बायोजेएस

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बायोजेएस
Initial release2012
Written inJavaScript
TypeBioinformatics
LicenseApache 2
Websitebiojs.net

बायोजेएस वेब पर जैव सूचना विज्ञान डेटा के लिए संवृत-स्रोत परियोजना है।[1] इसका लक्ष्य जैविक डेटा की कल्पना करने के लिए जावास्क्रिप्ट घटकों की संवृत-स्रोत लाइब्रेरी विकसित करना है।[2] बायोजेएस छोटे बिल्डिंग ब्लॉक्स (घटकों) का विकास और सुरक्षा करता है जिनका दूसरों द्वारा पुन: उपयोग किया जा सकता है। उपलब्ध घटकों की शोध के लिए, बायोजेएस Archived 2018-03-13 at the Wayback Machine को संग्रहीत रजिस्ट्री बनाए रखता है। .

इतिहास

बायोजेएस का प्रथम संस्करण 2012 में जॉन गोमेज़ द्वारा प्रस्तावित किया गया था। इसे वेब अनुप्रयोगों में जैविक डेटा का प्रतिनिधित्व करने के लिए वेब घटकों की जावास्क्रिप्ट लाइब्रेरी के रूप में विकसित किया गया था। संस्करण 2.0 में लाइब्रेरी का पूर्ण नया डिज़ाइन सम्मिलित था और इसे 2014 में मैनुअल कॉर्पस (वैज्ञानिक) के नेतृत्व में गूगल समर ऑफ़ कोड परियोजना के रूप में प्रस्तावित किया गया था और डेविड डाओ और सेबेस्टियन विल्ज़बैक द्वारा विकसित किया गया था। तब से 100 से अधिक लोगों ने इस परियोजना में योगदान दिया। वर्तमान में बायोजेएस रजिस्ट्री में 150 से अधिक घटक उपलब्ध हैं।

प्रकाशित घटकों की चयनित सूची

  • डीएजी दर्शक[3]
  • डीएनए सामग्री दर्शक[4]
  • फ़ीचर दर्शक[5]
  • हीटमैपदर्शक[6]
  • इंटरमाइन विश्लेषण[7]
  • अंतबिंदुओं को अंतःस्थापित करें[8]
  • केइजीजीदर्शक[9]
  • पीपीआई-इंटरैक्शन[10]
  • साइक्विक ग्राफ़[11]
  • अनुक्रम[12]
  • विग्सप्लोरर[13]
  • ट्रीविजेट[14]

बायोजेएस का उपयोग करने वाले संस्थान

यह भी देखें

संदर्भ

  1. Corpas; Jimenez, Rafael; Carbon, Seth J; García, Alex; Garcia, Leyla; Goldberg, Tatyana; Gomez, John; Kalderimis, Alexis; Lewis, Suzanna E; Mulvany, Ian; Pawlik, Aleksandra; Rowland, Francis; Salazar, Gustavo; Schreiber, Fabian; Sillitoe, Ian; Spooner, William H; Thanki, Anil; Villaveces, José M; Yachdav, Guy; Hermjakob, Henning (2014). "BioJS: an open source standard for biological visualisation – its status in 2014". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-55.v1. ISSN 2046-1402. PMC 4103492. PMID 25075290.
  2. "बायोजेएस विजन और मिशन". BioJS. Archived from the original on 10 August 2014. Retrieved 29 August 2014.
  3. Kalderimis, Alexis; Stepan, Radek; Sullivan, Julie; Lyne, Rachel; Lyne, Michael; Micklem, Gos (2014). "BioJS DAGViewer: A reusable JavaScript component for displaying directed graphs". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-51.v1. ISSN 2046-1402. PMC 3945768. PMID 24627804.
  4. Thanki, Anil S.; Caim, Shabhonam; Corpas, Manuel; Davey, Robert P. (2014). "DNAContentViewer a BioJS component to visualise GC/AT Content". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-54.v1. ISSN 2046-1402.
  5. Garcia, Leyla; Yachdav, Guy; Martin, Maria-Jesus (2014). "फ़ीचरव्यूअर, प्रोटीन अनुक्रमों में स्थिति-आधारित एनोटेशन के विज़ुअलाइज़ेशन के लिए एक बायोजेएस घटक". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-47.v2. ISSN 2046-1402. PMC 3983936. PMID 24741440.
  6. Yachdav, Guy; Hecht, Maximilian; Pasmanik-Chor, Metsada; Yeheskel, Adva; Rost, Burkhard (2014). "HeatMapViewer: interactive display of 2D data in biology". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-48.v1. ISSN 2046-1402. PMC 4023661. PMID 24860644.
  7. Kalderimis, Alexis; Stepan, Radek; Sullivan, Julie; Lyne, Rachel; Lyne, Michael; Micklem, Gos (2014). "BioJS InterMine List Analysis: A BioJS component for displaying graphical or statistical analysis of collections of items from InterMine endpoints". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-45.v1. ISSN 2046-1402.
  8. Kalderimis, Alexis; Stepan, Radek; Sullivan, Julie; Lyne, Rachel; Lyne, Michael; Micklem, Gos (2014). "BioJS InterMineTable Component: A BioJS component for displaying data from InterMine compatible webservice endpoints". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-46.v1. ISSN 2046-1402.
  9. Villaveces, Jose M.; Jimenez, Rafael C.; Habermann, Bianca H. (2014). "KEGGViewer, KEGG पाथवेज़ को देखने के लिए एक BioJS घटक". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-43.v1. ISSN 2046-1402. PMC 3954160. PMID 24715980.
  10. Salazar, Gustavo A.; Meintjes, Ayton; Mulder, Nicola (2014). "PPI layouts: BioJS components for the display of Protein-Protein Interactions". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-50.v1. ISSN 2046-1402. PMC 4103490. PMID 25075288.
  11. Villaveces, Jose M.; Jimenez, Rafael C.; Habermann, Bianca H. (2014). "PsicquicGraph, PSICQUIC सर्वर से आणविक अंतःक्रियाओं को देखने के लिए एक BioJS घटक". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-44.v1. ISSN 2046-1402. PMC 4097353. PMID 25075287.
  12. Gomez, John; Jimenez, Rafael (2014). "अनुक्रम, अनुक्रमों को देखने के लिए एक बायोजेएस घटक". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-52.v1. ISSN 2046-1402. PMC 4103491. PMID 25075289.
  13. Thanki, Anil S.; Jimenez, Rafael C.; Kaithakottil, Gemy G.; Corpas, Manuel; Davey, Robert P. (2014). "विगएक्सप्लोरर, विग डेटा को विज़ुअलाइज़ करने के लिए एक बायोजेएस घटक". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-53.v2. ISSN 2046-1402.
  14. Schreiber, Fabian (2014). "treeWidget: a BioJS component to visualise phylogenetic trees". F1000Research. doi:10.12688/f1000research.3-49.v1. ISSN 2046-1402.


बाहरी संबंध