroides biacutis
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  • "Bacteroidaeota" Oren et al. 2015
  • "Bacteroidetes" Krieg et al. 2010[3]
  • "Bacteroidota" Whitman et al. 2018
  • "Saprospirae" Margulis and Schwartz 1998
  • "Sphingobacteria" Cavalier-Smith 2002

फाइलम (जीव विज्ञान) बैक्टेरॉइडोटा (पर्यायवाची जीवाणु ) ग्राम-नकारात्मक बैक्टीरिया के तीन बड़े वर्गों से बना है। ग्राम-नकारात्मक, नॉनस्पोरफॉर्मिंग, एनारोबिक या एरोबिक, और रॉड के आकार के बैक्टीरिया जो मिट्टी, तलछट सहित पर्यावरण में व्यापक रूप से वितरित होते हैं। , और समुद्र का पानी, और साथ ही जानवरों की आंत और त्वचा पर।

हालांकि कुछ बैक्टेरॉइड्स एसपीपी। अवसरवादी रोगजनक हो सकते हैं, कई बैक्टीरियोडोटा सहजीवी बैक्टीरिया हैं जो जठरांत्र संबंधी मार्ग से अत्यधिक समायोजित होते हैं। "बैक्टेरॉइड्स" आंतों में अत्यधिक प्रचुर मात्रा में होते हैं, जो 10 तक पहुंचते हैं11 सेल g-1 आंतों की सामग्री। वे चयापचय रूपांतरण करते हैं जो मेजबान के लिए आवश्यक होते हैं, जैसे कि प्रोटीन या जटिल चीनी पॉलिमर का क्षरण। बैक्टीरियोडोटा शिशुओं में पहले से ही गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल ट्रैक्ट को उपनिवेशित करता है, क्योंकि मां के दूध में गैर-सुपाच्य oligosaccharide बैक्टेरॉइड्स और Bifidobacterium एसपीपी दोनों के विकास का समर्थन करते हैं। बैक्टेरॉइड्स एसपीपी। विशिष्ट बातचीत के माध्यम से मेजबान की प्रतिरक्षा प्रणाली द्वारा चुनिंदा रूप से पहचाने जाते हैं।[4]


इतिहास

बैक्टेरॉइड्स फ्रेगिलिस पहली बैक्टेरॉइड्स प्रजाति थी जिसे 1898 में अन्य नैदानिक ​​मामलों में पथरी से जुड़े मानव रोगज़नक़ के रूप में अलग किया गया था।[4]अब तक, वर्ग (जीव विज्ञान) जीवाणु में प्रजातियों का सबसे अच्छी तरह से अध्ययन किया जाता है, जिसमें जीनस बैक्टेरॉइड्स (मनुष्यों सहित गर्म-रक्त वाले जानवरों के मल में प्रचुर मात्रा में जीव), और पोर्फिरोमोनस, मानव मौखिक में रहने वाले जीवों का एक समूह शामिल है। गुहा। क्लास बैक्टेरॉइडिया को पहले बैक्टेरॉइडेटेस कहा जाता था; जैसा कि हाल ही में संघ में एकमात्र वर्ग था, बर्गी के मैनुअल ऑफ सिस्टमैटिक बैक्टीरियोलॉजी के चौथे खंड में नाम बदल दिया गया था।[5] एक लंबे समय के लिए, यह सोचा गया था कि अधिकांश ग्राम-नकारात्मक गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल ट्रैक्ट बैक्टीरिया जीनस बैक्टेरॉइड्स के थे, लेकिन हाल के वर्षों में बैक्टेरॉइड्स की कई प्रजातियों का पुनर्वर्गीकरण हुआ है। वर्तमान वर्गीकरण के आधार पर, गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल बैक्टीरॉयडोटा प्रजातियों में से अधिकांश परिवार बैक्टेरोएडेसी, प्रीवोटेलेसी, रिकेनेलेसी, और पोर्फिरोमोनैडेसी परिवारों से संबंधित हैं। [4]इस फाइलम को कभी-कभी क्लोरोबायोटा, फाइब्रोबैक्टीरोटा, रत्नों से विभूषित, कैल्डिट्रिकोटा और समुद्री समूह ए के साथ एफसीबी समूह या सुपरफिलम बनाने के लिए समूहीकृत किया जाता है।[6] कैवेलियर-स्मिथ द्वारा प्रस्तावित वैकल्पिक वर्गीकरण प्रणाली में, यह टैक्सन इसके बजाय फाइलम स्फ़िंगोबैक्टीरिया (संघ) में एक वर्ग है।

चिकित्सा और पारिस्थितिक भूमिका

गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल माइक्रोबायोटा में बैक्टीरियोडोटा में बहुत व्यापक चयापचय क्षमता होती है और इसे गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल माइक्रोफ्लोरा के सबसे स्थिर हिस्से में से एक माना जाता है। कुछ मामलों में बैक्टीरियोडोटा की कम बहुतायत मोटापे से जुड़ी है। चिड़चिड़ा आंत्र सिंड्रोम वाले रोगियों में यह जीवाणु समूह समृद्ध प्रतीत होता है[7] और टाइप-1 डायबिटीज और मधुमेह प्रकार 2 में शामिल हैं।[4]बैक्टेरॉइड्स एसपीपी। प्रीवोटेला एसपीपी के विपरीत। हाल ही में कम जीन समृद्धि वाले विषयों के मेगाहेनजोम में समृद्ध पाए गए थे जो वसा, इंसुलिन प्रतिरोध और डिस्लिपिडेमिया के साथ-साथ एक भड़काऊ फेनोटाइप से जुड़े थे। बैक्टीरियोडोटा प्रजातियां जो फ्लेवोबैक्टीरिया और स्फिंगोबैक्टीरिया वर्ग से संबंधित हैं, विशिष्ट मिट्टी के बैक्टीरिया हैं और केवल कभी-कभी गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल ट्रैक्ट में पाए जाते हैं, कैप्नोसाइटोफेगा एसपीपी को छोड़कर। और स्फिंगोबैक्टीरियम एसपीपी। जिसे मानव मौखिक गुहा में पाया जा सकता है।[4]

बैक्टीरॉयडोटा गट माइक्रोबायोटा तक ही सीमित नहीं हैं, वे पृथ्वी पर विभिन्न प्रकार के आवासों का उपनिवेश करते हैं।[8] उदाहरण के लिए, स्यूडोमोनडोटा, बैसिलोटा और एक्टिनोमाइसेटोटा के साथ बैक्टेरॉइडोटा भी rhizosphere में सबसे प्रचुर मात्रा में बैक्टीरिया समूहों में से हैं।[9] वे विभिन्न स्थानों से मिट्टी के नमूनों में पाए गए हैं, जिनमें खेती वाले खेत, ग्रीनहाउस मिट्टी और अप्रयुक्त क्षेत्र शामिल हैं।[8]बैक्टीरिया मीठे पानी की झीलों, नदियों और महासागरों में भी रहते हैं। वे तेजी से समुद्री वातावरण में बैक्टीरियोप्लांकटन के एक महत्वपूर्ण डिब्बे के रूप में पहचाने जाते हैं, विशेष रूप से पेलाजिक क्षेत्र में।[8]हलोफाइल बैक्टीरियोडोटा जीनस सेलिनीबैक्टीरियम हाइपरसैलिन वातावरण में निवास करता है जैसे कि हाइपरसैलिन झीलों में नमक-संतृप्त ब्राइन। सेलिनीबैक्टर हेलोफिलिक आर्किया जैसे हेलोबैक्टीरियम और हलोक्वाड्रटम के साथ कई गुण साझा करता है जो एक ही वातावरण में रहते हैं। फेनोटाइपिक रूप से, सेलिनबैक्टर उल्लेखनीय रूप से हेलोबैक्टीरियम के समान है और इसलिए लंबे समय तक अज्ञात रहा।[10]


चयापचय

गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल बैक्टीरियोडोटा प्रजातियां प्रमुख अंत-उत्पादों के रूप में स्यूसेनिक तेजाब , एसीटिक अम्ल और कुछ मामलों में प्रोपियॉनिक अम्ल का उत्पादन करती हैं। एलिस्टिप्स, बैक्टेरॉइड्स, पैराबैक्टेरॉइड्स, प्रीवोटेला, पैराप्रेवोटेला, एलोप्रेवोटेला, बार्नेसिएला, और तनेरेला फोर्सिथिया जेनेरा से संबंधित प्रजातियां सैक्रोलाइटिक हैं, जबकि गंधक और पोर्फिरोमोनस से संबंधित प्रजातियां मुख्य रूप से एसाक्रोलाइटिक हैं। कुछ बैक्टेरॉइड्स एसपीपी। और प्रीवोटेला एसपीपी। स्टार्च, सेल्यूलोज, ज़ायलान और कंघी के समान आकार जैसे जटिल पौधे पॉलीसेकेराइड को नीचा दिखा सकते हैं। सेल से जुड़े प्रोटीज को सौंपी गई प्रोटियोलिटिक गतिविधि द्वारा बैक्टीरियोडोटा प्रजातियां प्रोटीन चयापचय में भी महत्वपूर्ण भूमिका निभाती हैं। कुछ बैक्टेरॉइड्स एसपीपी। यूरिया को नाइट्रोजन स्रोत के रूप में उपयोग करने की क्षमता है। बैक्टेरॉइड्स एसपीपी के अन्य महत्वपूर्ण कार्य। पित्त अम्लों के अपघटन और बलगम पर वृद्धि शामिल हैं।[4]फ्लेक्सिरुबिन समूह के पिगमेंट की उपस्थिति के कारण बैक्टीरिया के कई सदस्य (फ्लेक्सीबैक्टर, साइटोफेगा, स्पोरोसाइटोफागा और रिश्तेदार) पीले-नारंगी से गुलाबी-लाल रंग के होते हैं। कुछ बैक्टीरियोडोटा उपभेदों में, कैरोटीनॉयड पिगमेंट के साथ फ्लेक्सीरुबिन मौजूद हो सकते हैं। कैरोटीनॉयड पिगमेंट आमतौर पर समूह के समुद्री और हेलोफाइल सदस्यों में पाए जाते हैं, जबकि फ्लेक्सिरुबिन पिगमेंट नैदानिक, मीठे पानी या मिट्टी-उपनिवेशी प्रतिनिधियों में अधिक पाए जाते हैं।[11]


जीनोमिक्स

तुलनात्मक जीनोमिक विश्लेषण से 27 प्रोटीनों की पहचान हुई है जो कि बैक्टीरियोडोटा संघ की अधिकांश प्रजातियों में मौजूद हैं। इनमें से एक प्रोटीन सभी अनुक्रमित बैक्टेरोइडोटा प्रजातियों में पाया जाता है, जबकि दो अन्य प्रोटीन जीनस बैक्टेरॉइड्स के अपवाद के साथ सभी अनुक्रमित प्रजातियों में पाए जाते हैं। इस जीनस में इन दो प्रोटीनों की अनुपस्थिति चयनात्मक जीन हानि के कारण होने की संभावना है।[6]इसके अतिरिक्त, चार प्रोटीनों की पहचान की गई है जो साइटोफगा हचिंसोनी को छोड़कर सभी बैक्टेरॉइडोटा प्रजातियों में मौजूद हैं; यह फिर से चयनात्मक जीन हानि के कारण होने की संभावना है। एक और आठ प्रोटीनों की पहचान की गई है जो सेलिनबैक्टर रूबर को छोड़कर सभी अनुक्रमित बैक्टीरियोडोटा जीनोम में मौजूद हैं। इन प्रोटीनों की अनुपस्थिति चुनिंदा जीन हानि के कारण हो सकती है, या क्योंकि एस रूबर शाखाएं बहुत गहराई से हो सकती हैं, एस रूबर के विचलन के बाद इन प्रोटीनों के जीन विकसित हो सकते हैं। एक संरक्षित हस्ताक्षर इंडल्स की भी पहचान की गई है; सीएलपीबी चैपरोन (प्रोटीन) में यह तीन-अमीनो-एसिड विलोपन, एस. रूबर को छोड़कर बैक्टीरॉयडोटा फाइलम की सभी प्रजातियों में मौजूद है। यह विलोपन एक क्लोरोबायोटा प्रजाति और एक आर्कियस प्रजाति में भी पाया जाता है, जो क्षैतिज जीन स्थानांतरण के कारण होने की संभावना है। ये 27 प्रोटीन और तीन-अमीनो-एसिड विलोपन बैक्टीरियोडोटा के लिए आणविक मार्कर के रूप में काम करते हैं।[6]


बैक्टीरियोडोटा, क्लोरोबायोटा, और फाइब्रोबैक्टीरोटा फ़ाइला का संबंध

बैक्टेरॉइडोटा और क्लोरोबायोटा फ़ाइला शाखा की प्रजातियाँ फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ों में एक साथ बहुत करीब से मिलती हैं, जो एक करीबी रिश्ते का संकेत देती हैं। तुलनात्मक जीनोमिक विश्लेषण के उपयोग के माध्यम से, तीन प्रोटीनों की पहचान की गई है जो बैक्टीरियोडोटा और क्लोरोबायोटा फ़ाइला के वस्तुतः सभी सदस्यों द्वारा विशिष्ट रूप से साझा किए जाते हैं।[6]इन तीन प्रोटीनों का साझाकरण महत्वपूर्ण है क्योंकि उनके अलावा, बैक्टीरिया के किसी भी अन्य समूह द्वारा बैक्टेरॉइडोटा या क्लोरोबायोटा फ़ाइला से कोई प्रोटीन साझा नहीं किया जाता है। कई संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स की भी पहचान की गई है जो विशिष्ट रूप से फ़ाइला के सदस्यों द्वारा साझा किए गए हैं। इन आणविक हस्ताक्षरों की उपस्थिति उनके घनिष्ठ संबंध का समर्थन करती है।[6][12] इसके अतिरिक्त, फाइलम फाइब्रोबैक्टीरोटा को विशेष रूप से इन दो फाइला से संबंधित होने का संकेत दिया गया है। इन तीन संघों से युक्त एक क्लैड को कई अलग-अलग प्रोटीनों के आधार पर फाइलोजेनेटिक विश्लेषणों द्वारा दृढ़ता से समर्थित किया जाता है।[12]कई महत्वपूर्ण प्रोटीनों में संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स के आधार पर ये फ़ाइला भी उसी स्थिति में शाखा करते हैं।[13] अंत में और सबसे महत्वपूर्ण, दो संरक्षित सिग्नेचर इंडल्स (RpoC प्रोटीन और सेरीन हाइड्रॉक्सीमिथाइलट्रांसफेरेज़ में) और एक सिग्नेचर प्रोटीन PG00081 की पहचान की गई है जो इन तीनों फ़ाइला की सभी प्रजातियों द्वारा विशिष्ट रूप से साझा किए गए हैं। ये सभी परिणाम सम्मोहक साक्ष्य प्रदान करते हैं कि इन तीनों संघों की प्रजातियों ने अन्य सभी जीवाणुओं के अनन्य पूर्वज को साझा किया है, और यह प्रस्तावित किया गया है कि उन सभी को एक FCB सुपरफिलम के हिस्से के रूप में मान्यता दी जानी चाहिए।[6][12]


फाइलोजेनी

वर्तमान में स्वीकृत वर्गीकरण नामकरण में स्थायी के साथ प्रोकैरियोटिक नामों की सूची पर आधारित है[2]

Whole-genome based phylogeny[14] 16S rRNA based LTP_12_2021[15][16][17] GTDB 07-RS207 by Genome Taxonomy Database[18][19][20]
 
 
 

Chlorobiota

 
 
 

Balneolota

 
 

Rhodothermota

 
 
 
Bacteroidota
 

Saprospiria

 
 
 
 
 

Chitinophagia

 
 

Sphingobacteriia

 
 
 

Cytophagia

 
 
 
 

Bacteroidia

 
 

Flavobacteriia

 
 
 
 
 
 
 
 

Ignavibacteriota

 
 

Chlorobiota

 
 
 
 

Rhodothermota

 
 
 

Balneolota

 
Bacteroidota
 

Raineyaceae

 
 
 

Microscillaceae

 
 
 

Cytophagia

 
 
 

Chitinophagia

 
 
 

Sphingobacteriia

 
 
 

Bacteroidia

 
 

Flavobacteriia

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Bacteroidota
 
"Kapabacteria"

"Kapabacteriales"

 
 
"Kryptonia"

"Kryptoniales"

 
"Ignavibacteriia"

Ignavibacteriales

 
 
 
 
"Chlorobiia"

Chlorobiales

 
 
Rhodothermia
 

Balneolales

 
 

Rhodothermales

 
 
Bacteroidia
 

Cytophagales

 
 
 

Chitinophagales

 
 
 

Sphingobacteriales

 
 
 

Bacteroidales

 
 

Flavobacteriales

 
 
 
 
 
 
 
 


यह भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. S2CID 239887308.
  2. ↑ 2.0 2.1 Euzéby JP, Parte AC. ""Bacteroidetes"". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved June 23, 2021.
  3. ↑ Krieg NR, Ludwig W, Euzéby J, Whitman WB (2010). "Phylum XIV. Bacteroidetes phyl. nov.". In Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ, Ward NL, Ludwig W, Whitman WB (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 4 (2nd ed.). New York, NY: Springer. p. 25.
  4. ↑ 4.0 4.1 4.2 4.3 4.4 4.5 Rajilić-Stojanović, Mirjana; de Vos, Willem M. (2014). "मानव गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल माइक्रोबायोटा की पहली 1000 सुसंस्कृत प्रजातियां". FEMS Microbiology Reviews (in English). 38 (5): 996–1047. doi:10.1111/1574-6976.12075. ISSN 1574-6976. PMC 4262072. PMID 24861948.
  5. ↑ Krieg, N.R.; Ludwig, W.; Whitman, W.B.; Hedlund, B.P.; Paster, B.J.; Staley, J.T.; Ward, N.; Brown, D.; Parte, A. (November 24, 2010) [1984(Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). बैक्टीरॉइडेटेस, स्पाइरोकेट्स, टेनेरिक्यूट्स (मॉलिक्यूट्स), एसिडोबैक्टीरिया, फाइब्रोबैक्टीरिया, फ्यूसोबैक्टीरिया, डिक्टियोग्लोमी, Gemmatimonades, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, और Planctomycetes. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 4 (2nd ed.). New York: Springer. p. 908. ISBN 978-0-387-95042-6. British Library no. GBA561951.
  6. ↑ 6.0 6.1 6.2 6.3 6.4 6.5 Gupta, R. S.; Lorenzini, E. (2007). "फाइलोजेनी और आणविक हस्ताक्षर (संरक्षित प्रोटीन और इंडल्स) जो बैक्टीरिया और क्लोरोबी प्रजातियों के लिए विशिष्ट हैं". BMC Evolutionary Biology. 7: 71. doi:10.1186/1471-2148-7-71. PMC 1887533. PMID 17488508.
  7. ↑ Pittayanon R. et al., Gastroenterology, 2019, 157(1):97-108.
  8. ↑ 8.0 8.1 8.2 Thomas, François; Hehemann, Jan-Hendrik; Rebuffet, Etienne; Czjzek, Mirjam; Michel, Gurvan (2011). "Environmental and Gut Bacteroidetes: The Food Connection". Frontiers in Microbiology. 2: 93. doi:10.3389/fmicb.2011.00093. ISSN 1664-302X. PMC 3129010. PMID 21747801.
  9. ↑ Mendes, Rodrigo; Garbeva, Paolina; Raaijmakers, Jos M. (2013). "The rhizosphere microbiome: significance of plant beneficial, plant pathogenic, and human pathogenic microorganisms". FEMS Microbiology Reviews (in English). 37 (5): 634–663. doi:10.1111/1574-6976.12028. ISSN 1574-6976. PMID 23790204.
  10. ↑ Oren, Aharon (2013). "Salinibacter: An extremely halophilic bacterium with archaeal properties". FEMS Microbiology Letters (in English). 342 (1): 1–9. doi:10.1111/1574-6968.12094. PMID 23373661.
  11. ↑ Jehlička, Jan; Osterrothová, Kateřina; Oren, Aharon; Edwards, Howell G. M. (2013). "बैक्टीरॉइड्स के दो जेनेरा से फ्लेक्सिरूबिन पिगमेंट का रमन स्पेक्ट्रोमेट्रिक भेदभाव". FEMS Microbiology Letters (in English). 348 (2): 97–102. doi:10.1111/1574-6968.12243. PMID 24033756.
  12. ↑ 12.0 12.1 12.2 Gupta, R. S. (2004). "'फाइब्रोबैक्टीरस', 'क्लोरोबी', और 'बैक्टेरोएडेट्स' की फाइलोजेनी और सिग्नेचर सीक्वेंस विशेषताएँ". Critical Reviews in Microbiology. 30 (2): 123–140. doi:10.1080/10408410490435133. PMID 15239383. S2CID 24565648.
  13. ↑ Griffiths, E; Gupta, RS (2001). "The use of signature sequences in different proteins to determine the relative branching order of bacterial divisions: Evidence that Fibrobacter diverged at a similar time to Chlamydia and the Cytophaga–Flavobacterium–Bacteroides division". Microbiology. 147 (Pt 9): 2611–22. doi:10.1099/00221287-147-9-2611. PMID 11535801.
  14. ↑ García-López M, Meier-Kolthoff JP, Tindall BJ, Gronow S, Woyke T, Kyrpides NC, Hahnke RL, Göker M (2019). "Analysis of 1,000 Type-Strain Genomes Improves Taxonomic Classification of Bacteroidetes". Front Microbiol. 10: 2083. doi:10.3389/fmicb.2019.02083. PMC 6767994. PMID 31608019.
  15. ↑ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
  16. ↑ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
  17. ↑ "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2021.
  18. ↑ "GTDB release 07-RS207". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  19. ↑ "ar53_r207.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.
  20. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 20 June 2022.


बाहरी संबंध

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